随机扩增多态性DNA反应体系优化的研究
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佛手种质资源遗传多样性的随机扩增多态性DNA分析(作者:___________单位: ___________邮编: ___________)【摘要】目的研究佛手种质资源多样性和遗传关系。
方法采用随机扩增多态性随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了佛手13份种质材料的亲缘关系。
结果从110条引物中筛选出16条多态性高的引物,共扩增出185条DNA带,其中多态性带有168条,多态率为90.8%。
通过聚类分析,在相似系数0.67的水平上将13份材料分为3类。
结论佛手种质间存在较丰富的遗传多样性,聚类结果与以产地为依据对佛手进行品种类群划分较为一致。
【关键词】佛手随机扩增多态度性DNA分析遗传多样性佛手Citrus medica L. var. sarcodactylis (Noot.) Swingle(CMS)为芸香科柑桔属植物,其干燥果实入药,具有舒肝理气、和胃止痛的功效[1]。
佛手悠久的栽培历史,形成了一些各具特色的地方品种,药材现行规格按产地主要分为广佛手、川佛手和浙佛手[2]。
目前,有关佛手种质资源的研究很少,对其种质资源的多样性和遗传结构缺乏系统的研究。
随机性扩增多态性DNA(RAPD)技术是20世纪90年代发展起来的一种快速便捷的分子标记技术,已被证明是研究植物遗传多样性及种质鉴定的有效手段,广泛应用于药用植物种内、种间及近缘属间系统学研究[3~5]。
本文拟采用RAPD技术分析佛手不同产地、不同栽培品种的亲缘关系及遗传多样性,旨在探究其基因组上的差异,为佛手种质资源的评价和育种提供分子依据。
1 器材和方法1.1 材料佛手Citrus medica L. var. sarcodactylis (Noot.) Swingle(CMS)的叶片,经广州中医药大学鉴定教研室张丹雁教授鉴定。
样品来源见表1。
1.2 仪器与试剂Beckman -15CSR冷冻高速离心机;PCR仪(Applied Biosystems 2720 Thermal cycler);UVP GDS7600型凝胶成像仪;ECAN Spectra FLUOR plus多功能酶标仪。
玉米种质资源RAPD分子标记优化体系的建立摘要:玉米是我国重要的作物之一,在我国农业生产中占有重要的地位。
吉林省玉米生产条件优越,推广面积广,品种的多样性丰富,为实现品种的管理高效科学,本实验以用玉米为材料进行rapd 的研究。
建立并优化了高效、稳定的玉米rapd实验体系,为后续玉米品种的管理提供了理论基础和实验支持。
关键词:玉米;rapd;体系中图分类号:s513 文献标识码:a 文章编号:1674-0432(2012)-10-0050-1rapd(random amplified polymorphic dna,rapd)也称之为ap-pcr (arbitrary primer pcr),即随机扩增多态性dna技术,是由williams和welsh等发明的分子标记技术,是一项基于pcr技术的分子生物技术[1,2]。
是以基因组dna为模板,常以一个10mer随机的寡核苷酸序列作引物,通过pcr扩增,产生许多不连续的dna 产物,以检测dna序列的多态性。
它可以在物种遗传背景没有任何分子生物学研究的情况下,对其进行基因组指纹图谱进行研究,还可用于检测体细胞杂种和微生物分型[3]。
玉米是最为古老的栽培作物之一,目前为我国栽培作物的第二位。
吉林省是我国的玉米大省,玉米种植面积在全国位于前五,每年审定的新品种数目为全国第一。
由于目前玉米为品种检定手段还不完善,导致品种管理有一定的难度。
故本文进行了玉米rapd分子标记体系的相关研究。
1 材料与方法1.1 供试材料购买市售玉米主推品种种子。
1.2 试验试剂和仪器taqdna聚合酶、10×pcr buffer(含mg2+)、10碱基随机引物、dntps;琼脂糖、dna分子量标准(d2000maker)等购自上海生工。
1.3 rapd方法1.3.1 dna的提取以玉米种子产生的嫩芽为材料,使用植物基因组试剂盒提取。
dna回溶于灭菌水中,-20℃保存备用,1%琼脂糖凝胶电泳检测质量。
何首乌及其混伪品序列相关扩增多态性反应体系的优化(作者:___________单位: ___________邮编: ___________)【摘要】目的建立何首乌及其混伪品序列相关扩增多态性(SRAP)分子鉴定技术体系。
方法正交优化影响SRAP-PCR 的Mg2+、dNTPs、引物浓度与Taq聚合酶量。
结果20 μl反应体系的优化组合为:Mg2+ 2.5 mmol/L,dNTPs 0.4 mmol/L,引物0.35μmol/L,Taq酶1U。
结论Mg2+、dNTPs、引物浓度与Taq聚合酶量对不同物种SRAP-PCR结果有不同程度影响,利用SRAP分子鉴定前应对此4因素进行优化。
【关键词】何首乌混伪品序列相关扩增多态性优化Abstract:ObjectiveIn order to characterize Polygonum multiflorum Thunb. and its adulterants, the SRAP molecular marker system was established.MethodsOrthogonal design was used to optimize the concentrations of Mg2+, dNTPs, primers and Taq DNA olymerase. ResultsThe optimum system of 20 μl was as follows: Mg2+ 2.5 mmol/L, dNTPs 0.4 mmol/L, primer 0.35 μmol/L,Taq DNA polymerase 1 U. ConclusionThe concentrations of Mg2+, dNTPs, primers, Taq DNA olymerase have different effect in the result of SRAP-PCR in different species. It is necessary to optimize these four factors before using SRAP to identity different species.Key words:Polygonum multiflorum Thunb.; Adulterants; SRAP; Optimize何首乌Polygonum multilorum Thunb.是我国传统名贵中药,广东十大“道地药材”之一。