医学院常用数据库
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医疗领域有许多公开的数据集可供使用,以下是一些常见的医疗公开数据集的示例:
1. MIMIC-III:医学信息全息化和临床研究中最常用的数据库之一。
包含了来自多个医疗机构的数十万份匿名化的电子病历数据。
2. PubMed:世界上最大的生物医学文献数据库,提供了大量的研究文章和文献摘要。
3. PhysioNet:提供了许多公开的生理信号数据集,如心电图、脑电图等。
其中包括了MIT-BIH心电数据集、MIMIC-II等。
4. CDC Wonder:美国疾病控制与预防中心(CDC)提供的在线数据库,包含了多种健康和流行病学数据,如慢性疾病统计、出生率、死亡率等。
5. Kaggle:一个数据科学竞赛网站,提供了许多医疗领域的公开数据集和挑战,如胸部X光图像、肺癌图像等。
6. UCI Machine Learning Repository:一个包含各种领域的
机器学习数据集的数据库,包括一些与医疗相关的数据集,如糖尿病数据集、乳腺癌数据集等。
这只是一小部分可用的医疗公开数据集范例,还有许多其他数据库和在线平台提供了丰富的医疗数据供研究和分析使用。
在使用这些数据集时,应该遵守相关的数据使用规定和隐私保护措施,并根据具体需求选择合适的数据集。
常见循证医学数据库对比循证医学被称为是“医学的圣经”、“震动21世纪的伟大思想”,循证医学的核心思想包括了医疗决策中将临床证据、个人经验与患者的实际状况和意愿三个要素组成的。
由此可见,寻找医疗决策的临床证据是循证医学的基础。
目前,能够帮助我们寻找证据的工具主要有:BMJ公司的Clinical Evidence、EBSCO公司的DynaMed、OVID公司的OVID EBM、美国的UpToDate、荷兰的First consult和北京康健公司推出的FEBM。
下面就针对这几个有代表性的数据库分别从每个库所含数据内容、系统功能、各自特点这几个角度进行总结与分析。
一、循证数据库产品的数据内容分析目前,市场上的循证产品的数据内容主要分为两大类:一种是知识型数据,另一种是二次文献型数据。
知识型数据库的内容并不是期刊文献,而是从这些证据文献中总结得到的某一具体临床问题的知识总结、摘要或结论。
像Clinical Evidence、DynaMed、UpT oDate、First Consult都属于这个类别的数据库。
二次文献型数据得到就是最基础的证据文献内容,例如OVID EBM、北京康健的FEBM。
因此,我们在谈EBM数据库的时候首先不可避免的要知道循证数据库的数据属于哪个类型。
知道了这些以后,我们还要对数据库的内容质量、容量、更新频率这些最基本的数据库情况做相应了解。
数据库的具体内容与特点对比详见附件1。
1.数据库的类型与数据量表数据库名称数据类型数据量Clinical Evidence 知识型470多种reviews DynaMed 知识型5500多主题UpToDate 知识型8500多主题First Consult 知识型1531多主题OVID EBM 文献型68万多篇FEBM 文献-知识型一千多万篇医学文献说明:FEBM之所以叫做文献-知识型数据库,就是因为FEBM不仅有循证文献检索的特点,同时经过数据标引等人工处理方式,而且拥有像对文献结论提取的TBL和即将推出的POEMS文献过滤等功能。
五大医学文献数据库:只知道PubMed你就out了循证医学时代,写文章无论是背景、讨论、引用研究,一定要参考文献。
作为医学文献老大的Pubmed,基本无人没用过,而下面介绍的这些文献数据库,你可不能错过了。
1. 中国生物医学文献数据库(CBM)一个集检索、免费获取、个性化定题服务、全文传递服务于一体的生物医学中外文整合文献服务系统。
由中国医学科学院医学信息研究所开发研制。
收录1978 年以来1600 多种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录,年增长量约40 余万篇,数据总量达350 余万篇。
学科范围涉及基础、临床、预防学等生物医学的各个领域。
CBM 注重数据的规范化处理和知识管理,全部题录均根据美国国立医学图书馆最新版《医学主题词表》、中国中医研究院中医药信息研究所《中国中医药学主题词表》等进行主题标引和分类标引。
此外,检索系统与PUBMED 具有良好兼容性:CBM 检索系统(CBMWEB) 具有检索入口多,检索方式灵活,以及主题、分类、期刊、作者等多种词表辅助查询功能,可满足简单检索和复杂检索的需求,与 PUBMED 具有良好兼容性。
可获得良好的查全率和查准率。
2. Embase主要特点:近 2000 种 Medline 以外的特有期刊,11 00 万条记录,覆盖更多疾病和药物的信息,无可匹敌的欧洲、亚洲文献汇总,使用 EMTREE 主题词表(包含了所有 MeSH 词)。
检索内容除了文章外,还支持药物和疾病检索。
embase 数据库(Excerpt Medica Database)是由荷兰 Elsevier Science 出版公司建立的 EM 的书目型数据库,收录 70 多个国家出版的 4550 种左右期刊的医药文献,每年约 50 多万条文献记录,累积约994 万条,80% 的文献带有文摘。
EMBASE 医学外文文献数据库中收录药物方面的文献量大,占 40% 左右,并设置了与药物有关的副主题词(连接词)17 个,与疾病有关的副主题词(连接词)14 个,2000 年又新增与给药途径的副主题词(连接词)47 个,设了许多与药物有关的字段,如药物主题词字段(DR),药物分类名称字段(EL),药物商品名字段(TN)等。
众所周知,互联网是个宝库,有各种各样的医学资料。
可是,在我们需要的时候,常常找不到自己想要的资源。
今天,我就给大家介绍一实用的医学网站及其特点,希望对大家能有所帮助。
1,常用的医学数据库:1,Pubmed检索说到医学数据库,就不的不说大名鼎鼎的Pubmed(/)了。
PubMed 提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要,而且更重要的是这些免费,它为研院校图书馆以外的用户提供了一个强大的数据检索平台。
数据库来源为MEDLINE。
其核心主题为医学,该搜寻引擎是由美国国立医学图书馆提供,作为Entrez 资讯检索系统的一部分。
虽然PubMed 的资讯并不包括期刊论文的全文,但可能提供指向全文提供者(付费或免费)的连结。
PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW,查询方便快捷。
但是使用Pubmed使用上有一个很大的问题,不支持中文检索。
由于语言的限制,造成我们的检索效率很低,其实大可不必为输入繁琐的医学词汇出错而头痛。
我国的技术人员聪明的想了出Pubmed汉化检索,汉化检索的地址是:/pubmed/pubmed_search.jsp 有兴趣了大家可以试试。
该程序可以自动对汉语完成匹配,大大提高了检索效率,同时还能对检索到的摘要信息进行全文求助(付费服务,要是能免费就好了)。
还有我国国产的两个期刊数据库,一个是万方(),另一个是知网(/),都是收费服务,如果你所在的医院没有包库,只有羡慕那些免费检索的人了,不过知网不知怎么回事,最近好像更新很慢。
还有许多国内外免费医学数据库。
篇幅有限这里就不多说了。
发个链接,挺全面的的,大家自己去看看吧。
/cate/733.htm2 国内著名医学论坛一览表:1 丁香园论坛()丁香园是国内老牌的医学、生命科学论坛,路人皆知,这里就不多说了。
2 协和眼科联盟(/bbs/)是国内资深的眼科专业论坛,眼科的朋友请不要错过。
3 爱爱医,()主要是面向低年资医师和乡村医师的交流平添,如果你刚毕业进入医疗领域,不妨去要去看看。
医学信息获取方法及其应用医学信息获取是指通过各种渠道和途径获取与医学相关的知识、信息和数据,包括医学研究文献、医学数据库、医学网站、医学期刊等。
医学信息获取是医学研究、医学教育和临床实践中不可或缺的一部分。
本文将介绍一些常见的医学信息获取方法及其应用。
一、医学研究文献医学研究文献是医学领域中最重要的信息来源之一。
它包括期刊论文、会议论文、专利、学位论文等形式。
常见的医学研究文献数据库包括PubMed、EMbase、Web of Science等。
通过这些数据库,我们可以获取到最新的医学研究成果,了解到前沿的医学知识。
在应用上,医学研究文献可以用于撰写学术论文、开展医学研究和制定临床指南等。
二、医学数据库医学数据库是储存和管理医学信息的系统化、结构化和标准化的资源。
常见的医学数据库包括临床试验注册与结果报告数据库、药物数据库、疾病数据库等。
通过这些数据库,我们可以获取到全球范围内的临床试验信息、药物信息和疾病信息。
在应用上,医学数据库可以用于临床决策、药物评价和疾病管理等。
三、医学网站医学网站是提供医学信息和资源的在线平台。
常见的医学网站包括国际、国内医学协会的官方网站、医学教育机构的网站、医院的网站等。
通过医学网站,我们可以获取到各种医学教育资源、医学指南和专家共识等。
在应用上,医学网站可以用于学术交流、医学教育和临床决策支持等。
四、医学期刊医学期刊是以出版医学研究成果为主要内容的专业期刊。
常见的医学期刊包括NEJM、JAMA、The Lancet等。
医学期刊在医学研究、学术交流和知识传播方面起到了关键作用。
通过医学期刊,我们可以获取到最新的医学进展和研究成果。
在应用上,医学期刊可以用于学术讨论、研究发表和新知识掌握等。
五、其他方法除了上述常见的方法外,还有一些其他方法可以获取医学信息。
例如,参加学术会议、研讨会和学术讲座,可以通过与专家交流和听取报告来获取医学信息;利用社交媒体平台关注相关的医学账号和专家,可以获取到专家观点和最新的医学动向;参与医学研究项目,可以从项目中获取到丰富的医学信息和数据。
以下英文缩写对应的数据库中主要收集中文文献
以下是一些常见的英文缩写对应的数据库中主要收集中文文献:
1. PubMed (Publications from MEDLINE): 包括医学和生命科学领域的文献,主要收集医学和生物医学方面的中英文文献。
2. CNKI (China National Knowledge Infrastructure): 中国国家知识基础设施,收集包括学位论文、期刊、会议论文等多种学术资源,主要为中文文献。
3. Wanfang Data: 万方数据,收集包括期刊、学位论文、会议论文等学术资源,主要为中文文献。
4. VIP Database (Chinese Science and Technology Periodical Database):
中国科技期刊数据库,收集中国科技期刊中的中文文献。
5. Chinese Medical Database (CMDB): 中国医药数据库,主要收集中文医学文献。
6. Chinese Social Sciences Citation Index (CSSCI): 中国社会科学引文索引,主要收集中国社会科学领域的中文文献。
7. China Academic Journal Network Publishing Database (CAJ): 中国学术
期刊网络出版总库,收集包括社会科学、科技、医药等多个领域的中文文献。
以上是一些常见的数据库,它们主要收集中文文献,但其中有部分也收集英文文献。
生命科学中最常用的5个数据库介绍生命科学是一个庞大而复杂的学科,其中包含了关于生命现象的各种研究。
对于生命科学的研究,特别是在分子水平上进行的研究,需要大量的数据支持。
这些数据包括分子序列、蛋白质结构、代谢途径等等。
为了有效地管理这些数据,生命科学中广泛应用了各种数据库。
本文将介绍生命科学中最常用的5个数据库。
1. GenBankGenBank是全球最大的分子生物学数据库,包含了全球各地实验室提交的DNA和RNA序列。
它由美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护。
GenBank包含了数十亿条序列记录,其中包括了不同物种的基因组、蛋白质序列、DNA和RNA序列等。
与DNA和RNA序列相关的信息包括序列长度、基序、带电的特殊域、结构域、转录因子结合位点以及其他数据。
GenBank还包含了元数据,如物种和菌株的信息、文献引用以及序列的提交日期。
2. PubMedPubMed是美国国家医学图书馆(NLM)维护的一个生命科学文献数据库,包括了生命科学、医学和健康相关的数百万篇论文。
PubMed提供了对文献的全文搜索和存储,使科学家在查找特定话题时更加方便。
除了搜索全文的功能,PubMed还提供了很多额外的服务,如翻译摘要、相关文章推荐、绘制图表等。
3. EnsemblEnsembl是一种数据库、搜索引擎和分析平台,专门用于处理各种生命科学的数据。
Ensembl已经成为了全球最大的基因组数据库之一,包含了人类、其他哺乳动物、鸟类、篮球、双子蝎、无脊椎动物等近700个物种的基因组信息。
Ensembl提供的数据包括生物序列、调控区域、基因家族、基因结构、基因组的变异和基因表达信息等。
4. Protein Data Bank (PDB)蛋白质数据银行(PDB)是一个三维蛋白结构数据库,由改华大学、美国罗格斯大学和欧洲生物信息研究所等机构共同维护。
PDB存储了全球各地实验室提交的蛋白质晶体结构和生化分析,包括了大多数已知的蛋白质家族和酶。
医学研究证据常用的检索数据库
- 中国生物医学文献数据库(CBM):收录了国内医学期刊种类较多,与 Pubmed 有良好的兼容性。
- Medline:是美国国立医学图书馆生产的国际性综合生物医学信息书目数据库,是当前国际上最权威的生物医学文献数据库。
- ScienceDirect 数据库:收录了爱思唯尔出版集团的同行评议期刊、系列丛书、手册和参考书等。
- Cochrane library:是循证医学数据库,提供有关最新医疗的客观信息。
- SpringerLink:是德国施普林格出版集团提供的电子图书数据库,包括各种类型的Springer 图书产品。
- OALib:可以免费获取各类文献,包括经过同行评议过的期刊文章、参考文献、技术报告、学位论文等全文信息。
- Free Medical Journals:是因特网上免费提供生物医学全文最多的期刊集合网站,收录了1460余种生物医学全文期刊。
- 科学公共科学图书馆(PLOS):旨在推广世界各地的科学和医学领域的最新研究成果,使其成为一种公众资源。
PLOS 出版了8种生命科学与医学领域的期刊,可以免费获取全文。
不同的数据库有不同的特点和优势,建议根据研究需求和学科领域选择合适的数据库进行检索。
医学院常用数据库
文摘库:外文文摘库:MEDLINE, EMBASE, BIOSIS Preview, SciFinder, 中文文摘库:CBM, CBA。
全文库:外文全文库:OVID, Springer Link, PML, Blackwell, Elsevier, Wiley, EBSCO。
中文全文库:cqvip, CNKI, 万方
循证医学库:Ovid 循证医学数据库
药物数据库:Micromedex临床暨医药学数据库
学位论文库:外文PQDD, 中文万方博硕论文库
综合性数据库:Web of Knowledge
评价:
本讲座从实用的角度,着重讲解了医学常用的数据库,包括数据库的收录学科范围,期刊数目,收录年份,核心期刊比例等。
特别值得推荐的是,每种类型的数据库都有一个小结,用表格对比了不同数据库的收录年份,期刊数等重要指标。
看了这个讲座,您对医学文献检索会有一个整体的认识,文献检索的千里之行,将由此展开。
常用的医学数据库按照内容揭示程度分为:
文摘数据库
电子全文数据库
引文数据库
事实型数据库
2.1.1 中文文摘数据库
CBMdisc收录年限比CMCC要长,收录的期刊范围更广,而且有规范的主题词标引,是文献查新的主要中文检索工具。
主要缺点是时滞长,一般在3~4月。
相比而言,CMCC更新快,这一点是突出于CMBdisc的最大优势。
2.1.2 外文文摘数据库
比较:
MEDLINE偏重于生物医学,EMBASE偏重于生物医学与药理学,在药理上比MEDLINE 收录的更全面。
MEDLINE和EMBASE收录的期刊中,有50%以上是重复的。
BIOSIS Preview 偏重于生物学。
CA偏重于化学。
目前,文摘数据库一般都实现了与全文数据库的全文链接。
如果您的单位订购了这些全文库,那么在文摘数据库中检索到特定的文献后,能直接链接到全文数据库,打开该全文
2.1.3 中文全文数据库
比较:
CNKI是目前国内最好、使用最多的中文全文数据库,CNKI旗下的CHKD面向医学专业,做得比较专业,在国内很多医院购买。
重庆维普比CNKI收录的年限要早,但是期刊收录的不全,有漏刊。
万方数据收录的年限晚,收录的期刊比较精。
2.1.4 外文全文数据库
1 在外文电子全文数据库中,有必要分清两个概念,集成商和出版商。
集成商的全文数据库,并不能保证收录的每一种期刊都可以永远地保留在数据库中。
另外,有些期刊存在延迟出版情况,最多甚至延迟1年出版。
出版商的全文数据库,延迟出版情况少,有些期刊优先以电子方式出版,也就是在印刷版出来之前,就能看到电子版全文。
下面是集成商和出版商的一个列表。
2 Science Direct 是全球最全面的全文文献数据库,涵盖了几乎所有学科领域,且大多数为核心期刊。
是国内使用频率最高的外文全文数据库。
通过ScienceDirect网站,,能免费查看几十本期刊(标记为Complimentary),比如著名的Cell,能查看一年以前的全文。
3 外文全文库和中文全文库不同,期刊分布的分散性更强,没有任何一个数据库能包揽大部分期刊。
如果图书馆的文摘数据库没有链接系统,普通用户获取全文存在一定的困难。
这也是PubMed的LinkOut功能受到大家欢迎的一个原因。
2.1.5 引文数据库
科学引文索引(SCI)介绍
SCI(科学引文索引,英文全称为Science Citation Index)是美国科学情报研究所(Institute for Scientific Information,简称ISI,网址:,ISI又是Thomon公司下属的一个机构。
)出版的一部世界著名的期刊文献检索工具,最初书本式发行,1988年推出光
盘版,1997年ISI推出引文索引的网络版:Web of Science。
2001年ISI推出了基于Web的新一代学术信息资源整合平台—Web of Knowledge,Web of Science成为Web of Knowledge平台上的产品之一。
SCI的独特之处在于,作为一部检索工具,一反其它检索工具通过主题或分类途径检索文献的常规做法,而设置“引文索引”(Citation Index)。
即通过先期的文献被当前文献的引用,来说明文献之间的相关性及先前文献对当前文献的影响力。
ISI有三大引文:
SCI(Science Citation Index,科学引文索引:收录3500种科学技术期刊,是SCI核心期刊。
SCIE(Science Citation Index Expanded,SCI扩展版):是SCI的扩展版,收录6300种期刊。
SSCI(Social Sciences citation Index,社会科学引文索引):1800种社会科学期刊。
A&HCI(Arts & Humanities Citation Index,艺术与人文引文索引):1100多种艺术与人文类期刊。
ISI通过严格的选刊标准和评估程序挑选刊源,而且每年略有增减,从而做到SCI收录的文献能全面覆盖全世界最重要和最有影响力的研究成果。
SCI以上做法上的特点,使得SCI不仅作为一部文献检索工具使用,而且成为科研评价和的一种依据。
科研机构被SCI收录的论文总量,反映整个机构的科研、尤其是基础研究的水平;个人的论文被SCI收录的数量及被引用次数,反映他的研究能力与学术水平。
JCR(期刊引用报告)介绍:
ISI每年6月会出版上一年的JCR(《期刊引用报告》,全称Journal Citation Reports)。
JCR 对包括SCI收录的3500种期刊在内的4700种期刊之间的引用和被引用数据进行统计、运算,并针对每种期刊定义了影响因子(Impact Factor)等指数加以报道。
一种期刊的影响因子,指的是该刊前二年发表的文献在当前年的平均被引用次数。
一种刊物的影响因子越高,也即其刊载的文献被引用率越高,一方面说明这些文献报道的研究成果影响力大,另一方面也反映该刊物的学术水平高。
因此,JCR而成为一种期刊评价工具,论文作者可根据期刊的影响因子排名决定投稿方向。
2005年最新SCI影响因子查询:
2005年最新的SCI影响因子查询,摘自2005年JCR(期刊引用报告):JCR2005.excel
2.1.6 事实型数据库
Micromedex临床暨循证医药学数据库
Micromedex数据库由美国Thomson公司出版,不同于一般文摘索引型或全文型数据库,属于综述型事实数据库,其内容是由医药学专家针对全世界2000余种医药学期刊文献进行分类、收集、筛选后,按照临床应用的需求,编写为基于实证的综述文献,直接提供给专业人士使用。
内容包括:药物信息,疾病信息,毒物信息,传统医学信息,患者的卫生教育信息。
目前世界上已有超过90个国家、9000多个医疗机构、药学院、医药大学、医药研究单位、药厂正在使用此数据库。
国内购买Micromedex的院校有:北京大学,北京协和医学院,复旦大学,上海交通大学医学院等。