结合DNA特性的机械设计
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实验一D N A提取公司内部档案编码:[OPPTR-OPPT28-OPPTL98-OPPNN08]实验一 DNA的小量制备小量法提取植物基因组DNA(CTAB法)1 实验目的:随着基因工程等分子生物学技术的迅速发展及广泛应用,人们经常需要提取高分子量的植物DNA,用于构建基因文库、基因组 southern 分析、酶切及克隆等,这是研究基因结构和功能的重要步骤。
本实验目的是学习从植物材料中提取和测定DNA 的原理并掌握CTAB 提取DNA 的方法,进一步了解DNA 的性质。
2 实验原理细胞中的DNA 绝大多数以DNA-蛋白复合物(DNP)的形式存在于细胞核内。
提取DNA 时,一般先破碎细胞释放出DNP,再用含少量异戊醇的氯仿除去蛋白质,最后用乙醇把DNA 从抽提液中沉淀出来。
DNP 与核糖核蛋白(RNP)在不同浓度的电解质溶液中溶解度差别很大,利用这一特性可将二者分离。
以NaCl 溶液为例:RNP 在L NaCl中溶解度很大,而DNP 在其中的溶解度仅为纯水中的1%。
当NaCl 浓度逐渐增大时,RNP的溶解度变化不大,而DNP 的溶解则随之不断增加。
当NaCl 浓度大于1mol/L 时,DNP的溶解度最大,为纯水中溶解度的2 倍,因此通常可用L NaCl 提取DNA。
为了得到纯的DNA 制品,可用适量的RNase 处理提取液,以降解DNA 中搀杂的RNA。
关于植物总DNA 的提取主要有两种方法:1. CTAB 法:CTAB(十六烷基三甲基溴化铵,hexadecyltrimethylammonium bromide, 简称CTAB):是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(LNaCl)是可溶的,当降低溶液盐的浓度到一定程度( mol/L NaCl)时从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB 与核酸的复合物同蛋白、多糖类物质分开,然后将CTAB 与核酸的复合物沉淀溶解于高盐溶液中,再加入乙醇使核酸沉淀,CTAB 能溶解于乙醇中。
中国医疗核酸检测行业自动化进程及国内外核酸自动提取仪常见品牌浅析国内在核酸检测方面的自动化进程尚且远远落后于美国日本等国,很多医院仍然在进行手动提取检测的模式。
因为大多数核酸检测的目的基因是HBV、HCV、HIV等传染性病毒,这种检测方法大大增加了一线操作人员的感染风险,且工作效率低下,无法完成大量样本的快速检测。
目前国内医疗资源紧张,很多病人都反映在医院看病难,速度慢,等待时间长,价格贵等等。
这和我国医疗机构的自动化进程普遍较低也有关系。
试想,一个熟练的核酸提取及检测人员每次仅能进行20~30个样本的提取检测,每次提取需要1~2个小时,面对数以千记的需要检测的病人,想要完成检验,要么需要很长的时间,要想缩短时间,就要大量增加人手,显然就会增加医疗成本。
要解决这些问题,推动国内医疗检测行业的自动化进程是非常有必要的。
要推进核酸检测类别的自动化进程,就需要引入自动化仪器,目前国内外很多仪器厂商都致力于生产开发改进核酸自动提取仪。
国外主流品牌有以下几个:贝克曼库尔特SPRI-TE作为小型化的自动提取,提供高质量,高效率,可重复的磁珠核酸提取,专门为小实验室设计。
Vidiera NsP则更倾向于血站,CDC,大型医院实验室等大客户。
贝克曼库尔特是提供和QIAGEN签约的extraction reagents,而且提取的核酸可以同LightCycler,* Cobas* Taqman* or 96-well Thermowell Plate等联用去做定量检测的结果。
产品性能:SPRI-TE自动化处理1-10个样品即开即用的试剂UV去除污染Vidiera NsP全自动样品提取96 样本提取需要2.5小时阳性样本追踪预制样本提取和用户定义样本提取雅培雅培m2000系统是由雅培加拿大公司研发成功的,旨在用于医学诊断实验室样品的自动提取,可以和m2000 rt联用。
目前可以应用的检测有RT HIV-1, RT HBV, RT HCV 和RT CT/NG。