中国沙塘鳢属鱼类线粒体12S rRNA基因序列分析

林彦均，杨天燕，朱岚倩，等．龙头鱼ＩＳＳＲ－ＰＣＲ多态性引物最佳退火温度的筛选［Ｊ］．江苏农业科学，２０２０，４８（８）：７０－７３．ｄｏｉ：１０．１５８８９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００２－１３０２．２０２０．０８．０１２龙头鱼ＩＳＳＲ－ＰＣＲ多态性引物最佳退火温度的筛选林彦均，杨天燕，朱岚倩，郑亦佳，王莹莹，斯舒谨，郭泽豪（浙江海洋大学水产学院，浙江舟山３１６０２２） 摘要：为了开展龙头鱼遗传多样性和近缘物种间的遗传变异分析，建立龙头鱼的简单序列重复区间标记（ｉｎｔｅｒ－ｓｉｍｐｌｅｓｅｑｕｅｎｃｅｒｅｐｅａｔ，简称ＩＳＳＲ）－ＰＣＲ反应体系，拟筛选龙头鱼ＩＳＳＲ－ＰＣＲ多态性引物的最佳退火温度。

参考加拿大哥伦比亚大学（ＵＢＣ）公布的１００条ＩＳＳＲ引物，采用温度梯度ＰＣＲ的方法，得到适用于龙头鱼基因组ＤＮＡ扩增的１２条ＩＳＳＲ分子标记引物，分别为８１１、８３４、８３６、８４０、８４１、８４２、８４４、８５３、８７３、８８０、８８１、８９９。

１２条引物中，最高退火温度为５８．９℃，最低退火温度为４７℃，两者间的差异达到了１１．９℃。

１２条引物的变异系数为７．７１％，相关系数为０．２３。

结果表明，龙头鱼ＩＳＳＲ多态性引物的最佳退火温度与理论退火温度间没有显著相关性，同一种引物的退火温度在不同物种中也存在一定的差异，需要通过温度梯度试验进行具体分析。

关键词：龙头鱼；ＩＳＳＲ－ＰＣＲ；退火温度；引物筛选 中图分类号：Ｓ９１７ 文献标志码：Ａ 文章编号：１００２－１３０２（２０２０）０８－００７０－０４收稿日期：２０１９－０３－１７基金项目：２０１８年国家级大学生创新创业训练计划（编号：２０１８１０３４００１０）；浙江省大学生科技创新活动计划暨新苗人才计划（编号：２０１９Ｒ４１１０１３）；浙江海洋大学人才引进科研基金（２０１６－２０１７）；浙江省一流学科（Ａ类）大学生创新性科研项目（编号：１１０３４０６０２１６）。

鳅科鱼类 DNA 条形码分析及泥鳅和大鳞副泥鳅的分子鉴定张望;陈秀开;彭勇;李正高【摘要】采集了23种鳅科鱼类89尾个体的线粒体COI基因5端序列，分析了碱基组成以及不同鳅科鱼类之间的种间遗传距离和种内遗传距离。

结果显示，鳅科鱼类的种间遗传距离显著大于种内遗传距离，表明以COI作为鳅科鱼类DNA条形码进行品种鉴定具有一定的可行性。

在建立鳅科鱼类DNA条形码的基础上，设计了主要物种泥鳅（Misgurnus anguillicaudatus）和大鳞副泥鳅（Paramisgurnus dabryanus）特异性引物，结果显示，该引物具有较高的特异性和灵敏度，能够实现对泥鳅、大鳞副泥鳅及其混合样品的物种鉴定。

%Mitochondrial COI 5 ’ sequences of 89 cobitidae fishes belonging to 23 species were collected .The DNA base composition was analyzed , the genetic variation among species and within species were calculated .It was proved that COI gene is a valid DNA barcoding gene for species identification of Cobitidae .On the basis of Cobitidae DNA barcoding, spe-cies-specific primers for Misg runus anguillicaudatus and Para misgurnus dabryanus were designed.The result suggests the species-specific primers could identify Misgurnus anguillicaudatus, Paramisgurnus dabryanus and their mixtures with high specificity and sensitivity .【期刊名称】《淡水渔业》【年(卷),期】2015(000)003【总页数】6页(P19-24)【关键词】泥鳅(Misgurnus anguil licaudatus);DNA条形码;鳅科;物种鉴定【作者】张望;陈秀开;彭勇;李正高【作者单位】连云港出入境检验检疫局，江苏连云港 222042;连云港出入境检验检疫局，江苏连云港 222042;连云港出入境检验检疫局，江苏连云港 222042;连云港出入境检验检疫局，江苏连云港 222042【正文语种】中文【中图分类】S917.4泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)属于鲤形目(Cypriniformes)鳅超科(Cobitoidea)鳅科(Cobitidae)，是国内外消费者喜爱的经济鱼类［1］。

文章编号：１００４－２４９０（２０２０）０３－０２８７－０９中国沿海蓝点马鲛繁殖群体的耳石形态差异 收稿日期：２０１９－０９－０２基金项目：中央级公益性科研院所基本科研业务专项资金（中国水产科学研究院东海水产研究所）资助项目（２０１６Ｍ０１）；国家公益性行业（农业）科研专项经费项目（２０１３０３０４７）；宁波市重大科技攻关项目（２０１３Ｃ１１０１４）作者简介：杨林林（１９８５—），男，江苏南通人，助理研究员，从事渔业资源与生态研究。

Ｅ ｍａｉｌ：ｓｅａｓｕｎ１０７＠１２６．ｃｏｍ通信作者：李圣法，研究员。

Ｅ ｍａｉｌ：ｓｈｅｎｇｆａ＠ｓｈ１６３．ｎｅｔ杨林林，姜亚洲，刘尊雷，林　昱，凌建忠，李圣法（中国水产科学研究院东海水产研究所，农业农村部东海渔业资源开发利用重点实验室，上海　２０００９０）摘　要：为阐明中国沿海蓝点马鲛（Ｓｃｏｍｂｅｒｏｍｏｒｕｓｎｉｐｈｏｎｉｕｓ）繁殖群体耳石形态的特异性，科学判定中国沿海蓝点马鲛繁殖群体的种群归属，根据２０１６—２０１８年４—６月在莱州湾、海州湾、吕四渔场、象山港、沙埕港等蓝点马鲛产卵场采集的２４２尾２龄蓝点马鲛成熟个体样本，结合计算出的环率、圆度、椭圆率、矩形趋近率、纵横比、形态因子、半径比和面密度等８个耳石形状指标，运用相似性分析、非参数多维标度分析、相似性百分比分析探讨了耳石形态的群体间差异。

结果显示，海州湾和吕四渔场蓝点马鲛繁殖群体的耳石形态不存在显著性差异（Ｐ＞０．０５）；象山港和沙埕港蓝点马鲛繁殖群体的耳石形态不存在显著性差异（Ｐ＞０．０５）；渤海、黄海和东海３个海区之间繁殖群体的耳石形态差异均达到了极显著水平（Ｐ＜０．０１）；半径比、纵横比、面密度和矩形趋近率是对各个繁殖群体组内相似性贡献度较高的耳石形态典型指标；面密度、形态因子和半径比则是对各繁殖群体组间相异性贡献度较高的耳石形态分歧指标。

通过逐步判别分析建立了５个蓝点马鲛繁殖群体的判别公式，判别准确率在５５．２６％～９２．５９％，综合判别正确率为７１．０７％。

锦鲤溃疡病病原菌的分离及16S rRNA鉴定姜娜;马志宏;李铁梁;邢薇;罗琳【摘要】为寻找引起养殖锦鲤( Orna mental ca rp)病害的致病因子,从北京地区自然患病的锦鲤体内分离疑似致病菌,再将此菌人工感染健康锦鲤,确定致病菌.采用生理生化鉴定与16S rRNA基因序列的系统发育学分析相结合的方法确定该致病菌株的系统发育地位,同时采用琼脂扩散法测定该菌对抗菌类药物的敏感性.试验结果表明,从病鱼体内分离得到革兰氏阴性杆菌CL0901,人工感染健康锦鲤后,能够引起鱼生病甚至死亡,症状与自然发病症状一致.菌株CL0901与Aeromonasveronii ATCC 35624T的16S rRNA基因序列相似性达99.9％,构建系统发育树,并结合形态特征与生理生化测定结果,将该致病菌鉴定为维氏气单胞菌(Aeromonas veronii).在21种抗菌类药物对该菌的抑菌试验中,左氧氟沙星、诺氟沙星和洛美沙星等10种药物的抑菌效果较好.本研究为进一步防制锦鲤养殖病害提供依据.%The study was carried out to search for the pathogenic factor causing Ornamental carp ulcer disease. A pathoge-netic bacterial strain CL0901 was isolated from naturally infected Ornamental carp (Cyprinus carpio L. ) in Beijing.The strain was identified according to its physiological and biochemical properties, and the sequence analysis of 16S rRNA gene. The drugs sensitivity was detected with Kirby-Bauer's agar diffusion method. Basedon the result of 16S rRNA sequence analysis, the strain CL0901 shares 99. 9% sequence identity with the type strain ATTCC 35624T of Aeromonas veronii. Combining with bacteria observation, physiological and biochemical characteristics, the pathogenetic bacterial strain CL0901 was identified as Aeromonas veronii. Drug sensitive tests showed that isolation wassensitive to Neomycin, Piperacillin, Levofloxacin, Nor-floxacin, Gentamicin, Amikacin, Tazobactam, Pefloxacin, Lomefloxacin and Tobramycin.【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2012(039)002【总页数】4页(P174-177)【关键词】锦鲤;溃疡病;生理生化特性;16S rRNA基因;药敏试验【作者】姜娜;马志宏;李铁梁;邢薇;罗琳【作者单位】北京市农林科学院北京市水产科学研究所,北京 100068;北京市农林科学院北京市水产科学研究所,北京 100068;北京市农林科学院北京市水产科学研究所,北京 100068;北京市农林科学院北京市水产科学研究所,北京 100068;北京市农林科学院北京市水产科学研究所,北京 100068【正文语种】中文【中图分类】S943锦鲤（Ornamental carp）又称绯鲤，是一种温水性的淡水观赏鱼，以其健壮的体形、艳丽似锦的色彩、变幻多姿的斑纹而闻名。

鱼类环境 DNA 研究中通用引物的筛选验证刘军;赵良杰;凡迎春;张新磊;刘其根【摘要】为了筛选一个通用性和适用性良好的能够运用于环境DNA（ eDNA）研究的鱼类引物，从相关文献中选取了鱼类线粒体基因组部分片段的5对引物，分别对线粒体D-loop区、16S rRNA基因、 COI基因以及Cytb基因部分片段进行扩增。

对千岛湖48种鱼类基因组DNA进行扩增后比较发现，引物16 s和COI 均可以取得良好的扩增效果，通用性优于其他几对引物。

引物16s的扩增产物经凝胶电泳检测均出现明亮的目的条带，引物COI则有3种鱼的条带经凝胶电泳检测亮度较暗。

利用上述引物对环境样品eDNA扩增时发现，只有16s和COI的引物具有良好的扩增效果，能够得到明显单一的亮带。

对该两种引物的PCR产物克隆后测序比对发现，16s的PCR产物均为千岛湖常见鱼类物种的基因片段， COI 的PCR产物则为细菌COI基因的部分片段。

综上，我们认为引物16s在通用性和适用性上都更为适合作为鱼类群落结构eDNA研究的通用引物。

%In order to screen the primer of well universality and applicability for eDNA research, five pairs of universal primer of fish mitochondrial genome fragment were chosen from the previous references to amplify the partial sequences of D-loop region, 16S rRNA gene, COI gene and Cytb gene.These primers were used to amplify genome of 48 species of fish in Qiandao Lake to test the universality, it was found that the 16s and COI were better than the other primers.Gel e-lectrophoresis showed that all 16s DNA bands of the 48 species of fish was light, but 3 COI gene bands of the fish species was dark.The eDNA from Qiandao Lake were amplified by these five pairs of primer, and the electrophoretogram showed that the PCR product of 16sDNA and COI gene presented a clear bright band.According to the cloned sequencing and BLAST results, the PCR product of 16s DNA was coincident to the fragments of fishes from Qiandao Lake, but the PCR product of COI gene was in accord with the COI gene of bacteria.In summary, the primer of 16S rRNA was the most suit-able universal primer to study on eDNA of fish community structure in the Qiandao Lake.【期刊名称】《淡水渔业》【年(卷),期】2016(046)001【总页数】9页(P9-17)【关键词】引物筛选;线粒体标记;环境DNA;千岛湖【作者】刘军;赵良杰;凡迎春;张新磊;刘其根【作者单位】上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室，上海 201306;上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室，上海 201306;上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室，上海 201306;上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室，上海 201306;上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室，上海 201306【正文语种】中文【中图分类】S917.4环境DNA(eDNA)是指从有机体脱落释放进入到自然环境中(如空气、水、土壤等)的DNA，包括细胞中的DNA和细胞破碎后游离出细胞外的DNA分子。

基于线粒体Cytb基因探讨我国日本囊对虾4个地理群体的遗传结构及种群分化曾凡荣;王军;周孔霖;游欣欣;毛勇【摘要】利用线粒体细胞色素b基因序列分析了4个不同地理群体(北海群体、陵水群体、惠来群体和厦门群体)的野生日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)的群体遗传结构.以特异引物进行PCR扩增,获得了日本囊对虾530 bp的基因片段序列.序列分析结果表明,在120个日本囊对虾个体中,共检测到75个多态位点,获得62个单倍型,其中有44个简约信息位点,占整段序列的8.3%.各单倍型变异无碱基的插入或缺失,全部为转换或颠换,碱基频率含量(fA+fT)为59.4%,大于(fG+fC)(40.6%).核苷酸多态性以惠来群体最高,其它3个群体较低.群体内遗传距离为0.45%～2.60% ,群体间遗传距离在0.50%～5.30%之间.采用分子方差分析(AMOVA)方法,结果显示,群体间遗传变异占总变异的69.9%,群体内的遗传变异占总变异的31.1%,群体间变异是总变异的主要来源.构建的4个群体分子系统树表明,北海群体、陵水群体和部分惠来群体由于亲缘关系较近而聚在一起,而厦门群体则和部分惠来群体聚成另一支,两支的平均遗传距离为5.17%,分化接近亚种水平,据此认为我国东南近海的日本囊对虾可以分为2个种群,2个种群的分布区域在广东惠来海域附近存在重叠.【期刊名称】《厦门大学学报（自然科学版）》【年(卷),期】2010(049)005【总页数】6页(P701-706)【关键词】日本囊对虾;细胞色素b基因;遗传多样性【作者】曾凡荣;王军;周孔霖;游欣欣;毛勇【作者单位】厦门大学海洋与环境学院,福建,厦门,361005;厦门大学海洋与环境学院,福建,厦门,361005;厦门大学海洋与环境学院,福建,厦门,361005;厦门大学海洋与环境学院,福建,厦门,361005;厦门大学海洋与环境学院,福建,厦门,361005【正文语种】中文【中图分类】P745日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)隶属于甲壳纲(Crustacea),十足目(Decapoda),对虾科(Penaeidae),囊对虾属(Marsupenaeus).日本囊对虾的分布极其广泛,在整个印度-西太平洋,从非洲东部和南部到红海穿过马六甲海峡到地中海都有分布,在我国主要分布在长江口以南沿海,是具有重要经济价值的养殖虾类[1].由于市场价格高、需求量大,加剧了对日本囊对虾的过度捕捞,导致其资源不断衰退.因此对其野生资源现状进行调查研究,了解其野生群体的地理分布、遗传结构及种群分化水平,有利于对日本囊对虾野生资源的准确评估,为对其资源的保护和可持续利用提供科学依据.目前国内外已有部分学者对我国近海日本囊对虾的群体遗传学方面做了相关的研究[2-5],但他们的取样范围仍存在一定的不足,从而将影响对日本囊对虾地理分布成因及种群分化的探讨.动物线粒体DNA(mtDNA)由于具有结构简单、严格的母系遗传、几乎不发生重组、进化速度快且不同区域进化速度存在差异等特点,已成为研究动物起源进化、群体遗传、系统发育等的重要标记[6-7].其中,细胞色素b(cytochrome b,简称Cyt b)基因的结构和功能在mtDNA的13个蛋白质编码基因中已被探明[8],且进化速度适中,因此在鱼虾类的种群分化与生物地理学中得到广泛应用[9-10].本文以4个不同地理群体的日本囊对虾为研究对象,利用线粒体Cyt b基因序列对我国日本囊对虾自然群体的遗传结构和种群分化特征进行分析,为进一步开展我国东南近海日本囊的谱系生物地理学研究提供基础数据,并为日本囊对虾种质资源的开发利用及良种选育提供更多理论依据.用于本实验4个群体的日本囊对虾为2008年11月—2009年3月分别从福建厦门、广东惠来、海南陵水和广西北海等4个水域采集的野生群体(图1),每个群体取样30尾,雄虾体质量50～80 g,雌虾则是100～150g.所有样品均取对虾的第6腹节背部肌肉, -20℃无水乙醇保存.1.2.1 基因组DNA的提取和检测每个样品取肌肉组织0.1 g,采用SDS/蛋白酶K消化,酚-氯仿抽提和乙醇沉淀法[11]提取总DNA, 1.0%(质量分数)琼脂糖凝胶电泳检测DNA,于-20℃冰箱中保存备用.1.2.2 PCR扩增及序列测定根据GeneBank中公布的日本囊对虾线粒体基因全序列(序列号:AP006346)中Cyt b基因设计PCR引物,引物的核苷酸序列为:CBF 5′-TCCAAATTGTTACTGGGCTCT-3′和CBR 5′-AAGGGCAGTTAGCATTACGAT-3′,由上海英骏生物技术有限公司合成.反应体积为50μL,其中10×PCR buffer(plus Mg2+)5μL,dNTPs(10mmol/L)1μL,Taq酶(2.5U/ μL)1μL(东盛公司),正反向引物(10pmol/μL)各1 μL,1μL模板(约100 ng),加超纯水至50μL.反应条件为:94℃预变性3min;35个循环,每个包括94℃变性30s,56℃退火30s,72℃延伸45s;再72℃链延伸7min.PCR产物经质量分数为1.0%琼脂糖凝胶电泳检测,OMEGA试剂盒(Cycle-Pure Kit)纯化,纯化产物送北京六合华大基因科技股份有限公司测序.1.2.3 数据分析利用Clustal X软件[12]对测序结果进行对位排列,并辅以人工校正;DnaSP软件[13]确定单倍型,计算多态位点和多态简约信息位点数;以 MEGA软件[14]统计序列的平均碱基组成和转换/颠换比率 R,基于Kimura-2parameter计算遗传距离;用Arlequin3.1软件[15]中的分子方差分析(AMOVA)方法估算遗传变异在群体内和群体间的分布.采用邻接法(Neighbor-joining,NJ)、MEGA软件[14]构建分子系统树,遗传距离模型选择 Kimura双参数模型,将序列中的转换和颠换位点均视为信息位点并对所有位点一致性加权[14].应用NETWORK[16]软件构建单倍型网络关系图.测序结果经过比对校正后,4个群体Cyt b基因序列长度均为 530 bp(GenBank登入号:GU992213-GU992274).总的来说,序列中的转换明显比颠换多,R= 7.2,说明序列突变还未达到饱和,其中T-C转换多于AG,A-C和A-T颠换多于C-G和T-G.在长度为530 bp序列中共检测到75个多态位点,其中有44个简约信息位点,占整段序列的8.3%,无碱基的插入或缺失,全部为转换或颠换.所有被分析序列的相对碱基频率为 fT= 34.8%,fC=24.1%,fA=24.6%,fG=16.5%,fA+f T含量为59.4%,明显高于fG+fC含量(40.6%).单倍型在群体中的分布如表1,在4个群体的120个序列中,共检测到62个单倍型,其中,有9个是群体间共享单倍型,50个单倍型(占80.65%)只在1个个体中检测到. 核苷酸多态性以惠来群体最高,其他3个群体较低(表2).Tajima[17]检验及 Fu和Li[18]检验均支持厦门群体内部存在自然选择作用;Tajima检验不支持陵水、北海和惠来群体有选择作用,而 Fu和Li检验支持其有选择作用.如表3所示,群体内遗传距离为0.45%～2.60%,群体间遗传距离在0.50%～5.30%之间,北海群体与厦门群体之间的遗传距离最大为5.28%,北海群体与陵水群体的遗传距离最小为0.505%,群体内遗传距离惠来群体2.62%为最大,厦门群体则最小为0.45%.日本囊对虾62个单倍型间的遗传距离为0.38%～5.55%.AMOVA分析结果如表4所示,群体间遗传变异占总变异的69.9%,群体内的遗传变异占总变异的31.1%,可见群体间变异是总变异的主要来源.基于日本囊对虾Cyt b基因62个单倍型系列构建的NJ树如图2所示,NJ树采用Kimura双因子参数模型构建,树上各分支上的数字代表1 000次Bootstrap统计分析后对该支的支持百分比(即置信度).由图2可见,62个单倍型构建的邻接关系树显示日本囊对虾群体内存在2个明显的单倍型类群:类群A(上面1支)包括陵水群体、北海群体和部分惠来群体的单倍型,而类群B仅包括厦门群体和部分惠来群体的单倍型.类群A的核苷酸多态性为1.01%,而类群B的则为0.73%.这两类群间平均遗传距离为5.17%,AB类群内遗传距离分别为1.02%和1.07%(表5).日本囊对虾单倍型网络图如图3所示,网络图很明显由2支构成,上支为厦门群体和部分惠来群体,含1个优势单倍型(Hap-36,占14.17%),其他单倍型围绕它呈辐散状发出;下支由余下群体组成,其中拥有3个优势单倍型(Hap-1,Hap-15和Hap-22,分别占8.33%,7.5%和11.67%).图中黑点表示可能存在的但是未被检测到的单倍型. 宋林生等[2]和庄志猛等[3]利用 RAPD和同工酶技术,对日本囊对虾的福建、台湾海峡野生群体和相应的养殖群体间的遗传变异进行了分析,结果显示中国的日本囊对虾野生种群的多态位点比例较高,遗传多样性较为丰富.Tzeng等[4]分析了采自日本海、中国东海和南海5个日本囊对虾群体共95个个体的线粒体控制区序列,在长992bp的序列中共检测到292个变异位点,共定义了95个单倍型,显示出很高的遗传多样性水平.本文研究结果同样也表明,4个不同地理群体的日本囊对虾Cyt b基因不论是从单倍型多样性(0.954)还是从核苷酸多态性(2.74%)来衡量,日本囊对虾的遗传变异水平都是非常高的.上述研究结果表明,目前我国日本囊对虾野生种群的遗传变异水平较高,野生种质资源处于较好状态.在渔业管理过程中,及时有效加强对日本囊对虾野生资源的管理保护,就能够保证日本囊对虾资源的可持续利用,可以避免由于过度捕捞而出现的种质衰退、遗传性状单一的现象.AMOVA分析结果(表4)表明,日本囊对虾群体间的遗传变异百分率(69.9%)显著高于群体内的遗传变异百分率(30.1%),说明遗传变异主要发生在群体之间.北海群体和陵水群体共享5个单倍型,北海群体、陵水群体和惠来群体共享2个单倍型,而厦门群体与惠来群体拥有4个共享单倍型.从NJ树和单倍型网络图上也可以看出,厦门群体只与惠来群体聚在一起,表明日本囊对虾的分化已具有明显的地域性.如图1所示,北海群体和陵水群体被海南岛所隔离,珠江径流影响着它们与惠来群体和厦门群体的基因交流.日本囊对虾的生活史包括了无节幼体、溞状幼体、糠虾、仔虾和幼虾、成虾,它们的迁移距离有限,并没有明显的产卵洄游,仅随个体生长由近岸向远岸迁移[19].因此,作者认为地理分布的差异是日本囊对虾4个群体造成群体遗传分化的主要原因,本身有限的迁移能力是造成群体遗传分化的内在因素.根据群体间及群体内遗传距离的计算结果(表3),群体内单倍型遗传距离为0.45%～2.62%,北海群体与陵水群体的遗传距离最小(0.50%),厦门群体与北海、陵水2个群体的遗传距离较大,分别为5.28%和5.25%.Billington等[20]报道鱼类种内单倍型差异一般在10%以内,对其他一些动物的Cyt b基因系列分析表明,种内个体间的系列差异一般在0～4.06%,差异超过6%的个体间已有明显的亚种或者种的分化[21-22],由此可见,厦门群体与北海和陵水群体的分化已接近亚种水平.Tsoi等[5]根据头胸甲花纹类型的不同将日本囊对虾分为2个类型(类型(I,II)),类型 I主要分布在日本海、中国东海和南海北部,而类型 II则广泛分布于东南亚、地中海和澳大利亚.本文所研究的我国东南近海4个群体中的2个分化类群的地理分布与 Tsoi的2个类型相吻合.日本囊对虾成体的迁移距离有限,但在幼体阶段可以随海流运动而扩散,因此基因流动主要源于幼体阶段的扩散.我国东南沿海的主要流系有南海暖流、黑潮暖流、南海沿岸流和浙闽沿岸流等[23],这些交汇的海洋环流同样加强了该海域日本囊对虾卵和幼体的扩散能力.因此,在自身迁移和海流的共同影响下,南海的日本囊对虾可以往北扩散,同样福建及其以北海域的日本囊对虾也可以向南交汇,因而促进了沿岸各日本囊对虾群体间的交流.除上述海流外,珠江径流对南海北部和东海南部海域的水文状况和生物群落结构也有较大的影响[24],但是目前没有相应的研究表明珠江径流是日本囊对虾扩散的一个有效障碍,对其遗传结构有无显著影响还需进一步验证.最后,作者认为我国东南近海的日本囊对虾可以分为2个种群,是否提升为亚种有待进一步考证,而这2个种群的分布区域在广东惠来海域附近存在重叠.【相关文献】[1] 刘瑞玉,钟振如.南海对虾类[M].北京:农业出版社, 1990.[2] 宋林生,相建海,李晨曦,等.日本对虾野生种群和养殖种群遗传结构的RAPD标记研究[J].海洋与湖沼,1999,30 (3):261-266.[3] Zhuang ZM,MengXH,QuanJX,etal.Geneticdiversity in thewildpopulationandhatchery stockof Penaeus japonicas shrimp by isoenzymeanalysis[J].ZoologicalResearch,2000,21(4):323-326.[4] Tzeng TD,Yeh SY,HuiCF.Populationgenetic structureof the kuruma prawn(Penaeus japonicus)in East Asia inferred 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洞庭湖水系3种鲿科鱼的染色体核型分析文永彬;史怡雪;刘良国;刘畅;罗婉仪;杨春英【摘要】采用植物血球凝集素（ phytohaemagglutinin ，PHA）和秋水仙素胸腔注射，取活体肾细胞低渗、固定、火焰干燥法制作染色体标本，对洞庭湖水系3种鲿科鱼（瓦氏黄颡鱼、圆尾拟鲿、大鳍鳠）的染色体核型进行分析。

结果表明，3种鲿科鱼的中期染色体均为二倍体，其中瓦氏黄颡鱼和圆尾拟鲿的二倍体染色体数相同，但核型存在差异，瓦氏黄颡鱼的核型为2n＝52（18m＋10Sm＋12st＋12t），臂数（nf）＝80；圆尾拟鲿的核型为2n＝52（24m＋16Sm＋12st），臂数（nf）＝92；大鳍鳠的染色体数为2n＝60，核型为2n ＝20m＋12sm＋16st＋12t，臂数（nf）＝92。

并将3种鱼的核型与前人报道的其他鲿科鱼类核型作了比较，探讨了鲿科鱼类的染色体遗传多样性和系统分类。

【期刊名称】《江苏农业科学》【年(卷),期】2013(000)012【总页数】4页(P235-237,238)【关键词】鲿科鱼;核型;洞庭湖水系【作者】文永彬;史怡雪;刘良国;刘畅;罗婉仪;杨春英【作者单位】动物学湖南省高校重点实验室/湖南文理学院生命科学学院，湖南常德415000;动物学湖南省高校重点实验室/湖南文理学院生命科学学院，湖南常德415000;动物学湖南省高校重点实验室/湖南文理学院生命科学学院，湖南常德415000;动物学湖南省高校重点实验室/湖南文理学院生命科学学院，湖南常德415000;动物学湖南省高校重点实验室/湖南文理学院生命科学学院，湖南常德415000;动物学湖南省高校重点实验室/湖南文理学院生命科学学院，湖南常德415000【正文语种】中文【中图分类】Q917鲿科(Bagridae)隶属鲇形目(Siluriformes)，分布于亚洲、非洲。

鲿科在我国的分布仅次于鲇科(Siluridae)，是一类肉质细嫩、少肌间刺、味鲜美的淡水经济鱼类。

中国少鳞鳜不同地理群体的遗传变异分析的开题报告
一、研究背景
中国少鳞鳜是一种重要的淡水鱼类资源，广泛分布于我国江河湖泊中。

然而，由于过渡捕捞、水质污染等因素，该物种数量逐渐减少，已经成为濒危物种。

为了保护和有效利用该物种资源，进行种群遗传学分析是非常重要的。

二、研究目的
本研究旨在分析中国少鳞鳜不同地理群体的基因遗传变异情况，探究其种群遗传结构和遗传多样性水平，为该物种保护和资源利用提供科学依据。

三、研究内容和方法
1、样本收集
本研究将采集中国少鳞鳜样本，包括来自不同地理群体的个体。

在样本收集过程中，应遵守国家有关保护和野生动物管理的法律法规。

2、DNA提取和PCR扩增
从每个个体中提取DNA，使用PCR扩增目标基因。

目前可以使用的基因标记有mitchondrial DNA(mit DNA)和核基因DNA(nuc DNA)。

mit DNA通常用于种群遗传学的分析，而nuc DNA更多用于遗传变异的研究。

3、基因测序
通过基因测序，获取目标基因的DNA序列信息，进一步分析目标基因的遗传变异情况及其遗传多样性水平。

基于DNA序列信息，可以建立基因型谱和进化树，进行种群和遗传学分析。

4、统计分析
使用SPSS或其他统计软件对数据进行分析，包括种群遗传分化分析、遗传多样性水平分析等。

四、研究意义
本研究将有助于深入了解中国少鳞鳜种群的遗传变异特征和遗传多样性水平，为该物种的保育和资源合理利用提供科学依据，也对我国的淡水生态保护和水产资源管理提供指导。