枇杷属植物遗传多样性的ISSR分析

枇杷胚败育机制及退化种子株系的ISSR遗传多样性研究的
开题报告
一、选题背景与意义
枇杷是中国南方地区的一种重要水果，其种子在发芽后容易胚败育，导致种子的利用效率较低。

同时，枇杷品种之间的遗传多样性较低，需要进行遗传多样性的研究
和保护。

因此，本研究的选题意义在于探究枇杷胚败育机制，为提高种子利用效率提
供理论基础；同时对枇杷退化种子株系进行ISSR遗传多样性研究，为枇杷遗传资源的保护和利用奠定基础。

二、研究内容和方法
1.枇杷胚败育机制研究
（1）采集不同枇杷品种的种子，测定其胚发率和胚败育率。

（2）通过组织学手段观察枇杷种子的胚发过程，分析胚败育的原因。

（3）利用基因芯片技术和RT-PCR技术分析胚败育过程中关键基因的表达情况。

2.枇杷退化种子株系的ISSR遗传多样性研究
（1）采集不同枇杷退化种子株系的叶片样品，提取基因组DNA并纯化。

（2）设计合适的ISSR引物，进行PCR扩增，并通过聚丙烯酰胺凝胶电泳方法
分析扩增产物。

（3）对枇杷退化种子株系的ISSR遗传多样性进行聚类分析和主成分分析。

三、预期成果
1.深入探究枇杷胚败育的机制，为提高种子利用效率提供理论依据。

2、对枇杷退化种子株系进行ISSR遗传多样性研究，为枇杷遗传资源的保护和利用提供重要参考。

3.发表相关研究论文或取得相关专利。

二十个枇杷品种(系)ISSR标记的遗传多样性分析
刘小英;蔡益航;吴碧君;张游南;刘国强
【期刊名称】《热带农业科学》
【年(卷),期】2022(42)11
【摘要】为促进枇杷种质资源的开发和利用,以收集的20份枇杷种质资源为研究对象,采用ISSR分子标记方法进行遗传多样性分析。

结果显示:13条引物共扩增141条DNA片段,其中多态性片段100条,多态性比率为70.92%;供试材料间的遗传相似系数为0.702 1~0.879 4,平均相似性系数为0.813 2。

对20份供试材料进行聚类分析,在遗传相似系数为0.759 6时,可将所有供试材料分为两大类,台湾白枇杷自成一类,其他供试材料聚为一类;在遗传相似系数为0.789 6时,除台湾白枇杷以外的供试材料又可分成3个亚类;聚类结果与开花时期、地理分布、果肉颜色相关性不明显,但同一亲本的杂交后代大部分聚成一类。

研究结果为枇杷资源的分类、保存与利用、遗传进化等研究及杂交组合选配提供一定的理论和技术支持。

【总页数】6页(P58-63)
【作者】刘小英;蔡益航;吴碧君;张游南;刘国强
【作者单位】莆田市农业科学研究所;莆田市生物工程研究所
【正文语种】中文
【中图分类】S667.3
【相关文献】
1.基于ISSR标记的17个杨树品种的遗传多样性分析
2.24个菊芋品种(系)遗传多样性的ISSR标记分析
3.基于ISSR标记的铁线莲园艺品种遗传多样性分析和指纹图谱构建
4.利用ISSR标记分析福云(半)同胞系茶树品种(系)的遗传多样性和亲缘关系
5.基于ISSR分子标记的冬种马铃薯品种遗传多样性分析
因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

枇杷属植物分子遗传图谱的构建及遗传多样性研究的开题报告一、研究背景和意义枇杷是我国传统的果树之一，主要分布在我国南方地区，包括华南、江南和闽南等地。

枇杷属植物具有极高的经济价值和药用价值，其果实可以直接食用或加工成各种产品，如果酱、蜜饯、饮料等，同时具有良好的药用价值，特别是其叶片和根皮具有滋阴清热、化痰止咳、生津润肺等功效。

近年来，随着人们对健康食品和中药材的需求增加以及市场需求的不断扩大，枇杷属植物的种植和利用呈现出快速增长的趋势。

因此，对枇杷属植物的遗传多样性进行研究，对于丰富枇杷遗传资源、推动枇杷生产与科研发展、推广枇杷产品和提高其经济价值具有重要的意义。

二、研究目的和内容本研究旨在构建枇杷属植物分子遗传图谱，探究其遗传多样性和群体结构，并对其进行分析和评估。

本研究主要内容包括以下三个方面：1. 构建枇杷属植物分子遗传图谱本研究采用分子标记技术（如AFLP、RAPD和SSR等）对枇杷属植物进行DNA分型，构建分子遗传图谱，以了解枇杷属植物的遗传多样性和群体结构，为枇杷资源的保护和利用提供基础数据。

2. 研究枇杷属植物的遗传多样性本研究将通过多态性指数、遗传距离、主成分分析、聚类分析等方法，对枇杷属植物进行遗传多样性分析，探究枇杷属植物的遗传多样性水平和分异程度，以及不同种群间的遗传相似度和遗传差异度。

3. 评估枇杷属植物的群体结构本研究将通过AMOVA和STRUCTURE分析方法，对枇杷属植物的群体结构和遗传分化进行评估，了解种群间的遗传流动、亲缘关系和种群遗传分化情况。

三、研究方法本研究将采取以下方法进行研究：1. 植物材料采集和DNA提取采集不同种群的枇杷属植物叶子样本，进行DNA提取。

2. 分子标记技术采用AFLP、RAPD和SSR等分子标记技术，对枇杷属植物的DNA进行分型，构建分子遗传图谱。

3. 遗传多样性分析通过多态性指数、遗传距离、主成分分析、聚类分析等方法，对枇杷属植物进行遗传多样性分析。

基于转录组测序枇杷EST-SSR标记的开发与利用枇杷(Eriobotrya japonica Lindl.)起源于我国东南部,是中国特色水果,具有极高医疗保健价值,栽培历史悠久,品种繁多,与其他国家相比我国枇杷种质资源更为丰富。

但目前对枇杷的遗传研究及基因组信息研究较少,因此我们需要对枇杷进行更深一步的分子基因组研究,为其种质资源分类、遗传多样性分析及分子标记辅助选育等研究奠定基础。

本试验通过对洞庭枇杷的转录组进行大规模测序,利用获得的转录组序列进行EST-SSR分子标记的开发,将开发的标记进行枇杷及其近缘物种间的通用性分析和遗传多样性分析,并对洞庭野生型和突变型枇杷进行特异EST-SSR片段克隆进而对其差异基因进行探讨,主要研究结果如下：1.我们总共获得61587个Unigene,对其进行微卫星搜索,得到6693个Unigene包含7649个SSR位点。

在对SSR位点进行重复类型统计发现,在二核苷酸到六核苷酸之间,重复类型最多的是二核苷酸其数量总计4593,占所有重复类型的60.05%;最少的重复类型是五核苷酸,占总数的2.08%。

在对重复类型最多的序列进行统计发现,重复序列中出现频率最高的是二核苷酸重复类型中的AG/CT,占所有重复序列的52.6%；其次是三核苷酸重复类型中的AAG/CTT和AGG/CCT,分别占所有重复序列的6.6%和6%;而在二核苷酸重复序列类型中没有出现CG/GC重复序列。

2.通过MISA搜索获得到7649个SSR位点,成功设计出278对引物,我们用这278对引物在‘洞庭红肉’和‘洞庭白肉,枇杷中进行扩增,结果发现其中246对引物都可以得到清晰明亮条带,扩增效率达到88.5%。

3.从278对EST-SSR引物中选择扩增效果好、条带明亮和具有高多态性的25对引物分别对18份枇杷种质、6份苹果种质以及3份桃种质进行扩增,结果发现这25对引物在这三种材料中扩增效果都达到了92%,说明我们在洞庭枇杷上开发的EST-SSR分子标记在其他枇杷品种及其近缘物种上也具有一定通用性；并且我们发现Ejl、Ej46、Ej229这三对引物可以用于区分这三大类试材。

52份枇杷种质资源遗传多样性分析与DNA指纹图谱构建赵科;孙淑霞;李靖;涂美艳;王玲利;何成勇;徐子鸿;江国良;宋海岩;陈栋【期刊名称】《西南农业学报》【年(卷),期】2024(37)2【摘要】【目的】丰富枇杷种质资源鉴定方法,为枇杷种质资源发掘和利用提供理论依据。

【方法】利用277对EST⁃SSR标记和1对果肉颜色相关InDel标记,对52份国内外枇杷种质资源和国家西南特色园艺作物种质资源圃(成都)枇杷育种与栽培创新团队创制的杂交后代进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。

【结果】筛选出扩增带型清晰、稳定性和重复性好的9对引物,每对引物扩增条带为2~5条,平均85条;多态性条带比率为40.00%~100.00%,平均71.55%;多态性信息含量(PIC)为0.250~0.999,平均0.685。

遗传多样性分析显示,52份枇杷种质资源和创制的杂交后代的平均相似系数为0.791;果肉颜色一致或地理分布相近的枇杷种质资源被聚类到相近的分类单元,并且可以准确地将西班牙、日本枇杷种质资源与其他种质资源进行区分。

此外,本研究还构建了52份枇杷种质资源的DNA指纹图谱和色块矩阵。

【结论】丰富了枇杷种质资源鉴定的分子标记,为今后发掘分子标记紧密连锁的功能基因或片段提供了理论依据。

【总页数】8页(P242-249)【作者】赵科;孙淑霞;李靖;涂美艳;王玲利;何成勇;徐子鸿;江国良;宋海岩;陈栋【作者单位】四川省农业科学院园艺研究所;农业农村部西南地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室【正文语种】中文【中图分类】S667.3【相关文献】1.睡莲种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建2.基于iPBS标记的石斛兰种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建3.基于cpSSR标记的山药种质资源DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析4.木奶果种质资源的遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建5.50份无花果种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

福建果树2009(1):4～10Fujian Fruits枇杷种质资源坐果的遗传多样性及其相关分析林旗华　许奇志　郑　姗　章希娟　郑少泉3(福建省龙眼枇杷育种工程技术研究中心,福建省农业科学院果树研究所,福建福州350013)摘　要　对国家果树种质福州枇杷资源圃内239份枇杷种质的坐果进行了鉴定评价,结果显示,枇杷种质资源坐果存在丰富的遗传多样性,不同种质类型的枇杷坐果遗传多样性较大,野生枇杷种质坐果达2915个,大于其他枇杷种质类型,不同国家间枇杷种质坐果遗传多样性不大,但中国13个省(区)间遗传多样性较为丰富,源自云南的种质坐果4611个,源自台湾的种质坐果仅为912个。

枇杷种质坐果分布广,种质间差异大,坐果最高的为6318个,最低的仅为318个,平均1511个,以坐果在6～15个的枇杷种质最多,达150份,占6218%;高于33个的枇杷种质11份;低于6个的有5份。

根据综合分析结果,初步提出了枇杷种质坐果的分级标准。

为了解枇杷种质坐果的影响因素,对6个质量性状因子各自不同水平下坐果的差异进行统计分析,结果表明野生枇杷与地方品种、选育品种和野生近缘种的坐果有极显著差异;枇杷种质不同果实排列紧密度间的坐果以及源自云南的枇杷种质与其他省(区)枇杷的坐果均有极显著差异;6个国家(中国、日本、西班牙、新西兰、美国和南非)间、不同果实着生姿态间和果肉颜色间的枇杷种质坐果的差异均不显著。

对9个数量性状因子与坐果的相关分析表明,果穗长度和花序支轴数对枇杷种质坐果有极显著影响;花冠直径和侧枝数对坐果有显著影响;其他性状(叶片宽度、总叶片数、叶片长度、中心枝长度和中心枝粗度)对坐果没有影响。

本文为枇杷种质资源的坐果生物学研究提供了理论依据。

关键词　枇杷;种质资源;坐果数;多样性;相关分析Ana lysis on the D i versity and Correl a ti on of Fru it Bear i n gi n L oqua t Germ pl a s m ResourcesL I N Q i-hua　XU Q i-zhi　ZHENG Shan　ZHANG Xi-juan　ZHENG Shao-quan3(Fu jian F ru it B reed ing Eng ineering Technology R esea rch Cen ter for L ongan&L oqua t,F ru it R esea rch Institu te of FAAS,Fuzhou350013,Fu jian Ch ina)Abstract　The fruit bearing of239l oquat ger mp las m res ources in Loquat Res ource Nurseries of Fuzhou Nati onal Fruit Gene-pool were studied and the influential fact ors on fruit bearing were inves2 tigated.The results indicated that there was abundant diversity a mong the m.Fruit bearing in different ger mp las m types had great diversity,such as fruit bearing number in wild l oquat ger mp las m was 2915,extre mely higher than other ger mp las m types;fruit bearing number in different p r ovinces(dis2 tricts)had great difference although had little difference in different countries.Among the m fruit bearing number of l oquat ger mp las m fr om Yunnan was4611,and fr om Tai w an was only912.There was w ide distributi on and great difference in l oquat ger mp las m,fruit bearing number was high and the average of fruit bearing number was1511.150out of t otal239l oquat ger mp las m res ources were situ2 ated bet w een6and15,accounting f or6218%.11ger mp las m were more than33and only5ger m2 p las m were l ower than6.The grading standard of fruit bearing in l oquat was tentatively p r oposed after multifact or analysis.6qualitative characters w ith different levels were analyzed by variance analysis.收稿日期:2009-03-18基金项目:农作物种质资源保护项目(NB06-070401-08、NB07-2130135-08、NB08-2130135-08)、国家科技基础条件平台工作子项目(2005DK A21002-27)、国家支撑计划(2007BAD07B01)和福建省财政专项(STI F-08)作者简介:林旗华(1980-),男,助理研究员,硕士,主要从事枇杷、杨梅、黄皮种质资源和分子遗传学研究3为通讯作者There was very significant different bet w een w ild l oquat and other 3l oquat types (traditi onal cultivar,i m p r oved cultivar and w ild kindred ).D ifference of fruit bearing bet w een Yunnan and other p r ovinces als o reached extre mely significant level,but difference of fruit bearing a mong 6countries (China,Ja 2pan,Spain,Ne w Zealand,US A and South Africa )did not reached extre mely significant level .D ifference of fruit bearing a mong 3attitude of fruit in relati on t o main axes (upwards,out w ards and downwards )and 5fruit col or types (orange red,orange yell ow,yell ow,yell ow ish white and m ilky )als o had not reached extre mely significant level .9quantitative characters were analyzed and correla 2ti on analysis was adop ted .The fruit cluster length and secondary peduncles number reached extre mely significant effect on fruit bearing,cor olla size and the lateral shoots number reached significant effect on fruit bearing,other characters (leaf blade width,number of t otal leaf blade,leaf blade length,central shoot length and central shoot thickness )had no significant effect on the fruit bearing .Keywords Loquat;Ger mp las m res ources;Fruit bearing Number;D iversity;Correlati on analysis枇杷(E riobotrya japonica L indl .)属蔷薇科(Rosaceae )枇杷属(E riobotrya ),多年生常绿乔木,是原产于我国南方的常绿特色果树。

41份枇杷属植物材料的RAPD和ISSR分析的开题报告一、研究背景和意义枇杷属植物是一种常见的果实作物，常见于中国南方，具备丰富的营养价值和药用价值。

但是，枇杷属植物种类繁多，不同物种之间的遗传差异很大，这会对选种、繁殖和育种带来困难。

因此，了解枇杷属植物的遗传特性，分析不同物种之间的遗传差异，对于枇杷属植物的选育和繁殖具有重要意义。

随着分子生物学技术的不断发展，RAPD和ISSR技术已被广泛应用于植物的遗传分析中。

它们具有高度的多态性和传递性，可以反映植物品种差异和种内基因变异，是现代遗传学研究的重要手段。

本研究将对41份枇杷属植物材料进行RAPD和ISSR分析，目的是探究它们之间的遗传差异和亲缘关系，为枇杷属植物的选育和繁殖提供基础遗传学数据。

二、研究内容和方法1. 研究内容本研究将分别采用RAPD和ISSR技术对41份枇杷属植物材料进行遗传分析，主要研究内容包括：（1）RAPD和ISSR扩增反应的优化和建立（2）RAPD和ISSR扩增产物的分析和比较（3）根据RAPD和ISSR结果进行聚类分析和构建系统发育树2. 研究方法（1）DNA提取：采用CTAB法从41份枇杷属植物材料的叶片样品中提取基因组DNA。

（2）RAPD扩增反应：选用10条随机引物，对41份样品进行RAPD扩增反应。

（3）ISSR扩增反应：选用10条ISSR引物，对41份样品进行ISSR扩增反应。

（4）扩增产物测序和分析：将RAPD和ISSR扩增产物进行测序和比较分析，得到它们之间的遗传关系。

（5）聚类分析和系统发育树的构建：根据RAPD和ISSR结果，对41份样品进行聚类分析和系统发育树的构建，得到它们之间的亲缘关系。

三、预期研究结果和意义本研究预期得到如下结果：（1）RAPD和ISSR扩增反应的优化和建立。

（2）RAPD和ISSR扩增产物的分析和比较，得到不同样品之间的遗传差异和亲缘关系。

（3）根据RAPD和ISSR结果进行聚类分析和构建系统发育树，进一步探究不同样品之间的遗传关系。

贵州野生枇杷资源遗传多样性的ISSR分析
范付华;宋莎;洪怡;赵亚楠;文晓鹏
【期刊名称】《中国南方果树》
【年(卷),期】2012(41)3
【摘要】采用ISSR标记,构建了贵州39份野生枇杷种质的DNA指纹图谱,并对其遗传多样性进行评价。

结果表明,以筛选出的15条引物进行PCR扩增,获得清晰、重复性好的谱带125条,其中多态性谱带108条,多态性比例为86.4%;应用引物815、825和841的组合,构建了39份枇杷种质的ISSR指纹图谱,可以有效区分所有供试材料;15条引物的谱带数据聚类分析表明,供试种质的遗传相似性系数为0.40～0.98,在相似性系数为0.70时,可将供试种质分成五大类;聚类结果与种质表型相关,与地理分布的相关性不明显。

【总页数】5页(P36-39)
【关键词】枇杷;种质资源;ISSR;遗传多样性
【作者】范付华;宋莎;洪怡;赵亚楠;文晓鹏
【作者单位】贵州大学贵州省农业生物工程重点实验室
【正文语种】中文
【中图分类】S667.3
【相关文献】
1.贵州野生匍匐剪股颖种质资源遗传多样性的ISSR分析 [J], 尚以顺;杨春燕;钟理
2.云南南部野生大叶千斤拔资源遗传多样性的ISSR分析 [J], 王桂娟;肖文祥;唐寿
贤
3.贵州野生半夏资源遗传多样性的ISSR分析 [J], 王爱华;季祥彪;文晓鹏
4.新疆野生山楂资源遗传多样性及亲缘关系的ISSR分析 [J], 刘欢;廖康;刘娟;赵世荣;孙琪;曹倩
5.贵州高原山地野生西南红山茶ISSR遗传多样性分析 [J], 朱亚艳;霍达;罗扬;李芳;王进;罗在柒;许杰
因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。