Ig基因重排信号序列
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抗体多样性及分子基础抗体多样性来源抗体的多样性来源主要有4个,分别是:1、VH, DH 和JH三条链重组成有功能的重链,VL 和VJ (λor κ) 两条链组成有功能的轻链,轻链要么λ型,要么是κ型,二者不会同时出现在同一个抗体上。
2、VDJ基因拼接时,接头的多样性,这个多样性的主要有4种产生方式:1)D基因可以已任一方向在三个开放阅读框中的任何一个中翻译,以产生总共六个可能的肽片段。
2)在重排过程中会形成发卡结构,导致氮核苷酸的增加或者减少,从而增加多样性。
3)VDJ连接机制,可能添加或去除氮核苷酸作为VDJ连接过程的一部分。
有时,几个氨基酸残基的编码序列可能在重组过程中丢失。
4)可以通过末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)的活性来添加或替换氮核苷酸,特别是在构成功能性V区的CDR-H3的VDJ连接的D片段的任一侧上。
据估计,这些氮核苷酸的变化可导致CDR-H3的多样性大于107,包括CDR长度范围从仅仅几个氨基酸残基到超过25个氨基酸残基。
3、体细胞高频突变。
4、类别转换和基因转换。
人类抗体基因组成配系细胞中含有如下抗体基因1、C基因片段(constant gene segment)其编码抗体轻链和重链C区;2、轻链V基因片段(variable gene segment)和J基因片段(joining segment),二者编码轻链可变区;3、重链V、D基因片段和C基因片段(diversity segment),他们编码重链可变区。
上述基因片段位于不同染色体上,呈不连续成簇分布。
如图1所示,人抗体基因中总共有170-176个IGH(Immunoglobulin heavy chain:免疫球蛋白重链)基因,其中有76-84个是有功能的,包括38-46个IGHV基因(重链V基因片段)、23个IGHD基因(重链D基因片段)和9个IGHC基因(重链C基因片段)。
编码k轻链的基因座位于2号染色体的短壁上,k基因座一共有82个基因,由76个IGKV(k 轻链V基因片段)基因和5个IGKJ(k轻链J基因片段)基因组成,大概只有31-36个IGKV 基因参与形成有功能的V k(k型抗体的重链)。
IgH基因单克隆重排检测及其在B细胞性非霍奇金淋巴瘤诊断中的应用李银珍;王芳;邵琼;张旭;邓玲;汤涛;张晓;吴秋良【摘要】AIM: To establish a reliable and feasible protocol for detection of monoclonal immunoglobulin heavy chain (IgH) gene rearrangements for routine diagnosis of B - cell non - Hodgkin lymphoma ( B - NHL). METH-ODS : Using the primer combinations of FR2, FR3, LJH and VLJH, modetube A + tube B, and semi - nested PCR, the monoclonal IgH gene rearrangements in 121 cases of B - NHL, 58 cases of T - cell non - Hodgkin lymphoma ( T - NHL) and 19 cases of reactive lymphoid hyperplasia were detected. The differences of clonality detection rate between B - NHLgroup and T - NHL group, B - NHL group and reactive lymphoid hyperplasia group, and between the use of FR2, FR3 and FR2 + FR3primers were analyzed. RESULTS: The clonality detection rates of B - NHL, T - NHL and reactive lymphoid hyperplasia were 81% (96/118), 4% (2/54)and 0% (0/19). There were remarkable differences between B - NHL group and T - NHL group, B - NHL group and reactive lymphoid hyperplasiagroup in monoclonal IgH gene rearrangements ( P < 0. 05 ) . In B - NHL group, monoclonality was found in 58% of the cases using primer FR2, 55% using FR3 , andrn81% using the combination of both primers, with significant differences (P <0. 05) . CONCLUSION: Using the primer combinations of FR2, FR3 , LJH and VLJH, detection of paraffin - embedded tissues, the method of tube A + tube B mode and semi -nested PCR for determining monoclonal IgH gene rearrangements is feasible and reliable, and the clonality de-tection rate is high enough for clinical diagnosis of B - NHL.%目的:建立准确可靠、操作性强、适用于临床实际工作的免疫球蛋白重链(immunoglobulin heavy chain,IgH)基因单克隆重排检测方法,用于B细胞性非霍奇金淋巴瘤(B-cell non-Hodgkin lymphoma,B-NHL)的辅助诊断.方法:采用骨架区(framework region,FR)引物FR2、FR3和重链连接区(joining region of heavy chain,JH)引物LJH、VLJH组合、A管+B管模式、半巢式聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)法对121例B-NHL、58例T细胞性非霍奇金淋巴瘤(T-cell non-Hodgkin lymphoma,T-NHL)和19例淋巴结反应性增生的石蜡组织进行IgH基因单克隆重排检测,分析IgH基因单克隆重排检出率在B-NHL组、T-NHL组和淋巴结反应性增生组中的差异,以及B-NHL中联合应用FR2和FR3与单独应用FR2、FR3之间IgH基因单克隆重排检出率的差异.结果:118例成功检测的B-NHL中,IgH基因单克隆重排检出率为81%(96/118);54例成功检测的T-NHL中,IgH基因单克隆重排检出率为4%(2/54);19例成功检测的淋巴结反应性增生中未检出IgH基因单克隆重排.B-NHL组与T-NHL组、淋巴结反应性增生组相比,IgH基因单克隆重排检出率差异具有显著性(P<0.05).B-NHL中,FR2基因单克隆重排检出率为58%(68/118),FR3基因单克隆重排检出率为55%(65/118),联合应用FR2和FR3,IgH基因单克隆重排检出率为81%(96/118),联合应用FR2和FR3与单独应用FR2、FR3的检出率有显著差异(P<0.05).结论:采用FR2、FR3、LJH及VLJH引物组合、A管+B管模式和半巢式PCR法进行石蜡组织IgH基因单克隆重排检测,简单易行,结果准确可靠,阳性率较高,可用于临床B-NHL的辅助诊断.【期刊名称】《中国病理生理杂志》【年(卷),期】2012(028)011【总页数】5页(P1994-1998)【关键词】淋巴瘤;免疫球蛋白;基因重排【作者】李银珍;王芳;邵琼;张旭;邓玲;汤涛;张晓;吴秋良【作者单位】华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心病理科,广东,广州,510060【正文语种】中文【中图分类】R733.4免疫球蛋白重链(immunoglobulin heavy chain,IgH)基因单克隆重排是B细胞性非霍奇金淋巴瘤(B-cell non-Hodgkin lymphoma,B-NHL)的重要特征,国内外病理界已达成一致共识:应用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术检测IgH基因单克隆重排可以辅助诊断BNHL[1-3]。