研究表明,每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,起 始拷贝数越多,Ct值越小。
;
13
实时荧光定量
Ct 18 and Ct 22, 2^(4 Ct shift) = 16 fold difference
;
14
实时荧光定量PCR原理
利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,其中横坐标代表起始拷贝数 的对数,纵坐标代Ct值。因此只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上 计算出该样品的起始拷贝数。
;
22
(一)选择靶基因
TaqMan技术主要用于检测,所以其扩增的基因必须是特异的,如: 某种病原微生物所共有的保守基因
(检测某种病原微生物); 某个血清型所特有的基因序列
(区分检测某个血清型); 选择决定毒力强弱的基因
(区分强毒和弱毒)等。
;
23
(二)选择探针
选择探针需要同时满足以下条件: 1、在靶基因的保守区域 2、G+C含量在40%以上; 3、相同碱基连续不超过4个; 4、Tm值在71±2℃;
以PCR反应的前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号 (baseline),荧光域值 的缺省设置是3~15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍。
threshold = 10 ´ SDcycle 6-15
;
9
实时荧光定量PCR原理
如果检测到荧光信号超过域值被认为是真正的信号,它可用于定义样本的域值 循环数(Ct)。
;
24
(二)选择探针
5、内部自身配对较少; 6、5’端不为G; 7、G数目比C数目少;
如果6和7难以满足的时候,就要考虑用互补序列作探针。
;
25
(三)选择引物