有一部分嵌在膜里
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膜外
3.多肽链构象中的势能影响
φ、ψ的取值关系到主链侧链原子或基团的 空间位置,天然构象处于稳定的低势能形状
能量对二面角〔φ、ψ〕分布的影响 非键作用能 偶极相互作用能 单键旋转的本征改动能 思索主要3类能量
非键作用能 EKL〔φ、ψ〕
非键作用能 EKL〔φ、ψ〕
恣意2个原子或粒子间的 推斥力 范德华力吸引力
两种β-构造,边上的折叠股有能够比中间的更为亲 水些
蛋白质中混合的折叠片也可存在,几率不高。
β-折叠构造中 普通6-10股 股平均长度为6个残基
整个构造常呈扭曲,这种扭曲也具手性规律如图
3.无规那么卷 曲
多肽链主链骨架中,与有规那么的右手α螺旋和β-折叠构造不同的构象,都称为无规那 么卷曲或无规线团、自在折叠等。
生物大分子是一切生命方式的根底,重 要的生物大分子有4类:
蛋白质、核酸、多糖和脂类。 蛋白质由氨基酸聚合而成
核酸由核苷酸聚合而成 多糖由单糖聚合而成 脂类,一切能被脂溶性溶剂提取的动植 物组织部分均定义为脂类。
构型〔configuration〕和构像(conformation)
构型——是指分子在立体异构体种的取代原子 或集团以共价键相连时,他们在空间的取向。
球状蛋白质构造的不同程度
一级构造、二级构造、三级构造、四级构造 超二级构造和构造域〔domains〕 球状蛋白质构造的不同程度
第二节 蛋白质分子的构造原理
讨论重点
讨论蛋白质分子的构象的普遍性规律 构成天然构象的物理与化学缘由
一.蛋白质空间构象与肽平面关系
1.氨基酸的手性特征
除 Gly 外的19种L-氨基酸分3类 疏水的氨基酸 Ala, Val, Leu , Ile, Phe, Pro, Met 带电荷氨基酸 Arg, Lys, Asp, Glu 极性氨基酸 Ser, Thr, Cys, Asn, Gln, His, Tyr, Trp