土拉菌的实验室检测及分析技术研究进展
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684中国人兽共患病学报ChineseJournal
ofZoonoses
文章编号:1002—2694(2009)07—0684—05
土拉菌的实验室检测及分析技术研究进展*
朱晓宇,海荣中图分类号:R378.6文献标识码:A土拉弗朗西斯菌(Francisellatularensis)属弗朗西斯菌属,能引起人或动物的土拉菌病(Tulare-mia)。患者可见发热、淋巴结肿大、肺炎等症状。土拉菌在世界各地分布广泛,自然疫源地主要分布在北半球。目前,至少有包括中国在内的18个国家曾经报导过人间病例。1911年,土拉菌在美国加利福尼亚被首次分离,并被命名为Bacteriumtularensis。此后多年,其分类学地位几经更改,并在最近的伯杰氏手册中被命名为Francisellatularensis。目前,弗朗西斯菌属至少包括Francisellatularensis、Francisellaphilomiragia两个种,而Francisellatularensis又可分为tularensis、holarctica、novicida、mediasiati—ca等亚种u’。tularensis亚种又称为A型土拉菌,holarctica也被称为B型土拉菌。土拉菌不但是广泛分布的人兽共患病,而且是被各国国防机构密切关注的生物战剂。近年来,对土拉菌的研究日益增加,而土拉菌的实验室检测及菌株特性分析技术也较上世纪有了飞速发展。本文将对近几年的研究进展及主要结论进行综述。1实验室检测技术现状1.1病原学检测对病原体的分离是确定土拉菌病的最直接证据。然而,鉴于对营养要求苛刻,生长缓慢、菌体小、感染力强等原因,直到今日,对土拉菌的分离仍然是难度较大的工作。土拉菌在37℃生长缓慢,28℃更不适于生长,而与之相似的其他细菌,如鼠疫菌、F.philomiragia,都能在28℃较好生长n3。土拉菌属半胱氨酸缺陷型,只有在含有半胱氨酸的培养基上才能生长。土拉菌也不易在液体培养基中生长。在添加了半胱氨酸的液体培养基中,大量接种后培养24h,产量仍然很低n3。土拉菌曾经从溃疡组织、淋巴节活组织、痰液中成功分离n3。脑脊液、血液、尿液也都可以作为分离的标本旺。3’。此外,动物的肝、脾组织也是常见标本。3。很多培养基都可用于土拉菌分离培养。除了葡萄糖半胱氨酸血琼脂培养基外,巧克力培养基(ChocolateAgar)、含有羊血的Cysteineheartagar(CHAB)、ModifiedThayer—Martin和Martin—Lew—is等培养基都可于土拉菌的分离培养,少数菌株还可用哥伦比亚血平板或胰酶大豆(Trypticasesoy)
平板培养n‘‘3。在CHAB平板上,土拉菌菌落的直
径大约2~4rflm,呈绿色或白色,光滑湿润H3。从现场标本中分离土拉菌较为困难。过去从病畜尸体中分离土拉菌的成功率仅有30%。1。最近,KierstenJKugeler等人建议在疫情现场用CHAB
培养基进行土拉菌分离,其成功率可以达到90%。此外,用添加有抗生素的CHAB培养基(CHA&A培养基)可以抑制杂菌生长,是从受污染标本,甚至尿液标本,分离土拉菌的好方法。他们的经验还表明,若将现场标本浸入Cary-Blair培养基中,运输至实验室再进行分离,阳性率反而低于将标本直接低温冻存后再运输至实验室分离。其原因在于Cary—Blair培养基使标本中的假单胞菌、葡萄球菌、变形菌等杂菌得以大量繁殖,从而与土拉菌形成竞争。1.2分子生物学检测目前,PCR及巢式PCR仍然是较常用的快速检测方法。除16SrRNA基因
外,编码外膜蛋白的fopA基因、琥珀酸脱氢酶基因座的sdhA基因及编码17kDa脂蛋白的tul4基因都已经被用做检测土拉菌的靶位点(表1)“。63。在中国的420只鼠类标本中检测fopA基因,其阳性率为4.76%,其中来自吉林省的标本阳性率为11.65%,新疆的标本为10.oo%,黑龙江为6.56%,内蒙古为1.77%u3。通过序列比对也证实,所检测到的阳性片段均属holarctica亚种。tul4、fopA都是在荧光定量PCR检测中常用的靶点(表2)。1∞。此外,土拉菌基因组的插入序列ISFtu2及编码23kDa蛋白(intracellulargrowth10—
CU8Cprotein)的iglC基因都已经成为研究者的关注对象o’。相比传统的PCR方法,荧光定量PCR的优势不仅在于其高特异性、高灵敏性或短时快速性,更有前景的是其多靶点性。通过在探针上标记
*国家科技重大专项资助(项目号:2008ZXl0004-010)通讯作者:海荣.Email:hairong@icde.cn作者单位:中国疾病预防控制中心传染病预防控饲所,传染病预防
控制国家重点实验室.北京102206
万方数据2009,25(7)害.恩s全Jo兽urn共al患ofZ病oO学DOs报es685nln
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表2常用的荧光定量PCR引物及探针
不同的荧光物质,荧光定量PCR可以实现在一次反应中同时检测三个目标基因。美国疾控中心(CDC)的研究组在疫情处理时常常同时检测ISFtu2、iglC和tul4三个基因03。而加拿大公共卫生署(PulbicHealthAgencyofCanada)也已经能够从一次反应中检测包括土拉菌在内的三种病原菌。对于荧光定量PCR,现场的应用和普及较难达到。有些探针和引物已经开始在便携式的荧光定量PCR仪中尝试应用并取得较好效果,具有一定前景n∞。1.3血清学检测由于分离培养给检测人员带来感染风险,血清学方法在很长一段时间都受到重视。在发病两周之后,患者体内可以产生抗体,而利用乳胶凝集、ELISA、免疫荧光、免疫组织化学及胶体金免疫层析等方法均能对土拉菌及其抗体进行检测n1。1∞。针对土拉菌的单克隆抗体在上世纪90年代已经成功研发,然而早期研发的单克隆抗体绝大部分都识别土拉菌的脂多糖(表3)n¨钉。进入本世纪后,
万方数据686中国人兽共患病学报ChineseJournalofZoonoses2009.25(7)
不断有新的单克隆抗体问世。这些抗体中有些已经可以识别LPS之外的蛋白。单克隆抗体Ft9不与LPS抗原反应,与全菌甲醛固定抗原杂交可出现13条典型的糖蛋白梯形印迹带o∞。近来还发现了M11D3、M13810、S11E7和U22F2单克隆抗体,也能识别不同分子量的土拉菌蛋白n∞。土拉菌的特异性抗原也不断被发现(表4)。较早的研究已经确定了土拉菌17kDa和43kDa的外膜蛋白,它们直至今日仍被广泛应用于土拉菌的检测及鉴定。这两个蛋白分别由tul4和fopA基因编码。TUL4是一种脂蛋白,可以刺激土拉菌免疫病人的淋巴细胞增值,特别是激活CD}细胞,进而产生IL一2和IFN-7。FopA蛋白可以协助诱导小鼠产生抗体,但是其本身并不能产生抗原保护作用n刀。用蔗糖密度梯度离心分离蛋白时,土拉菌外膜蛋白主要分布在1.17~1.20g/mL范围内n们。这种方法可以分离到包括TUL4和FopA在内的至少15种外膜蛋白。结合蔗糖密度梯度、双向电泳免疫印迹杂交及质谱分析等技术发现,土拉菌的FopA、TUL4、GroEL,KatG、PilQ、OmpA、ATP合成酶等蛋白都能与小鼠抗血清发生反应,说明这些蛋白具有免疫原性。此外,用病人血清与土拉菌LVS疫苗株进行双向电泳免疫印迹杂交也发现TUL4、60kDa伴侣蛋白GroEL及10kDa伴侣蛋白GroES等蛋白都具有免疫原性n盯。蛋白质芯片及生物信息学技术也已经应用于土拉菌特异性抗原的研究中。利用病人抗血清与点有土拉菌蛋白的生物芯片杂交,发现了至少15种抗原蛋白o∞。生物信息学方法预测这些蛋白大部分与细胞膜或表面相关,进而提示这些蛋白可能具有免疫原性,具有血清学诊断的应用前景。2菌株特性的实验室分析进展2.1生化反应特性对于新分离的菌株,生化反应
裹3部分已经研发成功的单克隆抗体表4多次证据显示具有免疫原性的蛋白特性仍是最基本信息之一(表5)。通过甘油发酵反应可将F.tularensis分为A、B两个亚型o”。A型为甘油发酵阳性,即tularensis亚种;B型为甘油发酵阴性,即holarctica亚种。吲哚、尿素酶、氧化酶、过氧化氢酶、蔗糖、硫化氢产物等指标都曾被用来分析土拉菌的种间差异。’。在这些生化反应中,A型土拉菌与B型土拉菌均为阴性(表5)。novicida亚种的蔗糖反应为阳性,甘油酵解在不同菌株间有一定差异。F.philomiragia的吲哚、氧化酶、蔗糖及硫化氢产物均为阳性。此外,在6%或6.5%氯化钠中的生长状况也可作为描述土拉菌的指标。Tula—rensis亚种在6%或6.5%的氯化钠中不生长,而有些novicida亚种或F.philomiragia可见阳性结果。此外,近来报导的某些弗朗西斯菌属的新种也有其独特的生化特性(表5)o㈣。
表5部分弗朗西斯菌的生化反应特征
十,反应阳性;一,反应阴性;W,反应较弱;V.在不同菌株问有差异;ND,没有检测. 万方数据2009,25(7)中国人兽共患病学报ChineseJournalofZoonoses687
2.2遗传学特征2.2.1基因序列差异分析像其它细菌一样,16SrRNA序列往往是描述土拉菌的遗传学特性的首要选择。根据16SrRNA序列比较可知,土拉菌tula-rensis亚种与mediasiatica亚种最为相近,他们都可能与F.tularensissubsp.novicida有紧密的亲缘关系。’。土拉菌holarctica亚种的基因序列略有变化,而F.philomiragia的变化更大。PPIase基因(Peptidylprolyleis—transisomer—asegene)序列也是被分析的靶基因。对该基因编码区中的213核苷酸的序列分析也可以得到与16SrRNA序列分析相似的结果。土拉菌holarctica亚种与novicida亚种的序列最接近,其次为tularen-sfs亚种,而与F.philomiragia的序列差异最大∞∞。此外,在不同菌株中,该基因编码区下游可能有较大变异。仅tularensis和holarctica两亚种之间就相差三十碱基旺∞。其它已知的基因,如tul4、ISFtu2及iglC基.因,也都是研究者调查的指标。黝。除F.philomi-ragia的有些株之外,大部分弗朗西斯菌属菌株都含有ISFtu2基因。此外,目前发现的A型和B型土拉菌以及novicida亚种都含有tul4及iglC基因,而多数F.philomiragia菌株都不含有这两个基因。在含有tul4的菌株中,其序列在同种之间较保守而在不同种之间也有一定差异。2.2.2基因组差异区段分析近年的研究表明,多位点串联重复序列(VNTR或MLVA)分析对来自世界各地的菌株均有较高的可行性∞们。根据25个位点的信息可将F.tularensissubsp.tularensis分为A.I和A.II两群,将holarctica亚种分为B.I、B.II、B.III、B.IV和B.V五个群。除美国北部的菌株外,斯洛伐克、加拿大的一些菌株属于A.I群。A.II群包括了美国和加拿大的菌株。绝大部分亚洲和欧洲的菌株均属于B型的各群。此外,NVTR分析还发现,在同一次疫情暴发中分离的各菌株具有相同的遗传特征。对美国的tularensis亚种的分析也进一步证实A.I和A.II的存在,A.I与novicida亚种较为接近,而A.II与holarctica亚种较接近姑们。更重要的是,A.I型主要分布在美国东部,A.Il型主要分布在西部.且这种分布规律与两种主要野兔宿主S.floridanus和S.nuttallii有对应关系,进而提示S.floridanus可能是A.I型的重要宿主,而S.nuttal一例则可能是A.II型的重要宿主。此后,Staples等人又用脉冲场电泳(PFGE)对A型土拉菌的病人分离株进行了分析。盯。结合地理及临床资料,他们提出A.II感染对人的威胁要轻于A.I型或holarcti-Ca亚种的感染。最近的研究更进一步发现,A.I和A.II菌株的基因组之间至少存在13处差异区段Ⅲ’。最近的一项分子流行病调查显示,来自黑龙江、吉林、内蒙古的33份阳性标本的Ft—M3基因座共有7种基因型,重复数在七至十五之间旺∞。其中,七次重复的基因型在holarctica亚种中尚属首次发现,而过去这种基因型往往在tularensis亚种中才能检测到。PFGE也可以将弗朗西斯菌区分为多种型别。钉。Xhol酶切可以将弗朗西斯菌分为五种菌型,而利用BamHI可以分为四种型。若用XhoI和BamHI双酶切,则49株分离株可被分为七个群(表6)。其中,大部分holarctica菌株属于III群,主要分离自西班牙和捷克。Tularensis亚种均属于I群,novicida亚种和F.philomiragia分别属于VI群和VII群。分离自美国的菌株分别属于I、Vl、VII群,而分离自俄罗斯的菌株属于V群。扩增片断长度多态性分析(AmplifiedFrag—