武汉大学 侯华 分子模拟实验报告 1分子优化

  • 格式:docx
  • 大小:142.50 KB
  • 文档页数:4

下载文档原格式

  / 4
  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

一、优化常见分子

1.084

1.365

1.785

0.943

1.398

0.942

1.088

1.182 1.322

1.184 1.527

1.316

1.212

二、水的二聚体

HF/6-31 -95409.0

-95651.6

-95871.6

-110.4

三、收获与感想

1.实验结果

C-H键长约为1.08 Å,O-H键长约为0.94 Å,C=O键长约为1.18 Å,C-F键长约为1.37 Å,C-Cl键长约为1.79 Å,碳碳单键约为1.53 Å,碳碳双键约为1.32 Å,碳碳三键约为1.21 Å,等等。

水的二聚体实验结果为氢键长度O-O大约为 2.9~3.0Å;氢键强度D~5.0 kcal/mol。HF/6-31++G(d)方法的计算结果与实验数据最接近。

2.理论方法

在求解Hartree-Fock-Roothaan方程时,可以把分子轨道向某一基组(basis set)展开,从而把非线性的微积分方程转化为一组代数矩阵方程,简化计算过程。3.模拟技巧

建模要迅速采用最简便的方法,不要浪费太多时间。本次实验都是简单分子,都可以采用分子式输入直接建模法。水的二聚体建模,可以直接输入两个水分子,灵活运用shift键,调整好两个水分子之间的距离(1.8 Å左右)以及取向,右键勾选显示氢键,即可。

每次计算之前都要检查一遍设置选项,特别是五个重要选项,以免运行错误。

文件以及截图保存的文件名命名需要有序且注明内容。可采取数字编号+分子式的格式。以免需要再次打开时难以寻找。