GeneXpert仪PCR检测技术在基层实验室结核病特定人群中的应用
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开放科学 资源服务 标识码 !"#$的开放科学计划以二维码为入口 提供丰富的线上扩展功能 包括作者对论文背景的语音介绍 该研究的附加说明 与读者的交互问答 拓展学术圈等 读者 扫一扫 此二维码即可获得上述增值服务!!%&'!()*+,-,"./'001*()))2--3(*3)3(*()*)33基金项目!上海市公共卫生体系建设三年行动计划%3)3),3)33年&重点学科建设%H D X 2()*(26`)+&'上海市卫生健康委员会科研课题%3)(,:a )(-,&作者单位!3))++-上海市疾病预防控制中心结核病检测实验室通信作者!江渊(;<='>!.'=1Z Y V =1!0C %C /0?/C 1)短篇论著)L $)$W #$%&A K : B >X 联合线性探针检测技术在耐药结核病诊断中的应用研究李静!郁晨蕾!张阳奕!王莉莉!沈旭辉!陈炜!江渊摘要 选择上海市(,家结核病定点医院作为研究现场(对3)(7年(3月至3)(4年(3月初诊为可疑肺结核患者的痰样本%+,)+份&同时进行痰涂片0N R 9M ;98H #M,-)液体培养%简称#液体培养$&和H I 1I 6J I K L 8M N "O #P %简称H I 1I 6J I K L &检测(研究H I 1I 6JI K L 检测结核分枝杆菌的效能'对同期收集到的7)7例临床诊断肺结核患者的分离菌株采用线性探针检测技术%>'1I J K &W I =00=Y (Q S R &进行利福平耐药性检测(将检测结果与H I 1I 6J I K L 检测结果不一致的痰样本(用培养阳性菌株采用最低抑菌浓度%<'1'<V 1'1?'W 'L &K Y C &1C I 1L K =L '&1(8#9&法和H I 1I 6J I K L 方法复测(比较同一例患者从痰样本中采用H I 1I 6JI K L 检测利福平耐药情况与其培养阳性菌株采用Q S R 检测利福平耐药情况的一致性-结果显示(+,)+例痰标本同时进行痰涂片0液体培养和H I 1I 6JI K L 检测(阳性检出率分别为(,*-+F %7--"+,)+&03G *,+F %()(3"+,)+&03G *(-F %,43"+,)+&-H I 1I 6JI K L 阳性检出率高于痰涂片(差异有统计学意义%"3g +:*+,)(,$)*))(&'略低于液体培养(但差异无统计学意义%"3g )*-()(,g )*:+-&-以液体培养%培养阳性鉴定为结核分枝杆菌&为标准(H I 1I 6JI K L 检测的敏感度和特异度分别为4(*3+F %433"()(3&和,:*:7F %37+("34,(&(痰涂片检测的敏感度和特异度分别为-:*,3F %-G 7"()(3&和,-*3+F %3743"34,(&-对同一例患者的痰样本采用H I 1I 6JI K L 检测利福平耐药性(与对其培养阳性菌株采用Q S R 检测利福平耐药性进行比较(两种分子检测技术符合率达,4*+)F %-,G "7)7&-H I 1I 6JI K L 和Q S R 两种方法检测利福平耐药性符合率很高(但也可能存在漏检或过诊情况-对于检测结果不一致的情况(还需要引入其他检测方法(为精准诊断提供实验室依据-关键词 !结核'!抗药性'!分子诊断技术'!分子探针技术'!利福平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0&@0JV L V <0<I =K (>'\V '%C V >L V K I=1%H I 1I 6J I K LB I K I (,*-+F %7--"+,)+&(3G *,+F %()(3"+,)+&=1%3G *(-F %,43"+,)+&(K I 0J I C L '_I >Y/M ?I J &0'L '_I %I L I C L '&1K =L I &@H I 1I 6J I K L B =00'Z 1'@'C =1L >Y ?'Z ?I K L ?=1L ?=L &@0J V L V <0<I =K %"3g+:*+,)(,$)*))(&(W V L >&B I K L ?=1L ?=L &@>'\V '%C V >L V K I %"3g)*-()(,g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中国结核病预防控制工作技术规范%3)3)年版&/中对于肺结核患者耐药筛查要求为(对具备分子生物学核酸耐药检测技术的实验室(优先采用分子生物学耐药检测'对初治患者首次分子生物学检测为利福平耐药(需取另一份痰标本进行重复检测(若仍为利福平耐药(则判定为利福平耐药(否则按利福平敏感处理-对肺结核的治疗方式要求根据肺结核病情及利福平耐药与否制定不同的治疗方案(由此可见(应用分子生物学检测利福平的耐药性对于临床诊断和后续化疗方案的制定可以起到关键性的作用-上海市(,家结核病定点医院实验室在3)(-年根据国家结核病分级诊疗和综合防治服务模式试点工作的要求逐步配备了H I1I6J I K L8M N"O#P%简称H I1I6J I K L&设备(并开展临床检测-本研究收集3)(7年(3月至3)(4年(3月上海市(,家结核病定点医院临床诊断为肺结核患者的培养阳性菌株(在上海市疾病预防控制中心结核病实验室采用线性探针检测技术%Q S R&进行利福平耐药性检测(评估从患者痰样本中采用H I1I6J I K L检测利福平耐药性与从患者痰标本中分离培养获得的阳性菌株采用Q S R检测利福平耐药结果的一致性(探讨分子生物学快速检测技术在临床工作中的实际应用价值-材料和方法一0标本来源和研究内容选择上海市(,家结核病定点医院作为研究现场(纳入3)(7年(3月至3)(4年(3月初诊的可疑肺结核患者-肺结核可疑症状者的标准为咳嗽0咯痰时间超过3周(因呼吸道症状接受检查-(,家结核病定点医院实验室对初诊肺结核可疑症状者的同一份合格痰样本开展痰涂片0N R9M;9 8H#M,-)液体培养%简称#液体培养$&0H I1I6J I K L共+种方法检测(合格的痰样本为黏液样或干酪样性状的痰液(避免使用口水痰(痰量("+<>为宜-上海市疾病预防控制中心结核病实验室对收集到的:437例患者的检测结果进行数据整理(去除4G4份重复样本03-份培养污染样本0:)份H I1I6J I K L检测失败样本(最终对+,)+份有效样本进行H I1I6J I K L检测-上海市疾病预防控制中心结核病实验室对3)(7年(3月至3)(4年(3月(,家结核病定点医院临床诊断的773例%包含于在:437例患者中&肺结核患者的培养阳性菌株(采用(-"K O T R测序方法进行菌种鉴定(-G例%4*:3F&为非结核分枝杆菌(7)7例%,(*G4F&为结核分枝杆菌复合群(对7)7株结核分枝杆菌临床菌株采用Q S R进行利福平耐药性检测(对于Q S R法得到的利福平耐药性检测结果(与使用患者痰样本进行H I1I6J I K L检测结果不一致者(采用其培养阳性菌株进行H I1I6J I K L复测(并同时采用最低抑菌浓度法%<'1'<V<'1?'W'L&K Y C&1C I1L K=L'&1(8#9&进行复核(评估Q S R和H I1I6J I K L两种分子生物学检测技术检测利福平耐药性的情况-二0检测方法(/痰涂片检查!按照.痰涂片镜检标准化操作及质量保证手册/*(+中的操作程序执行-3/分离培养和鉴定!分离培养采用T2乙酰2Q2半胱氨酸2T=!E法进行标本处理(按照.结核病实验室检验规程/*3+进行操作-对于培养阳性菌株((,家结核病定点医院实验室采用免疫色谱法%胶体金法&进行结核分枝杆菌和非结核分枝杆菌鉴定-上海市疾病预防控制中心结核病实验室采用(-"K O T R测序*M2())S9O仪%N'&2O=%公司&0 H I>$&C M86O c紫外凝胶成像仪%N'&2O=%公司&+方法进行菌种鉴定-+/药物敏感性%简称#药敏$&试验!采用结核分枝杆菌最低抑菌浓度法(使用M O;`"I10'L'L K I8a9!M N#药敏板%美国赛默飞世尔科技公司&按照说明书进行操作-参考美国临床和实验室标准协会9Q"#83:2R3标准(利福平临界浓度为(*)(Z"<>(耐药判定标准!菌株的8#9值#临界浓度值(则为耐药'8#9值"临界浓度值(则为敏感-:/H I1I6J I K L检测!按照H I1I6J I K L8M N"O#P%美国9I J?I'%公司&操作说明书上的步骤进行(结果通过专用软件判读-G/Q S R检测!采用H I1&M Y J I8M N$O J>V0耐药检测试剂盒%德国E='18M N$O J>V0公司&(按操作说明书进行操作-三0质量控制室内质控!8#9法采用标准菌株E+7O_%R M99373,:&作为质控菌株'Q S R采用标准菌株E+7O_%R M99373,:&作为结核分枝杆菌复合群和耐药基因位点的质控菌株(无菌蒸馏水为空白对照'室间质控!上海市疾病预防控制中心结核病检测实验室通过国家结核病参比实验室组织的药敏熟练+)((3)3(():+()!9?'1UR1L'L V W I K C!C L&W I K3)3(X&>*:+T&/()度测试'上海市疾病预防控制中心结核病检测实验室及各结核病定点医院均通过国家结核病参比实验室组织的分子生物学质控(结核病定点医院结核病实验室液体培养污染率均小于4F -四0统计学处理采用"S ""(7*)统计软件进行统计学分析-三种不同检测方法阳性检出率的比较采用配对"3检验(检验显著性水平定为)*)G '以液体培养法为标准(计算痰涂片和H I 1I 6J I K L 检测结果的敏感度0特异度0阳性预测值0阴性预测值0符合率和一致性%]1))1检验&(符合率,G F 8/值的计算采用D '>0&1估计法'Q S R 和H I 1I 6J I K L 两种分子检测技术检测利福平耐药性的一致性采用]1))1检验(]1))1&)*7G 说明一致性较好(]1))1$)*:说明一致性较差()*7G #]1))1&)*:说明一致性一般-结!!果一0H I 1I 6JI K L 检测结核分枝杆菌的效能+,)+例痰标本同时进行痰涂片0液体培养%培养阳性菌种鉴定为结核分枝杆菌&和H I 1I 6JI K L 检测(阳性检出率分别为(,*-+F %7--"+,)+&03G *,+F %()(3"+,)+&03G *(-F %,43"+,)+&-H I 1I 6JI K L 阳性检出率高于痰涂片(差异有统计学意义%"3g +:*+,)(,$)*))(&'略低于液体培养(差异无统计学意义%"3g )*-()(,g )*:+-&-以液体培养%培养阳性鉴定为结核分枝杆菌&为标准(H I 1I 6J I K L 检测的敏感度0特异度0阳性预测值0阴性预测值分别为4(*3+F%433"()(3&0,:*:7F %37+("34,(&04+*7(F %433",43&0,+*G )F %37+("3,3(&(两种方法检测结果符合率为,(*)+F (]1))1值为)*7-:(两者一致性较好'痰涂片检测的敏感度0特异度0阳性预测值0阴性预测值分别为-:*,3F 0,-*3+F 04G *77F 044*-4F (两种方法检测结果符合率为44*((F (]1))1值为)*--:(两者一致性一般-见表(-二0Q S R 和H I 1I 6JI K L 检测利福平耐药性的效能分析%一&两种方法检测利福平耐药情况和一致性分析7)7株结核分枝杆菌中(采用Q S R 检测利福平耐药有+,例%G *G 3F &(采用H I 1I 6JI K L 检测痰样本的利福平耐药有:(例%G *4)F &(差异无统计学意义%"3g)*)G )(,g )*4(4&-两种方法从同一例患者初诊痰样本与初诊痰培养阳性菌株中检测利福平结果符合率为,4*+)F %-,G "7)7&(,G F 8/值为,7*)-F ",,*)+F ']1))1%,G F 8/&值为)*4:(%)*7G +")*,3,&(说明两种方法检测利福平耐药性的一致性很好-%二&检测结果不一致复核情况两种方法检测不一致共计(3例-其中(G 例Q S R 检测为利福平耐药但H I 1I 6JI K L 检测为利福平敏感(7例Q S R 检测为利福平敏感但H I 1I 6JI K L 检测为利福平耐药-见表3-(/H I 1I 6J I K L 复测情况!(3例采用菌株复测(G 例利福平前后结果一致(均为耐药%:(*-7F &'7例利福平耐药性前后结果不一致-3/复核情况!(例患者的菌株为混合生长无法进行药敏检测(((例患者的菌株采用8#9法进行利福平耐药性复核-Q S R 08#9和H I 1I 6J I K L +种方法检测利福平的耐药性(7例结果均一致%-+*-:F &(:例结果不一致-不一致结果中(3例Q S R 和8#9法检测为利福平敏感而H I 1I 6J I K L 检测为利福平耐药(3例Q S R 检测为利福平敏感而H I 1I 6JI K L 和8#9法检测为利福平耐药-讨!!论DE !于3)()年推荐H I 1I 6JI K L 检测技术用于肺结核的诊断*++(该项技术已在多个国家和地区进行了验证评估(显示其高敏感度和高特异度*:27+-本研究结果显示(以液体培养结果为标准(H I 1I 6JI K L 检测的敏感度和一致性均高于痰涂片(特异度低于痰涂片(与国内报道略有不同*724+-同时比较从患者痰样本中采用H I 1I 6JI K L 与从患者痰标本中分表C !以液体培养为标准比较痰涂片和H I 1I 6JI K L 检测痰样本的效能%+,)+份&检测方法结果液体培养%份&阳性=阴性敏感度*F %,G F 8/&+特异度*F %,G F 8/&+符合率*F %,G F 8/&+阳性预测值*F %,G F 8/&+阴性预测值*F %,G F 8/&+]1))1值%,G F 8/&痰涂片-:*,3%-(*44"-7*4G &,-*3+%,G *:G ",-*44&44*((%47*)-"4,*),&4G *77%4+*)G "44*(+&44*-4%47*G ("4,*7-&)*--:%)*-+-")*-,3&!阳性-G 7(),!阴性+G G3743H I 1I 6J I K L 4(*3+%74*-G "4+*G -&,:*:7%,+*G G ",G *3-&,(*)+%,)*()",(*4,&4+*7(%4(*3("4G *,+&,+*G )%,3*G 3",:*+G &)*7-:%)*7:(")*744&!阳性433(-)!阴性(,)37+(注=!液体培养阳性为鉴定为结核分枝杆菌的份数:)((3)3(():+()!9?'1UR 1L 'L V W I K C !C L &W I K 3)3(X &>*:+T &/()表D !(3株Q S R 和H I 1I 6JI K L 检测利福平耐药性不一致结核分枝杆菌的结果及复核结果菌株编号Q S R=H I 1I 6J I K L =%痰样本检测结果&H I 1I 6JI K L =%培养阳性菌株检测结果&8#9W %(Z "<>&)+-4敏感耐药*J K &W I;%G 3,"G ++&+耐药*J K &W I;%G 3,"G ++&+敏感%(*)&):G 3敏感耐药*J K &W I;%G 3,"G ++&+耐药*J K &W I;%G 3,"G ++&+耐药%:*)&)G 37敏感耐药*J K &W IR %G )7"G ((&+敏感敏感%)*3G &)-((耐药*"-),8]M+%"G +(Q &+敏感耐药*J K &W I;%G 3,"G ++&+耐药%(-*)&)-:4敏感耐药*J K &W I;%G 3,"G ++&+耐药*J K &W I;%G 3,"G ++&+耐药%3*)&)43(耐药*"-),8]M+%"G +(Q &+敏感耐药*J K &W I;%G 3,"G ++&+耐药%(-*)&)4-7敏感耐药*J K &W IR %G )7"G ((&+敏感敏感%)*(3&)44G 敏感耐药*J K &W I;%G 3,"G ++&+耐药*J K &W I;%G 3,"G ++&+敏感%(*)&),,4耐药*"-),8]M+%"G +(Q &+敏感耐药*J K &W I;%G 3,"G ++&+耐药%(-*)&():+耐药*"-),8]M+%"G +(Q &+敏感耐药*J K &W I;%G 3,"G ++&+耐药%4*)&(::(敏感耐药*J K &W I N %G (3"G (4&+耐药*J K &W I N %G (3"G (4&+混合生长(:G 4耐药*"-),8]M+%"G +(Q &+敏感耐药*J K &W I;%G 3,"G ++&+耐药%(-*)&注=!括号中表示检测为耐药的菌株利福平耐药基因突变位点'W !括号中表示利福平耐药水平(利福平临界耐药水平为#(*)(Z"<>离培养获得的阳性菌株(采用Q S R 检测利福平的耐药性(结果显示两种检测技术对同一例患者初诊痰样本与初诊痰培养阳性菌株中检测利福平结果符合率达,4*+)F -对(3例两种方法检测结果不一致者使用阳性菌株分别采用H I 1I 6J I K L 和8#9法检测(结果显示+种方法检测利福平耐药性7例结果%-+*-:F &一致'H I 1I 6J I K L 复测G 例%:(*-7F &前后结果一致-本研究采用不同方法检测结核分枝杆菌(H I 1I 6JI K L 阳性检出率%3G *(-F &高于痰涂片法%(,*-+F &(略低于液体培养法%3G *,+F &-相比液体培养(H I 1I 6J I K L 除标本前处理外检测均在封闭的反应盒内自动完成(具有操作简单0快速0交叉污染低0安全等特点-H I 1I 6JI K L 从检测到报告仅需3*G ?(比液体培养%阳性时间(("33%&*,+大大缩短了检测时间-H I 1I 6J I K L 检测结核分枝杆菌的效能显示其检测敏感度0阴性预测值为4(*3+F 和,+*G )F (高于痰涂片法%-:*,3F 和44*-4F &(其特异度和阳性预测值%,:*:7F 和4+*7(F &略低于痰涂片法%,-*3+F 和4G *77F &-此结果与陈蕾和吴桂辉*4+研究得出的H I 1I 6JI K L 检测特异度和敏感度结果略有不同(分析一种原因可能是由于不同的检测方法使用前处理方法各不相同(因此虽然使用同一份痰样本(但是由于痰样本性状黏稠(不能保证样本能平均分配(特别是对于低阳性级别的痰样本'还有一种原因可能是不同检测方法检出限的不同而影响其检测效能-多项研究显示(当结核分枝杆菌含量达到G e ()+"G e ():9P ]"<>时痰涂片法才能得到阳性结果(液体培养法检测限为()"())9P ]"<>(而H I 1I 6JI K L 技术最低检出限为(+(9P ]"<>*4(()2(3+-本研究也显示(H I 1I 6J I K L 与液体培养法两种方法检测结果符合率高(一致性较好-本研究采用Q S R 检测7)7株结核分枝杆菌菌株(利福平耐药有+,株%G *G 3F &-采用H I 1I 6J I K L 检测痰样本结果显示(利福平耐药有:(株%G *4)F &-Q S R 和H I 1I 6J I K L 两种方法从同一例患者初诊痰样本与初诊痰培养阳性菌株中检测利福平耐药性结果符合率为,4*+)F (]1))1值为)*4:((说明两种方法检测利福平耐药一致性较好-对于(3例Q S R 检测利福平与H I 1I 6J I K L 检测痰样本不一致的结果(本研究对其培养阳性菌株采用H I 1I 6J I K L 进行复测(除(株为混合生长(其余((株进行8#9法药敏检测-结果显示(利福平检测结果+种方法一致7株(:株不一致结果中(Q S R 检测结果利福平均为敏感'H I 1I 6JI K L 检测结果为利福平耐药(均表现为J K &W I ;%G 3,"G ++&探针突变'8#9法3例表现为利福平敏感((例为低水平耐药((例为高水平耐药-3例Q S R 和8#9检测为利福平敏感而H I 1I 6J I K L 结果为耐药(可能是在")-,基因上发生了沉默突变而出现假阳性结果-有研究报道(在")-,基因上发生沉默基因突变(这类基因不表达或低表达*(++(与利福平耐药无关-3例Q S R检测利福平敏感而H I 1I 6J I K L 和8#9结果为耐药(是否为Q S R 检测利福平耐药性敏感度不高(将在今后的工作中进一步扩大样本量进行研究-对于复测的(3例H I 1I 6J I K L 出现7例前后结果不一致的结果(笔者认为有可能是由于两类样本的优势菌群不同而产生利福平耐药性检测结果的差异-赵冰等*(:+研究表明(标本中的结核分枝杆菌含量会影响H I 1I 6JI K L 检测利福平耐药的准确性-本研究结果显示(G 例G )((3)3(():+()!9?'1UR 1L 'L V W I K C !C L &W I K 3)3(X &>*:+T &/()H I1I6J I K L检测痰标本中利福平敏感者菌株复测G例均为耐药(这G例患者中+例患者痰涂片结果仅为("3条-本研究未对全部入选的患者菌株进行复测(现有的数据还不足以证明以上结论(我们将在今后的工作中进行进一步探讨-综上所述(H I1I6J I K L和Q S R两种分子检测方法检测利福平耐药性总体符合率较高(但也可能存在漏检或过诊情况-因此(有条件的实验室可考虑引入其他分子检测方法以弥补上述方法的不足(为临床精准诊断和治疗提供准确可靠的实验室依据-志谢!感谢上海市疾病预防控制中心郭俊涛副主任医师对本文统计学方法和结果的指导和审核-参!考!文!献*(+赵雁林(姜广路/痰涂片镜检标准化操作及质量保证手册/北京!中国协和医科大学出版社(3)),!72((/*3+赵雁林(逄宇/结核病实验室检验规程/北京!人民卫生出版社(3)(G!+,2::/*++D&K>%E I=>L?!K Z=1'^=L'&1/DE!I1%&K0I01I BK=J'%L V W I K2C V>&0'0L I0L/H I1I_=!D&K>%E I=>L?!K Z=1'^=L'&1(3)()/ *:+M?I K&1H(5'.I1=?Q(9?=1%=$(I L=>/P I=0'W'>'L Y(=C C V K=C Y( =1%C>'1'C=>I@@I C L&@J&'1L2&@2C=K I6J I K L8M N"O#P L I0L'1Z@&K L V W I K C V>&0'0'1J K'<=K Y2C=K I0I L L'1Z0'1R@K'C=!=<V>L'C I1L K I( K=1%&<'0I%(C&1L K&>>I%L K'=>/Q=1C I L(3)(:(+4+%,,(G&!:3:2 :+G/%&'!()/()(-"")(:)2-7+-%(+&-3)7+2G/*G+彭英(苏欣(江琦(等/新型分子检测技术在基层实验室诊断肺结核的效能分析/中国防痨杂志(3)(,(:(%3&!(:G2(:4/%&'!()/+,-,"./'001/()))2--3(/3)(,/)3/))G/*-+王启明(朱帆(李青峰(等/6S I K L8M N"O#P与8H#M对结核菌检测及药敏的比较研究/临床肺科杂志(3)(,(3:%(3&!33(42333(/%&'!()/+,-,"./'001/()),2---+/3)(,/(3/)(,/*7+刘荣梅(马丽萍(高孟秋(等/6J I K L8M N"O#P与E='18M N2 $O J>V0检测技术快速诊断肺结核及其耐药性的临床应用价值/中国医刊(3)(4(G+%G&!G G+2G G-/%&'!()/+,-,"./'001/ 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GeneXpert MTB/RIF检测结核性脑膜炎患者脑脊液标本的临床应用价值作者:许超陈宇李巧思朱雅娟来源:《中国现代医生》2021年第28期[摘要] 目的探讨GeneXpert MTB/RIF(以下简称“GeneXpert”)检测结核性脑膜炎患者的脑脊液应用价值。
方法选取2014年12月至2019年12月在沈阳市第十人民医院住院治疗的初诊为结核性脑膜炎患者120例作为研究对象,收集患者的脑脊液标本,进行脑脊液抗酸杆菌涂片检测、脑脊液结核分枝杆菌960培养及脑脊液GeneXpert检测,分析GeneXpert的检测效能。
结果脑脊液抗酸杆菌检测阳性9例,阴性111例;脑脊液结核分枝杆菌960培养阳性40例,阴性80例;脑脊液GeneXpert检测阳性39例,阴性81例。
以脑脊液涂片为标准,GeneXpert检测的灵敏度及特异度分别为100.00%和72.97%;以脑脊液960培养为标准,GeneXpert检测的灵敏度及特异度分别为97.50%和100.00%;以临床诊断为标准,GeneXpert检测的灵敏度及特异度分别为95.12%和100.00%。
结论脑脊液GeneXpert检测灵敏度和特异度较高、检测时间短,有利于临床早期诊断结核性脑膜炎。
[关键词] 核酸扩增技术;结核性脑膜炎;脑脊液;分子生物学[中图分类号] R378.91 [文献标识码] B [文章編号] 1673-9701(2021)28-0134-04Clinical application value of GeneXpert MTB/RIF in detecting cerebrospinal fluid samples from patients with tuberculous meningitisXU Chao CHEN Yu LI Qiaosi ZHU YajuanDepartment of Tuberculosis, Shenyang Tenth People's Hospital, Shenyang 110044, China[Abstract] Objective To investigate the value of GeneXpert MTB/RIF(hereinafter referred to as"GeneXpert") in detecting cerebrospinal fluid (CSF) in patients with tuberculous meningitis. Methods A total of 120 newly diagnosed tuberculous meningitis patients hospitalized in Shenyang Tenth People's Hospital from December 2014 to December 2019 were selected as the study subjects. Cerebrospinal fluid samples were collected for cerebrospinal fluid acid-fast bacilli smear detection,cerebrospinal fluid Mycobacterium tuberculosis 960 culture and cerebrospinal fluid GeneXpert detection. The detection efficacy of GeneXpert was analyzed. Results 9 cases were positive, and 111 cases were negative for acid-fast bacilli. Forty cases were positive, and 80 cases were negative for Mycobacterium tuberculosis 960 culture. Thirty-nine cases were positive, and 81 cases were negative for the GeneXpert test. Using cerebrospinal fluid smear as the standard, the sensitivity and specificity of GeneXpert detection were 100.00% and 72.97%, respectively. Using cerebrospinalfluid 960 culture as the standard, the sensitivity and specificity of GeneXpert detection were 97.50% and 100.00%, respectively. And using clinical diagnosis as the standard, the sensitivity and specificity of GeneXpert detection were 95.12% and 100.00%, respectively. Conclusion The GeneXpert detection in cerebrospinal fluid has high sensitivity and specificity, and a short detection time, which is helpful for early clinical diagnosis of tuberculous meningitis.[Key words] Nucleic acid amplification technology; Tuberculous meningitis; Cerebrospinal fluid; Molecular biology结核性脑膜炎(以下简称“结脑”)是结核分枝杆菌引起的脑膜非化脓性炎症,是由结核菌经直接蔓延或血液循环侵入神经系统的蛛网膜下间隙所致。
甘肃科技Gansu Science and Technology第37卷第4期2021年2月Vol.37 No.4Feb. 2021Xpert MTB/RIF 检测技术用于肺结核病诊断的价值研究高波(景泰县人民医院,甘肃景泰730400)摘 要:研究Xpert MTB/RIF 检测技术用于肺结核病诊断的价值。
选择2019年1月-2020年2月期间于景泰县人民 医院就诊的疑似肺结核病患者178例作为本次研究对象,收集痰标本,均应用涂片镜检法、固体培养法、Xpert MTB/RIF 检测技术、比例法药敏试验进行检测,以固体培养结果为金标准,比较不同检测方法结合分枝杆菌检出情况;以比例法药敏试验结果为金标准评价Xpert MTB/RIF 检测技术检测利福平耐药性情况。
①178份痰标本均采用不同检测 方法实施检测,涂片镜检法:阳性痰标本共48份,阳性率26.97%;固体培养法:阳性痰标本共72份,阳性率40.45%;Xpert MTB/RIF 检测技术:阳性痰标本共98份,阳性率55.06%。
固体培养法痰标本阳性检出率高于涂片镜检法用=7.241,P=0.007) ;Xpert MTB/RIF 检测技术痰标本阳性检出率高于涂片镜检法(^=29.028,/H).000) ;Xpert MTB/RIF 检测技术痰标本阳性检出率高于固体培养法於=7.611 ,P=0.006)。
②以固体培养结果为金标准,Xpert MTB/RIF 检测技术 检测的灵敏度94.44%(68/72)明显高于涂片镜检55.56%(40/72), 较差异有统计学意义(^=29.037,7^0.000) ;XpertMTB/RIF 检测技术检测的Kappa 值明显优于涂片镜检。
©Xpert MTB/RIF 检测技术检测利福平耐药率20.59%( 14/68)与比例法药敏试验耐药率22.06%(15/68)比较,差异无统计学意义(^=29.037,7^0.000);Xpert MTB/RIF 检测技术与比例法药敏试验符合率98.53%(67/68)。
•论 著•GeneXpert MTB/RIF 检测系统在结核病诊断中的应用价值** 基金项目:国家科技部科技重大专项(2018ZX10715003)作者简介:陈小娟,女,主管技师,主要从事结核病临床分子诊断相关研究。
△ 通信作者疋-mi : *****************.cn 。
本文引用格式:陈小娟,赵珍珍,向尹,等.GeneXpert MTB/RIF 检测系统在结核病诊断中的应用价值:J].国际检验医学杂志,2021,42(2):133-136.陈小娟12,赵珍珍1,向 尹2,应斌武山1.四川大学华西医院实验医学科,四川成都610041;2.乐山市人民医院医学检验科,四川乐山614000摘 要:目的 探讨GeneXpert MTB/RIF 检测系统(简称GeneXpert MTB/RIF )在结核病诊断中的临床应用价值。
方法 纳入四川大学华西医院2020年7 — 9月高度疑似结核病的住院患者(401例),其中临床诊断 结核病186例(结核组),非结核病215例(非结核组)回顾性分析抗酸染色、结核分枝杆菌脱氧核糖核酸(TB-DNA )荧光定量PCR.GeneXpert MTB/RIF 、结核感染T 细胞了-干扰素释放试验(TB-GRA)的检测结果。
通过系统性分析各项检测技术的效能指标如灵敏度、特异度等评估GeneXpert MTB/RIF 在结核病诊断中的临床价值。
结果 GeneXpert MTB/RIF 在结核病诊断中的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为41.94%、100.00%、1()0.00%、66.56%。
4种检测方法中,GeneXpert MTB/RIF 特异度最高,而且其灵敏度明显高于抗酸染色(P V0.05),而与T1-DNA 荧光定量PCR 相比,虽然其灵敏度较高,但差异无统计学意义(P = 0. 459)TB-IGRA 检测灵敏度明显优于GeneXpert MTB/RIF ,但特异度明显低于其他几种方法。
支气管肺泡灌洗液 Genexpert检测在青海地区菌阴肺结核中的临床诊断价值【摘要】目的:探讨支气管肺泡灌洗液Genexpert检测在青海地区菌阴肺结核中的临床诊断价值。
方法:选取我院2018年5月~2019年10月的100例拟诊断为初治菌阴肺结核患者作为本次研究对象,对研究对象行支气管镜检查,分别采集此次研究对象的痰液和支气管肺泡灌洗液(BALF)进行Genexpert检查,并以 BALF 的罗氏培养结果及临床诊断标准作为肺结核诊断的阳性标准,比较两种检测方式诊断菌阴肺结核的敏感度、特异度、阳性预测值。
结果:100例研究对象中, BALF和痰液进行Genexpert检查的阳性率分别为66.7%(56/84)、45.2%(38/84),BALF进行Genexpert检查的敏感度明显高于痰液,两者比较差异有统计学意义(P<0.05);以临床诊断作为判断肺结核的阳性标准,BALF进行Genexpert检查诊断初治菌阴肺结核的敏感度为66.67%(56/84),特异度为100.00%(16/16),阳性预测值为100%(56/56),痰液进行Genexpert检查诊断初治菌阴肺结核的敏感度为45.24%(38/84),特异度为100.00%(16/16),阳性预测值为100%(38/38),两者比较灵敏度差异有统计学意义(P<0.05);以BALF 的罗氏培养结果作为肺结核诊断的阳性标准,BALF进行Genexpert检查诊断初治菌阴肺结核的敏感度为95.45%(21/22),特异度为100.00%(16/16),阳性预测值为100%(21/21),痰液进行Genexpert检查诊断初治菌阴肺结核的敏感度为72.73%(16/22),特异度为100.00%(16/16),阳性预测值为100%(16/16),两者比较灵敏度差异有统计学意义(P<0.05)。
结论:为菌阴肺结核患者进行支气管肺泡灌洗液Genexpert检测,具有较高的灵敏度,能有效提高结核杆菌检出率,能快速诊断出菌阴肺结核,具有较高的临床价值,值得临床推广。
GeneXpert分子诊断技术在疑似结核感染患者中的应用价值分析发布时间:2021-03-23T03:14:24.903Z 来源:《医药前沿》2020年32期作者:王怡悦1 管桂波2 陈红丹3[导读] 分析GeneXpert分子诊断技术在疑似结核感染患者中的应用价值。
(1龙泉市人民医院检验科浙江龙泉 323700)(2龙泉市人民医院药剂科浙江龙泉 323700)(3龙泉市人民医院内科浙江龙泉 323700)【摘要】目的:分析GeneXpert分子诊断技术在疑似结核感染患者中的应用价值。
方法:选取2018年9月—2020年3月于医院治疗且胸片提示感染的患者或痰培养为阴性又提示肺部感染的患者100例。
采集研究对象痰液标本,并采用痰涂片法、GeneXpert分子诊断技术、结核分枝杆菌分离培养检测,此外,采用GeneXpert分子诊断技术和比例法药敏试验检测利福平耐药情况。
结果:GeneXpert分子诊断技术检出结核分枝杆菌阳性率显著高于痰涂片检查,P<0.05;而与结核分枝杆菌分离培养相比较,无显著差异(P>0.05)。
GeneXpert分子诊断技术检出利福平耐药率与比例法药敏实验结果无显著差异(P>0.05)。
结论:GeneXpert分子诊断技术应用于疑似结核感染患者中具有较高诊断价值,且该方法还可有效检出利福平耐药情况,因此值得应用。
【关键词】GeneXpert分子诊断技术;结核;诊断;利福平;耐药;感染【中图分类号】R52 【文献标识码】A 【文章编号】2095-1752(2020)32-0126-02肺结核是一种长期危害人类健康的传染性疾病,该疾病主要由结核杆菌所引发,侵害人体健康。
当人体感染肺结核后,如不及时治疗或彻底治疗则会给人类健康造成极大危害,甚至致呼吸衰竭或死亡[1]。
肺结核主要通过呼吸道进行传播,尤其是艾滋病患者和老年人等免疫力低下人群。
早期诊断、及时治疗是改善患者预后的关键,以往临床诊断主要以结核菌培养、痰涂片为主,而该类方法的局限性在于痰液的标本,如果不是深部咳出的痰,或患者吐得是口水痰,唾沫,再加上技术的局限性,技术人员的主观性,对结果的阳性率大大减低;且该方法检测所需时间较长[2]。
World Latest Medicine Information (Electronic Version) 2019 V ol.19 No.102192投稿邮箱:sjzxyx789@分子Gene-Xpert 技术在肺结核病原体检测中的应用罗妙玲(新疆博州人民医院 检验科,新疆 博乐)摘要:近年来临床广泛使用Genen-Xpert 分子检测技术应用中使用定量PCR 分子检测过程中样品的准备,核酸纯化,基因倍增,将其步骤使用把样本的制备和扩增整合成自动化程序,可以准确快速安全的得出实验结果,已成为新型分子POCT 检测技术平台为感性疾病检测病原体提供新的方法,特别是在结核病中的诊断尤其重要达到早检、早诊、早治。
所以介绍Genen-Xpert 分子检测技术在临床中的意义和将来发展的趋势及临床应用中存在问题。
关键词:Genen-Xpert 分子检测技术;肺结核;病原体检测中图分类号:R521 文献标识码:B DOI: 10.19613/ki.1671-3141.2019.102.120本文引用格式:罗妙玲.分子Gene-Xpert 技术在肺结核病原体检测中的应用[J].世界最新医学信息文摘,2019,19(102):192.0 引言目前在临床中应用的胶体金免疫层析技术为代表的即时检验技术在感染病原体检测领域中广泛应用,同时该技术操作简单并逐步显示其优越性,在临床检验工作中我院在结核病检查中特别是对疑似结核和利福平耐药的患者进行检测应用,使用后临床反馈较好。
现在就我院结核杆菌检测316例经行检测通过传统涂片方法和该方法检测对比显示出明显的优越性,现将上述检测过程及方法做如下分析[1-2]。
1 试验材料和方法试验所需仪器是由自治区卫计委配送的,主要仪器有Gene-Xpert 检测仪和液体培养仪BD960及配套使用的试剂和一些辅助设备。
方法:让符合检测标准条件的病人留取合格的痰标本2 mL 左右2个样本。
首先涂片检查,若为阳性则必须用液体培养的方法。
Gene—Xpert MTB/RIF在西藏地区结核病诊断中的应用研究摘要目的探讨Gene-Xpert MTB/RIF在西藏地区结核病诊断中的应用价值。
方法对974例可疑结核病患者的标本同时进行结核涂片抗酸染色镜检和Gene-Xpert MTB/RIF检测。
对比两种检测结果。
结果974例检测标本中,Gene-Xpert MTB/RIF检测阳性率为12%(118/974),其中利福平敏感的标本为93例,利福平耐药的标本为25例(耐药率为21%)。
抗酸染色阳性标本为15例,检测阳性率为2%。
Gene-Xpert MTB/RIF检测阳性率高于抗酸染色,差异具有统计学意义(P<0.05)。
结论Gene-Xpert MTB/RIF在西藏地区结核病诊断和治疗中具有较好的临床应用价值,且方法简便、快速。
关键词Gene-Xpert MTB/RIF;结核分枝杆菌;利福平;耐药【Abstract】Objective To investigate the application value of Gene-Xpert and MTB/RIF in the diagnosis of tuberculosis in Tibet. Methods Specimens of 974 suspected tuberculosis patients all received acid fast staining microscopy and Gene-Xpert MTB/RIF test by tuberculosis smear,and the two test results were compared. Results Among 974 test specimens,the positive rate of Gene-Xpert MTB/RIF was 12% (118/974),including 93 rifampicin-sensitive specimens and 25 rifampicin-resistant specimens (resistance rate as 21%). There were 15Acid-positive specimens,with detection positive rate as 2%. The positive rate of Gene-Xpert MTB/RIF was higher than that of acid-fast staining,and the difference was statistically significant (P<0.05). Conclusion Gene-XpertMTB/RIF shows excellent clinical application value in diagnosis and treatment of tuberculosis in Tibet,and this method is simple and rapid.【Key words】Gene-Xpert MTB/RIF;Mycobacterium tuberculosis;Rifampin;Resistance在中國,结核病患者高达130万,位居世界第二,是全球22个结核高负担国家之一[1]。
GeneXpert、QFT.TB、BACTECMGIT960快速联合检测在肺结核诊断中的应用研究作者:王霖王晓燕李才信来源:《中国实用医药》2019年第22期【摘要】目的探讨利福平耐药结核杆菌实时荧光定量扩增检测技术(GeneXpert)、结核感染T细胞检测(QFT.TB)和结核杆菌快速培养、鉴定及药敏培养(BACTEC MGIT 960)快速联合检测在肺结核诊断中的应用研究。
方法选取200例疑似肺结核患者作为研究对象,均行GeneXpert、QFT.TB、BACTEC MGIT 960快速聯合检测。
比较GeneXpert、QFT.TB、BACTEC MGIT 960单纯检测与联合检测结核病的结果;GeneXpert、QFT.TB、BACTEC MGIT 960单纯检测与联合检测肺结核病效能。
结果 QFT.TB、 QFT.TB+BACTEC MGIT 960、GeneXpert+QFT.TB+BACTEC MGIT 960对肺结核检测的阳性率分别为73.5%、81.5%、81.5%,高于GeneXpert、BACTEC MGIT 960单独检测及二者联合检测的44.0%、39.0%、44.0%,差异均具有统计学意义(P<0.05)。
QFT.TB、QFT.TB+BACTEC MGIT 960、GeneXpert+QFT.TB+BACTEC MGIT 960诊断肺结核的AUC比较差异均无统计学意义(P>0.05),但QFT.TB、QFT.TB+BACTEC MGIT 960、GeneXpert+QFT.TB+BACTEC MGIT 960诊断肺结核的AUC均大于GeneXpert、BACTEC MGIT 960、GeneXpert+BACTEC MGIT 960的AUC,差异均具有统计学意义(P<0.05)。
结论肺结核诊断中, GeneXpert、QFT.TB、BACTEC MGIT 960三者快速联合检测的结果准确、可靠,价值更高,值得在临床上推广与应用。