国际肝干细胞研究文献可视化分析
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三维可视化技术在肝外科临床教学中的应用分析
王若愚;章琎;吴东;李恒宇;周伟平
【期刊名称】《中国临床实用医学》
【年(卷),期】2018(009)003
【摘要】在我国有庞大的肝外科患者群体,肝外科专科人才培养对提升我国人民的健康水平有重要的社会意义.肝外科临床教学重在使专科学员掌握理论知识,提高临床能力.传统的教学方法存在诸多弊端,三维可视化技术应用于肝外科临床教学,能够给学员提供虚拟的肝三维模型,还能进行模拟手术训练.将三维可视化技术引入肝外科临床教学,可改进教学模式,提高教学质量,促进肝外科临床教学水平的提高.
【总页数】3页(P75-77)
【作者】王若愚;章琎;吴东;李恒宇;周伟平
【作者单位】200438 上海,海军军医大学第三附属医院肝外一科;200438 上海,海军军医大学第三附属医院肝外一科;200438 上海,海军军医大学第三附属医院肝外一科;海军军医大学第一附属医院普通外科四科;200438 上海,海军军医大学第三附属医院肝外三科
【正文语种】中文
【相关文献】
1.三维可视化及虚拟手术在肝脏外科临床教学中的应用价值
2.影像三维可视化在功能神经外科临床教学中的应用
3.数字虚拟技术在肝胆外科临床教学中的应用分析
4.功能神经外科临床教学中影像三维可视化的应用
5.微课联合三维可视化技术在骨肿瘤外科临床实习教学中的应用
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基于文献计量学的中医药研究可视化知识图谱分析符瀚文;程成娇;陈如欣;熊玲珠【期刊名称】《江西科学》【年(卷),期】2024(42)3【摘要】目的:通过系统总结和分析Web of Science核心集数据库2016—2023年所刊文的内容特征与热点,以期为中医药的发展提供参考。
方法:运用CiteSpace等文献计量工具,从刊文量、研究机构、刊文国家、主要关键词、刊文共被引情况等,进行多维视角的可视化分析。
结果:年刊文数量呈上升趋势;中医药高校为中医药领域核心研究力量;中国为推动中医药研究绝对核心国家;领域内研究热点包括表达式、细胞凋亡等;细胞凋亡等关键词具有较高的中心度,为中医药领域研究的重要内容;随机对照试验、抑郁症及胰岛素抵抗等将成为未来几年研究趋势。
结论:中药成分、作用机制和治病机理等是领域内关注的核心内容;中医药领域正在从“重技术”到“重对象”发生转变。
【总页数】8页(P618-625)【作者】符瀚文;程成娇;陈如欣;熊玲珠【作者单位】江西中医药大学针灸推拿学院;江西中医药大学附属医院;海南现代妇女儿童医院;江西中医药大学计算机学院【正文语种】中文【中图分类】R2-5【相关文献】1.基于文献计量学对血源性职业暴露研究文献知识图谱的可视化分析2.基于文献计量学的子宫肌瘤中医药研究的知识图谱可视化分析3.国外智慧农业研究热点和发展趋势分析——基于Web of Science数据库文献计量学和知识图谱的可视化分析4.结直肠癌领域的中医药研究现状、热点演化与整合展望——基于文献计量学的可视化图谱分析5.基于文献计量学的肝性脑病中医药研究的知识图谱可视化分析因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
肝脏细胞在体外培养技术的研究肝脏是人体最重要的器官之一,其主要功能是解毒、代谢、贮藏和合成。
然而,肝脏疾病在世界范围内仍然是一个重要的公共卫生问题。
在过去几十年中,肝脏细胞在体外培养技术的研究逐渐成为了一项重要的生物医学研究领域。
这项技术是指从人体肝脏中分离出来的肝细胞,通过外界提供的营养条件,使其在体外继续生长和分化。
这项技术不仅有助于深入了解肝脏生理学和疾病发生机制,还可以用于药物筛选、毒理学研究和肝移植等领域。
然而,肝脏细胞在体外培养的难度很大,一方面是因为肝脏细胞在体外容易失去其功能和特性,另一方面则是由于肝脏细胞的可塑性非常弱。
因此,如何在体外培养肝脏细胞,并保持其结构和功能的完整性成为了研究的重点。
从组织学角度来看,肝脏的结构非常复杂。
肝脏由肝小叶组成,每个肝小叶包含数百万个肝细胞、肝窦和肝管。
肝细胞没有直接连接,而是通过肝窦相连。
这样的结构能够使肝细胞与血液接触,从而能够达到解毒和代谢的作用。
因此,要在体外培养肝脏细胞就需要考虑如何模拟肝脏这种结构。
在研究中,肝细胞常用的培养基是DMEM/F12(1:1),其中DMEM包含了必需的氨基酸、糖类和维生素,而F12则富含微量元素。
为了模拟肝脏的组织结构,可以使用3D培养体系,如细胞聚集体、生物支架和生物芯片等。
这些3D培养体系可以更好地模拟肝小叶和肝窦之间的关系,从而提高肝细胞在体外培养中的生存率和功能表现。
其中,生物支架是一种被广泛使用的3D培养体系,它可以提供一种类似于肝窦的微环境,并通过支架对肝细胞进行定位和定向生长。
生物芯片则是一种新型的3D培养系统,基于微流体和微加工技术,能够在非压力、低剪力的微环境下培养肝细胞。
使用这种技术,可以更精确地调控细胞生长的微环境,从而获得更稳定的结果。
除了3D培养体系之外,肝细胞在体外培养中的质量管理也非常重要。
在这方面,正常的肝细胞生态系统、细胞密度、超生和梯度离心等操作都会对细胞的品质产生重要影响。
肝脏可视化与功能分析技术研究近年来,随着医学技术的进步,肝脏可视化技术和功能分析技术的研究已经取得了许多重要进展。
这些技术对于临床诊断和治疗具有举足轻重的地位,可以为医生提供更为准确的图像和数据,从而更好地帮助患者进行治疗。
本文将从肝脏可视化技术和肝脏功能分析技术两个方面进行探讨。
一、肝脏可视化技术肝脏可视化技术是指通过一系列的影像学手段对肝脏进行成像和观察。
常见的肝脏可视化技术包括X线透视、CT、MRI、超声等。
这些技术各有其优缺点,医生需要根据具体情况选择合适的成像技术。
其中,CT技术可以提供更多的细节和更好的空间分辨率,因此被广泛应用于肝脏可视化。
CT技术通过将肝脏在几mm厚度内切成多个薄层,再进行扫描,可以获得高分辨率的3D图像。
这种成像技术可以帮助医生准确诊断肝脏的病变并制定治疗方案。
而MRI成像技术则更适合于对肝脏的软组织进行成像。
MRI技术可以提供更为清晰的图像,并且具有不使用放射性物质的优点,因此适用于对小儿和孕妇等特殊人群进行检查。
此外,MRI通过对不同类型的磁共振信号进行分析,可以挖掘出更多肝脏病变的信息。
二、肝脏功能分析技术肝脏功能分析技术是指通过对肝脏功能进行分析,帮助医生更准确地了解肝脏的病变和功能异常。
肝脏功能分析技术包括肝脏血流动力学分析、肝功能评估、肝脏弹性成像等。
肝脏弹性成像是一种新兴的技术,通过对肝脏组织的弹性性进行测量,可以帮助医生准确评估肝脏纤维化和硬化的程度。
该技术可以通过超声、MRI等成像技术进行,而且操作简便、不侵入性,已经得到了广泛的应用。
此外,肝脏血流动力学分析可以通过对肝脏血流速度的测量,评估肝脏的血液供应量和血流状态。
这种技术对于一些肝脏疾病的诊断和治疗非常有帮助。
例如,在肝硬化患者中,肝脏会出现血管扩张的现象,这种现象可以通过肝脏血流动力学分析进行诊断和治疗。
总结肝脏可视化技术和肝脏功能分析技术是现代医学中一项非常重要的技术,对临床医学的发展和患者的治疗有着重要的意义。
Cell单细胞技术揭示人肝细胞图谱目前对肝脏细胞层面的研究较少,今天我们来看一篇单细胞分析肝脏的文章,原文题目为:A human liver cell atlas reveals heterogeneity and epithelial progenitors该团队对来自9个正常人体的肝组织的10000+个细胞进行单细胞分析,描绘了一个详尽的肝细胞图谱(GSE124395),确认了内皮细胞、Kupffer细胞和肝细胞新的亚型。
其进一步使用研究的图谱来阐明发生在肝癌细胞和移植到小鼠肝脏的人肝细胞和肝内皮细胞中的表型变化。
该人类肝细胞图谱提供了一个强大的资源,使我们能够在正常和病变的肝脏中发现以前未知的细胞类型。
方法:1.收集了9例实施肝切除的病人标本,其本身无基础肝脏疾病。
2.组织分离和单细胞悬浮液的制备3.单细胞RNA扩增及文库制备其使用了mCEL-Seq2技术4.转录丰度的量化基于ENCODE V245.单细胞分析质控阈值为>1000 UMIs有10372个人正常细胞、1052个类器官细胞、1282个肝癌细胞和311个移植后小鼠细胞使用RaceID3(FateID包)进行后续分析;并标准化6.扩散伪时间分析和自组织映射使用destiny包7.对比小鼠使用GSE84498的数据来分析了人和小鼠肝区进化保护情况8.EPCAM+的谱系分析使用RaceID3包提取并重分析几个EPCAM+亚群,参数为mintotal = 1000 and minexpr = 2,minnumber = 10 outminc = 2。
9.差异表达分析使用RaceID包的diffexpnb函数10.通路富集分析和GSEA使用clusterProfiler包和ReactomePA包11.使用the Human Protein Atlas验证蛋白表达下面看一下部分结果1.人体肝脏的单细胞分析基于marker基因的表达,该图谱包含了几乎所有的肝细胞类型:肝细胞、EPCAM+胆管细胞(胆管细胞)、CLEC4G+肝窦内皮细胞(LSECs)、CD34+PECAMhigh大血管内皮细胞(MaVECs)、肝星状细胞和肌成纤维细胞、库普弗细胞和免疫细胞。
基于Web of Science的肝硬化护理研究文献分析过丽珍;田君;卢根娣【摘要】目的采用文献挖掘与信息可视化方法,通过分析1986至2017年全球肝硬化护理研究文献,梳理肝硬化护理研究现状、热点及趋势,为我国临床肝硬化护理提供借鉴.方法将Web of ScienceTM(WoS)核心合集数据库检索到的文献,采用CiteSpace软件,对检索到的文献进行信息分析,从而对肝硬化护理研究文献进行研究.结果 1986至2017年间共33个国家或地区的684位研究者,在42门学科的96种期刊上面发表了共156篇肝硬化护理研究文献,“疾病管理”、“危险因素”和“生活质量”是肝硬化护理研究的热点.其中,美国的研究实力遥遥领先,亚洲在肝硬化护理研究领域亦占有一席之地.其次,跨地域、跨专业的研究明显不足,研究多以同一国家、地区或机构的内部合作为主.《Gastroenterology Nursing》是肝硬化护理研究发文的主要期刊.结论肝硬化护理研究受到越来越多的关注.我国肝硬化护理研究实力尚处在萌芽阶段,需要政府或研究机构加大扶持力度,探索与国际接轨且适合我国国情的肝硬化护理模式,并促进研究成果的国际认可.【期刊名称】《浙江医学》【年(卷),期】2018(040)005【总页数】4页(P516-519)【关键词】肝硬化;护理;文献计量分析【作者】过丽珍;田君;卢根娣【作者单位】201203 上海中医药大学附属曙光医院5AICU;201203 上海中医药大学附属曙光医院5AICU;201203 上海中医药大学附属曙光医院护理部【正文语种】中文肝硬化是一种常见的慢性、进行性、弥漫性肝病,是肝脏疾病的终末期病变[1]。
据2010年数据统计显示,全球死于肝硬化的人数超过了100万[2]。
肝硬化累及多个系统,可出现消化道出血、肝性脑病、感染、腹水等临床症状,成为严重威胁国民生命,影响国民生活质量,增加国民经济负担的疾病。
世界中西医结合杂志2022年第17卷第2期 WorldJournalofIntegratedTraditionalandWesternMedicine 2022,Vol 17,No 2·文献研究·DOI:10.13935/j.cnki.sjzx.220205基金项目:北京市自然科学基金青年项目(7204332)作者单位:1.中国中医科学院望京医院肿瘤科,北京100102;2.北京中医药大学研究生院,北京100029通信作者:高业博,Email:booperfect@163.com近10年中医药治疗肝癌研究的知识图谱分析肖琨珉1,2 朱世杰1,2 李可歆2 薛鹏1 高业博1【摘要】 目的 全面分析近10年中医药治疗肝癌的科学成果,了解其新兴的研究趋势,为其未来的研究提供参考。
方法 使用中国知识基础设施工程(CNKI)数据库检索2010年1月1日—2020年12月31日期间中医药治疗肝癌的相关文献;使用Excel2019和Cytoscape管理数据并进行可视化分析。
结果 共有2751篇相关文献被纳入研究,近十年来中医药治疗肝癌研究出版物数量已经具备了较大的规模,虽然有波动,但是总体是呈增长趋势。
上海中医药大学基础医学院是发文量最多的机构,但是不同研究团队之间合作较少。
吴孝雄是近年来是中医药治疗肝癌研究领域最活跃且非常有潜力的作者,发文量最多并且爆发力最强。
至今处于前沿的研究方向包括中医外敷防治肝癌疾病、中医药联合射波刀中西医结合治疗肝癌、肝癌证候以及肝癌中医量表的规范化研究、中药复方或者中药单体治疗肝癌的机制探索研究、中药复方以及中药单体质量控制评价研究。
临床研究依然是未来的研究热点,与人工智能和数据挖掘相结合的多学科交叉融合研究将成为中医药治疗肝癌领域的新兴趋势。
结论 文章通过文献计量分析与可视化分析,初步展示了近十年中医药治疗肝癌的研究现状和研究热点,为该领域今后的发展提供借鉴与参考。
运动调控肌肉、肝脏、脂肪的运动因子的文献计量学分析唐韶慨;耿元文;林琴琴;李若明;王柏慧;余一荣;李浩【期刊名称】《首都体育学院学报》【年(卷),期】2022(34)5【摘要】目的:对国内外关于运动调控肌肉、肝脏、脂肪的运动因子的相关研究进行可视化分析,探讨此领域的研究热点及前沿。
方法:以“Web of Science”和“CNKI”数据库中2004—2020年收录的关于运动调控肌肉、肝脏、脂肪的运动因子的相关研究文献为数据来源,借助“CNKI”可视化分析功能及“Cite Space V”软件绘制知识图谱。
结果:1)国内相关研究共纳入166篇文献,总体呈缓慢上升趋势,研究热点主要为有氧运动调控脂肪运动因子改善胰岛素抵抗,不同运动方式及运动负荷对肌肉、肝脏、脂肪的运动因子表达影响,肌肉、肝脏、脂肪的运动因子对代谢性疾病的调控作用。
2)国外相关研究共纳入632篇文献,尚处于初始发展阶段。
美国以156篇发文量位居首位,国家(地区)间合作关系较为单一。
Frontiers in Physiology是刊载文献(19篇)最多的期刊,高产作者与团队集中在巴西圣保罗联邦大学。
研究前沿关键词为激活、鸢尾素和生物标志物,研究热点主要集中于运动调控肌肉、肝脏、脂肪的运动因子对肥胖的影响研究,运动调控肌肉、肝脏、脂肪的运动因子对心血管疾病的影响研究和有氧运动调控肌肉运动因子对脑功能的影响研究3大聚类群。
结论:有氧运动可调控脂肪运动因子表达改善胰岛素敏感性;不同运动方案可调控肌肉、肝脏、脂肪的运动因子差异性表达;肌肉、肝脏、脂肪的运动因子可降低代谢性疾病危险因素。
运动可调控瘦素及肿瘤坏死因子-α水平,改善肥胖;介导肌肉、肝脏、脂肪的运动因子,抑制细胞凋亡,缓解心血管疾病进程;提高肌肉运动因子表达改善脑功能。
未来应加大运动调控肌肉、肝脏、脂肪的运动因子相关研究的深度与合作力度;加强肌肉、肝脏、脂肪的运动因子防治糖尿病、肥胖、心血管疾病、脑部疾病及多种代谢性疾病的机制研究;探索肌肉、肝脏、脂肪的运动因子最佳作用效果的确切运动方案及其作为疾病检测与预后判断的新型生物标志物,系统梳理运动调控肌肉、肝脏、脂肪的运动因子与疾病关联的相关信号通路。
肝脏类器官研究的文献计量学分析徐灿丽;何文星;汪磊;吴芳婷;王佳慧;段雪琳;赵铁建;赵斌;郑洋【期刊名称】《中国组织工程研究》【年(卷),期】2024(28)7【摘要】背景:近些年,肝脏类器官的发展使其成为国际肝病研究领域的热点,但目前仍未有文献对其进行文献计量学分析。
目的:基于文献计量学与可视化分析探索近20年肝脏类器官的热点趋势。
方法:从Web of Science(科学网,WOS)核心合集中检索2002-01-01/2022-11-12肝脏类器官的相关文献,运行Origin、Office和CiteSpace软件进行文献计量与可视化分析,通过生成图表的方式来统计分析文献的年发文量、国家、机构、作者、期刊和关键词等内容。
结果与结论:肝脏类器官研究领域近20年的发文量、被引频次、加入研究的机构和人员总体呈现上升趋势,说明该领域发展迅速关注度也逐渐升高。
在该领域中,美国的发文量最多、影响力最强,虽然投入大量的时间与精力,但是在众多研究机构中美国单个研究机构的发文量并非最高;中国发文量仅次于美国,中国科学院和复旦大学是国内发文量最多的机构。
荷兰乌得勒支大学是发文量最多的机构,发文量最高的作者是Clevers H,共引频次最高的文章是“Long-term culture of genome-stable bipotent stem cells from adult human liver”,分子学、生物学、免疫学是肝脏类器官研究的主流学科,出现次数最高的关键词包括stem cell(干细胞)、in vitro(体外)和culture(培养),肝脏类器官领域的研究热点主要集中在体外干细胞三维培养、分化及基因表达。
【总页数】6页(P1099-1104)【作者】徐灿丽;何文星;汪磊;吴芳婷;王佳慧;段雪琳;赵铁建;赵斌;郑洋【作者单位】广西中医药大学;广西中医药大学;广西中医药大学;广西中医药大学【正文语种】中文【中图分类】R459.9;R318.14;R617【相关文献】1.1999-2004年我国体育类核心期刊足球运动研究的文献计量学研究——足球文献的年代、地域及内容分布的分析2.1999—2004年我国体育类核心期刊足球运动研究的文献计量学研究——足球文献的作者及其研究对象分布的分析3.基于文献计量学的近五年肝脏肿瘤分子影像学研究热点分析4.基于文献计量学的国内外人体器官捐献协调员研究现状分析与展望5.基于Web of Science数据库对肝脏类器官相关文献的计量学分析因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
·4091··知识窗·1991—2021年肝硬化营养研究热点及趋势可视化分析陈冉1,杨皓然2,史会连1,刘琼1,汤婷1*【摘要】 背景 肝硬化作为一种慢性消耗性疾病,对患者身体机能和营养状态的影响逐渐被学术界重视。
定期回顾全球肝硬化营养领域研究热点,有助于推进我国肝硬化营养领域的创新和发展。
目的 通过文献计量学方法梳理与总结1991—2021年肝硬化营养领域相关研究并做可视化分析,探究该领域的发展情况、研究热点和发展趋势,以期为今后肝硬化营养相关研究提供参考与借鉴。
方法 以Web of Science 数据库为来源,检索1991—2021年肝硬化营养研究的相关文献,运用CiteSpace 知识图谱分析工具中合作网络和共现网络两个功能,对肝硬化营养研究的国家、机构、作者、关键词、突现关键词进行数据挖掘和可视化分析。
结果 1991—2021年肝硬化营养研究的文献共1 520篇,发文量呈波浪式上升,2020年及2021年发文量均突破100篇。
美国是发文量(424篇)和中介中心性(0.32)均位居第一的国家。
机构分布:梅奥诊所(美国)发文量(25篇)及中介中心性(0.08)位居第一,其次是岐阜大学(日本)、克利夫兰诊所(美国)、奥尔胡斯大学附属医院(丹麦)等。
机构间形成以美国梅奥诊所、克利夫兰诊所为中心的美洲合作网络和以德国柏林查理特医科大学、瑞典卡罗斯卡学院为中心的欧洲合作网络。
作者合作网络图谱共纳入891位作者,以TANDON P、KAWAGUCHI T 为代表;高频关键词包括营养状况、肝移植、身体成分等,关键词突现分析中肌肉减少症的突现程度最高(突现强度26.170 9)。
结论 有关营养评估、肝移植和身体成分等内容的研究是肝硬化营养领域的研究热点,肝硬化伴肌肉减少症患者营养不良的病理生理机制和对此类患者的营养管理是今后研究的重点方向。
【关键词】 肝硬化;肌肉减少症;营养不良;CiteSpace;Web of Science;可视化分析【中图分类号】 R 575.2 【文献标识码】 A DOI:10.12114/j.issn.1007-9572.2022.0247陈冉,杨皓然,史会连,等. 1991—2021年肝硬化营养研究热点及趋势可视化分析[J]. 中国全科医学,2022,25(32):4091-4098. []CHEN R,YANG H R,SHI H L,et al. Hotspots and trends in research on nutrition in cirrhosis from 1991 to 2021:a visualized review[J]. Chinese General Practice,2022,25(32):4091-4098.Hotspots and Trends in Research on Nutrition in Cirrhosis from 1991 to 2021:a Visualized Review CHEN Ran 1,YANG Haoran 2,SHI Huilian 1,LIU Qiong 1,TANG Ting 1*1.Infectious Disease Department ,Affiliated Hospital of Nanjing University of Chinese Medicine/Jiangsu Province Hospital of Chinese Medicine ,Nanjing 210029,China2.First Clinical Medical College ,Nanjing University of Chinese Medicine ,Nanjing 210046,China*Corresponding author :TANG Ting ,Nurse-in-charge ;E-mail :【Abstract 】 Background Cirrhosis is a chronic consumption disease,whose impact on patients ' physical functionand nutritional status has been increasingly valued by the academic community. It is helpful to promote the innovation and development in nutrition for cirrhosis in China by reviewing the hotspots in global research on nutrition for cirrhosis periodically. Objective To perform a bibliometric and visualized review of the development,hotspots,and trends of studies on nutrition for cirrhosis published from 1991 to 2021,providing a reference for future studies related to nutrition in cirrhosis. Methods The studies about nutrition in cirrhosis published during 1991-2021 were searched from the database of Web of Science. Collaboration and co-occurrence network analyses supported by CiteSpace were used for data mining and visualization analysis of countries,institutions,authors,keywords,and burst keywords relevant to studies of nutrition in cirrhosis . Results A total of 1 520 studies were finally included,the yearly number of these studies demonstrated a wave-like growth during the period of 1991-2021,in particular,it exceeded 100 in 2020 and 2021. The U.S. ranked first in terms of the number of published studies (424)基金项目:国家自然科学基金青年科学基金(81903974)1.210029江苏省南京市,南京中医药大学附属医院 江苏省中医院感染科2.210046 江苏省南京市,南京中医药大学第一临床医学院*本文数字出版日期:2022-05-19扫描二维码查看原文·4092·E-mail:******************.cn肝硬化是以弥漫性结节再生和假小叶形成为病理特点的慢性、进行性、弥漫性肝病,是各种慢性肝病的终末阶段,每年约有130万人死于与其相关的并发症[1]。
国际肝干细胞研究文献可视化分析刘晓婷王敏张燕舞张玢许培扬(北京协和医学院医学信息研究所,北京100005)摘要:本文利用文献计量学方法和信息可视化方法对科学引文索引数据库(SCIE)数据库收录的肝干细胞文献进行分析,主要分析指标有时间分布、国家分布、机构分布、期刊分布、学科分布、主题分析,总结国际肝干细胞研究主题演化轨迹和研究热点,并对我国肝干细胞研究提出建议。
关键词:肝干细胞;可视化分析;文献计量学;共词分析;共引分析;聚类分析Visualization Analysis of International Publications on Liver Stem Cells Liu Xiao-ting,Wang Min,Zhang Yan-wu,Zhang Bin,Xu Pei-yang (Institute of Medical information ,Peking Union Medical College,Beijing 100005,China)Abstract: Articles about Liver stem cells were obtained by SCIE database and they were analyzed by the method of bibliometrology and information visualization. The publication years, countries, journals, organizations, subjects, topic were analysed in this paper in order to get the situation , history and hot topic of liver stem cells study. At last some advices were given to advance the studies of china.Key Words: Liver stem cells; Visualization analysis; Bibliometrics;Co-word analysis; Co-citation analysis; Cluster analysis肝干细胞是一种具有很强的自我增殖和分化潜能的细胞,可直接修复损伤肝脏或进行肝干细胞移植,故将成为严重肝脏疾病的细胞替代疗法以及构成生物人工肝的供体细胞,目前肝干细胞已经成为国际研究热点。
因此,本文利用文献计量学方法和可视化方法对国际肝干细胞领域文献进行分析,总结研究热点和前沿,为把握国际肝干细胞重点研究方向、选择前沿技术课题、进行科学合理的科技布局提供决策信息支持。
1 数据收集以肝干细胞、肝上皮干细胞、肝祖细胞、骨髓源性肝干细胞、肝卵圆细胞等为检索词,检索科学引文索引数据库(SCIE)数据库收录的1975年至今的肝干细胞文献,共检索到1092篇,检索时间是2009-10-09,以下将对这1092篇文献进行分析。
2 分析方法及工具本文采用基于数量统计的文献计量学分析方法、共词分析、聚类分析和可视化分析方法,利用Thomson Data Analysis(TDA)、SPSS、CiteSpace分析工具,对肝干细胞研究文献的时间、国别、机构、期刊、学科、主题进行分析并进行可视化展示。
3 分析结果3.1时间分布从1975年至1999年,肝干细胞研究文献较少,每年文献量不足30篇;在2000年小鼠和人体的骨髓细胞可横向分化为肝细胞被证实以后,肝干细胞研究文献进入快速增长期,2008年的文献量已经是2000年的3倍多,见图1,说明近年来肝干细胞的研究在国际上比较受关注。
图1 1975年至今国际肝干细胞研究文献时间分布3.2国家分布(1)文献数量分析肝干细胞研究主要集中在全球35个国家。
对第一作者所在的国家进行分析发现,肝干细胞文献排名前10的国家主要为发达国家,如美国、日本、德国等,其中美国在肝干细胞领域占有绝对优势,占该领域总文献量的29.85%,其次是日本;而发展中国家的肝干细胞研究相对比较薄弱,仅有中国发文量进入前十名,排名第三,发表文献58篇,距美国和日本还有很大差距,见表1。
表1作为第一作者发表肝干细胞研究文献排名前10的国家(2)国家合作网络分析采用国家-国家共现分析方法,利用TDA 软件对发表肝干细胞文献的35个国家进行分析,生成国际肝干细胞研究国家合作网络可视化图谱,如图2所示,美国是肝干细胞研究的核心主体,已经与多个国家开展科研合作研究;中国也与美国、日本、德国、希腊等国家开展了合作研究。
图2 肝干细胞研究国家合作网络图谱3.3机构分布对国际肝干细胞文献第一作者所在进行机构分析显示,肝干细胞文献产出前10位的机构均分布在发达国家且以大学为主,如美国、澳大利亚、比利时、日本、英国,其中美国的大学数量最多。
中国虽然第一作者发文量位居世界第三,但尚未形成肝干细胞研究的核心机构,见表2。
表2作为第一作者发表肝干细胞研究论文排名前10的机构3.4期刊分布1092篇有关肝干细胞文献分布在278种期刊上,其中刊载文献最多的10种期刊(表3)刊载的论文数占总论文的50.72%,说明肝干细胞研究论文发表所在的期刊相对比较集中。
表3 刊载肝干细胞论文数排名前10的期刊3.5学科分布1092篇有关肝干细胞的文献共分布在53个学科,采用TDA软件、SPSS 软件对文献量大于5的26个学科进行共现和聚类分析,结果显示26个学科聚成12个类,见图3。
从学科来看,肝干细胞研究是一个交叉学科的研究,学科间存在相互联系。
如细胞生物学、生物化学与分子生物学、显微镜学等学科联系较为紧密,肝干细胞分子水平的研究较多,涉及肝干细胞识别、鉴定、分化等多个研究热点;肿瘤学、血液学、生物技术与应用微生物联系较为紧密,这可能与肝干细胞的抑癌分化研究有关。
此外,移植、免疫、外科学成一类,这说明肝干细胞在手术移植、移植免疫领域应用广泛。
图3 肝干细胞学科类目关系分布图3.6主题分析本文采用共引分析、共词分析与信息可视化技术相结合,研究肝干细胞研究的主题演化轨迹,揭示肝干细胞研究的发展历程以及重要科研成果。
主题演化分析1092篇肝干细胞文献共涉及参考文献21306条,利用CiteSpace分析工具,对21306条参考文献进行共引分析,把握肝干细胞研究的主题演化轨迹(图4)。
从图4可初步看出,肝干细胞研究经历了三个研究比较活跃的历史阶段:二十世纪五十年代、二十世纪九十年代、二十一世纪初期。
二十世纪五十年代是肝干细胞的发现、辨认阶段。
如1956年Farber[1]首次提出在肝内存在小上皮细胞,并将这种具有很强增殖和分化能力的细胞定义为卵圆细胞;1958年Wilson和Leduc提出肝干细胞的概念[2],这些都为肝干细胞研究奠定了基础。
二十世纪九十年代研究人员主要探讨了肝干细胞的来源并发现其具有增生和分化能力。
1996年,Alison[3]提出胆管上皮是有效潜在的肝干细胞池,Haruna 证实了肝干细胞的可在体外大量增殖生物功能;1999年Petersen[4]提出肝卵圆细胞可来源于骨髓,并且发现肝卵圆细胞可以进一步分化成肝细胞或胆管细胞。
二十一世纪初期是肝干细胞基础应用研究阶段,主要探讨肝干细胞的分离、分化等技术的应用并取得了初步成功。
日本Suzuki[5]在2002年等利用流式细胞术分离出胚胎肝干细胞;2005年Takumi发现胚胎干细胞在诱导因子作用下可直接分化为有功能的成熟肝细胞。
图4 肝干细胞研究主题演化轨迹研究前沿分析本文利用CiteSpace软件,对2005-2009年的文献题名、摘要、关键词中的突发词进行分析,生成肝干细胞研究前沿图谱(图5),通过分析可以看出当前肝干细胞的研究热点有:(1)肝干细胞的识别和移植后鉴定。
通常情况下,肝干细胞处于静止状态,确认其标记蛋白较为困难。
随着干细胞标记蛋白水平的提高,已筛选出一些高度表达的标志物,可作为肝干细胞的初步筛选,但尚未发现肝干细胞特异性标记物。
肝干细胞移植后鉴定主要是通过基因标记技术、化学标记、Y染色体鉴定技术进行移植细胞踪示,其中基因标记技术中的EGFP系统已成为常用的标记技术[6]。
(2)肝干细胞的分离。
目前文献报道的肝干细胞分离方法主要有:成体肝分离、肝切除/药物阻止肝再生、利用肝先天疾病分离、胚胎肝分离等;分离技术多采用胶原酶灌注消化、梯度离心洗涤,获取细胞进行原代培养等。
近年采用免疫磁珠法筛检、流式细胞仪分离法等技术[7],提高了肝干细胞的分离效率和纯度,但需要特异的标志物和特殊仪器[8]。
(3)肝干细胞的体外培养和扩增。
除正常细胞培养的条件外,肝干细胞培养还需要一定的细胞因子和细胞外基质。
目前肝干细胞的体外培养获得率仍较低,因此,寻找有效的体外大规模培养、扩增以及保存技术、如何保持肝干细胞在体外培养与扩增时维持不分化状态等是目前研究人员关注的热点[9]。
(4)肝干细胞的分化。
实验研究表明卵原细胞、骨髓干细胞、胚胎干细胞可诱导分化成肝干细胞,但诱导后的细胞自我更新能力差、易死亡。
肝干细胞的诱导分化是一个复杂过程、是在肝脏微环境和细胞因子的共同作用下完成的,其调控机制尚不明朗。
肝干细胞研究已经取得了很大进展,但是目前仍处于基础研究阶段,距临床应用还有很大差距,以上研究热点均为肝干细胞由基础研究向临床研究转化的关键问题。
图5肝干细胞研究前沿图谱4 结论本文采用信息可视化方法、工具和传统的文献计量学方法对国际肝干细胞文献进行外部特征和内部特征分析,并将结果做可视化展示,初步揭示了国际肝干细胞研究的主题演化轨迹、研究热点。
肝干细胞正处于基础实验阶段,经分析认为我国应从以下几方面加强肝干细胞研究:(1)加大对肝干细胞研究的资金投入。
虽然我国的肝干细胞研究也取得了一定进展,但是与美国等发达国家相比,无论是在文献数量和核心研究机构数量还很大差距,因此我国加大对此领域的投入。
(2)加强与其他国家和机构的交流合作。
虽然我国文献数量较多,但尚未形成核心研究机构,因此我国科研人员应加强与国外优秀研究机构之间的合作,吸取经验教训,尽快形成有国际影响力的核心研究机构。
(3)关注肝干细胞研究专业期刊。
我国研究人员应选择肝干细胞研究专业期刊来关注其最新进展,同时也应将研究成果在专业性期刊上发表,以提高我国的国际影响力。
(4)紧跟研究前沿,自主创新。
我国研究人员应紧跟肝干细胞研究前沿,自主创新,突破肝干细胞分离、分化等亟待解决的关键技术,引导肝干细胞基础研究向临床研究转化。
参考文献[1]Farber E.Simularities in the sequence of early histologic changes induced in the liver ofthe rat by ethionine.2-acetylaminofluorene.and 3-methyl-4dimethylaminoazobenzene.Cancer Res,1956,16:142-149.[2]Wilson JW,Leduc EH.Role of cholangioles in restoration of the liver of the mouse afterdietary injury.J Pathol Bacteriol,1958,76(2):441-449.[3]Alison MR,Golding M,Sarraf CE,et al.Liver damage in the rat induces hapatocyt stemcells from biliary epithelia cells.Castroenterology,1996,110:1182-1190.[4]Petersen BE, Bowen WC, Patrene KD, Mars WM, Sullivan AK, Murase N, Boggs SS,Greenberger JS, Goff JP. Bone marrow as a potential source of hepatic oval cells. Science.1999 .14;284(5417):1168-70[5]Suzuki A,Zheng YW,Kondo R,et al.Flow-cytometric sepatation andenrichment of hepaticprogenitor cells in the developing mouse liver.Hepatology,2001,32:1230-1239[6]钟晓刚.肝干细胞的研究进展.广西医学,2008,30(10):1514-1516[7]龚雪,刘慧雯. 肝干细胞的来源与移植应用. 中国临床康复,9(26):186-188[8]Oertel M,Menthena A,Chen YQ,et a1。