NCBI(美国国立生物技术信息中心)资源介绍及使用手册
作者：未知 来源：中科院上海生命科学研究院生物信息中心 时间：2006-12-27
NCBI 资源介绍
本文目录：
NCBI(美国国立生物技术信息中心) 简介
NCBI 站点地图
NCBI癌症基因组研究
NCBI－Coffee Break
NCBI－基因和疾病
NCBI－UniGene
Cluster of Orthologous Groups of proteins（COG）介绍
Gene Expression Omnibus （GEO）介绍
LocusLink介绍
关于RefSeq：NCBI参考序列
NCBI(美国国立生物技术信息中心)简介
介绍
理解自然无声但精妙的关于生命细胞的语言是现代分子生物学的要求。通过只有四个字母来代表DNA化学亚基的字母表，出现了生命过程的语法，其最复杂形式就是人类。阐明和使用这些字母来组成新的“单词和短语”是分子生物学领域的中心焦点。数目巨大的分子数据和这些数据的隐秘而精细的模式使得计算机化的数据库和分析方法成为绝对的必须。挑战在于发现新的手段去处理这些数据的容量和复杂性，并且为研究人员提供更好的便利来获得分析和计算的工具，以便推动对我们遗传之物和其在健康和疾病中角色的理解。
国立中心的建立
后来的参议员Claude Pepper意识到信息计算机化过程方法对指导生物医学研究的重要性，发起了在1988年11月4日建立国立生物技术信息中心（NCBI）的立法。NCBI是在NIH的国立医学图书馆（NLM）的一个分支。NLM是因为它在创立和维护生物信息学数据库方面的经验被选择的，而且这可以建立一个内部的关于计算分子生物学的研究计划。NCBI的任务是发展新的信息学技术来帮助对那些控制健康和疾病的基本分子和遗传过程的理解。它的使命包括四项任务：
建立关于分子生物学，生物化学，和遗传学知识的存储和分析的自动系统
一步一步教你使用 NCBI 查找DNA
一步一步教你使用 NCBI 查找DNA、mRNA、cDNA、Protein、promoter、引物设计、BLAST
序列比对等
最近看到很多战友在论坛上询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用 BLAST 进行序列比对„„，这些问题在 NCBI 上都可以方便的找到答案。现在我就结合我自 己使用 NCBI的一些经历(经验)跟大家交流一下 BCBI 的使用。希望大家都能发表自己的使
用心得，让我们共同进步～
我分以下几个部分说一下 NCBI 的使用:
Part one 如何查找基因序列、mRNA、Promoter
Part two 如何查找连续的 mRNA、cDNA、蛋白序列
Part three 运用 STS 查找已经公布的引物序列
Part four 如何运用 BLAST 进行序列比对、检验引物特异性
特别感谢本版版主，将这个帖子置顶～
从发帖到现在，很多战友对该帖给与了积极的关注，在此向给我投票的(以及想给我 投票却暂时不能投票的)各位战友表示真诚的感谢，谢谢各位战友～
请大家对以下我发表的内容提出自己的意见。关于NCBI 其他方面的使用也请水平较高 的战友给予补充
First of all，还是让我们从查找基因序列开始。
第一部分 利用Map viewer 查找基因序列、mRNA 序列、
启动子(Promoter)
下面以人的 IL6(白细胞介素 6)为例讲述一下具体的操作步骤 1( 打开Map viewer 页面， 网址为: 在 search 的下拉菜单里选择物种，for
后面填写你的目的基因。操作完毕如图所示:
2(点击“GO”出现如下页面:
3( 在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框， 在Gene
前面的小方框里打勾，然后点击Filter. 出现下图:
说明一下:1、染色体的红色区域即为你的目的基因所处位置。2、下面参考序列给出了 三个，是不同的部门做出来的，经我验证，序列有微小的差异，但总体来说基本相同。尽管 你分别点击后，序列代码、序列代码等有所差异，但碱基基本一致，不影响大家研究分析序 列。现在普遍采用的是最上面的那个序列，这一条是世界范围的生物科学家用计算机合成的 一个序列。我也推荐大家使用这个序列。
一步一步教你使用 NCBI 查找DNA、mRNA、cDNA、...
最近看到很多战友在论坛上询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用
BLAST 进行序列比对……，这些问题在 NCBI 上都可以方便的找到答案。现在我就结合我自
己使用 NCBI的一些经历（经验）跟大家交流一下 BCBI 的使用。希望大家都能发表自己的使
用心得，让我们共同进步！
我分以下几个部分说一下 NCBI 的使用：
Part one 如何查找基因序列、mRNA、Promoter
Part two 如何查找连续的 mRNA、cDNA、蛋白序列
Part three 运用 STS 查找已经公布的引物序列
Part four 如何运用 BLAST 进行序列比对、检验引物特异性
特别感谢本版版主，将这个帖子置顶！
从发帖到现在，很多战友对该帖给与了积极的关注，在此向给我投票的（以及想给我
投票却暂时不能投票的）各位战友表示真诚的感谢，谢谢各位战友！ 请大家对以下我发表的容提出自己的意见。关于NCBI 其他方面的使用也请水平较高
的战友给予补充
First of all，还是让我们从查找基因序列开始。
第一部分 利用Map viewer 查找基因序列、mRNA
序列、
启动子（Promoter）
下面以人的 IL6（白细胞介素 6）为例讲述一下具体的操作步骤
1． 打开Map viewer 页面， 网址为： /mapview/index.html
在 search 的下拉菜单里选择物种，for 后面填写你的目的基因。操作完毕如图所示：
2．点击“GO”出现如下页面：
3． 在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框， 在Gene
前面的小方框里打勾，然后点击Filter. 出现下图：
说明一下：1、染色体的红色区域即为你的目的基因所处位置。2、下面参考序列给出了
一步一步教你使用 NCBI 查找DNA、mRNA、cDNA、...
最近看到很多战友在论坛上询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用
BLAST 进行序列比对„„，这些问题在 NCBI 上都可以方便的找到答案。现在我就结合我自
己使用 NCBI的一些经历（经验）跟大家交流一下 BCBI 的使用。希望大家都能发表自己的使
用心得，让我们共同进步！
我分以下几个部分说一下 NCBI 的使用：
Part one 如何查找基因序列、mRNA、Promoter
Part two 如何查找连续的 mRNA、cDNA、蛋白序列
Part three 运用 STS 查找已经公布的引物序列
Part four 如何运用 BLAST 进行序列比对、检验引物特异性
特别感谢本版版主，将这个帖子置顶！
从发帖到现在，很多战友对该帖给与了积极的关注，在此向给我投票的（以及想给我
投票却暂时不能投票的）各位战友表示真诚的感谢，谢谢各位战友！
请大家对以下我发表的内容提出自己的意见。关于NCBI 其他方面的使用也请水平较高
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First of all，还是让我们从查找基因序列开始。
第一部分 利用Map viewer 查找基因序列、mRNA 序列、
启动子（Promoter）
下面以人的 IL6（白细胞介素 6）为例讲述一下具体的操作步骤
1． 打开Map viewer 页面， 网址为：
/mapview/index.html
在 search 的下拉菜单里选择物种，for 后面填写你的目的基因。操作完毕如图所示：
2．点击“GO”出现如下页面：
3． 在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框， 在Gene
前面的小方框里打勾，然后点击Filter. 出现下图：
说明一下：1、染色体的红色区域即为你的目的基因所处位置。2、下面参考序列给出了
