乙肝病毒基因分型
- 格式:pdf
- 大小:92.42 KB
- 文档页数:5
乙型肝炎病毒DNA定量、分型检测与血清学检测的相关性分析何玉红【摘要】目的探讨乙型肝炎病毒血清学与DNA定量及基因分型检测间的相关性.方法选取68例乙肝血清学及DNA定量阳性的样本,使用ELISA法对乙肝血清学进行检测,荧光PCR法进行DNA定量及基因分型检测,分析血清学结果与DNA定量及基因分型结果的相关性.结果大三阳与小三阳样本HBV DNA定量结果之间存在显著性差异(P<0.01),而与HBV基因型无统计学差异(P>0.05),HBV DNA定量结果与基因型之间也无统计学差异(P>0.05).HBV基因型在西安地区的分布与其他相关研究报道一致,以B、C型为主,且C型高于B型.结论 HBV血清学结果与HBV DNA载量之间有密切的相关性,但与基因型分布无相关性,HBV DNA载量与基因型之间无相关性.【期刊名称】《延安大学学报(医学科学版)》【年(卷),期】2017(015)003【总页数】3页(P70-72)【关键词】HBV;血清学;HBVDNA;HBV基因分型【作者】何玉红【作者单位】子长县人民医院检验科,陕西子长717300【正文语种】中文【中图分类】R446Abstract:Objective To investigate the correlation between the hepatitis B virus serologic and HBV DNA and genotyping detection.Methods Sixty-eight samples of hepatitis B serology and HBV DNA positive samples were selected.HBV serology was detected by ELISA.DNA quantification and genotyping were performed by fluorescence PCR.The results of serological analysis were correlated with DNA quantification and genotypingsex.Results There were significant differences between the quantitative results of HBsAg and HBeAg(P<0.01),while there was no significant difference between HBV DNA quantification and genotype(P>0.05).The distribution of HBV genotype in Xi'an area was consistent with other related studies,mainly B and C,and C was higher than that of typeB(P>0.05).Conclusion There is a close correlation between HBV serological results and HBV DNA loads,but has no correlation with genotype distribution,no correlation between HBV DNA loads and genotype.Key words:HBV; Serology; HBV DNA; HBV genotyping2016年全国乙型肝炎(HBV)血清流行病学调查表明,我国1~59岁一般人群HBsAg携带率为7.18%[1-2]。
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)是世界上感染人数最多的病毒之一,世界范围内大约有20亿人(占世界人口的1/3)有血清学证据在过去或持续感染HBV。
HBV属嗜肝性病毒,其病毒基因组是3.2kb的部分双链DNA,有4个开放读码框架(S、C、X、P)。
S读码框架可编码3种蛋白。
S基因编码主蛋白,前S2基因与S基因共同编码中蛋白,前S1和S2基因与S基因共同编码大蛋白。
众多研究表明,HBV变异与其血清学标志物表现形式、乙肝过程以及乙肝预防和治疗失败等可能有十分密切的关系。
人体感染HBV后可以表现为无症状乙型肝炎表面抗原携带(ASC1)、慢性乙型肝炎(CHB1)、肝纤维化(LC)、肝细胞癌(HCC)等各种不同的疾病谱。
根据HBV全基因序列异质性大于或等于8%,现已明确HBV分为A-H8个基因型[1]。
本文应用PCR-反向点杂交(poly-merase chain reaction-reverse dot blot,PCR-RDB)技术对住院和门诊患者进行了病毒基因分型,旨在了解凉山州HBV基因型的分布情况,并探讨在临床的应用价值。
1资料与方法1.1一般资料收集2009年3~7月门诊和住院乙型肝炎患者共44例,病毒载量大于或等于1.00×105IU/ml,男23例,女21例,年龄6~65岁,平均32.05岁;诊断符合2000年《病毒性肝炎防治方案》[2]。
另选6例健康人做对照。
1.2仪器美国应用生物技术公司生产的ABI7500fast RT荧光定量PCR仪,FYY-3型分子杂交仪,低温高速离心机SORVALL誖Riofuge PrimoR,河北白洋离心机B160A,日本SANYO MDF-382E 冰箱,漩涡混合器XH-B型,超净工作台。
1.3试剂HBV基因分型检测试剂盒(PCR-RDB)由中山大学达安基因股份有限公司提供。
1.4引物及探针设计选取HBV基因组中前S1基因的编码区为扩增靶区域,设计特异性引物及各型特异性探针,利用PCR及RDB技术,检测HBV3种(B、C、D)基因型DNA。
hbv的核酸类型为双链环状DNA。
乙型肝炎病毒:乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)是引起乙型肝炎(简称乙肝)的病原体,属嗜肝DNA病毒科,该科病毒包含正嗜肝DNA 病毒属和禽嗜肝DNA病毒属两个属,引起人体感染的是正嗜肝DNA 病毒属。
HBV感染是全球性的公共卫生问题,随着基因工程疫苗的生产和投入,乙肝疫苗的普及率逐年上升,感染率呈下降趋势。
1.形态和结构乙肝病毒在电子显微镜下可呈3种形态的颗粒结构:直径约42nm的大球形颗粒、直径约22nm的小球形颗粒以及管型颗粒。
大球形颗粒(Dane颗粒)为完整的病毒颗粒,由包膜和核衣壳组成,包膜含HBsAg、糖蛋白和细胞脂肪,核心颗粒内含核心蛋白(HBcAg)、环状双股HBV-DNA和HBV-DNA多聚酶,是病毒的完整形态,有感染性。
小球形颗粒以及管型颗粒均由与病毒包膜相同的脂蛋白组成,前者主要由HBsAg形成中空颗粒,不含DNA和DNA 多聚酶,不具传染性;后者是小球形颗粒串联聚合而成,成分与小球形颗粒相同。
2.病毒生活周期HBV通过低亲和力受体(如硫酸乙酰肝素、蛋白多糖等),黏附到肝细胞表面,再通过大包膜蛋白的preS1区与病毒受体结合介导细胞对病毒的内吞作用。
钠离子-牛磺胆酸供转运多肽(NTCP)是介导HBV进入细胞和建立感染的重要受体,在内吞体病毒包膜和吞体膜融合将衣壳释放入细胞质,衣壳被运送至核孔复合体内部的病毒基因组rcDNA释放入细胞核。
在细胞核内,rcDNA可能通过细胞的DNA复制机制转化成共价闭合环状DNA(cccDNA)。
cccDNA有高度的稳定性,在细胞核内可以维持数月至数年,这是抗病毒治疗结束后病毒反弹的根本原因,因此清除cccDNA对根治乙型肝炎具有决定性意义。
病毒利用cccDNA转录出3.5kb,2.4kb,2.1kb及约0.8kb的mRNA,其中3.5kb为前基因组RNA(pgRNA),可反转录出基因组DNA并作为编码病毒核心蛋白和聚合酶蛋白的模板,HBsAg合成后在粗面内质网中多聚化,并转运至高尔基体前腔以包装核心颗粒,装配好的HBV颗粒与亚病毒颗粒转运至高尔基体进行HBsAg的糖基化修饰,最后以出芽方式将完整的病毒粒子分泌出宿主细胞而完成生活周期。
乙肝病毒基因分型
近年来,随着分子生物学技术的迅猛发民和对HBV认识的不断深入,国内外
许多学者对HBV基因分型及其临床的相关性开展了大量的研究.HBV基因
分型比血清亚型更能反映原型病毒株之间的自然异质性.HBV基因分型方
法有多种,以全基因测序为HBV基因分型的金标准,基于全基因核甘酸序列
比较,HBV可分为A、B、C、D、E、F、G、H8个基因型。HBV基因型呈
地理区域性分布,且不则基因型致病性不同,HBV基因型与乙型肝炎病情
的进展,临床表现、治疗、预后有密切的关系。
近年来HBV基因分布的研究成为国内外学者关注的研究热点。研究发现,
HBV基因的分布具有一定的地域性,A型主要分布在西欧、北欧、北美洲
及非洲地区,B型和C型是亚洲和大洋洲的特征性基因型,B型主要见
于中国、日本、印度尼西亚、越南和巴西,D型分布最为广泛,主要分布
在中东、北非和南欧,也是地中海地区HBV的主要基因型,还发现于亚
洲少数地区;E型主要分布于非洲撒哈拉沙漠地带;F型主要分布于美国、
南美洲和土著居民;G型在法国、美国、德国、英国和意大利被发现;H
型已在尼加拉瓜、墨西哥及美国加利氟尼亚地区被发现。
大量研究表明,我国HBV基因型南方以B型为主,北方以C型为主,D
型仅见于西部及少数民簇地区,A,F型偶有发现,还未发现其它性别。
也有学者研究表明D基因型在我国宁夏地区,广东地区和香港地区约占感
染者15%,因而HBV基因型在我国的确切分布状况仍不十分清楚。
HBV基因型的临床意义
(1)HBV基因型与病毒复制及变异的关系
HBV基因型与病毒复制水平及病毒标志物的表达有一定的相关性。
Watanabe等研究报道,基因C型的HBeAg阳性率高于B型和A型,而
B型HBeAg阴性率高于C型,同时B型血清HBeAg清除率较C型显著
常见且较早发现;基因C型血清HBVDNA水平显著高于B型;A型的HBV
DNA自然清除率高于D型和F型,同时A型的HBsAg自然清除率也比
D型高;以上均提示C型HBV复制较活跃,易形成持续病毒血症,不易
发生e系统血清转换发生快,免疫清除HBV较C型早。
(2)HBV基因型临床疾病谱及疾病预后的关系
HVB感染不仅可以引起急.慢性病毒性肝炎,而且还与肝硬化(LC)和干
细胞癌(HCC)的发生,发展有密切关系。HBV感染的临床转归一方面决定
于患者的年龄和免疫能力,另一方面也与感染病毒株的基因型种类密切相
关。近年研究发现HBV基因型是影响慢性乙型肝炎的临床转归的主要决
定因素之一。
人类感染HBV基因型的不同类型,与感染后的临床疾病谱及疾病预后有
一定的相关性,提示不同的基因型有致病性差异。在B,C为优势地区,C
型具有较
强的疾病能力,预后差;在以A,D为优势的地区,
D型具有较强的致病性,肝病严重,预后不良;基因型C在乙肝后肝硬化
的发病中起一定的作用,然而基因型B与年轻无肝硬化患者肝癌的发生有
关。Mayerat和Akuta等报道HBV急性感染后,A型易成为慢性持续感
染,而D型在急性肝炎中常见。Kao等报道我国台湾地区以B,C型为优势
株,50岁以上HCC和LC患者中以C型为优势基因型,而50岁以下以
B型为主,提示C型与严重肝病有关,而B型似乎与年轻人肝癌有关。Chan
等报道C型患者炎症坏死指数分值高于B型。Sakugawa等报道日本冲绳
地区以B型为优势基因型,而该地区是乙型肝炎高发区,但因肝病死亡的
比例却最低,提示B型预后良好。Thakur等报道印度以A,D两型为主,
D型与严重肝病及年轻人肝癌有关。Sanchez-Tapias等报道基因型F引
起肝病的死亡率要比基因型A或D高。Yotsuyanagi等则报道急性乙肝
中以基因型A最常见,A型较C型有较低的最高ALT水平,且较C型有
较长及较轻的临床经过。
(3)HBV基因型与抗病毒疗效之间有关系
抗病毒治疗的疗效即可能与感染者自身的免疫状况有关,也可能与病毒的
基因特性有关。目前,干扰素是公认的治疗HBV感染的首选药之一,干
扰素抗病毒作用是通过激活基因,编码产生一系列抗病毒蛋白来完成,大
量研究以发现,干扰素抗病毒疗效与HBV基因型有一定的相关性,基因C
和D对干扰素的治疗反应比基因型A和B要差。Erhardt等对165例慢
性乙肝患者的研究发现,不论是HBeAg阳性或是阴性者,干扰素治疗后
的持久应答A基因型比D型好。Kao等对58例患者用于扰素-a2b治疗
24周并随访24周后ALT复常率B,C基因型分别为50%和17%,完全
应答率则分别为41%和15%。Flink等对266例HBeAg阳性患者研究
发现,干扰素治疗对基因A型可产生较好的HBeAg清除率。Wai等应用
干扰素-a治疗HBeAg阳性慢性乙肝患者,结果表明B基因型的应答率高
于C型。通过多变量分析基因型,治疗前ALT水平和HBVDNA水平与
干扰素应答之间的关系,发现B基因型,治疗前低HBVDNA水平和高
ALT水平与干扰素高应答率有关,因而,他们认为,与C基因型相比,B
型有较高的干扰素诱导的HBeAg清除率。
核苷类似物具有较高的抑制HBV复制的作用,拉米夫定抑制HBVDNA
聚合酶,从而有效抑制HBV的复制。阿德福韦酯口服后最终在细胞内转
化为阿德福韦双磷酸酯,后者可选择性抑制HBVDNA聚合酶。研究发明,
对拉米夫定治疗的疗效及停药后治疗效的持久性基因B型明显较C型好,
而对拉米夫定耐药性的发生率基因型A高与D。Kao等31例HBeAg血
清转化率分别率为23%和11%,耐药发生率分别为15%和22%,提示B
型对拉米夫定的病毒应答
率高于C型。Suzuki等对日本234例用拉米夫
定治疗学应答率高于C型。目前众多临床研究发现,长时期使用拉米夫定
可引起HBV耐药或病毒变异,常见的变异为YMDD变异(包括YIDD和
YVDD变异).Zollner等研究发现,出现YIDD变异者,D型中有67%,
A型中有19%,而出现YVDD变异者,A型中有81%,D型中有33%,
提示不同的基因型可能对YMDD变异产生不同的影响。但是,Yuen等对
中国慢性乙肝患者的研究发现,HBV基因型B和C对抗病毒治疗的反应
及YMDD变异的发生率均无差别。目前,Westland等,Westland等研
究表明,阿德福韦酯抗病毒治效与HBV基因型,HBeAg及种族均没有明
显相关性。
总之,HBV基因型与病毒复制与清除,病毒变异,临床表现,治疗应答和
预后均有一定的关系,提示不同基因型具有不同的致病性。基因分型的研
究为乙肝病毒变异的研究,发病机制的探讨,病情评估,治疗药物的选择和
预后判定以及分子流行病学研究提供了有力工具