Western Blot 实验步骤(自己总结)
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Western Blot步骤北京协和医学院 阜外心血管病医院 心外科 心血管病国家重点实验室吴益和一.心肌总蛋白提取(一)——TRIzol® Reagent蛋白质的提取1. 准备试剂:异丙醇;含0.3M盐酸胍的95%乙醇;无水乙醇; 1%SDS。
1. 含0.3M盐酸胍的95%乙醇:盐酸胍(分子量95.53):95%乙醇=14.3295g:500ml2.1%SDS:SDS:H2O=0.5g:50ml2. 操作步骤:1. 取沉淀DNA后剩余的上清,用异丙醇沉淀蛋白质。
每使用1ml TRIzol加1.5ml异丙醇,室温放置10分钟,2~8℃12000×g离心10分钟弃上清;2. 准备0.3M盐酸胍(guanidine hydrochloride)的95%乙醇洗涤液;3. 用含0.3M盐酸胍(guanidine hydrochloride)的95%乙醇洗涤蛋白质沉淀。
每使用1ml TRIzol加2ml洗涤液,室温放置20分钟(Note: .蛋白质沉淀可保存在含0.3M盐酸胍的95%乙醇中2~8℃一个月以上或-20℃一年以上);4. 2~8℃7500×g离心5分钟,弃上清;5. 重复3-4两次以上;6. 在三次洗涤后加2ml无水乙醇到蛋白质沉淀中,涡旋混匀15秒(Note: .蛋白质沉淀可保存在无水乙醇中2~8℃一个月以上或-20℃一年以上);;7. 室温下孵化20分钟;8. 2~8℃7500×g离心5分钟,弃上清;9. 风干蛋白质沉淀5-10分钟(可以延长时间直到满意为止),不要干燥过度;10.蛋白质重悬浮:1)用1% SDS(十二烷基硫酸钠)溶解蛋白质(200 μL),反复吸打,50℃温浴使其完全溶解;2)2~8℃10000×g离心10分钟除去不溶物;3)将包含蛋白质的上清转移到新的EP管中(此时分离得到的蛋白质样品可直接用于Western Blot(之前先测浓度)或-20℃保存备用);4)因为不同溶剂中某些蛋白质的溶解性不同,SDS溶液中蛋白质的可溶性差,如果蛋白质沉淀在SDS溶液中不可溶,那么可以选择下面的溶剂(Hummon et. al., 2007)来溶解蛋白质沉淀:1% SDS and 62.5 mM sarkosyl(肌氨酰:裂解病毒颗粒或感染细胞的一种去污剂)at pH 8.0–8.8; 9.5 M urea and 2% CHAPS, pH 9.1; 250mM glycerol(甘油), 10mM TEA, and 4% CHAPS; 2% diethylamine(二乙胺); 10M Urea(尿素)。
3. 常见问题分析:1. 得率低:A.样品裂解或匀浆处理不彻底;B.最后得到的蛋白质沉淀未完全溶解。
2. 蛋白质降解:组织取出后没有马上处理或冷冻。
3. 电泳时条带变形:蛋白质沉淀洗涤不充分。
要不直接用裂解液或SDS缓冲液来代替1% SDS溶解蛋白质采用上述方法提取的蛋白,可以用lowry法或BCA法进行蛋白定量一.心肌总蛋白提取(二)——裂解液法提取总蛋白1.材料心肌:手术室活检标本试剂:蛋白裂解液,碧云天,产品编号P0013仪器:组织匀浆机,Tekmar2.方法和过程:(1)将心肌组织块(2×2×2mm)放入含有裂解液的1.5ml EP管中(裂解液含量视组织量而定),用微量匀浆器进行冰上迅速低温匀浆,直到看不见颗粒为止。
(如果需要测磷酸化蛋白,则在裂解液中加入磷酸酶抑制剂(普利来公司),具体方法见说明书)(2)将匀浆液移至EP管中,冰上放置10分钟,14000rpm/min,4℃,离心15分钟,取上清,-80℃保存备用,待测浓度。
二.蛋白浓度测定1.材料准备:试剂:碧云天BCA蛋白浓度测定试剂盒(增强型)产品编号P0010仪器:酶标仪(BIO-RAD 680)2.方法步骤(见试剂盒说明书):(1)取1.2ml蛋白标准配制液加入到一管蛋白标准(30mg BSA)中,充分溶解后配制成25mg/ml的蛋白标准溶液。
配制后可立即使用,也可-20℃长期保存;(2)稀释标准品:取适量25mg/ml蛋白标准,稀释至0.5mg/ml(蛋白样品在什么溶液中,标准品也宜用什么溶液稀释。
但为了简便起见,也可以用0.9%NaCl或PBS稀释标准品)。
稀释后的0.5mg/ml蛋白标准也可-20℃长期保存;(3)配制BCA工作液:按50体积试剂A加1体积试剂B配制适量工作液,充分混匀(配制的量视样本量而定,200µl/孔)。
工作液室温24小时内稳定。
(4)加标准品:将标准品按0、1、2、4、8、12、16、20µl加入96孔板的标准品孔中(做副孔),加标准品稀释液补足到20µl。
(5)加样品:加2μl样品到96孔板的样品孔中,加18μl PBS(最好用1%SDS或裂解液,保持与原样本中的一致),使总体积达到20μl。
(6)加工作液:每孔加入200µl步骤2所配制工作液。
(7)37℃静置20-30分钟。
可室温放置2小时。
(8)酶标仪测定A562,540-595nm之间的波长也可接受。
(9)EXCEL绘制标准曲线,根据标准曲线计算样品的蛋白浓度。
附:倍比稀释方法1.取8个EP tubes;2.第1管加入25μl 0.5mg/ml蛋白标准品,其余各管加入25μl ddH2O(最好用1%SDS或裂解液,保持与样本中的一致);3.向第2个tube中加25μl BSA蛋白标准品,混合均匀后从第2个tube中取25μl稀释后的BSA到第3个有25μl ddH2O的tube中,混合均匀;再从第3个tube中取25μl第二次稀释后的BSA到第4个有25μl ddH2O的tube中;……直到第7个tube;4.第8个管为空白孔,单加ddH2O(最好用1%SDS或裂解液,保持与样本中的一致);5.如此配制出稀释了1倍,2倍,4倍,8倍,16倍,32倍,64倍,空白……的蛋白标准品溶液。
三.Western Blot用蛋白样品制备1.材料:5×loading buffer(普利莱公司)或4×loading buffer(Takara公司)2.方法:样品 40μg蛋白量 10-40µg,我的20µg足已4μl(20μl体系)/6μl(30μl体系)5×SDS loading buffer或4×loading buffer 5μl(20μl体系)/7.5μl(30μl体系)上样缓冲液中含有DTT,不需要再加DTT加ddH2O 至总体积20μl(30μl)100℃,加热5min使蛋白变性,立即放冰中速冷,-20℃放置备用。
(上样总体积一般不超过20μl,加样孔的最大限度可加30μl样品。
)四.聚丙稀酰胺凝胶电泳1. SDS聚丙稀酰胺凝胶的配制(自制胶)准备:玻璃板用水冲干净,直立晾干,餐巾纸擦干净。
装上玻璃板,前后推动,最后往前拉些距离,扣上开关。
槽下面的海绵条带些水,可以部分抵抗漏水。
放装有玻璃板的架子于槽上,先放下部,再靠上部,加紧。
加入水,液面稍高些,等15分钟,看是否漏水。
然后拿整个槽将水倒掉,再用吸水纸吸干玻璃板内的残余水份。
1)安装玻璃板z玻璃板洗干净即可z小玻璃板向前,两玻璃板间夹上spacer,拧紧螺栓固定(安装一定要平,防漏水)z加满蒸馏水,看是否漏水,静置 15min(记录漏液体积,以胶补充)z用窄滤纸条吸干两玻璃板间的水滴2)按分子量配制一定浓度的分离胶(12%,体积10ml)ddH2O 3.3ml 30%丙烯酰胺溶液 4.0ml1.5 mol/L Tris(PH8.8)2.5ml10%SDS溶液 100μl10%过硫酸铵(AP) 100μlTEMED 4μlz加TEMED之前,充分混匀内容物,一旦加入TEMED,快速旋动混合物。
z在两玻璃板的间隙中灌胶,每板约3.5ml,加至旁边绿色柱子的上缘(如开始有漏液现象,则要补上漏的那部分体积)z在胶溶液上加满ddH2O(或加无水乙醇可以消泡),室温30min(可防止氧气扩散进入凝胶而抑制聚合反应)附:标准的:SDS-聚丙烯酰胺凝胶的有效分离范围丙烯酰胺浓度(%)线性分离范围(kDa)15 10-4312 12-6010 20-807.5 36-945.0 57-212网上的:分子量范围与凝胶浓度的关系分子量范围适用的凝胶浓度/(%)蛋白质<10420-301-4×10415-201-5×104-1×10510-151×1055-10>5×1052-5核酸(RNA)<10415–20104–1055-10105-2×1062-2.63)分离胶聚合完全后倾去上层水,用窄滤纸尽可能排去凝胶上的水,再用纸巾的边缘吸净残留液体(倾斜胶,吸水纸放于一侧洗净水分),用记号笔做一个分离胶上沿记号,以备电泳换压。
4)按试剂配制部分给出的数值在小瓶中配置5ml/2块板的积层胶ddH2O 3.4ml 30%丙烯酰胺溶液 830μl1.0 mol/L Tris(PH6.8) 630μl10%SDS溶液 50μl10%过硫酸铵(AP) 50μlTEMED 5μlz加TEMED之前,充分混匀内容物,一旦加入TEMED,快速旋动混合物z在两玻璃板的间隙中灌胶,每板约2mlz灌好胶后立即在积层胶溶液中插入Teflon梳子,小心避免混入气泡z再加入积层胶以充满梳子之间的空隙,室温下垂直放置30min。
等待期间拿出蛋白marker及样本放在冰中,并配制1×电泳液:400ml 5×电泳液+1600mlddH2O。
每个电泳槽内加大约800ml电泳液,先加外槽,再加内槽。
内槽必须用新的电泳液,外槽可以用旧的电泳液(只能用2次)。
附:制备胶1. 不同分子量需要的缓冲液:15 kDa to 260 kDa (MOPS Buffer),3.5 kDa to 160 kDa (MES Buffer)2. 拿出蛋白marker及样本放在冰中,并配制1×电泳液:每次需500ml, ddH2O稀释。
3. 每个电泳槽内加大约500ml电泳液,先加内槽观察有无漏水,再加外槽。
内槽必须用新的电泳液,外槽可以用旧的电泳液(只能用2次)。
2. 上样电泳注:上样体积<30ul,蛋白50-100ug(我的10-40ug)1)拔去梳子,用洗瓶加蒸馏水洗涤加样槽去除未聚合的丙烯酰胺(制备胶不用)。
2)把凝胶固定在电泳装置上,内外槽均加入1×Tris-Gly电泳缓冲液(固定凝胶时,短面玻璃朝里,制备胶则是有字方向朝外)z每个电泳槽内加大约500ml电泳液,先加内槽观察有无漏水,再加外槽。