(精选)蛋白质分子中的超二级结构
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超二级结构和基序什么是超二级结构?蛋白质是由氨基酸组成的大分子,它们在生命过程中发挥着重要的作用。
蛋白质的结构可以分为四个层次:一级结构、二级结构、三级结构和四级结构。
一级结构是指蛋白质的氨基酸序列,它决定了蛋白质的基本特性。
二级结构是指蛋白质主链的空间走向,它由氢键稳定,有两种常见的形式:α-螺旋和β-折叠。
三级结构是指蛋白质在空间中的整体形状,它由侧链之间的各种相互作用维持,如疏水作用、离子键、氢键、范德华力和二硫键等。
四级结构是指由多个多肽链组成的复合蛋白质的空间排列,它由相同或不同的三级结构单元相互作用形成。
超二级结构是一种介于二级结构和三级结构之间的层次,它是由相邻的二级结构单元组合在一起,相互作用,形成有规则排列,在空间上能够辨认的二级结构组合体。
超二级结构是进一步构成三级结构的基础,它可以看作是蛋白质的“标准折叠单位”或“折叠花式”。
超二级结构的概念由美国物理学家及微生物学家Rossmann M.G.于1973年首次提出。
常见的超二级结构有哪些?目前已知的超二级结构有三种基本的组合形式:αα、βαβ和ββ。
αα组合αα组合是一种α-螺旋束,一般是由两股或三股右手α-螺旋彼此缠绕形成的左手超螺旋(或称卷曲螺旋,coiled coil)。
α-螺旋束中还发现有三股螺旋和四股螺旋等形式。
超螺旋是纤维状蛋白质(如α-角蛋白、肌球蛋白和原肌球蛋白等)的主要结构元件。
超螺旋也存在于球状蛋白质中(如蚯蚓血红蛋白、烟草花叶病毒外壳蛋白等)。
球状蛋白质中的α-螺旋束是由同一条肽链的一级序列上邻近的α-螺旋组成,不像纤维状蛋白质中由几条肽链的α-螺旋区相互缠绕而成。
α-螺旋束中的α-螺旋主链的φ角和ψ角与正常值略有偏差,每卷螺旋为3.5个残基而不是通常的3.6个残基。
α-螺旋沿超螺旋轴有相当的倾斜,重复距离从5.4 nm缩短至0.51 nm。
超螺旋的螺距约为14 nm,直径约为2 nm,两股α-螺旋的轴相距约1 nm,使两股α-螺旋的侧链能紧密结合以增强螺旋结构。
1. 蛋白质超二级结构:在蛋白质分子中,特别是球状蛋白质中,由若干相邻的二级结构单元(即α-螺旋,β-折叠片和β-转角等)彼此相互作用组合在一起,形成有规则、在空间上能辨认的二级结构组合体,充当三级结构的构件单元,称超二级结构。
2 sanger反应:在弱碱性溶液中,氨基酸的α-氨基易与DNFB(2,4-二硝基氟苯)反应,生成黄色的DNP-AA(二硝基苯氨基酸),此反应最初被sanger用于测定N-末端氨基酸,又被称为sanger反应。
6 引发体:引物酶与相关蛋白质结合成的一个有活性的复合体叫做引发体。
8 分子病:由于基因突变导致蛋白质一级结构发生变异,使蛋白质的生物学功能减退或丧失,甚至造成生理功能的变化而引起的疾病,称为分子病。
10 固定化酶:将酶从微生物细胞中提取出,将其用固定支持物(称为载体)固定,使其成为不溶于水或不易散失和可多次使用的生物催化剂,这种固定的酶称为固定化酶。
11 解偶联作用:在完整线粒体内,电子传递与磷酸化是紧密偶联的,当使用某些试剂而导致的电子传递与ATP形成这两个过程分开,只进行电子传递而不能形成ATP的作用,称为解偶联作用二,简答1. 简述信号肽的特点和转运机制。
答:信号肽具有两个特点:1)位于分泌蛋白前体的N-端2)引导分泌蛋白进入膜以后,信号肽将被内质网腔内的信号肽酶切除。
信号肽的转运机制:信号肽运作的机制相当复杂,有关组分包括信号肽识别颗粒(SRP)及其受体、信号序列受体(SSR)、核糖体受体和信号肽酶复合物。
信号肽发挥作用时,首先是尚在延伸的、仍与核糖体结合的新生肽链中的信号肽与SRP结合,然后通过三重结合(即信号肽与SSR的结合、SRP及其受体结合、核糖体及其受体的结合)。
当信号肽将新生肽链引导进入内质网腔内后,在信号肽酶复合物的作用下,已完成使命的信号肽被切除。
3. 生物膜主要有哪些生物学功能?任举一例说明膜结构与功能的密切关系。
生物膜的生物学功能可以概括如下:1)区域化或房室化 2)物质的跨膜运输 3)能量转换(氧化磷酸化) 4)细胞识别4. 研究蛋白质一级结构有哪些意义?蛋白质的一级结构即多肽链中氨基酸残基的排列顺序(N端—C端)是由基因编码的,是蛋白质高级结构的基础,因此一级结构的测定成为十分重要的基础研究。
1、什么是蛋白质超二级结构与蛋白质结构域?解答:蛋白质的超二级结构是指由若干相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,形成有规则在空间上能够辨认的二级结构组合体,三种基本组合形式αα、αβα、βββ。
蛋白质的结构域是指在超二级结构基础上组装而成的,多肽链折叠成近乎球状的组装体,这种相对独立的三维实体叫结构域。
2、什么是盐溶与盐析?解答:盐溶是指蛋白质溶液中由于加入低浓度的中性盐后,使蛋白质溶解度增加的现象称为盐溶。
盐析是指高浓度中性盐可使蛋白质分子脱去水化层并中和其电荷而使蛋白质从溶液中凝集出来的现象叫做盐析。
3、什么是蛋白质变性与复性?解答:蛋白质的变性作用是指天然蛋白质分子由于受到物理或化学因素的影响使次级键破坏,引起天然构象的改变,导致生物活性的丧失及一些理化性质的改变,但未引起肽键的断裂,这种现象叫做蛋白质的变性作用。
蛋白质的复性是指当变性因素除去后,变性蛋白又可重新回复到天然构象,这一现象叫蛋白质的复性。
4.组成蛋白质的氨基酸根据R基团的极性可分为哪几类?写出每类所包含氨基酸的中文名称及三字母符号。
解答:组成蛋白质的氨基酸根据R基团的极性共分为四类:(1)具有非极性或疏水的R基团的氨基酸:丙氨酸(Ala)、亮氨酸(Leu)、异亮氨酸(ilc)、缬氨酸 (Val)、脯氨酸(Pro)、苯丙氨酸(Phe)、色氨酸(Try或Trp)、甲硫氨酸(Met);(2)具有极性不带电荷的R基团的氨基酸:甘氨酸(Gly)、丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)、半胱氨酸(Cys)、酪氨酸(Tyr)、天冬酰胺(Asn)、谷酰胺(Gln);(3)R基团带负电荷的氨基酸:天冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu);(4)R基团带正电荷的氨基酸:赖氨酸(Lys)、精氨酸(Arg)、组氨酸(His)。
5.何谓蛋白质的一级结构?研究蛋白质一级结构有什么重要意义?解答:蛋白质的一级结构是指氨基酸在肽链中的排列顺序及二硫键的位置。
固定相和流动相:层析系统中的两个互不相溶的相:一是固定相(固体或吸附在固体上的液体),一是流动相(液体或气体)。
级联放大作用:由于酶的共价修饰反应是酶促反应,只要有少量的信号分子(如激素)存在,即可通过加速这种酶促反应,而使大量的另一种酶发生化学修饰,从而获得放大效应,这种调节方式快速,效率极高。
蛋白质超二级结构:在蛋白质分子中,特别是球状蛋白质中,由若干相邻的二级结构单元(即α-螺旋,β-折叠片和β-转角等)彼此相互作用组合在一起,形成有规则、在空间上能辨认的二级结构组合体,充当三级结构的构件单元,称超二级结构。
肽平面:组成肽键的四个原子及与之相连的两个α-碳原子都处在同一个平面内,这个刚性平面称为肽平面。
酶的国际单位:1个酶活力单位是指在特定条件下,在1min内能转化1u mol底物的酶量。
测定条件为250C和其他最适条件,该单位为国际单位。
PCR:聚合酶链式反应,又称体外基因扩增。
该法模拟体内DNA的复制过程,首先使DNA变性,两条链分开,然后是引物模板退火,二者碱基配对,DNA聚合酶随即以4种dNTP为底物,在引物的引导下合成与模板互补的DNA新链。
重复此过程,DNA以指数方式扩增。
引物为特定引物。
RAPD:随机扩增多态性。
其方法是用一个随机核苷酸序列为引物对基因组DNA进行PCR扩增,产生不连续的DNA产物,再通过凝胶电泳来观察扩增片段的多态性,获得特异分子标记。
RFLP限制性片段多态性,由限制性内切酶把很大的DNA分子降解成许多长短不同的较小片段,其数目和长度反映了限制性内切酶的切点在DNA分子上的分布,它能作为某DNA或含这种DNA生物所特有的“指纹”,不同个体的等位基因之间碱基代换、重排、插入、缺失等都会引起这种“指纹”的多态性。
AFLP:扩增片段长度多态性。
是RFLP和PCR技术相结合产生的一项新技术,用限制性内切酶消化基因组DNA,由于不同材料的DNA的酶切片段存在差异,用特定引物选择性的扩增基因组限制性酶切片段,再用凝胶电泳分离就可以观察基因组DNA的多态性拓扑异构酶通过切断DNA的一条或两条链中的磷酸二脂键,然后重新纠缠和封口来改变DNA连环数的酶。
蛋白质二级结构名词解释蛋白质的二级结构又称超二级结构,它包括4种变构(主要发生在变构象)、 5种重排、 7种折叠。
蛋白质的二级结构是指蛋白质空间结构的复杂性和多样性,是蛋白质分子结构与功能相互关系的体现。
蛋白质中的亚基都具有二级结构,一个完整的蛋白质分子通常由两条或两条以上的多肽链构成。
蛋白质的二级结构包括4种变构(主要发生在变构象)、 5种重排、 7种折叠。
protein的二级结构protein的结构蛋白质的二级结构有三个层次:一级结构、二级结构、三级结构。
1、一级结构,也叫天然结构,指蛋白质晶体中氨基酸的几何排列,或者说是氨基酸按照一定规律排列起来所形成的空间结构。
protein的二级结构一级结构是蛋白质结构最基本的单位,它表明蛋白质分子内部的氨基酸的排列顺序及其相互之间的空间关系。
2、二级结构又称超二级结构,它包括4种变构(主要发生在变构象)、 5种重排、7种折叠。
protein的二级结构一级结构是蛋白质结构最基本的单位,它表明蛋白质分子内部的氨基酸的排列顺序及其相互之间的空间关系。
而二级结构不仅反映了一级结构的信息,而且决定着蛋白质分子的功能。
protein的二级结构在生物体内各类蛋白质的二级结构相同的只占总数的很小部分,大部分蛋白质的二级结构是不同的。
蛋白质二级结构是指蛋白质空间结构的复杂性和多样性,是蛋白质分子结构与功能相互关系的体现。
蛋白质中的亚基都具有二级结构,一个完整的蛋白质分子通常由两条或两条以上的多肽链构成。
1、氨基酸的平面二级结构,即肽链在空间的布局,是构成蛋白质多肽链的基本骨架。
2、局域结构(又称亚细胞结构,也就是三级结构),局域结构是蛋白质的三维空间结构,是指某一特定氨基酸残基在三维空间中所处的状态,是对三级结构的进一步划分。
protein的二级结构蛋白质的二级结构包括4种变构(主要发生在变构象)、 5种重排、 7种折叠。
蛋白质的二级结构是指蛋白质空间结构的复杂性和多样性,是蛋白质分子结构与功能相互关系的体现。