重组克隆的筛选与鉴定
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蓝白斑筛选:蓝白斑筛选是一种基因工程常用的重组菌筛选方法。
野生型大肠杆菌产生的β-半乳糖苷酶可以将无色化合物X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷切割成半乳糖和深蓝色的物质5-溴-4-靛蓝。
有色物质可以使整个培养菌落产生颜色变化,而颜色变化是鉴定和筛选的最直观有效的方法。
设计适用于蓝白斑筛选的基因工程菌为β-半乳糖苷酶缺陷型菌株。
阳性克隆含有重组DNA分子的克隆子被称为重组子,如果重组子中含有外源目的基因则又称为阳性克隆子或期望重组子。
TA载体TA载体是基因工程中用于转导目的基因的一种载体。
TA载体用于TA 克隆,有以下几个特点:(1)快速克隆基因。
仅需5 分钟反应的时间;(2)便于筛选重组子,高克隆效率。
提供氨苄青霉素和卡那霉素两种筛选标记。
当某个基因来源于含有氨苄青霉素基因质粒时,可以选择卡那霉素筛选标记;当某个基因来源于含有卡那霉素质粒时,可以选择氨苄青霉素筛选标记,降低了克隆背景,对照插入片段克隆效率达95%以上。
(3)容易判断载体中有无外源基因的插入。
包含lacZ 基因,在含有IPTG,X-gal 的平板培养基上,进行蓝白斑筛选,很容易判断载体中有无外源基因的插入。
常见问题分析(1)克隆效率低影响克隆效率有许多因素,如扩增目的基因所用引物,基因的结构,插入片段和载体的比例等。
如发现克隆效率低,尝试用下列方法提高克隆效率。
a. 纯化PCR 产物。
b. 如插入片段的浓度太低,增加插入片段的量(1~4 µl)。
c. 延长反应时间。
d. 重新设计引物,5′端包含“G”,以增加PCR 产物3′末端“A”的效率。
(2)PCR 鉴定重组子失败用PCR 方法鉴定重组子,没有得到目的扩增产物,又没有载体自连,说明PCR反应失败。
重新优化PCR 反应条件或提取质粒,以质粒作模板扩增或酶切鉴定包含重组子的克隆。
(3)重组克隆呈现淡蓝色.这是由于插入片段没有影响lacZ 基因读码框,这种情况下菌落呈现淡蓝色。
重组DNA转化及筛选实验报告引言DNA重组技术是现代生物学研究中不可或缺的工具之一,它可以将外源基因片段插入到宿主细胞的染色体中,从而实现特定基因的表达。
DNA转化是重组技术的关键步骤之一,通过电刺激或化学方法将外源DNA引入宿主细胞中。
本实验旨在通过DNA转化及筛选,构建宿主细胞中的重组DNA,并对成功转化的细胞进行筛选。
实验材料和方法材料:1. E. coli DH5α细胞2.外源质粒DNA3.LB琼脂培养基4.青霉素/链霉素抗生素5.离心管6.PCR仪7.恒温摇床方法:1.准备转化液:将50 mL LB琼脂培养基加入含有适量抗生素的离心管中,混匀。
2.取出青霉素/链霉素抗生素的冻存液,解冻后加入LB培养基中,使其浓度为最佳浓度。
3.取出冻存的E. coli DH5α细胞,放在冰上解冻。
4.加入转化液中的合适量DNA,比例为1:10(DNA:转化液)。
5.放入37℃恒温培养箱中孵育30分钟。
6.取出孵育后的细胞转化液,通过离心将细胞沉淀。
7.倒掉上清液,用适量的无菌去离子水悬浮细胞。
8.取一小部分悬浮液涂抹在含有抗生素的琼脂平板上。
9.将琼脂平板放置在37℃恒温培养箱中培养过夜。
10.检查平板上是否有菌落生长,记录结果。
11.选取生长菌落较大、菌落形态规则的菌落进行进一步筛选。
12.取一小部分菌落涂抹在新的琼脂平板上进行单克隆分离。
13.重复步骤12,直至获得纯合阳性克隆菌落。
14.提取纯合阳性菌落中的质粒DNA,进行PCR验证。
结果与讨论经过上述实验操作,我们成功地进行了重组DNA的转化和筛选。
在配制转化液时,选择适量的抗生素浓度非常重要,它可以帮助筛选出成功转化的细胞。
通过在琼脂平板上培养过夜后,我们可以观察到菌落的生长情况。
有菌落生长的平板可以说明转化成功,而没有菌落生长的平板则说明转化失败。
选取生长较大、形态规则的菌落进行进一步筛选是为了确保筛选出的细胞是单克隆的。
通过单克隆分离,我们获得了纯合阳性克隆菌落。