Western Blot相关试剂配方及详细实验步骤
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Western Blot详细实验步骤及试剂配方1. 溶液配置1.1 5×SDS-PAGE上样缓冲液(Loading buffer)药品用量1 M Tris-HCl (PH=6.8) 1.25 mLSDS 0.5 gBPB(溴酚蓝,有毒)25 mg甘油 2.5 mL去离子水up to 5 mL分装至1.5 mL离心管中,每管500 μL,室温保存,使用前每管加入25 μL的β-巯基乙醇。
1.2 10×SDS-PAGE电泳缓冲液(Running buffer 母液)药品用量Tris 30.3 gGlycine (甘氨酸) 144.2 gSDS 10 gddH2O up to 1 L室温保存即可,使用时稀释为1×的工作液,可回收反复使用4~5次。
1.3 Tris-HCl缓冲液(1)1.5 M Tris-HCl (PH=8.8)→制分离胶Tris (MW: 121.14) 45.43 gH2O up to 250 mL浓盐酸调PH 8.8(2)1.0 M Tris-HCl (PH=6.8)→制浓缩胶Tris (MW: 121.14) 30.29 gH2O up to 250 mL浓盐酸调PH 6.8二者高压灭菌后,置于室温保存即可。
1.4 10% SDS (十二烷基硫酸钠)SDS 10 gddH2O up to 100 mL室温保存即可。
1.5 10% AP (过硫酸铵)→1.5 mL 离心管配制过硫酸铵(刺激性,腐蚀性) 0.1 g超纯水up to 1 mL混匀后,锡箔纸包住,避光处理,置于-20℃保存。
1.6 30% 丙烯酰胺溶液丙烯酰胺 150 g甲叉双丙烯酰胺 4 gMilli-Q水 30 mL滤纸过滤,Milli-Q水定容至500 mL,装入棕色瓶子中,4℃保存。
1.7 10×转膜缓冲液(Trans buffer 母液)Tris (MW: 121.14) 30.3 gGlycine (甘氨酸) 144 g去离子水 up to 1 L室温保存即可,其1×的工作液配制为:100 mL母液+200 mL甲醇(有毒)+700 mL水。
1.8 脱色液(蛋白胶考染后脱色)甲醇 30 mL冰醋酸 10 mLddH2O up to 100 mL注意:甲醇具有挥发性,对人体的神经系统和血液系统影响最大,它经消化道、呼吸道或皮肤摄入都会产生毒性反应,甲醇蒸气能损害人的呼吸道粘膜和视力,使用过程中最好戴口罩。
脱色液常温放置即可。
1.9 考马斯亮蓝染色液(100 mL)考马斯亮蓝R-250 0.25 g甲醇 45 mLddH2O 45 mL冰醋酸 10 mL过滤除去颗粒状物质。
1.10 10×TBS缓冲液Tris (MW: 121.14) 12.11 gNaCl 87.66 gH2O up to 1 L调PH 7.4~8.0高压灭菌后,室温保存即可。
1.11 洗脱液(TBS-T)10×TBS 100 mLH2O up to 1 LTween 20/80 0.5 mL加了Tween 20/80后的洗脱液,需要置于4℃保存。
1.12 10×PBS缓冲液NaCl 80 gNa2HPO4 28.8 gKH2PO4 2 gH2O up to 1 L高压灭菌后,室温保存即可。
1.13 洗脱液(PBS-T)10×PBS 100 mLH2O up to 1 LTween 20/80 0.5 mL加了Tween 20/80后的洗脱液,需要置于4℃保存;PBS-T与TBS-T同功。
1.14 封闭液(现配)脱脂奶粉 5 g1×T/PBS-T up to 100 mL混匀后,与4℃可保存一周,若加了防腐剂,一抗可以回收循环使用直到杂不出蛋白为止。
1.15 一抗孵育液(鼠源His抗体为例)封闭液 15 mL鼠源His抗体 2 μL冰上操作,于4℃保存即可,可回收使用。
1.16 二抗孵育液(鼠抗为例)封闭液 10 mL鼠抗 2 μL现配现用,不用回收。
1.17 100 mM PMSF (苯甲基磺酰氟)PMSF 0.174 g异丙醇 up to 10 mL混匀后分装到1.5 mL离心管中,每管1 mL,置于-20℃保存,其工作液一般为1 mM,我们实验室使用的是2 mM的工作液,有剧毒,使用时注意安全,吸入、误服或通过皮肤吸收,都可致命。
2. 实验步骤(原核表达为例)2.1 菌种培养将原核表达载体转化BL21感受态细胞,之后涂板(含抗生素的培养基,一般是卡纳或氯霉素),过夜培养后,挑选单克隆到装有2 mL LB培养基(Kan+)的10 mL离心管中,在摇床中(37℃,225 rpm)过夜活化(12 h左右)。
2.2 原核表达菌扩大培养按1:100的比例稀释(如在装有25 mL抗性LB培养基的50 mL离心管中加入250 μL菌种培养液),在摇床中(37℃,225 rpm)培养2 h。
2.3 OD值测量提前开好超净工作台的紫外,将扩大培养的菌在超净工作台中吸取1 mL放入1.5 mL的EP管中,待检测,记得吸取无菌的LB培养基去调零。
大肠杆菌菌液OD值为0.5~0.6时为对数期最佳,此时的细胞活性最佳。
以A732的分光光度计为例,说明OD值测量的详细过程。
(1)开机:实验室的分光光度计有些问题,需要提前40 min打开,第一次打开,程序会卡在检查步骤四,需经过5 min后关掉,再打开,静候35 min。
(2)吸收光设置:按1(光度)→GOTO WL→输入“600”→ENTER→F1 (T% / ABS) →F3(测量屏幕)。
(3)调零:用1 mL移液枪吸取800 μL无菌的LB培养基(空白对照)加入比色皿中(应素平提供,若是全空的比色皿可能需要3 mL),放入测量位置→AUTO ZERO(稍等片刻,听到有跳闸声)→START→测得到LB培养基的OD值为0左右。
(4)菌液OD值测量:在超净工作台中量取1 mL菌液至1.5或2 mL PE管中,然后量取其中的800 μL至比色皿中(菌液换取应倒入固定的锥形瓶中,稍后高压灭菌,使抗生素失活),比色皿放入卡槽,点击START测量其OD值,将OD值调为0.6左右为佳(比如测到OD值为0.45,则再培养10 min继续测,OD 值为0.5~0.6最佳)。
(5)关机:RETURN→MODE→F3(是)→关闭电源,清洗比色皿。
2.4 IPTG诱导吸出5 mL左右作为对照(不加IPTG),剩余的菌液中加入IPTG,其工作浓度约为0.8-1.0 mM(如在23 mL菌液中加入23 μL 浓度为1 M的IPTG),置于摇床中,16℃诱导培养10-12 h(注:IPTG浓度和诱导温度需要摸索,不同蛋白可能不一样,IPTG有毒,操作小心)。
如果没有蛋白表达就需要筛选条件了,如进行过0.4 mg/20 mL ,0.6 mg/20 mL,0.8 mg/20 mL,1.0 mg/20 mL,摇床温度25或28℃等。
2.5 收集细胞吸出1.8 mL菌液于2.0的EP管中,4℃,5000 rpm离心10 min收集细胞,将上清倒掉,加入1.8 mL PBS重悬(或bing buffer)细胞,并加入PMSF使终浓度为2 mM,并将其转移至5 mL离心管中,准备破碎细胞。
剩余的菌液于A732的立式离心机,4℃,5000 rpm离心10 min收集细胞,沉淀可以在-20℃保存;待日后使用。
2.6 细胞破碎利用超声波破碎仪裂解细胞,工作5 s停5 s,打8 min,看到原来比较浑浊的菌液变得比较澄清,说明细胞破碎得很好。
裂解过程需低温处理,将样品放于冰水混合物中进行破碎操作;细胞破碎后,12000 rpm,1 min,收集上清和沉淀,或将上清分装到1.5 mL离心管中,每管20 μL,保存于-80℃。
或直接进行SDS-PAGE检测,确定蛋白是否表达出来,是否会形成包埋体,同时调整蛋白浓度。
2.7 蛋白胶的制备先将玻璃板和梳子洗干净,晾干,然后配胶。
13% 分离胶的配制:去离子水 2.7 mL30% 丙烯酰胺 4.6 mL1.5 M Tris-HCl (PH=8.8)2.5 mL10% SDS 100 μL10% AP 100 μLTEMED(四甲基乙二胺) 4 μL按如上顺序加样,加到SDS之后的样品都需要用枪头搅拌混匀,用1 mL的枪吸取分离胶加到已装好的板子上,然后用去离子水压线,大约半小时即可凝固。
注意:AP(过硫酸铵)对皮肤粘膜有刺激性和腐蚀性,吸入后引起鼻炎、喉炎、气短和咳嗽等;眼、皮肤接触可引起强烈刺激、疼痛甚至灼伤。
口服引起腹痛、恶心和呕吐。
长期皮肤接触可引起变应性皮炎。
TEMED(四甲基乙二胺)有毒,易燃,有腐蚀性和刺激性。
<5% 浓缩胶的配制:去离子水 3.4 mL30% 丙烯酰胺 830 μL1.0 M Tris-HCl (PH=6.8) 630 μL10% SDS 50 μL10% AP 50 μLTEMED 5 μL按如上顺序加样,加到SDS之后的样品都需要用枪头搅拌混匀,将压线的水倒干净,然后用1 mL的枪吸取浓缩胶加到已装好的板子上,插梳子,给1小时凝固时间。
2.8 煮样将已经分装好的20 μL/ 1 EP管中加入5 μL的5×Loading buffer,在煮样机中100℃煮12 min。
目前比较惯用的做法是将样品放到PCR管中,利用PCR 仪进行蛋白质变性工作。
2.9 点样跑胶Marker 为6 μL,样品7 μL,所有孔都要点上样品,让其平衡。
跑浓缩胶的条件为恒压90 V/20 min,分离胶为110 V/1.5 h,电泳至前沿溴酚蓝刚刚跑出。
注:①用移液器取7 μL样品;tip投紧靠玻璃板,慢慢加入样液,加入上样孔中切勿产生气泡(样液中一般会加入溴酚蓝作为指示剂);②上样完成后,检查Running buffer是否过最低玻璃板,即胶块要浸在Running buffer中才能有电流通过;(使用新鲜的buffer);③组装电泳仪(红色部分对准红色电极,黑色部分对准黑色电极),矮的一面在内测,待会会浸泡在Running buffer中。
90V,电流在60 mA左右为正常。
(先采用90V跑浓缩胶,后采用110V跑分离胶)2.10 考染用考马斯亮蓝考染1小时,然后用去离子水煮法脱色,考马斯亮蓝可以回收循环利用(先倒在小烧杯中,再倒到瓶子里)。
水煮法是先用1 L烧杯盛500 mL 水在电炉上煮开,然后放胶进去煮10分钟左右,然后换水,再煮,重复3次左右即可,注意不要让胶折叠,不然边缘有缺口的地方会裂,导致蛋白胶断裂;脱色好的胶拿到8楼的显影仪照胶。