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一个巴西橡胶树过氧化物酶基因克隆与生物信息学分析邓玉杰;余海洋;张宇;王萌【期刊名称】《热带农业工程》【年(卷),期】2014(038)004【摘要】采用分子生物学和生物信息学技术,在橡胶树热研7-33-97的叶片中扩增了一个过氧化物酶基因的全长cDNA,命名为HbPRX2.该基因全长1 179 bp,5’端29 bp,3’端145 bp,阅读框1 005 bp,编码335个氨基酸.推导的氨基酸理论分子量34.85 u,等电点4.98.推导的氨基酸含有过氧化物酶蛋白特征性的Peroxidase4结构域.HbPRX2蛋白与巴西橡胶树HbPRX1、HbPRX42、拟南芥AtPER42和水稻OsPRX33的过氧化物酶蛋白相似性分别为63.22％、32.37％、33.73％和37.80％.生物信息学分析表明,橡胶树HbPRX2蛋白定位于分泌途径中,属于亲水性蛋白,性质稳定,在7-24、36-55、130-151和278-301氨基酸处具有跨膜结构域,在29-30氨基酸处具有信号肽结构.本研究为深入研究HbPRX2基因的结构与功能及其抗逆机制奠定基础.【总页数】8页(P1-8)【作者】邓玉杰;余海洋;张宇;王萌【作者单位】海南大学海南海口 570228;海南大学海南海口 570228;海南大学海南海口 570228;海南大学海南海口 570228【正文语种】中文【中图分类】S794.1【相关文献】1.巴西橡胶树LIM结构域基因克隆与生物信息学分析 [J], 吴瑞;朱家红;张全琪;张治礼2.巴西橡胶树β-木糖苷酶基因的克隆与生物信息学分析 [J], 古小玲;涂敏3.巴西橡胶树磷饥饿调控基因 HbPHR1克隆与生物信息学分析 [J], 高乐;覃怀德;何鹏;曾日中4.巴西橡胶树HbCXE1基因克隆及其生物信息学分析 [J], 陈月异;赵悦;田维敏5.巴西橡胶树Profilin基因克隆及生物信息学分析 [J], 李德军;刘向红;邓治因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
巴西橡胶树生长素响应HbJAR1基因克隆与表达分析Gene Cloning and Expression Analysis of AuxinResponsive HbJAR1 in Rubber TreeLI Xiaona1，XIAO Houzhen3，WAN Sanlian4，ZHANG Dong2，ZHANG Yu2 *1 Institute of Scientific and Technical Information，CATAS，Haikou，Hainan *****，China2 Hainan Key Laboratory for Sustainable Utilization of Tropical Bio-resources / College of Tropical Agriculture and Forestry，Hainan University，Haikou，Hainan *****，China3 College of Materials and Chemical Engineering，Hainan University，Haikou，Hainan *****，China4 Sanya City Modern Agricultural Inspection and Warning Center for the Prevention and Control，Sanya，Hainan *****，ChinaAbstract JAR1，a auxin response gene，maintains dynamic balance of auxin concentration in plant，strengthens plant tolerance ability stress. To clarify the gene structure and function of JAR1 in rubber tree（Hevea brasiliensis Müll. Arg.），HbJAR1 gene was cloned in the leaves of rubber tree CATAS7-33-97 by RT-PCR. The deduced amino acid of HbJAR1 protein has special GH3 superfamily domain structure，no signal peptide，no transmembrane region，located in the cytoplasm. The gene expression of HbJAR1 in the leaves of rubber tree was significantly affected by light intensity，mechanical wounding and powdery mildew infection. IAA，GA3，ET，JA and ABA treatments alsoinduced HbJAR1 expression at different levels. The results suggested that HbJAR1 is a member of plant JAR1 gene family，involved in stress response such as light and wounding signal in rubber tree，etc.Key words Hevea brasiliensis Müll. Arg.；HbJAR1；gene clone；bioinformatics；expression analysisdoi 10.3969/j.issn.1000-2561.2017.08.017JAR1（*****TE *****NT 1）基因是植物生长素早期响应基因之一，这类基因与植物的生长发育密切相关。
巴西橡胶树HbDRM的克隆与表达分析汪晗;李辉亮;杨子平;郭冬;彭世清【摘要】运用PCR和RACE技术从巴西橡胶树中克隆出了一个域重排甲基转移酶(Domains rearranged methyltransferase,DRM)基因(HbDRM).HbDRM全长为2 245 bp,含有1 917 bp的阅读框,145 bp的5'-UTR和176 bp 3'-UTR,编码638个氨基酸,分子量为71.39 ku,等电点为4.90.HbDRM的氨基酸序列与可可、葡萄、黄瓜、鹰嘴豆、番茄、拟南芥DRM家族成员的同源性分别为77％、74％、72％、67％、64％和52％.定量RT-PCR分析表明HbDRM在巴西橡胶树的根、树皮、叶、花、胶乳、胚和愈伤组织中均有表达,其中在花和愈伤组织中表达量较高,在胶乳中表达量最低,此外HbDRM在橡胶树自根幼态无性系的胶乳中表达比其供体胶乳中的表达低.HbDRM的克隆和表达分析为下一步研究HbDRM在巴西橡胶树自根幼态无性系高产中的作用打下基础.【期刊名称】《热带作物学报》【年(卷),期】2014(035)007【总页数】6页(P1341-1346)【关键词】巴西橡胶树;域重排甲基转移酶;DNA甲基化;自根幼态无性系;克隆与表达【作者】汪晗;李辉亮;杨子平;郭冬;彭世清【作者单位】海南大学农学院,海南海口570228;中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室海南海口571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室海南海口571101;海南大学农学院,海南海口570228;中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室海南海口571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室海南海口571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室海南海口571101【正文语种】中文【中图分类】S794.1doi 10.3969/j.issn.1000-2561.2014.07.016表观遗传是指不因DNA序列的变化而形成的基因功能的改变，这种改变又可随细胞的有丝分裂和/或减数分裂遗传下去的现象[1]。
巴西橡胶树HbbHLH转录因子的克隆及表达研究的开题报告研究背景和意义：巴西橡胶树是一种重要的能源作物，其乳胶含有丰富的橡胶，被广泛用于制造橡胶制品。
而橡胶树在生产过程中存在许多问题，如病虫害的影响、产量的不稳定性等，这些问题直接影响着其生产效益。
因此，对橡胶树的研究具有重要意义。
植物中的基因调控对植物的生长发育、适应环境等具有重要作用。
转录因子作为基因调控的重要参与者，在植物中发挥着重要的调控作用。
目前已经有许多植物转录因子基因的研究成果，但是，在巴西橡胶树中，转录因子基因的研究还相对较少。
本研究将克隆巴西橡胶树HbbHLH基因，并研究其在橡胶树生长发育过程中的表达情况和调控作用，为进一步了解橡胶树的基因调控机制提供一定的理论支持。
研究内容：1、克隆巴西橡胶树HbbHLH基因；2、对HbbHLH基因进行序列分析；3、利用RNA-Seq等方法研究HbbHLH基因在不同生长期巴西橡胶树中的表达情况；4、利用VIGS等技术研究HbbHLH基因在橡胶树生长发育过程中的调控作用；5、分析HbbHLH基因的生物学功能和作用机制。
研究方法：根据大豆bHLH基因家族设计一对引物，通过RT-PCR方法进行HbbHLH基因的克隆。
利用SMART软件对HbbHLH基因序列进行分析。
运用qRT-PCR和RNA-Seq方法研究HbbHLH基因在不同生长阶段巴西橡胶树中的表达情况。
利用VIGS等技术研究HbbHLH基因在橡胶树生长发育过程中的调控作用。
预期结果：1、成功克隆巴西橡胶树HbbHLH基因；2、获得HbbHLH基因的完整序列；3、揭示HbbHLH基因在橡胶树生长发育过程中的表达情况和调控作用；4、分析HbbHLH基因的生物学功能和作用机制。
研究展望：本研究有望为巴西橡胶树的基因调控研究提供理论支持，为橡胶树的生产提供技术支持，对于推动巴西橡胶树的发展具有重要意义。
同时，本研究对于植物基因调控研究也会具有一定的参考价值，有利于进一步深入了解植物的基因调控机制。
巴西橡胶树FERONIA类受体激酶基因HbFER的克隆及表达分析作者：王凉洁等来源：《热带作物学报》2014年第07期摘要植物受体类激酶在植物的生长发育和抗逆等生理过程中起着重要作用。
在橡胶树转录组测序的基础上，通过RACE技术和RT-PCR方法，扩增得到橡胶树的一个类受体激酶基因的全长，命名为HbFER。
该片段包含1个2 679 bp的开放阅读框，可编码892个氨基酸。
生物信息学分析结果表明：该氨基酸序列与拟南芥、番茄、甘蓝和杨树的FER蛋白高度同源，其同源性分别为74.5%、74.7%、73.4%、82.9%。
HbFER蛋白除了含有Malectin_like和PTKc 结构域外，还含有1个信号肽（含22个氨基酸）和2个跨膜结构域。
半定量分析结果表明，HbFER基因在不同组织中的表达水平存在差异，叶片和花中的表达丰度最高，胶乳中的表达丰度最低，且该基因在叶片中的表达受植物激素水杨酸的诱导。
关键词巴西橡胶树；FERONIA类受体激酶；表达分析中图分类号 S794.1 文献标识码 AAbstract The receptor-like kinases play important roles in the physiological processes of plant growth and stress resistances. Based on the result from the transcriptome sequencing and the data of RNA-Seq analysis in Hevea brasiliensis，the homolog of rubber FERONIA was cloned by RT-PCR and RACE named as HbFER. The sequencing result showed that the ORF of HbFER is 2 679 bp，encoding an 892 amino acids peptide with a 24 aa signal peptide， two transmembrane domains and two conserved domains， Malectin_like and PTKc， similar with FER from other plants. Bioinformatics analysis showed that the amino acid sequence of the HbFER is 74.5%， 74.7%，73.4%and 82.9% similar with that of FER from Arabidopsis thaliana， Solanum lycopersicum，Brassica oleracea and Populus tomentosa， respectively. Semi-quantitative RT-PCR analysis showed that the expression level of HbFER is significantly higher in leaves and flowers than in other tissues. Additionally phytohormone salicylic acid can induce the expression of HbFER in the leaf.Key words Hevea brasiliensis；FERONIA-like RLK；Expression assaydoi 10.3969/j.issn.1000-2561.2014.07.017作为细胞表面受体，类受体激酶（Receptor-like kinases，RLKs）在植物生长发育、器官生成及在抵抗环境胁迫和抗病免疫反应中起着重要作用[1-5]。
热带作物学报2021, 42(9): 2451 2457 Chinese Journal of Tropical Crops收稿日期 2020-11-04；修回日期 2021-01-21基金项目 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项（No. 1630022020010）；国家天然橡胶产业技术体系（No. CARS-34-GW5）。
作者简介 张议文（1996—），女，硕士研究生，研究方向：作物生理与分子生物学。
*通信作者（Corresponding author ）：袁 坤（YUAN Kun ），E-mail ：******************。
巴西橡胶树氰丙氨酸合成酶基因HbCAS 的克隆与表达分析张议文1，刘 辉2，冯成天2，胡义钰2，王真辉2，袁 坤2*1. 海南大学热带作物学院，海南海口 570228；2. 中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室，海南海口 571101摘 要：氰丙氨酸合成酶（β-cyanoalanine synthase ，β-CAS ）是植物氰化物解毒的关键酶，在调节植物生长发育及逆境胁迫中扮演重要角色。
本研究从巴西橡胶树中克隆氰丙氨酸合成酶基因HbCAS ，并对其进行分析。
结果表明：HbCAS 基因开放阅读框长为1113 bp ，编码370个氨基酸，其理论分子量为40.15 kDa ，等电点为8.90，属于色氨酸合成酶超家族。
实时荧光定量PCR 分析结果显示，HbCAS 基因在橡胶树各种组织中均有表达，其中在胶乳中的表达量最高。
同健康树相比，HbCAS 基因在死皮树中的表达显著下调。
过氧化氢及乙烯利、茉莉酸甲酯、水杨酸及脱落酸等多种激素均能调控HbCAS 基因的表达。
同时，HbCAS 基因的表达也受干旱、低温、甲基紫精、高盐等多种非生物胁迫调节。
本研究结果揭示HbCAS 基因可能在橡胶树死皮发生、活性氧信号、激素调节及多种非生物胁迫应答中起重要作用。
橡胶树中碱性转化酶基因HbNIN8的克隆与表达分析阳江华;龙翔宇;邹智;秦云霞【摘要】蔗糖是高等植物光合产物的重要存储方式,而转化酶和蔗糖合酶是水解蔗糖的主要酶.研究基于橡胶树的基因组和转录组数据,采用RT-PCR技术克隆到一个中碱性转化酶基因HbNIN8的全长cDNA.该基因预测编码630个氨基酸.同源和亚细胞定位分析表明,HbNIN8属于α 类中碱性转化酶,叶绿体定位.应用毕赤酵母真核表达获得其重组蛋白,分析了其酶活性特点,HbNIN8在毕赤酵母中重组蛋白的最适pH为7.5,最适温度为45℃.实时荧光定量PCR分析表明,HbNIN8主要在叶片中表达,其表达量随着叶片的成熟而逐渐增加,在稳定期叶片中达到最大,在成熟叶片中,HbNIN8的表达呈现明显的昼夜差异,晚上的表达水平相对高于白天.因此,HbNIN8很可能是负责将叶绿体中的蔗糖水解为单糖,从而调控橡胶树叶绿体内蔗糖和淀粉的分配.【期刊名称】《热带作物学报》【年(卷),期】2018(039)012【总页数】6页(P2421-2426)【关键词】巴西橡胶树;中碱性转化酶;HbNIN8;叶绿体【作者】阳江华;龙翔宇;邹智;秦云霞【作者单位】中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室,海南海口 571101;中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室,海南海口 571101;中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室,海南海口 571101;中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室,海南海口 571101【正文语种】中文【中图分类】S794.1蔗糖是植物光合作用的主要产物，其在植物生长发育、信号传导和胁迫应答过程中发挥重要作用。
巴西橡胶树抗坏血酸过氧化酶基因HbAPX的克隆及其对水杨酸的应答罗红丽;闫志烨【期刊名称】《热带生物学报》【年(卷),期】2011(002)003【摘要】在对橡胶树转录组进行测序的基础上,利用模式植物中抗坏血酸过氧化物酶(Ascorbate peroxidase,APX)基因的氨基酸序列进行比对并设计引物,通过RT-PCR方法扩增巴西橡胶树APX基因的cDNA片段,命名为HbAPX.该片段包含1个858核苷酸的开放阅读框,编码285个氨基酸的多肽.生物信息学分析结果表明,该蛋白氨基酸序列与麻风树(Jatropha curcas)的APX高度同源,同源性达90％,与杨树(Populus tomentosa)、陆地棉(Gossypium hirsutum)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)的APX同源性均在80％以上,并含有Ascorbate peroxidase保守结构域.系统发育分析结果显示,HbAPX属于过氧化酶体型APX.定量分析结果表明,该基因的表达受水杨酸(SA)的诱导,可能与植物的过敏反应(HR)和系统获得抗性(SAR)相关.【总页数】7页(P197-203)【作者】罗红丽;闫志烨【作者单位】海南大学海南省热带作物资源可持续利用重点实验室,海南海口570228;海南大学海南省热带作物资源可持续利用重点实验室,海南海口570228【正文语种】中文【中图分类】Q785【相关文献】1.柠条锦鸡儿抗坏血酸过氧化物酶基因(CkAPX)和谷胱甘肽还原酶基因(CkGR)cDNA片段的克隆及表达分析 [J], 康太;武宏豆;逯佰艳;龙晓刚;龚春梅;白娟2.条斑紫菜抗坏血酸过氧化酶基因的克隆及生物信息学分析 [J], 陈旸升;席海秀;佟少明;侯和胜3.香蕉NPR1基因片段的克隆及对水杨酸的早期应答反应 [J], 李敏;李胜军;裴新梧4.巴西橡胶树冷应答基因HbCOR47的鉴定与表达分析 [J], 程汉;陈相;黄华孙5.牦牛谷胱甘肽过氧化酶1基因(GPX1)的克隆及系统发育分析 [J], 李瑞哲;徐惊涛;马志杰;孙永刚;韩银仓;陈生梅因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
