Western blot实验流程

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Western blot一.仪器及器皿:棕色广口瓶5个(50ml),灭菌,烧杯3个灭菌,EP管,枪及枪头,分光光度计,超声破碎机,冷冻离心机,灭菌0.9%生理盐水,冰,灭菌水(1000ml),两套灭菌器械。

二.药品配制:1.TBS×10(Tris Buffered Saline):2.42 g Tris base8g NaCl100ml H2O, 用HCl调pH 7.6,4°C保存.(配TBST用)2.TBS:0.303 g Tris base0.4383g NaCl (150mM)0.05gSDS用HCl调pH至8.0(配裂解液用),50ml约用2.1mlHCl。

3.0.5M Tris-HCl(pH6.8),50ml,:3gTris-base加灭菌水约30ml,用6N盐酸缓缓调pH至6.8(约用1ml),定容至50ml,4℃保存。

(若调小了,用5.6%NaHCO3调回) 。

1.5M Tris-HCl(pH8.8),50ml,9.08gTris-base加灭菌水约40ml,用6N盐酸缓缓调pH至8.8(约用2ml),定容至50ml,4℃保存。

4.5×Running buffer pH8.3,500ml:Tris-base 7.5g,Glycine(甘氨酸) 36g,SDS 2.5g加灭菌水至500ml, 4℃保存,用时若有沉淀析出可提前拿出置37℃,不用调pH值,用时按1:5稀释,即60ml的5×Running buffer加入240ml水。

5.30%acrylamide(丙稀酰胺贮液):8.76g acrylamide, 0.24g N, N'-methylene-bisacrylamide(亚甲基双丙烯酰胺),加少许灭菌H2O搅匀,最后定容至30 ml 。

用0.45 µm的过滤器过滤后4°C避光可保存30天。

6.10%SDS:5gSDS+50 ml H2O,(难溶,需较长时间),常温保存。

7.10%APS (ammonium persulfate,过硫酸铵(粉剂也保存在4°C):100mg APS +1ml H2O,EP管中即可,4°C保存1周,-20°C保存1个月,时间长了胶难凝。

.8.0.1% bromophenol blue dye溴酚蓝10ml溴酚蓝10mg加ddH2O至10ml,搅匀溶解,过滤除去未溶颗粒。

9. 2×Sample buffer(1:1)避光保存10%SDS (1g/10ml) 400μl0.5M Tris(pH6.8) (0.6055g/10ml) 250μl100% Glycerol(甘油,丙三醇) 200μl2-mercaptoethanol(巯基乙醇) 100μl0.1% bromophenol blue (10mg/10ml) 80μl总计1030μl 避光4°C保存。

4×Sample buffer(1:1)避光保存:10.胶Stain Solution(蛋白染液):100mgCoomassie Brilliant Blue G 250(考马斯亮蓝)溶于50ml95%的乙醇,加入100ml 85%的H3PO4,及50mlddH2O, 4°C保存于棕色瓶中。

Coomassie Brilliant Blue R 250(考马斯亮蓝-R250):R250 0.5g甲醇 225ml →定容至500ml冰醋酸 50ml11. 胶Destain Solution(脱色液)for Coomassie Brilliant Blue:acetic acid(冰乙酸) 100mlmethanol(甲醇) 100ml加水至1000ml .若转完膜后染色则不用10及11,改用12和13。

12.NC膜染色液:0.1%氨基黑染液:氨基黑 0.2gmethanol(甲醇) 90ml冰醋酸 20ml加水至200ml.13.NC膜脱色液:methanol(甲醇) 180ml冰醋酸 4ml加水至200ml.14.配转膜液(transfer buffer):Tris 6.06gGlycine 28.8gMethanol (甲醇) 400mlDDH2O to 2000ml,混匀后不用调pH值, 4℃保存。

(提前将前两种配成800ml,为2×transfer buffer转膜时取400ml加入400mlH2O,另加200 ml Methanol (甲醇)即可)。

注:所用水最好为灭菌的去离子水便于长期保存。

三实验步骤.(一)提取蛋白并测蛋白浓度:1.开离心机,4 °C;2. 配裂解液:1mlTBS(pH至8.0)加入10μlNP-40,1μl Pepstatin(1μg/ml), 胃蛋白酶抑制剂A,溶于DMSO(二甲基亚枫),-20°C保存1μl Leupeptin(1μg/ml), 亮抑蛋白酶肽,溶于ddH2O,-20°C保存1μl Aprotinin(1μg/ml),抑蛋白酶肽,溶于ddH2O,-20°C保存。

5μl PMSF(100μg/ml),phenyl methylsulfonyl fluoride ,苯甲基磺酰氟,溶于异丙醇(isopropanol),-20°C保存。

3.拿冰置于冰盒内,裂解液配好后即放于冰水上;4.用1%戊巴比妥钠麻醉后取材,最好小于100mg,用冷TBS或冷生理盐水冲洗后(做蛋白最好灌流,做RNA要用70%酒喷毛,若不即用可在液氮中冷冻30min后,-70°C保存),加入裂解液(100mg/ml),放于冰上,剪碎组织;剩余裂解液仍放于冰上,以备稀释样品用;5.超声破碎,小烧杯内有冰,EP管置于冰水上,稳定并降温,4×10s,560W,间隔10S,超至无块状即可;6.离心4 °C,12000g,20min离心机转动时打至time档性能稳定;开分光光度计,595nm;7.于灭菌烧杯中配染液:4ml(protein dye regent, Sigma)+16mlH2O8.配标准蛋白,成倍数(根据药盒说明,有线性关系的浓度分别为0,0.15,0.3,0.6,0.9μg/μl ,因此0.3μg/μl 的标准蛋白各取0.5,1,2,3μl,各两个样,取0.5μl时要在液面上吸,每次取完液要目测一下,2μl 为最下线,10μl为第二线),并加入1ml染液;震荡混匀,测标品吸光值595nm,以备做曲线;用BLANK调0,再由低浓度向高浓度测,间隔时只需倒置于滤纸上吸干残液即可,箭头朝向光束方向,手指不要摸光面,杯内若有气泡,停一下再测,放置比色杯时位置要固定,用染液洗杯,用1cm光路测;9.取上清放于新EP管中,放于冰水上,取1μl加19μl ddH2O稀释20倍,从中再取1μl加入1ml 染液,室温后5min,测吸光值,各有两个样,应在混匀后30min之内测完。

10.对标品用Excel做图,输入吸光值及对应浓度(包括空白),做散点图,完成图后添加趋势线,截距为0,公式及R2(相关系数)均选,得到相应公式(Y= B×X),再计算浓度即可,结果应×20(稀释倍数)。

加样时每个孔应有50μg,用50/浓度即为加样量μl。

样品即用可放于冰上,否则分装后放于-70℃。

(二)电泳(SDS-polyacrylamide gel electrophoresis)1.检查电泳所需的各种试剂和器械(BIO-RAD第3代产品),并从4℃拿出药品;2.清洗电泳所用的玻璃板(平时浸泡于洗洁精液中),擦酒精(70%),晾干或60-70℃烤干;3.装置电泳玻璃板(长板在内短板在外)并固定(卡住);4.APS 和TEMED要最后用时再加,混匀,每边用枪从板左上角加入4ml,枪头内胶不要全推出,即再吸再加入,防止出气泡,加胶比5cm的刻度线稍高,用去离子水滑行方式加满覆盖压住胶(因为只在一角加入会使胶面不平),使凝固(水封下出现折光面),除去水层,用水冲洗2次,并用滤纸吸干残留的水分;等约30min。

加入浓缩胶,每边加满,立即插上梳子(平整面朝内,先一端插入,缓慢斜放至另一端插入)注意不要有气泡,可用70%酒精排出;等30min左右。

加完浓缩胶立刻开始准备样品,并打开水浴锅,100℃;胶凝后(可见齿边缘与胶有空隙)垂直拔出梳子;先用去离子水冲洗加样孔,再用Running buffer冲洗;5.准备样品,每孔使用总蛋白量50微克,计算使用的样本量,根据loading buffer的浓度,加样量为10μl,即样本量(50/浓度)用裂解液补充总体积至5μl再加入5μl Sample buffer(2×),另有marker 和一个Sample buffer(1×),上样时加在一侧(防止跑歪),也可不用。

(先加水,再加5μl Sample buffer,最后加蛋白),加完后离心再100℃水浴5min后放于冰上,准备上样。

6.放好电泳槽,将制好的胶板反过来(短面在内,如果跑单面胶,则放置好胶板后,另一面放塑料板,字面向内,夹紧),外加旧缓冲液Running buffer,两板之间加入稀释5倍的新缓冲液Running buffer(约用150ml,即35ml5×+140ml水)。

上样,吸样时枪要大于10μl(先调至8μl,再向大量程调枪,则余下进入,并保证枪尖上无气泡,但枪尖和管壁不要贴得太紧)。

100V,20min,再200V,45min。

(若在冰盒中电泳,时间可稍延长,但是浓缩胶一定要跑完才可以变电压再跑分离胶)。

(三)电泳转膜1.溴酚兰快达底部即可停止电泳;2.(切下Marker及样品1、 2、3的胶,用Coomassie Brilliant Blut G(考马斯亮蓝)染色约30min (摇床)后用Destain脱色液脱色2h,并于凝胶成像中观察)此步可省,可在转完膜后,将膜剪下再用氨基黑染色;3.配转膜液1000ml:取400ml 2×transfer buffer加入400mlH2O,另加200 ml Methanol (甲醇)即可;再加入1ml10%SDS利于转膜;4. PVDF 膜预处理:用甲醇浸泡1min→ddH2O 3个5min→转膜液浸泡15minNC膜(nitrocellulose membrane,硝酸纤维素膜)(8.5×5.5cm)直接用转膜液浸泡10min 切4张8.8×5.8cm滤纸(Whatman 3mm层析纸),与海绵垫均用转膜液浸泡10min;切除浓缩胶(记清方向及要剪下染全蛋白的膜长度,并用铅笔标记于NC膜上),将胶于转膜液中浸泡10min;5.摆放顺序夹子黑色面+海绵(聚乙烯板)+2滤纸+凝胶(剪左角)+NC膜(不分正反面)+2滤纸+海绵+夹子白色面(三明治),注意每放一层用玻璃棒赶一次气泡,并要始终保持湿润,否则胶易碎;将三明治固定在转膜槽内,且夹子黑色面对转膜槽黑色面;一定要赶净气泡,否则会产生高背景或影响蛋白转移。