Copia因子是果蝇的一种反转录转座子
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第三部分、分子生物学-信息途径第十六节:DNA的复制、修复和重组中大历年考题:一、填空题1. DNA 复制时,引发前体和引发酶构成____________。
(0828)2. 端粒的简单串联重复DNA 合成由_________酶负责。
(0724)3. 基因组中能独立复制的单位称__________。
(0725)4. 现已发现大肠杆菌有五种不同的DNA 聚合酶,其中真正负责DNA 复制的是_________。
(0619)5. DNA 复制的两大特点是_________复制和_________复制。
(0501)6. 基因组中能够独立复制的单位称_________。
(0502)7. DNA 连接酶催化的连接反应需要能量供给,大肠杆菌以_________为能量来源,而动物细胞以_________为能量来源。
(0503)8. 大肠杆菌的三种DNA 聚合酶中有5’-3’外切酶活性的是_________。
(0504)9. 真核生物DNA 聚合酶中负责冈崎片段合成的是_________。
(0505)10. 端粒的简单串联重复DNA 合成由_________酶负责。
(0506)11. DNA 复制后最常见的修饰是某些碱基的___________,目的是自我识别,以免受到自身核酸内切酶的破坏。
(0524)12. 反向重复序列_________(05三7)13. 基因突变________(05三9)14. 复制体________(05三10)15. 基因家族_________(04三5)16. 复制子__________(04三8)二、判断题1. 生物物种随基因组增大,独特基因减少,家族基因增多。
(0820)2. 细胞器基因组都是环状DNA 分子。
(0828)3.小鼠基因组的中性位点的年替换率大于人类的基因组。
(0830)4. 原核生物和真核生物的聚合酶都是以dNTP 为底物。
(0719)5. 噬菌体的整合由整合酶引发,其功能相当于Ⅱ型拓扑异构酶。
原核生物转座子类型
原核生物的转座子主要有以下几类:
1.插入序列(Insertional Sequence,IS):两端有IR,只编码转座酶。
2.类转座因子(类转座子):结构同IS但不能独立存在,只作为复合子的两端组件。
3.复合转座子:两端由IS或类IS构成,带有某些抗药性基因或其他宿主基因,一旦形成复合式转座子,IS序列就不能再单独移动,只能作为复合体移动。
4.TnA转座子家族:两端为IR可编码转座酶、解离酶和抗性物质。
此外,真核生物的转座子主要包括转座子和反转录转座子两类。
具体分类如下:
1.转座子:包含两类。
a.玉米内的可控制因子,可分为自主性因子和非自主性因子,如Ac-Ds体系。
b.果蝇中的转座子,如P转座子,导致杂种不育。
2.反转录转座子:包含三类。
a.反转录病毒RNA:整合宿主靶DNA。
b.病毒超家族:有LTR,编码反转录或整合酶,可含内含子。
如Ty Copia LINSL1。
c.非病毒超家族:无重复序列,不编码转座产物、无内含子。
如SINSB1/ALU、假基因。
以上信息仅供参考,建议查阅关于原核生物转座子的文献资料或咨询相关生物学家,获取更准确的信息。
自考医学考试分子生物学(试卷编号111)1.[单选题]同位素标记探针检测NC膜上的RNA分子( )A)叫做NorthernBlottingB)叫做SouthernBlottingC)叫做WesternBlottingD)叫做蛋白分子杂交答案:A解析:2.[单选题]滚环复制是A)细胞DNA的主要复制方式B)线粒体DNA的主要复制方式C)产生的复制子总是双链环状拷贝D)噬菌体DNA通常的复制方式答案:D解析:3.[单选题]下列关于DNA双螺旋模型的叙述,错误的是A)是DNA的二级结构B)双螺旋相互平行,走向相反C)磷酸与脱氧核糖组成了双螺旋的骨架D)碱基位于双螺旋的外侧答案:D解析:4.[单选题]下列不属于顺式作用元件的是A)启动子B)转录因子C)终止子D)衰减子答案:B解析:5.[单选题]下列关于逆转录酶活性的叙述,错误的是( )A)RNA指导的DNA聚合酶B)DNA指导的DNA聚合酶C)核糖核酸酶ⅡD)核酸外切酶6.[单选题]翻译停止时核糖体阅读的位置是A)终止子B)终止密码子C)终止因子D)AUG答案:B解析:7.[单选题]下列哪一种RNA发挥运载胞浆中游离氩基酸与信使RNA链上对应的密码子识别和结合的怍用?A)rRNAB)BtRNAC)mRNAD)snRNA答案:B解析:8.[单选题]原核生物参与转录起始的酶是( )A)解链酶B)引物酶C)RNA聚合酶IID)RNA聚合酶全酶答案:D解析:9.[单选题]通过自动获取或人为地供给外源DNA使真核细胞获得新的遗传表型,称为A)转化B)接合C)转导D)转染答案:D解析:10.[单选题]染色体末端的端粒所具有的功能,不包括A)防止染色体DNA降解B)保护染色体的完整性C)作为细胞的分裂时钟D)携带遗传信息答案:D11.[单选题]1979年,Rich对d(CGCGCG)结晶进行X射线衍射分析得到的DNA结构模型为A)A型B)B型C)C型D)Z型答案:D解析:12.[单选题]真核生物转录时结合RNA聚合酶的蛋白质称为A)启动子B)增强子C)P因子D)转录因子答案:D解析:13.[单选题]关于病毒粒子的叙述,错误的是A)由蛋白质和核酸构成B)能够独立地进行能量代谢C)许多代谢依赖于宿主细胞D)自身不能生长分裂答案:B解析:14.[单选题]下列哪一种质粒可将染色体基因和它本身转移到无质粒的细胞中A)F性因子B)R抗药性因子C)Col因子D)Ti因子答案:A解析:15.[单选题]逆转录是指A)以DNA为模板合成RNA的过程B)以RNA为模板合成DNA的过程C)以DNA为模板合成蛋白质的过程D)以RNA为模板合成蛋白质的过程答案:B解析:A)转录转座子B)逆转录转座子C)Ty转座子D)Copia转座子答案:B解析:17.[单选题]基因工程所用的载体是A)DNAB)RNAC)氨基酸D)蛋白质答案:A解析:18.[单选题]原核生物的基因一般是以下列哪一种形式存在?A)启动子B)增强子C)操纵子D)衰减子答案:C解析:19.[单选题]乳糖操纵子中与调节蛋白结合的位点是A)启动子B)操纵基因C)结构基因D)CAP结合位点答案:B解析:20.[单选题]大肠杆菌最常见的σ因子是A)σ70B)σ5C)σ43D)σ32答案:A解析:21.[单选题]核酸内切酶能够识别并切割某种特定核苷酸序列,该序列具有双重旋转对称结构,该结B)回文结构C)三叶草结构D)帽子结构答案:B解析:22.[单选题]多聚核糖体A)是核糖体大、小亚基聚合B)是核糖体小亚基与mRNA聚合C)在蛋白质合成中出现D)是氨基酸在核糖体上聚合答案:C解析:23.[单选题]下列不能作为DNA复制的原料是A)dATPB)dGTPC)dUTPD)Dctp答案:C解析:24.[单选题]原核生物RNA聚合酶的核心酶组成是A)α2βB)α2ββ’σC)α2ββ’D)αββ’答案:C解析:25.[单选题]干扰索(Interferon)是A)病毒本身存在的B)细菌产生的C)根据竞争性抑制原理没计的D)病毒感染后诱导细胞合成的答案:D解析:26.[单选题]σ亚基作为RNA聚合酶全酶组分在转录起始时结合在DNA模板上。
05级分子生物学真题一、选择题1、激活子的两个功能域,一个是转录激活结构域,另一个是(DNA结合域)2、转录因子包括通用转录因子和(基因特异转录因子)3、G-protein 激活needs ( GTP ) as energy.4、Promoters and (enhancers) are cis-acting elements.5、噬菌体通过(位点专一重组)整合到宿主中6、在细菌中,色氨酸操纵子的前导区转录后,(翻译)就开始7、mRNA的剪切跟(II)类内含子相似8、UCE是(I)类启动子的识别序列9、TATA box binding protein 在下列哪个启动子里面存在(三类都有)10、(5S rRNA)是基因内部启动子转录的11、人体全基因组大小(3200000000 bp)12、与分枝位点周围序列碱基配对的剪接体(U2 snRNP)13、tRNA基因是RNA聚合酶(III)启动的14、在细菌中,色氨酸操纵子的前导区转录后,(翻译)就开始15、乳糖操纵子与阻遏蛋白结合的物质是(异构乳糖)。
16、核mRNA的内含子剪接和(II类内含子剪接)的过程相似17、基因在转录时的特点(启动子上无核小体)18、RNA干涉又叫(转录后的基因沉默,PTGS)19、内含子主要存在于(真核生物)20、snRNA在下列哪种反应中起催化酶的作用(mRNA的剪接)二、判断题1、原核生物有三种RNA聚合酶。
2、抗终止转录蛋白的机制是使RNA聚合酶忽略终止子。
3、RNA聚合酶II结合到启动子上时,其亚基的羧基末端域(CTD)是磷酸化的。
4、Operon is a group of contiguous, coordinately controlled genes.5、RNA聚合酶全酶这个概念只应用于原核生物。
6、聚腺苷酸尾是在mRNA剪接作用前发生的。
7、σ在转录起始复合复合物中使得open到closed状态(closed转变成open)8、剪接复合体作用的机制:组装、作用、去组装,是一个循环三、简答题1、原核生物转录终止的两种方式。
中国科学技术大学2020—2021学年第1学期
《现代分子生物学》考试试卷(A卷)
院/系年级专业姓名学号
考生答题须知
1.所有题目答题答案必须做在考点发给的答题纸上,做在本试题册上无效。
请考生务必在答题纸上写清题号。
2.评卷时不评阅本试题册,答题如有做在本试题册上而影响成绩的,后果由考生自己负责。
3.答题时一律使用蓝、黑色墨水笔或圆珠笔作答(画图可用铅笔),用其它笔答题不给分。
4.答题时不准使用涂改液等具有明显标记的涂改用品。
中国科学技术大学2020—2021学年第1学期《现代分子生物学》考试试卷(A卷)
标准答案。
目录1P因子2果蝇的P因子P因子P因子又称备解素(properdin),是替代途径中除C3以外最先发现的一种血浆蛋白。
现已探明,P因子以聚合体形式而存在:即三聚体(54%)、二聚体(26%)和四聚体(20%)都有,但特异活性的顺序依次为:四聚体>三聚体>二聚体。
P因子为由4条相同的肽链(分子量各55kDa)组成的四聚体分子,链间以非共价键相连接,分子量为220kDa。
P因子的生物学活性是以高亲和力与c 3bBb和C 3bnBb相结合,结合后通过发生构象改变而加固C3b与Bb间的结合力,从而可使其半衰期由2分钟延长至26分钟。
另外,P因子还可封闭H因子的抑制作用,更增加了上述两种酶的稳定性及活性,有利于促进替代途径级联反应的继续进行。
因此,P因子实际上是替代途径中的一个重要的正调节分子。
因其常成为c 3bBb和C3bnBb复合物中的组成成分之一,故将其作为补体系统的固有成分在此一并描述。
此外,在膜增生性肾小球肾炎病人血清中发现有一种C3肾炎因子(C3nephritic factor,C3NeF)实际为C 3bBb的自身抗体,也可与C3bBb结合而增加c 3bnBb的稳定性,使其半衰期处长10-30倍。
果蝇的P因子果蝇的P因子有两种类型,一类是全长p因子,长2 907 bp,两端有33bp的反向重复序列(IR),有4个外显子,编码转座酶。
含户因子的果蝇称P品系。
另一类是不能编码转座酶,依赖于全长户因子才能转座移动的缺失型户因子。
这类P因子都是活性户因子的中段缺失型衍生物。
长度从0.5 kb到1.4 kb不等。
果蝇P品系的基因组有30—50份P因子拷贝,其中约三分之一是全长p因子。
全长P因子的4个外显子编码转座酶,但只在生殖系细胞中实现完整的RNA剪接,生成有活性的转座酶,相对分子质量为87×103。
在体细胞中,RNA剪接不完整,最后一个内含子未除去,因而只有前面3个外显子编码产生只有66×103的转座酶,是没有生物学活性的。
同源重组遗传交换、染色体上基因重排、断裂DNA的修复(1)同源重组的形式⏹常发生在同源染色体之间(分子间重组)⏹也可发生在同一DNA分子内(分子内重组)(2)Holliday 模型解释同源重组的一个经典模型基于重组过程中有十字形的中间产物(3)RecBCD重组途径存于E. coli中,需要RecBCD蛋白(RecBCD protein,recB、recC、recD基因的产物)参与DNA损伤造成的双链断裂以及外源DNA线性分子的DNA断端。
RecBCD是一种具多功能的酶,依赖于DNA的ATPase(水解ATP, 为DNA的解螺旋提供能量);DNA helicase; DNA nuclease,可作用于单链或双链DNA, 切割χ位点(GCTGGTGG)χ(chi): crossover hotspot instigator RecBCD的切点与底物的序列有关,可在χ位点3’端4 ~ 6 ntRecA :38 kD 的蛋白质,具多种功能,在重组中促进同源DNA单链的交换(主要是一单链与一双链中的同源单链交换);交换过程需ATP。
RuvA和RuvB :RuvA和RuvB均具DNA helicase活性,RuvB还有ATPase活性;RuvA特异性识别并结合到Holliday junction,并促使RuvB蛋白结合到这一位点;RuvB水解ATP,提供能量,促使分支迁移RuvC :解开Holliday junction的核酸内切酶,特异地与Holliday junction结合,在特异位点切开Holliday junction。
RuvC是二聚体,有2个活性位点,能切开Holliday junction的两条链,切割位点有特异的序列,必须等branch migration 到达特异序列后,RuvC才能起作用,以何种方式解开Holliday junction取决于RuvC切割位点在两对同源单链上的频率。
(4)减数分裂重组(meiotic recombination)真核生物中常见的重组,与细菌中的重组有不少相似之处,但在起始的步骤有较大的差异,涉及DNA双链断裂(double-stranded DNA break,DSB)Spo11:核酸內切酶,能在染色体DNA上产生双链断裂而启动减数分裂重组;DNA切割必须发生在已复制的同源染色体开始配对的时候;DNA切割位点没有序列特异性,但是多分布在核小体包装疏松的染色体区域(如启动子区)(5)基因转换(gene conversion)多见于真核生物,当两相似的序列(等位基因、非等位基因均可)靠在一起时,就有可能发生基因转换,即一DNA序列转换成另一相似的序列,基因转换的机制是基于重组,即先交换一段DNA序列,再进行修复,就会使某一序列的比例增加。
自考医学考试分子生物学(习题卷4)第1部分:单项选择题,共85题,每题只有一个正确答案,多选或少选均不得分。
1.[单选题]Lac阻遏蛋白结合乳糖操纵子的( )A)CAP结合位点B)O序列C)P序列D)Z基因答案:B解析:2.[单选题]下列哪一种质粒属于耐药性质粒?( )A)F质粒B)R质粒C)col质粒D)质粒噬菌体答案:B解析:3.[单选题]培养液中,影响腺苷酸环化酶的活力,使细胞内cAMP的活力下降,从而抑制LAC操纵子的转录的原因是由于存在A)乳糖B)葡萄糖C)半乳糖D)果糖答案:B解析:4.[单选题]密码子存在于A)DNAB)rRNAC)mRNAD)tRNA答案:C解析:5.[单选题]大肠杆菌DNA复制的延伸过程中,起主要作用的酶是A)DNA聚合酶Ⅲ全酶B)DNA聚合酶IC)DNA聚合酶ⅡD)引物酶答案:A解析:C)核糖体+蛋氨酰tRNA+mRNAD)翻译起始因子+核糖体答案:C解析:7.[单选题]下列不属于PCR体系的基本成分是A)DNA或RNA模板B)特异性引物C)核苷三磷酸(NTP)D)缓冲液答案:C解析:8.[单选题]下列不属于小分子RNA的是A)hnRNAB)snRNAC)scRNAD)miRNA答案:A解析:9.[单选题]顺式作用元件的形式不包括A)密码子B)增强子C)CAAT盒D)GC盒答案:A解析:10.[单选题]下列不属于顺式作用元件的是A)启动子B)转录因子C)终止子D)衰减子答案:B解析:11.[单选题]下列哪一种酶在DNA复制述程中具有校读作用A)DNA聚合酶IB)DNA聚合酶IIC)DNA聚合酶IIID)DNA解旋酶答案:A解析:12.[单选题]下列不属于细胞凋亡的特征是A)出现炎症反应B)出现凋亡小体13.[单选题]通过对异源双链区内不配对碱基的修复而进行的基因矫正过程称为A)碱基修复B)基因转换C)重组修复D)基因修复答案:A解析:14.[单选题]聚合酶链反应有三个基本步骤组成循环反应,它们是变性、和延伸。
考试范围及题型考试范围包括所讲过的内容考试题有选择题(单选)、是非题和问答题,其中选择题和是非题有50%左右以英语出题课程复习:原核生物与真核生物两大体系1.原核基因组与真核基因组(prokaryotic genomes and eukaryotic genomes)1.1.大小(size):基因组大小(genome size)一般以单倍体基因组的核酸量来衡量,单位有pg、Dalton、bp 或kb 、Mb等.1 pg = 6.02 x 1011 Daltons = 9.8 x 108 bp. 原核生物的genome size一般都比较小,且变化范围也不大(最大/最小约为20)。
由于原核生物基因组中的非基因DNA(non-genic DNA)的含量较少,因此它们的基因组大小与其所含的基因数目是相对应的.真核生物的genome size一般要比原核生物的大很多,且变化范围也很大(最大/最小可达8万)1.2.基因结构(gene structure: continuous coding sequences, split genes)类核基因组--环状,较小;通常由单拷贝或低拷贝(low-copy)的DNA序列组成;基因排列紧密,较少非编码序列(streamlined)核基因组--多线状;大小一般要比类核基因组大好几个数量级,且变化范围很大;有大量的非编码序列(重复序列、内含子等)1.3.非编码序列(non-coding sequences: repeated sequences, introns)局部分布的重复序列(串联式的高度重复序列)散布的重复序列(SINES, LINES)内含子(intron)I 类II 类III 类核mRNA内含子(nuclear mRNA intron)即剪接体内含子(spliceosomal intron)核tRNA内含子(nuclear tRNA intron)古细菌内含子(archaebacterial intron)1.4.细胞器基因组(organelle genomes: mitochondrial genomes, chloroplast genomes)线粒体基因组--在不同类型的生物(多细胞动物、高等植物、原生动物、藻类、真菌)中变化很大多细胞动物:细小、致密,没有或很少非编码序列高等植物:复杂、不均一,比动物的大得多原生动物、藻类、真菌:或偏向于动物型,或偏向于植物型,但又有其各自的独特之处叶绿体基因组--比较均一,85 ~ 292 kb(大部分都在120 ~ 160 kb之内);特例:伞藻属(Acetabularia),2000 kb2.转录(transcription)2.1.RNA聚合酶(RNA polymerase)原核生物:1种,全酶(holoenzyme)由核心酶(2α, β, β’)与σ亚基组成,σ亚基的作用是a)降低酶与非特异DNA的亲和力; b)提升酶与启动子的亲和力。
植物反转录转座子及其分子标记王子成1,2李忠爱2邓秀新1(1华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,湖北武汉,4300702 河南大学生命科学学院,河南开封,475001)摘要:反转录转座子(retrotransposon)是真核生物中一类可移动因子,可分为LTR反转录转座子和非LTR反转录转座子。
反转录转座子以高拷贝在植物界广泛分布,可以通过纵向和横向分别在世代之间和不同种之间进行传递,同一家族的反转录转座子具有高度的异质性. 在一些生物的和非生物的逆境条件下,反转录转座子的转录可以被激活。
由于反转录转座子的特点,使其作为一种分子标记得以应用。
S-SAP,IRAP,REMAP和RBIP等分子标记相继发展起来,在基因作图、生物遗传多样性与系统进化、品种鉴定等方面具有广泛的应用前景。
关键词反转录转座子,分子标记Plant retrotransposons and their molecular markersWang Zicheng1,2Li Zhongai2Deng Xuixin11 National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Huazhong Agriculture university HubeiWuhan, 4300702 College of life science ,Henan University, Henan Kaifeng, 475001Abstract: Retrotransposons are a class of eukaryotic transposable elements, consisting of the long terminal repeat (LTR) and non-LTRretrotransposons. Retrotransposons are ubiquitous in the plant kingdom by high copy number and can be transmitted between generations by vertical transmission and between species by horizontal transmission. The same family retrotransposons presented highly heterogeneous populations in all higher plant genomes. Many of the plant retrotransposons are transcriptionally activated by various biotic and abiotic stress factors. Retrotransposons are used as molecular markers for their traits. S-SAP, IRAP, REMAP and RBIP are developed and will be applied widely in gene mapping, genetic biodiversity and phylogeny studies, and cultivar certification.Key words: retrotransposons molecular markers反转录转座子是广泛分布于真核生物中的一类可移动因子,因其转座需经过由RNA介导的反转录过程而得名。