疑似致病基因突变的解读

最新：卵巢癌的筛查和预防卵巢是女性生殖系统的一对器官，位于子宫两侧，可产生卵子，并分泌雌激素和孕激素。

当卵巢或输卵管细胞生长失去控制，则导致卵巢癌。

在我国，卵巢癌年发病率居女性生殖系统肿瘤第3位，位于子宫颈癌和子宫体恶性肿瘤之后，呈逐年上升趋势，且死亡率位于女性生殖道恶性肿瘤之首，严重威胁女性健康。

卵巢恶性肿瘤包括多种病理类型，其中最常见的是上皮性癌，约占卵巢恶性肿瘤的70%，其次是恶性生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤，约各占20%和5%。

上皮性卵巢癌的5个主要亚型为：高级别浆液性癌（HGSC）、子宫内膜样癌、透明细胞癌、黏液癌和低级别浆液性癌（LGSC）。

哪些人群应进行卵巢癌筛查？筛查前，需要先搞清楚高危人群有哪些？卵巢癌（包括上皮性卵巢癌、输卵管癌及原发性腹膜癌）的高危人群包括：遗传性乳腺癌-卵巢癌综合征（即BRCA1或BRCA2胚系致病变异或疑似致病变异）患者；携带RAD51C或RAD51D或BRIP1胚系致病变异或疑似致病变异者；林奇综合征（遗传性非息肉病性结直肠癌综合征）患者；一级亲属确诊上述遗传性肿瘤综合征或携带上述致病或疑似致病基因，而未行或拒绝检测者；卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌、胰腺癌家族史或子宫内膜癌、结直肠癌及其他林奇综合征相关肿瘤家族史经遗传咨询、风险评估建议接受基因检测而未行或拒绝检测者；具有显著的卵巢癌及相关肿瘤家族史（多人发病），虽经遗传基因检测，家族患病者中未检出已知致病或疑似致病者（注：目前的基因检测及数据解读仍具有局限性）。

《居民常见恶性肿瘤筛查和预防推荐（2021版）》筛查建议：不推荐对无症状、非高危女性进行卵巢癌筛查。

推荐对尚未接受预防性输卵管-卵巢切除手术的上述高危女性进行定期筛查，以期早期发现卵巢癌，但目前尚缺乏卵巢癌筛查给高危女性人群带来临床获益的证据。

根据临床医生判断，30-35岁的高危女性可以考虑接受定期的卵巢癌筛查；筛查项目：血清CA12-5检查及经阴道超声检查（已婚女性）；筛查间隔：每3个月1次到每年1次；此外，已经出现腹胀、腹痛、阴道不规则出血等症状的女性，不在筛查探讨的范畴内，应尽早就医。

常见的基因检测技术及应用考核试题本次考核共计70题，单选35道（1分/道），多选35道（2分/道），满分105分1、以下哪些关于MLPA检测的描述是正确的？A、可以检测到单亲二倍体和嵌合体B、是一种针对待检DNA序列进行定性和半定量分析的新技术。

(正确答案)C、不会有假阳性结果D、样本DNA含量极少或纯度低也不会对实验结果造成影响答案解析：多重连接探针扩增技术（multiplex ligation-dependent probe amplification ,MLPA）于2002年由Schouten等首先报道，是近几年发展起来的一种针对待检DNA序列进行定性和半定量分析的新技术。

可以选B。

但是MLPA技术也有局限性，1：MLPA用于检测基因的缺失或重复，不适合检测未知的点突变类型，不能检测染色体的平衡易位和单亲二倍体；2：引物附近的点突变或SNP可能影响探针结合，可能造成缺失假阳性，故请结合测序结果或qPCR分析；3：如果样本DNA含量极少或纯度低可能会对实验结果造成影响。

因此，ACD不能选。

2、遗传病基因组序列本身上的主要变异形式不包括哪种？A、点突变B、染色体畸变C、外显子缺失重复D、甲基化异常(正确答案)答案解析：遗传病主要的变异形式，大（CNV、UPD、倒位、易位等），中（基因及外显子缺失重复、基因融合）小（SNV、indel，动态突变等）3、核型分析是以细胞分裂那个时期的染色体为研究对象？A、前期B、后期C、中期(正确答案)D、末期答案解析：处于细胞分裂中期的细胞所有的染色体都整齐地排列在赤道板上，与其他时期相比，染色体的形态更稳定、数目更清晰，染色体数目一旦发生变化，在中期是最容易看出来的，误差也小4、核型分析最大缺点是什么A、辨率不足，只能检测5M以上的变异(正确答案)B、检测不了倒位C、检测不了易位D、价格昂贵答案解析：核型分析作为传统最早被应用于检测染色体变异的技术，最大的缺点是分辨率不足，只能检测>4-5M以上的染色体层面的变异5、哪项检测方法需要培养细胞？A、核型分析(正确答案)B、FISHC、CMAD、CNVseq答案解析：核型分析以细胞分裂中期的染色体为研究对象，需要培养细胞6、哪项检测方法不需要探针？A、MLPAB、CMAC、FISHD、CNVseq(正确答案)答案解析：CNVseq是全基因组低深度扫描，不需要探针捕获7、CNVseq的技术原理是什么？A、目标区域捕获B、全基因组测序(正确答案)C、探针杂交D、G带显色答案解析：CNVseq是全基因组低深度扫描，不需要探针捕获和杂交；WES及Panel检测需要目标区域探针捕获；FISH和CMA需要探针杂交；G带显色是核型分析技术原理8、CNVseq（WGS低深度）的分辨率A、100kb(正确答案)B、200kbC、300kbD、400kb答案解析：一般认为CNVseq分辨率是有效检出>100kb的CNV9、下列哪项是CNVseq技术的局限？A、缺失B、非整倍体改变C、重复D、倒位(正确答案)答案解析：CNVseq技术能检测拷贝数变异，不能检测倒位、易位10、MLPA中哪项是决定探针总长度的关键？A、上游引物B、填充序列(正确答案)C、杂交序列D、下游引物答案解析：填充序列是决定探针总长度的关键11、下列哪种疾病不是用MLPA方法可检测的？A、共济失调(正确答案)B、SMAC、佩梅病D、DMD答案解析：共济失调通常是三碱基重复所致，常用的是毛细管电泳方法12、Sanger测序的敏感性约是多少？A、35%(正确答案)B、10%C、50%D、5%答案解析：一般认为Sanger测序的敏感性是35%以上突变率变异的检出，低于此值，容易分辨不出是干扰峰，或者嵌合体等13、以下哪种检测技术最适合用于解决基因异质性难题？A、Sanger检测B、MLPA检测C、WES/WGS(正确答案)D、Qpcr答案解析：Sanger一次实验只能检测一个基因的特定区域，通量低；MLPA/Qpcr 用于检测基因外显子缺失或重复，且一次实验也只能检测特定的目标基因，通量低；WES是高通量测序，一次实验可实现多个基因同时测序，甚至全基因外显子组测序，14、哪项不是NGS测序的优点？A、通量高B、成本低C、周期短D、读长长(正确答案)答案解析：二代测序读长约150bp,一代测序读长约为1000bp15、突变深度20X，总深度100X，突变率是？A、0.8B、0.2(正确答案)C、0.4D、0.6答案解析：突变率=突变深度/总深度16、相对可靠的覆盖度是多少X？A、1XB、2XC、10XD、20X(正确答案)答案解析：>20X的覆盖度是相对可靠的，理论上杂合变异10X，得到了10次的验证17、NGS测序中Q30对应的错误率A、碱基错误率千分之一(正确答案)B、碱基错误率1/100C、碱基错误率1/10D、碱基错误率30%答案解析：Q30对应的错误率为千分之一；Q20为百分之一18、哪种变异是用毛细管电泳方法检测？A、甲基化异常B、动态突变(正确答案)C、大片段倒转D、假基因干扰答案解析：动态突变（三碱基、四碱基等重复致病）采用的是毛细管电泳法19、智因线粒体高敏感检测平均测序深度A、10000XB、50000X(正确答案)C、20000XD、2000X答案解析：我司线粒体高敏感平均深度5万×20、哪项不是线粒体基因组的特征A、母系遗传B、同质性(正确答案)C、杂质性D、异质性答案解析：线粒体突变分布具有异质性和杂质性，线粒体基因组来源于卵母细胞，所以是母系遗传21、WGS（30X）测序深度下，检测线粒体变异突变率分辨率是A、1%B、5%(正确答案)C、10%D、0.1%答案解析：5%以上比较可靠，若低于5%，实际也可检出，但不能排除变异不可靠，所以一般会向生信部门核实突变可靠性才准予出报告22、WGS（30×）检测外显子缺失重复分辨率A、1个(正确答案)B、2个C、3个D、5个答案解析：WGS全基因组扫描，对于外显子缺失重复，可以精确到断点，单个也可以检出23、单亲二倍体中单亲异二体是指？A、同一亲本同一条染色体B、同一亲本的两条染色体(正确答案)C、同一亲本一条染色体片段来源D、三体染色体答案解析：同一亲本同一条染色为单亲同二体24、哪项不是完全性的单亲二倍体发生机制？A、同源染色体交叉互换(正确答案)B、三体营救C、配子互补D、有丝分裂复制答案解析：完全性的单亲二倍体发生机制有三种：三体营救、配子互补、有丝分裂复制，染色体交叉互换可能导致的是片段性的UPD25、某患者临床怀疑软骨发育不全，但又不能排除遗传代谢病，以下最佳的基因检测策略是？A、WES/WGS(正确答案)B、软骨发育不全PanelC、遗传代谢病PanelD、软骨发育不全Panel+遗传代谢病Panel答案解析：WES/WGS的基因检测范围全，避免漏检情况26、我们通常所说的遗传病大型变异的范围是多大A、>100K(正确答案)B、>50KC、>120KD、>80K答案解析：大型变异：>100k;中型变异：30bp~100k;小型变异：<30bp27、我们通常所说的遗传病中型变异的范围是多大A、>50KB、1K~100KC、30bp~100K(正确答案)答案解析：大型变异：>100k;中型变异：30bp~100k;小型变异：<30bp28、我们通常所说的遗传病小型变异的范围是多大A、<30bp(正确答案)B、<100bpC、<50bpD、<1K答案解析：大型变异：>100k;中型变异：30bp~100k;小型变异：<30bp29、下列哪项技术需要培养细胞A、核型分析(正确答案)B、FISHC、CMAD、二代测序答案解析：只有核型分析技术需要培养细胞，其他三项都不需要培养细胞30、核型分析技术的检测分辨率是多少A、<4MB、>4M(正确答案)C、>2MD、<1M答案解析：核型分析技术的检测分辨率是>4M31、FISH技术的检测分辨率是多少A、>300KB、>200~300K(正确答案)D、<100K答案解析：FISH技术的检测分辨率一般是200~300kb32、CNVseq的检测分辨率是多少A、>300KB、>100K(正确答案)C、>500KD、>10K答案解析：CNVseq的检测分辨率是>100K33、以下哪些变异可以用aCGH芯片进行检测A、易位B、倒位C、CNV(正确答案)D、单亲二倍体答案解析：aCGH芯片可以检测CNV，但不能检测倒位、易位34、CNVseq的技术原理是什么A、目标区域捕获B、全基因组测序(正确答案)C、探针杂交D、G带显色答案解析：CNVseq是基于全基因组测序的二代测序技术35、核型分析的技术原理是什么A、目标区域捕获B、全基因组测序C、探针杂交D、G带显色(正确答案)答案解析：核型分析的技术原理是G带显色36、大型变异常用的检测方法A、核型分析(正确答案)B、FISH(正确答案)C、染色体微阵列芯片分析(正确答案)D、NGS测序（CNVseq、WGS）(正确答案)答案解析：大型变异常用的检测手段有：核型分析、FISH、CMA（SNP芯片或aCGH等）、NGS测序；随着NGS发展，越来越多的使用NGS测序来检测大型变异，如CNVseq、WGS等37、中型变异常用的检测方法A、SNP芯片B、MLPA(正确答案)C、QPCR(正确答案)D、NGS测序（WES、WGS）(正确答案)答案解析：中型变异常用的检测手段有：MLPA，QPCR及NGS测序；随着NGS 发展，越来越多的使用NGS测序来检测中型变异，如（Trio）WES、（Trio）WGS等38、小型变异常用的检测方法A、Sanger测序(正确答案)B、SNP芯片(正确答案)C、NGS测序（WES）(正确答案)D、NGS测序（WGS）答案解析：ABCD均可进行小型变异的检出；但sanger测序通量低，周期长，成本高，适用于单个或某几个基因的检测，或NGS测序后的位点验证；一种snp芯片也只能检测特定的突变位点,拓展性较差，成本高；随着NGS发展，越来越多的使用NGS测序来检测中型变异，如（Trio）WES、（Trio）WGS等39、下列哪项是染色体畸变？（多选）A、5p缺失综合征(正确答案)B、21三体综合征(正确答案)C、平衡易位(正确答案)D、倒位(正确答案)答案解析：5p缺失综合征也称之为猫叫综合征，由于5号染色体短臂缺失属于CNV，21三体综合征由于21号染色体多了一条属于染色体非整倍数改变，染色体畸变包括数目改变，CNV，易位、倒位等。

基因突变解析基因突变是指基因序列发生了改变，这种变异可以是单个碱基的替换、插入或删除，也可以是更大范围的基因片段的重组。

基因突变是遗传变异的主要形式之一，通过对基因突变进行深入解析，我们可以更好地了解基因功能、遗传病的发生机制以及人类进化的过程。

一、基因突变的发生原因基因突变的发生原因多种多样，主要包括以下几个方面：1. 遗传因素：基因突变可以通过遗传方式传递给后代，造成家族性疾病的发生。

2. 自然辐射：一些自然射线，如紫外线、X射线等，都具有一定的致突变作用，过度暴露于这些辐射源可能增加基因突变的风险。

3. 化学物质：某些化学物质，如致癌物质，会导致基因序列的改变，从而引发基因突变。

4. 外部环境：一些外部环境因素，如烟草、空气污染等，也可增加基因突变的概率。

二、基因突变的分类基因突变可以按照不同的标准进行分类，下面是两种常见的分类方法：1. 按照突变类型分类：- 点突变：指发生在单个碱基上的突变，包括替换（点突变中最常见的一种）、插入和删除等。

- 编码区突变：指发生在基因编码区的突变，可能导致蛋白质序列的改变。

- 非编码区突变：指发生在基因非编码区的突变，可能影响基因的表达水平。

2. 按照突变后果分类：- 无义突变：指突变导致密码子转变成终止密码子，导致蛋白质合成中断。

- 错义突变：指突变导致密码子转变成编码不同氨基酸的密码子，可能导致蛋白质功能异常。

- 移码突变：指突变导致密码子的插入或删除，引起后续密码子的错位，从而产生错误的蛋白质序列。

- 无影响突变：指突变对基因功能没有明显影响，被认为是一种中性突变。

三、基因突变的检测方法基因突变的检测方法主要包括以下几种：1. 传统测序技术：通过测序技术对基因序列进行逐个碱基的测定，并与正常基因序列进行比较，从而发现突变位点。

2. 高通量测序技术：如全基因组测序、外显子测序等，通过扩大测序规模，可以更全面地检测基因突变。

3. 基因芯片技术：利用基因芯片上固定的探针与待测样本中的基因序列进行杂交，通过对杂交信号的检测来鉴定基因突变。

生物中考计划如何理解基因突变基因突变是生物学中一个重要的概念，对于理解生物进化、遗传变异和疾病发生等方面具有重要意义。

在中考生物考试中，对于基因突变的理解和认识是一个必备的知识点。

本文将介绍基因突变的定义、类型以及对生物进化和疾病发生的影响，并给出相关例子加深对这一概念的理解。

一、基因突变的定义基因是生物体遗传信息的载体，基因突变指的是基因序列发生的变异。

基因突变可以是遗传物质（DNA）中一个或多个碱基的变化，也可以是染色体结构的改变，包括基因重组、基因重排等。

这些变异可能会改变基因的功能和表达方式，从而对生物体的性状、适应性和健康状态产生影响。

二、基因突变的类型基因突变可分为点突变、插入突变、缺失突变和倒位突变等几种类型。

其中点突变是最常见的一种，它指的是DNA链中某个碱基被替换成另一个碱基，导致整个基因序列的改变。

插入突变是指在DNA链中插入一个或多个额外的碱基，造成基因序列多出一段不在原先序列中的片段。

缺失突变是指原本DNA链中的一个或多个碱基丢失，导致基因序列缺少一段原有的信息。

倒位突变则是指DNA链的一个片段在同一染色体上颠倒了位置，导致基因序列的顺序发生改变。

三、基因突变对生物进化的影响基因突变是生物进化的重要驱动力之一。

在自然选择的过程中，基因突变可以产生新的基因型和表型，为物种的适应性提供变异材料。

例如，在恒河猴的进化过程中，由于基因突变导致个体产生了长臂，从而更好地适应了树上生活的环境。

这种基因突变在繁殖中得到传递，逐渐形成了独特的物种特征。

因此，我们可以说基因突变为生物进化提供了物质基础和遗传基础。

四、基因突变对疾病发生的影响基因突变也是引起人类疾病的重要原因之一。

疾病是由于基因突变导致基因功能异常或缺失所致。

例如，遗传性疾病小儿先天性无毛症的发生就与一个基因突变相关。

该突变导致毛囊发育受到抑制，从而导致患者出生后无法生长出头发。

另外，一些癌症也与基因突变密切相关。

例如，乳腺癌的发生与乳腺癌基因突变（如BRCA1和BRCA2基因突变）有关。

基因突变的遗传特点基因突变是指在生物个体的基因组中发生的变异现象，它是基因的一种特殊变化形式。

基因突变可以分为两种主要类型：点突变和结构性突变。

1. 点突变点突变是指基因序列中的一个碱基发生改变，包括错义突变、无义突变和错义突变。

错义突变是指由于一个碱基的改变导致氨基酸序列发生改变，从而影响蛋白质的结构和功能。

无义突变是指由于一个碱基的改变导致密码子变为终止密码子，从而导致蛋白质的合成提前终止。

读位点突变是指由于一个碱基的改变导致密码子的读位发生改变，从而改变蛋白质的氨基酸序列。

2. 结构性突变结构性突变是指基因序列中的一段碱基序列发生插入、缺失或倒位等改变，从而导致基因组结构的变化。

这种突变可能会导致基因的功能丧失或改变。

例如，某个基因缺失了一段碱基序列，导致蛋白质无法正常合成或功能异常。

基因突变的遗传特点主要包括以下几个方面：1. 遗传稳定性基因突变是在个体的基因组中发生的，但并不一定会被遗传到下一代。

突变的遗传性取决于突变发生的细胞类型和时机。

例如，如果突变发生在生殖细胞中，那么它有可能被遗传到后代；相反，如果突变发生在体细胞中，那么它只会影响个体自身，不会被遗传。

2. 遗传模式基因突变可以以不同的方式遗传给下一代。

如果突变是显性突变，那么只要个体携带了该突变的一个等位基因，就会表现出突变的特征。

如果突变是隐性突变，那么个体必须携带两个突变等位基因才会表现出突变的特征。

3. 多样性基因突变可以导致个体之间的遗传多样性增加。

突变是基因组演化的重要驱动力之一，它可以导致新的基因型和表型的出现。

这种多样性对于物种的生存和适应环境起到重要的作用。

4. 可逆性虽然大部分基因突变是不可逆的，一旦发生就无法修复，但也存在某些突变是可逆的情况。

例如，一些外界因素（如辐射）引起的突变可能会被细胞修复机制修复，从而恢复到正常的基因序列。

5. 累积性基因突变是一个逐渐积累的过程。

在生物个体的一生中，由于各种内外因素的作用，基因组中会不断发生突变。

基因突变与遗传疾病的筛查基因突变是指在生物体的基因组中发生的变异或错误。

这种突变可能对个体的生理过程和遗传特征产生重大影响，包括导致遗传疾病的发生。

为了及早发现并诊断潜在的遗传疾病，基因突变的筛查变得越来越重要。

本文将讨论基因突变与遗传疾病的筛查，以及一些常见的筛查方法。

一、基因突变的概念及其与遗传疾病的关系基因突变是指在基因序列中发生的改变，可能是单个核苷酸的替换、插入或删除，也可能是基因片段的改变。

基因突变可以是遗传的，也可以是后天发生的。

当这些突变发生在影响个体正常生理过程的基因中时，就可能导致遗传疾病的发生。

遗传疾病是由异常基因引起的疾病，可以在个体或家族中遗传传递。

这些疾病的临床表现和严重程度因基因突变的不同而各异。

有些遗传疾病在婴儿出生后立即显现，而其他一些可能在成年后才会出现症状。

因此，对于存在遗传疾病家族史或可能遭受遗传疾病风险的人群进行基因突变的筛查至关重要。

二、常见的基因突变筛查方法1. 基因测序基因测序是一种确定DNA序列的方法，可用于检测基因突变。

这种筛查方法可以通过测序技术来寻找基因组中的突变和变异，从而确定遗传疾病的风险。

基因测序可以分为Sanger测序和下一代测序（Next Generation Sequencing，NGS）两种方法。

NGS技术已经成为当前最常用的基因突变筛查方法，其高通量和高灵敏度使其成为发现潜在遗传疾病的首选方法。

2. 基因芯片技术基因芯片技术是一种高通量、高度并行的分子生物学方法，它可以检测大量的基因突变。

基因芯片利用固定的核酸探针来检测DNA中的特定突变，从而确定个体的基因型。

这种技术具有高度自动化和高效率的优点，可以同时检测数千个基因变异。

3. 聚合酶链反应（PCR）聚合酶链反应是一种用于扩增特定DNA片段的方法。

通过在PCR 反应中使用特定的引物，可以扩增目标基因区域，并使其易于分析。

PCR技术可以用于检测已知的基因突变，并且具有高度敏感和特异性的优点。

841综合病例研究新医学2023年11月第54卷第11期PHIP 基因突变所致Chung -Jansen 综合征一例王慧超 李田华 杨柳 卢园园 【摘要】 Chung -Jansen 综合征（CHUJANS ）是一种常染色体显性遗传病，是新近发现的罕见肥胖综合征，主要表现为发育迟缓、智力障碍、肥胖和畸形。

该文报道1例以肥胖、睾丸小为主要表现的CHUJANS 患儿，该患儿发育迟缓、智力障碍，伴有左肾缺如及低促性腺激素性性功能减退，基因检测结果提示PHIP 基因突变，突变位点c.600+1G>C ，最终诊断为CHUJANS 。

经过长期综合性治疗，患儿远期生活质量获得极大改善。

CHUJANS 发病率低，且累及多系统，该例扩展了CHUJANS 的基因突变谱，有助于提高临床医师对该疾病的认识水平，及早识别并给予干预将有助于改善患者预后。

【关键词】 Chung -Jansen 综合征；PHIP 基因；杂合突变；儿童A case of Chung -Jansen syndrome caused by PHIP gene mutation Wang Huichao △， Li Tianhua ， Yang Liu ， Lu Yuanyuan. △970 Hospital of the PLA Joint Logistic Support Force ， Weihai 264299， China Corresponding author ， Lu Yuanyuan ， E -mail:*******************【Abstract 】 Chung -Jansen syndrome （CHUJANS ）， an autosomal dominant genetic disorder ， is a newly discovered rare obesitysyndrome ， mainly manifesting as developmental delay ， mental retardation ， obesity and dysmorphism. We reported one CHUJANS child with obesity and small testes as the main manifestations. The patient had developmental delay ， mental retardation ， complicated with left renal agenesis and hypogonadotropic hypogonadism. Genetic testing prompted PHIP gene mutation at c.600+1G>C. The child was diagnosed with CHUJANS. After long -term comprehensive treatment ， the long -term quality of life was significantly improved. As Chung -Jansen syndrome is low in prevalence and multi -systemic ， this case report expands the spectrum of mutations in CHUJANS ，which can deepen clinicians ’ understanding of this disease. Early diagnosis and intervention contribute to enhancing clinical prognosis.【Key words 】 Chung -Jansen syndrome ； PHIP gene ； Heterozygous mutation ； ChildrenChung -Jansen 综合征（CHUJANS ，OMIM#617991）是一种以发育迟缓、智力障碍、肥胖和畸形为特征的常染色体显性遗传病，由位于6q14染色体上的PHIP 基因（OMIM#612870）中的杂合突变所致，可在婴儿期发病，大多为基因突变从头合成，少数为家族遗传［1］。