SSR标记在玉米研究中的应用研究进展

玉米种子纯度SSR分子标记检测研究报告作者：李世聪朱华国薛飞来源：《种子科技》2019年第07期摘 ; 要：本试验利用SSR分子标记法，对玉米杂交种金庆707和世宾338玉米杂交种的种子纯度进行了检测。

结果表明：8对SSR引物bnlg1940k7、 phi053k2、bnlg2291k4、umc1705w1、bnlg2305k4、bnlg1702k1、phi080k15和umc1492y13可用于金庆707种子纯度鉴定;8对SSR引物umc2105k3、bnlg2291k4、umc1705w1、bnlg161k8、bnlg1702k1、umc1545y2、phi080k15和umc1432y6可用于品种世宾338种子纯度鉴定。

选用引物phi053k2检测金庆707的种子纯度为92%，选用引物bnlg1702k1检测世宾338的种子纯度为66%，两者均未达到国家标准。

本研究从玉米20对SSR核心引物中筛选出8对多态性引物可用于金庆707和世宾338两个品种的种子纯度检测，大大缩短了种子纯度检测的周期。

关键词：SSR分子标记;玉米杂交种;种子纯度玉米是我国一种很重要的粮食作物，也是饲料加工的重要来源，在我国农业生产中处于很重要的位置[1]。

种子是农业生产中最根本的生产资料，种子质量的好坏决定了农作物产量的多少和品质的优良，而种子纯度的高低又是显示种子质量好坏的一项重要因素[2]。

种子纯度的检测是发挥作物产量潜能和保证作物质量的必要措施。

根据前人的研究，种子纯度下降1个百分点，将会直接导致作物产量減少大约1%[3]。

种子市场的不规范，对育种者、种植户以及经销商的利益造成极大的损害。

新疆是中国的农业大省，种子市场的“多乱混杂”，严重危害到育种者、种植户以及经销商的利益，所以种子纯度的鉴定十分必要。

种子纯度鉴定的方法主要包括田间形态鉴定和生化标记鉴定及DNA分子标记鉴定等[4]。

最初的田间形态鉴定，存在鉴定周期长、结果受环境影响较大、准确性差等缺点[5];生化标记鉴定是利用不同品种蛋白质的不同得以鉴定，蛋白质电泳鉴定容易遭受环境和生长状况的影响。

利用SSR荧光标记分析我国糯玉米地方品种的遗传多样性
的开题报告
尊敬的评审委员会：
我计划开展的研究项目是：利用SSR荧光标记分析我国糯玉米地方品种的遗传多样性。

该研究旨在通过分析糯玉米地方品种的遗传多样性，为糯玉米遗传育种提供科
学依据和指导，推动糯玉米生产发展。

糯玉米是我国传统的农作物之一，其作为重要的食材和经济作物，具有重要的经济和社会意义。

通过分析其遗传多样性，可以研究种质资源的基础和多样性，进而为
糯玉米育种提供重要的资料。

本研究将采用SSR荧光标记技术对中国不同地方品种的糯玉米进行分析比较，选取适合糯玉米品种遗传多样性评估的SSR标记，通过PCR扩增进行DNA分离，再运
用荧光检测仪对PCR产物进行检测，获得糯玉米品种遗传学数据。

将采用90个微卫
星（SSR）标记对来自四个主要种植区（南方、东北、华北和西北）的81个本地糯玉米品种进行了遗传多样性分析。

样品数量和SSR标记数的选择会影响分析结果，最终
确定样品和SSR标记后，采用多种遗传多样性分析方法进行数据处理和结果分析。

主
要包括遗传距离计算，聚类分析，主成分分析和群体结构分析等。

本研究的预计结果为：（1）糯玉米品种的SSR标记多态性，有利于选择良好的品种用于育种；（2）糯玉米品种的遗传多样性存在区域差异，准确定位不同区域的品种；（3）品种间的遗传关系可以为品种评估和育种选择提供依据；（4）最终可以为
我国的糯玉米遗传育种提供科学依据和措施，促进糯玉米的生产和发展。

以上就是本研究项目的开题报告，希望能够获得评审委员会的支持和指导，谢谢！。

SSR分子标记在玉米育种中的研究进展摘要简要介绍了SSR分子标记的原理及特点，综述了近年来SSR分子标记在玉米遗传多样性分析、杂种优势群的划分、品种纯度及真伪鉴定、遗传连锁图谱的构建及基因定位、单倍体育种、分子标记辅助选择育种中的研究进展及应用前景，以期为SSR分子标记技术在作物育种中的应用提供参考。

关键词SSR；分子标记；玉米；遗传育种中图分类号S513 文献标识码 A 文章编号1007-5739（2016）07-0015-02Abstract The principle and characteristics of SSR molecular marker were simply introduced，the research advances and application prospect of SSR molecular marker in maize breeding were summarized in past years，such as the analysis of genetic diversity，division of heterosis groups，the detection of the hybred purity and its authenticity，construction of genetic spectrum and gene locating，haploid breeding and selection breeding assisted by molecular markers，in order to provide reference for the application of SSR molecular markers in crop breeding.Key words SSR；molecular markers；maize；geneticbreeding在传统的培育玉米的过程中，选择的依据常为表型的性状，由于受环境等多方面的影响，该依据效率不高，有很多缺点。

ssr标记鉴定玉米品种亲子关系的研究
玉米（Zeamays）是一种世界上最重要的作物之一，它的种植
正在发展日趋先进的科学技术，使育种学家和种子生产商能够利用抗性基因来改良植物的表型。

在维持品种的稳定性的同时，了解农作物的亲子关系非常重要。

最近，利用SSR（simple sequence repeats）标记鉴定了玉米品种的亲子关系，为基于DNA技术研究品种数据库提供了一种有效的方法。

SSR分析可以准确测定不同品种的亲缘关系，而且主要针对多拷贝的DNA序列，从而可以有效地提高特定基因的位点标记的检测精度。

为了评估SSR技术应用于玉米品种鉴定的有效性，在本研究中，我们选择了20个水稻杂交组合，并使用7个常用SSR标记。

本研究中使用的所有标记位点均可以有效检测玉米品种间的遗传分化和亲
子关系，检测率都非常高，达到97.5%。

此外，两个品种中样本间SSR 分型的多样性证明了这种技术能够有效地检测和鉴定玉米品种间的
亲缘关系。

本研究的结果表明，使用SSR标记鉴定玉米品种的亲子关系是一种有效的方法，并且具有优良的可行性和高分辨率。

同时，这种技术还可以有效地筛选出优良的单系杂交种，作为育种的起点，以提高新品种的性能。

从了解品种亲缘关系的角度出发，现实中利用SSR技术来进行玉米品种鉴定具有重要意义，为工程应用提供了基础材料。

今后研究中，
将有更多的SSR标记开发，才能满足不同品种研究者对SSR技术应用的要求。

总之，利用SSR标记鉴定玉米品种亲子关系具有可行性和高精度，能够有效改善玉米作物的育种工作。

未来，这种技术将持续发展，会为育种和遗传研究带来更多机会和收获。

利用SSR荧光标记分析96份国内外玉米地方群体的遗传多样性玉米(Zea mays L.)是重要的饲料、粮食和T业原料作物,在国民经济发展中占有举足轻重的地位。

我国地方玉米种质资源丰富,它们对地方环境的适应性强、遗传基础丰富、含有众多可被利用的性状(如抗病、耐早、适应性强和品质较好等)。

研究国内外玉米OPV群体的遗传多样性,分析群体的遗传组成和基因频率的变化,研究种质演化,确定群体内的遗传变异和群体问的遗传关系,为建立我国玉米种质遗传脆弱性监测机制和体系探索技术途径;划分初级杂种优势群,研究优良地方品种与外引种质的关系,玉米合成复合群体提供依据。

主要研究结果如下1.基于荧光SSR片段分析技术,建立了对玉米群体混合取样进行基因频率分析的方法;2.STRUCTURE混合模型分析表明,96份供试群体可以分为7个亚群,并给出每个地方品种米源于各亚群的遗传构成;3.我国玉米地方品种经过长期的自然选择和人工选择,形成了遗传变异丰富的地方品种资源,地理来源与群体遗传结构分析结果不尽一致,玉米种质间有一定的等位基因伸进;4.部分地方品种与国外综合群体材料相比,遗传组成较为独特,基因频率受生态环境与人为选择影响,为发掘特定适应性的基因资源奠定了初期的研究基础。

SSR标记在玉米研究中的应用研究进展SSR（Simple Sequence Repeats）是一类分子标记，在玉米研究中被广泛应用于遗传多样性分析、种质资源评价、亲缘关系确定、基因定位与连锁图构建、优良品种选育等方面。

随着分子生物学、生物信息学和基因组学等领域的快速发展，SSR标记的应用也得到了不断加强和拓展。

一、遗传多样性分析遗传多样性是指种群或个体间基因型和表型的差异程度。

通过SSR标记的多态性分析，可以准确测定玉米种质资源的遗传多样性水平，评估品种的亲缘关系，为玉米育种提供依据。

通过分析遗传多样性，可以发现不同地理分布的玉米亚种之间的遗传差异，从而为玉米的种质创新和种质改良提供理论指导。

二、新品种选育在玉米育种中，新品种的选育需要对大量的种质资源进行筛选和评估。

SSR标记可以帮助鉴定表现良好的亲本，加速杂交配制和品质改良过程。

通过SSR标记与目标性状之间的关联分析，可以筛选出与特定性状相关的分子标记，缩短选育周期，提高选育效率。

SSR标记也可用于品种纯度鉴定和品种保护。

三、基因定位与连锁图构建SSR标记常用于基因定位和连锁图构建，有助于了解玉米基因组结构和基因座间的遗传距离。

通过标记与性状的关联分析，可以找出与目标性状相关的分子标记，进而鉴定和定位相应的基因。

SSR标记的高度多态性和均匀分布特性，为构建高密度的连锁图提供了可靠的工具，促进了玉米的分子遗传学研究。

四、种质资源评价SSR标记可以帮助对玉米种质资源进行鉴定和评价。

通过遗传多样性的分析，可以评估遗传资源的丰富性和多样性。

通过SSR标记的分析，可以揭示种质资源中的关联关系和遗传背景，为玉米育种提供合适的亲本材料和育种策略。

SSR标记在玉米研究中有着广泛的应用。

通过对遗传多样性的研究，可以了解玉米种质资源的多样性和遗传背景，为玉米育种提供理论依据。

通过与目标性状的关联分析，可以筛选出与特定性状相关的分子标记，加速选育过程。

通过基因定位和连锁图构建，可以了解玉米基因组结构和基因座间的遗传距离。

ssr分子标记技术及其在玉米种子鉴定上的应用随着现代农业的发展，种子质量的鉴定变得越来越重要。

其中，分子标记技术成为了种子鉴定的重要手段之一。

SSR分子标记技术是一种基于DNA序列多态性的分子标记技术，具有高度的稳定性、可重复性和高度的信息含量。

本文将介绍SSR分子标记技术及其在玉米种子鉴定上的应用。

一、SSR分子标记技术的基本原理SSR分子标记技术是基于DNA序列上短重复序列的多态性而开发的一种分子标记技术。

这些短重复序列通常为2-6个碱基的重复序列，如ATATAT、AGAGAG等。

在不同个体中，这些短重复序列的重复次数和排列方式不同，因此可以用作分子标记。

SSR分子标记技术的基本原理是：首先从待分析的DNA样品中提取出DNA，并使用PCR技术扩增出含有SSR位点的DNA片段。

然后，利用电泳技术将扩增出的DNA片段分离出来，并通过染色体特异性的显色剂进行染色。

最后，通过比较不同个体的DNA条带图谱，确定不同个体之间的遗传差异。

二、SSR分子标记技术在玉米种子鉴定中的应用SSR分子标记技术在玉米种子鉴定中的应用主要体现在以下几个方面：1.玉米品种的鉴定SSR分子标记技术可以通过比较不同玉米品种的DNA条带图谱，确定不同品种之间的遗传差异。

这种方法比传统的形态学鉴定方法更为准确和可靠。

2.杂交种子的鉴定杂交种子是由不同品种的玉米杂交而成的，因此杂交种子的遗传背景比较复杂。

使用SSR分子标记技术可以快速准确地鉴定杂交种子的亲本品种，有助于杂交育种的进展。

3.种子纯度的鉴定种子纯度是指种子中所含的杂质和其他品种的比例。

使用SSR分子标记技术可以准确地鉴定种子的纯度，有助于保证种子的品质和纯度。

4.种子存储的鉴定种子存储过程中，可能会发生一些突变和遗传变异，从而影响种子的品质和纯度。

使用SSR分子标记技术可以快速准确地鉴定种子存储过程中的遗传变异，有助于提高种子的品质和纯度。

三、SSR分子标记技术在玉米种子鉴定中的应用案例1.玉米品种的鉴定一项研究使用SSR分子标记技术对中国南方地区的20个玉米品种进行了鉴定。

作者简介：王若丁（1986—），女，硕士，研究实习员，研究方向为牧草研究、饲草栽培、分子标记辅助育种。

*通信作者：钟鹏（1978—），男，硕士，研究员，研究方向为作物育种与栽培。

SSR分子标记在玉米研究中的应用王若丁1,2，钟鹏1,2*，王建丽3，高海娟1,2，孙蕊1,2，李伟1,2，徐艳霞1，杨曌1，李莎莎1，王晓龙1，刘丽4（1.黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院，黑龙江齐齐哈尔161005；2.黑龙江省草原与牧草育种重点实验室，黑龙江齐齐哈尔161005；3.黑龙江省农业科学院草业研究所，哈尔滨150086；4.黑龙江省农业科学院克山分院，黑龙江克山161606）摘要：SSR 简单重复序列也称微卫星DNA ，是由特异性的引物进行PCR 扩增分析的一种分子标记技术。

简要介绍了SSR 分子标记的原理，分析了SSR 分子标记在玉米的种质资源、品种纯度鉴定、真伪鉴定、遗传多样性、种质性状等方面的应用。

通过研究表明：能够利用SSR 分子标记技术对玉米的品种纯度鉴定、真伪性鉴定、遗传结构、亲缘关系、优劣群体的划分、种质性状等方面进行分析，同时也能为以后研究玉米的遗传连锁图谱构建、分子标记辅助育种、基因定位和种质资源等方面提供参考。

关键词：SSR ；分子标记；玉米；遗传多样性中图分类号：S513文献标志码：A文章编号：1001-0084（2024）01-0076-05Application of SSR Molecular Markers inMaize ResearchWANG Ruoding 1,2,ZHONG Peng 1,2*,WANG Jianli 3,GAO Haijuan 1,2,SUN Rui 1,2,LI Wei 1,2,XU Yanxia 1,YANG Zhao 1,LI Shasha 1,WANG Xiaolong 1,LIU Li 4(1.Branch of Animal Husbandry and Veterinary Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences,Qiqihar 161005,Heilongjiang China;2.Heilongjiang Provincial Key Laboratory of Grassland and Forage Breeding,Qiqihar 161005,Heilongjiang China;3.Grassland Research Institute of Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences,Harbin 150086,China;4.Keshan Branch,Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences,Keshan 161606,Heilongjiang,China )Abstract:SSR (simple sequence repeat)is a molecular marker technology for PCR amplification analysis by specific primers,also known as microsatellite DNA.The principle of SSR molecular markers was introduced,and the application of SSR molecular markers in germplasm resources,variety purity identification,authenticity identification,genetic diversity and germplasm traits of corn was analyzed.The results showed that SSR molecular marker technology could be used to analyze the variety purity identification,authenticity identification,geneticstructure,genetic relationship,division of superior and inferior groups,germplasm traits and other aspects of corn,and also could provide references for future researches on the construction of genetic linkage map of corn,molecular marker-assisted breeding,gene mapping,germplasm resources and other aspects.Key words:SSR (simple sequence repeat);molecular markers;corn;genetic diversitiesDOI:10.20041/ki.slbl.2024.01.016问题探讨Problem Discussion1SSR简介SSR也称微卫星DNA，是一种通过特异性的引物进行PCR扩增分析的分子标记技术。