环状RNA研究进展_付海璐
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环状RNA在肿瘤领域中的研究进展刘欢妹; 靖长友; 张曙光; 王雪; 张鑫鑫; 于胜吉【期刊名称】《《癌症进展》》【年(卷),期】2019(017)022【总页数】5页(P2612-2616)【关键词】环状RNA; 非编码RNA; 肿瘤; miRNA海绵; 乳腺癌【作者】刘欢妹; 靖长友; 张曙光; 王雪; 张鑫鑫; 于胜吉【作者单位】国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院骨科北京1000210【正文语种】中文【中图分类】R730.2环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类以共价键结构形成,不具有3'和5'末端头尾结构的环状长链非编码RNA。
circRNA因其闭环环状结构对核酸外切酶具有较高的耐受性,不易被降解,因此,可稳定存在于真核生物细胞的细胞质中。
1976年,Sanger等[1]利用电子显微镜首先在植物感染的病毒颗粒中观察到了共价闭合环装RNA分子,并将其命名为circRNA。
circRNA最初被认为是RNA剪接过程中产生的无功能产物。
随着高通量测序技术和生物信息学的发展,circRNA 在基因转录、转录后修饰及翻译调控中的作用逐渐被证实。
circRNA在神经系统疾病、心血管疾病和肿瘤等领域均积累了一定的研究成果,这提示circRNA具有疾病特异性。
乳腺癌、肝癌、胶质瘤和结直肠癌等恶性肿瘤中均存在circRNA的异常表达,circRNA可成为潜在的肿瘤疾病诊断指标和治疗靶点。
本文就circRNA的生物学特征及其在肿瘤领域的研究进展进行综述。
1 circRNA 的生成与降解circRNA是由特殊的前体mRNA通过可变剪接产生的。
根据前体mRNA的不同,circRNA可分为外显子circRNA、内含子circRNA、外显子-内含子circRNA和基因间型circRNA[2]。
外显子circRNA的形成机制为套索驱动的环化和内含子配对驱动的环化[3],前者是指一个外显子的3'剪接供体与另一个外显子的5'剪接受体共价结合后切除内含子,然后形成circRNA;后者是指由两个内含子先通过碱基互补配对形成环状结构,再切除内含子,最后形成circRNA。
环状RNA研究进展综述目录一、内容简述 (2)1. 环状RNA的定义与特点 (2)2. 环状RNA的研究意义 (3)二、环状RNA的发现与分类 (4)1. 环状RNA的发现历程 (5)2. 环状RNA的分类方法 (6)根据来源分类 (7)根据结构特征分类 (8)三、环状RNA的形成机制 (9)1. RNA聚合酶的作用 (10)2. 内含子剪接与外显子剪接 (12)3. 环状RNA的稳定性与调控 (13)四、环状RNA的功能与应用 (15)1. 基因表达调控 (16)作为ceRNA调控基因表达 (18)通过snoRNA介导的基因沉默 (19)2. 蛋白质相互作用与信号传导 (20)3. 环状RNA在疾病中的作用 (22)五、环状RNA的研究技术与方法 (23)1. 文库构建与测序技术 (25)2. 表观遗传学修饰分析 (26)3. 蛋白质相互作用研究 (27)4. 功能研究方法 (28)六、环状RNA的研究挑战与未来展望 (30)1. 研究面临的挑战 (32)环状RNA的稳定性和丰度问题 (33)环状RNA的生物学功能研究 (34)2. 未来发展方向 (36)深入挖掘环状RNA的生物学功能 (37)开发新的环状RNA研究技术 (38)七、结论 (40)1. 环状RNA研究的重要成果 (41)2. 对未来环状RNA研究的展望 (43)一、内容简述环状RNA(Circular RNA,简称circRNA)是一类具有特殊结构特征的非编码RNA分子,其特点是含有连续的反向互补序列(即环形结构),并且广泛存在于真核生物的细胞核和细胞质中。
随着高通量测序技术和生物信息学的快速发展,circRNA的研究取得了显著进展,成为了生物学领域的研究热点。
circRNA在基因表达调控、蛋白质相互作用、信号通路传导以及疾病发生发展等多个层面发挥着重要作用。
与线性RNA相比,circRNA 具有更稳定的结构、更长的半衰期以及更高的丰度,因此成为了研究基因表达和功能的新视角。
环状RNA的研究进展
肖时曦;王涛
【期刊名称】《岭南现代临床外科》
【年(卷),期】2017(017)001
【摘要】环状RNA(circular RNA,circRNA)又称环形RNA,是新近确认的一类特殊的非编码RNA(ncRNA),主要由外显子和(或)内含子构成.近年来研究发现,在某些疾病(如肿瘤、动脉粥样硬化、糖尿病、神经系统疾病)的发生发展过程中circRNA 起着重要的调控作用,这不仅使我们对环状RNA有了更好认识,而且在某些疾病的诊断、治疗及预防方面也为我们提供了新的研究方向.
【总页数】6页(P122-127)
【作者】肖时曦;王涛
【作者单位】421001 湖南衡阳南华大学医学院;518000 广东深圳深圳市孙逸仙心血管医院;518036 广东深圳北京大学深圳医院
【正文语种】中文
【中图分类】R34
【相关文献】
1.结直肠癌与环状RNA相关性研究进展 [J], 李婧;马燕渝;吴多;陈梓焜;莫雪妮
2.新型肿瘤靶标环状RNA的研究进展 [J], 徐昊;方梦蝶;李超;刘宸;任娟;张衍梅
3.环状RNAs在前列腺癌中的研究进展 [J], 冯天瑞;严维刚
4.环状RNA在衰老及衰老相关疾病中的研究进展 [J], 张林;何旭
5.环状RNA在眼部疾病中的研究进展 [J], 邹丽荣;王欣玲
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环状RNA在肿瘤中的研究进展苏文;杨宏宇【摘要】环状RNA是一种自然发生的具有广泛性和多样性的内源性非编码RNA.它们通常是稳定、丰富及保守的RNA分子,并表现出组织的特异性表达.环状RNA 通常起到microRNA海绵、RNA结合蛋白隔离剂和转录调节因子的作用.大量证据表明环状RNA可参与关键基因的转录和翻译等过程从而调控肿瘤的发生、进展和预后.而在唾液、外泌体和临床标准血样中检测出特异性环状RNA,将使它们成为肿瘤的潜在诊断或预测生物标志物.【期刊名称】《基础医学与临床》【年(卷),期】2019(039)003【总页数】5页(P409-413)【关键词】环状RNA;基因调控;肿瘤;靶向治疗【作者】苏文;杨宏宇【作者单位】北京大学深圳医院口腔颌面外科,广东深圳518036;安徽医科大学,安徽合肥230032;北京大学深圳医院口腔颌面外科,广东深圳518036;安徽医科大学,安徽合肥230032【正文语种】中文【中图分类】R730.231人类转录组基因是复杂多样的,其中包括10 000~32 000个长链非编码RNA(lncRNAs)、大约9 000个小RNA、约11 000个伪基因和接近21 000个编码蛋白mRNA[1]。
这表明人类基因组中很大一部分被转录成非编码RNA。
环状RNA (circular RNA,circRNA)是一类不具有5′末端帽子和3′末端poly(A)尾巴结构,并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。
有证据表明环状RNA是内源性、稳定、丰富和保守的RNA分子,在真核细胞中具有细胞类型或发育阶段特异性的表达模式[2]。
环状RNA的形成可发生在基因的区域或基因间区域,长度范围从几百到数千个核苷酸不等。
由于结构特异性和低丰度的特点,环状RNA是RNA的异常剪接产物或有机体中的“暗物质”[1]。
近年来,随着分子纯化方法与高通量测序技术的发展以及对数据计算分析的改进,这些“暗物质”逐渐被发掘并成为研究非编码类RNA的热点领域。
综述环状RNA在感染性疾病中的研究进展•1320 •医学研究生学报 2020 年 12 月第 33 卷第 12 期J Med Po取m,Vol.33, No.12, December, 2020黄纪综述,李瑞曦,徐军发审校[摘要]随着基因测序技术和生物信息分析技术的快速发展,被忽略近20年的环状KNAUkRNA)再度成为研究热点。
circRNA在生物体内广泛表达,具有高度的稳定性、特异性和保守性等特性,其生物学功能包括竞争性结合miRNA、调控基因表达、与RNA结合蛋白互作、编码蛋白等,在疾病的诊断和治疗方面应用潜力巨大。
文章总结circRNA在肺结核、病毒性肝炎、艾滋病等感染性疾病中的研究,为circRNA在感染性疾病的基础研究、临床庇用等方面提供理论依据:[关键词]环状RNA;感染性疾病;肺结核;病毒性肝炎;艾滋病[中图分类号]K521 [文献标志码]A[文章编号]1008-8丨99 (2020) 12-1320-06[DOI] 10.16571/ki. 1008-8199.2020.12.018Progress of circular RNA in infectious diseasesHUANG Ji reviewing, LI Rui-xi, XU Jun-fa checking(Institute o f Laboratory Medicine, Guangdong Medical University, Dongguan523808, Guangdong, China)[Abstract ] With the rapid development of gene sequencing technology and bioinformatics analysis technology, circRNA, which has been neglected for nearly 20 years, has become a research hotspot again. CircRNA is widely expressed in organisms with high stability, specificity and conservatism, and its biological functions include competitive binding t)f miRNA, regulation of gene expression, interaction with RNA-binding proteins, protein coding, etc., it has great potential in the diagnosis and treatment of diseases. This paper will summarize the research of circRNA in infectious diseases such as pulmonary tuberculosis, viral hepatitis and acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) , and provide theoretical basis for the basic research and clinical application of circRNA in infectious diseases.[Key words ] circRNA;infectious diseases;pulmonary tuberculosis;viral hepatitis;AIDS〇引言环状RNA 分子(circular RNA, circRNA)是一类在哺乳动物中广泛存在的,具有共价闭环结构的 非编码 RNA(non-coding RNA,ncRNA),其结构稳 定、高度保守,具有组织特异性和发育阶段特异性、比线性R N A更稳定等特点,广泛参与人类的生理和 病理过程,其生物学功能非常复杂,包括作为微小 RNA(microRNA,m iRNA)海绵调控靶 miRNA 的作 用、调控基因表达、与RN A结合蛋白互作、编码蛋白 等重要功能n。
中国兽医科学 2021,51 (03):349-355Chinese Veterinary Science网络首发时间:2020-12-25D O I:10.16656/j.issn. 1673-4696.2021.0027 中图分类号:S855.2 文献标志码:A文章编号:1673-4696 (2021) 03-0349-07环状RNA及其研究进展孔德来>,2,朱一帆i翟文俊郭爱珍,陈颖钰(1.华中农业大学农业微生物学国家重点实验室,湖北武汉430070;2.华中农业大学动物医学院,湖北武汉430070;3.国家动物结核病专业实验室(武汉),湖北武汉430070;4.农业农村部部兽用诊断制剂创制重点实验室,湖北武汉430070:5.农业农村部反刍动物生物制品重点实验室,湖北武汉430070;6.湖北省兽医流行病学国际科技合作基地,湖北武汉430070)摘要:环状RNA是非编码RN A家族的重要成员之一,广泛存在于真核生物内,并参与多种疾病的发生发展。
本文就环状RN A的生物学特征、功能及其在畜牧兽医和人类疾病如结核病领域的研究进展进行综述,并分析了环状RNA的未来研究方向和亟待解决的一些问题,期望能为相关研究提供有价值的参考。
关键词:环状RNA;非编码RNA;调节;疾病;转录;结核病Research progress on circular RNAKONG De-lai12,ZHU Yi-fan1-2 ,ZHAI Wen-junl 2,GUO Ai-zhen1^* ,CHEN Ying-yu1"6*(1. State Key Laboratory of A gricultural Microbiolog) ,Huazhong Agricultural University,Wuhan A20070,China ;2. CollegeofVeterinan, Medicine ,Huazhong Agricultural University ^Wuhun 430070 .China;3.National Animal TuberculosisPara-Reference Laboratory (Wuhan) ,Huaz h ong Agricultural University ,Wuhan 430070, China;4. Key Lab o rator) of Development of Veterinary Diagnostic Products ,Minis t r y of A griculture and Rural Affairs of China, Wuhan430070, C/ima;5.Key Laboratory of Ruminant Bio—products t Ministry of A griculture and Rural Affairs of China, Wuhan430070 .China;6.Hubei International Scientific and Technological Cooperation fiase of Veterinary Epidemiology% Wuhan 430070, China)Abstract:Circular RNA (circRNA) is oneof themost significant members of non-coding RNAsthatex- ists widely in eukaryotes and takes part in the genesis and development of various diseases. This paper provides an overview of the recent progresses of circRNAs in biological features functions,involvement in the areas of animal science and veterinary medicine and human diseases such as tuberculosis. In addition,the future directions and some critical issues remained to be resolved were proposed. It was aimed to provide a good reference to the colleagues interested in this area.Key words:circular RNA;non-coding RNA;regulation;diseases;transcription;tuberculosis* Corresponding authors:CHEN Ying-yu,E-mail :chenyingyu@mail. hzau. edu. cn;GU0 Ai-zhen,E-mail :****************环状RNA(circular RNA,circRNA)是真核生物 的稳定性以及时空和组织特异性。
环状RNA(circRNA)在肿瘤中的研究进展鲁菱娇;张艳亮【摘要】环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新发现的具有特殊结构的非编码RNA(non coding RNA,ncRNA),其在真核生物中广泛表达,并广泛存在于细胞胞浆内.circRNA具有跨物种保守性,且在体内表达具有时间、空间特异性.circRNA 大多数是由蛋白编码基因的外显子可变剪接产生的共价闭合环状结构,并且circRNA对核酸酶不敏感,因此比线性RNA更稳定.研究表明,circRNA具有miRNA海绵样作用,可抑制miRNA活性,阻断miRNA对其靶标的抑制作用,从而调控其他相关RNA的表达.此外,circRNA还能与RNA结合蛋白结合,调控基因的表达.基于circRNA的稳定性、时空表达特异性及参与基因的调控等特性,使得circRNA有望成为肿瘤诊断的生物学标志物或肿瘤治疗的潜在靶点.本文将对现阶段circRNA在肿瘤方面的研究进展作一综述.【期刊名称】《实验与检验医学》【年(卷),期】2017(035)006【总页数】4页(P823-826)【关键词】环状RNA(circRNA);竞争性内源RNA(ceRNA);肿瘤;肿瘤标志物【作者】鲁菱娇;张艳亮【作者单位】昆明医科大学第一附属医院检验科,云南昆明 650032;昆明医科大学第一附属医院检验科,云南昆明 650032【正文语种】中文【中图分类】Q522;R730.43引言环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种具有环形结构的特殊非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)。
上世纪的70年代,人们在研究RNA病毒时发现了环状RNA[1,2]。
然而,在circRNA被发现后的很长一段时间里,由于检测技术的限制,能检测出的circRNA量非常少,因此circRNA并未引起人们的重视。
随着高通量测序技术的出现,人们通过测序检测到了各种生物体内表达的circRNA的数量实际上是非常庞大的,甚至超过相应线性RNA的10倍之多。
环状RNA的研究进展靳也;郭杰;魏福兰【摘要】共价闭合的环状RNA(circular RNA,circRNA)主要是由真核生物中数千种基因的外显子的前体mRNA的3'和5'端反向剪接而成,是区别于大多数线性RNA的一类特殊的非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA).由于其结构的特殊性,circRNA具有高度的保守性和稳定性,使其具有许多潜在的功能,例如充当微小RNA(microRNA,miRNA)或者RNA结合蛋白(RNA binding protein,RBP)的海绵.该文主要论述circRNA的发现、特征、形成、分类和主要功能以及在疾病方面的研究进展.【期刊名称】《口腔医学》【年(卷),期】2019(039)005【总页数】5页(P450-454)【关键词】环状RNA;非编码RNA;microRNA海绵;可变剪接【作者】靳也;郭杰;魏福兰【作者单位】山东大学口腔医学院口腔组织再生重点实验室,山东济南 250012;山东大学口腔医学院正畸科,山东济南 250012;山东大学口腔医学院口腔组织再生重点实验室,山东济南 250012;山东大学口腔医学院正畸科,山东济南 250012;山东大学口腔医学院口腔组织再生重点实验室,山东济南 250012;山东大学口腔医学院正畸科,山东济南 250012【正文语种】中文【中图分类】R34环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类广泛存在于各种生物中的特殊的非编码RNA(noncoding RNA, ncRNA)[1]。
与正常线性RNA不同,它的3'和5'末端连接在一起形成共价闭合环状结构,这使得他们更加稳定和保守[2]。
最初circRNA在植物类病毒中被发现[3],随后的几十年中又在病毒和真核细胞中被发现。
刚开始它被认为是一种错误剪接形成的产物,因此没有引起人们的广泛关注,然而近几年新一代测序技术的出现和生物信息学的发展,有学者发现circRNA是细胞基因表达的一种普遍形式[4]。