基因表达载体和重组质粒的区别
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1.生物技术概念与特征定义:利用活体生物或它们的产物来生产或修饰一种产品以改良植物和动物、或发展具有特殊用途的微生物的技术。
2.基因工程的概念利用DNA体外重组或PCR扩增技术从某种生物基因组中分离感兴趣的基因,或是用人工合成的方法获取基因,然后经过一系列切割,加工修饰,连接反应形成重组DNA分子,再将其转入适当的受体细胞,以期获得基因表达的过程3.PCR反应体系基本原理PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。
PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成4.PCR反应参数:高温变性(94),低温退火(60),适温延伸(72)5.PCR反应体系:(1)模板DNA(2)特异性引物dNTP(3)耐热的DNA聚合酶(Taq酶)(4)缓冲溶液6.PCR反应原则:引物原则:(1)引物扩增跨度(2)引物解链温度(3)避免引物内部或引物之间存在互补序列(4)G+C含量:尽量控制在40%至60%之间(5)引物的3‘末端特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对(6)引物中有或能加上合适的酶切位点7.分子杂交:指具有一定同源序列的两条核酸单链(DNA或RNA),在一定条件下按碱基互补配对原则经过退火处理,形成异质双链的过程。
用途:(1)研究DNA之间的亲缘关系(2)发现基因的缺失或突变;(3)测定某种遗传信息的量(4)鉴定某种基因(5)基因治疗8.常用分子杂交类型:(1)DNA印迹技术Southern blotting(2)RNA印渍技术Northern blotting(3)蛋白质印渍技术Western blotting(4)斑点印迹Dot blotting(5)原位杂交in situ hybridization9.DEPC(二乙基焦碳酸盐)(C2H5OCOOCOOC2H5)10.Sanger双脱氧链终止法原理:(1)Sanger双脱氧链终止法的最大特点是引入了双脱氧核苷三磷酸(2ˊ,3ˊ-ddNTP)作为链终止剂,2ˊ,3ˊ-ddNTP与普通的dNTP不同之处在于前者的脱氧核糖的3ˊ位又少了个羟基。
第2节基因工程的基本操作程序课标内容要求核心素养对接阐明基因工程的基本操作程序主要包括目的基因的筛选与获取、基因表达载体的构建、将目的基因导入受体细胞和目的基因的检测与鉴定。
1。
科学思维:结合生产实例,举例说出基因工程的基本操作程序。
2.科学探究:针对人类生产和生活的某一需求,尝试提出初步的基因工程构想,完成初步设计。
一、目的基因的筛选与获取1.目的基因(1)概念:用于改变受体细胞性状或获得预期表达产物等的基因。
(2)实例:培养转基因抗虫棉用到的目的基因是Bt抗虫蛋白基因.2.筛选合适的目的基因(1)较为有效的方法:从相关的已知结构和功能清晰的基因中进行筛选。
(2)实例:在培育转基因抗虫棉之前,科学家不仅掌握了Bt基因的序列信息,也对Bt基因的表达产物—-Bt抗虫蛋白有了较为深入的了解。
(3)认识基因结构和功能的技术方法:DNA测序技术、遗传序列数据库、序列比对工具。
3.利用PCR获取和扩增目的基因(1)PCR的含义:PCR是聚合酶链式反应的缩写,它是一项根据DNA半保留复制的原理,在体外提供参与DNA复制的各种组分与反应条件,对目的基因的核苷酸序列进行大量复制的技术.(2)条件:DNA模板、分别与两条模板链结合的2种引物、四种脱氧核苷酸、耐高温的DNA聚合酶。
(3)过程:①变性:温度上升到90 ℃以上,目的基因DNA受热变性后解为单链.②复性:温度下降到50 ℃左右时,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合。
③延伸:温度上升到72 ℃左右时,溶液中四种脱氧核苷酸在耐高温的DNA聚合酶的作用下加到引物的3′端合成子链.④重复循环多次。
(4)结果:每次循环后目的基因的量增加一倍,即成指数形式扩增(约为2n)。
二、基因表达载体的构建1.构建基因表达载体的目的(1)使目的基因在受体细胞中稳定存在,并且可以遗传给下一代。
(2)使目的基因能够表达和发挥作用。
2.基因表达载体的组成[填图]3.基因表达载体的构建首先用一定的限制酶切割载体,使它出现一个切口,然后用同种限制酶或能产生相同末端的限制酶切割目的基因的DNA片段,再利用DNA连接酶将目的基因片段拼接到载体的切口处。
基因工程的载体载体的特征:在寄主细胞中能够自主复制;有一种或多种限制酶的单一切割位点,并在此位点插入外源基因片段;在基因组中有遗传标记,为寄主细胞提供易于检测的表型特征;载体分子较小,以便体外基因操作;对于表达型载体还应具有与宿主细胞相适应的启动子、增强子、加尾信号等基因表达元件;载体的类型⏹质粒⏹噬菌体⏹其他载体(如:酵母人工染色体、细菌人工染色体、植物Ti质粒、动物病毒)质粒(plasmid): 多数情况下,质粒是存在于细菌染色体外的小的双链闭合环状DNA分子,能自主复制,并在细胞分裂时遗传给子代细胞⏹并不是所有的质粒都是环状分子, 在多种细菌中都发现有线性质粒⏹质粒广泛存在于原核生物中, 其大小从相对分子量小于1X106 到大于200X106质粒的形态1) cccDNA—双链闭合环状DNA2) ocDNA—开环DNA3) cDNA—线形DNA(L型)在DNA促旋酶(gyrase)作用下成负超螺旋构型, 在拓扑异构酶I的作用下解旋。
溴化乙锭(ethidium bromide,EtBr)也有解旋作用溴化乙锭插入DNA超螺旋的作用随着插入的溴化乙锭数目增加,双螺旋解旋,导致超螺旋减少直至产生环状分子的开放形式. 进一步的插入在双螺旋中引入了过多的螺旋,导致反义的超螺旋(注意B和D处的螺旋方向). 为了清楚起见,只表示了双螺旋的一条单链质粒DNA的复制类型⏹严紧型质粒这些质粒的复制是在寄主细胞严格控制之下的,与寄主细胞的复制偶联同步。
所以,往往在一个细胞中只有一份或几份拷贝⏹松弛型质粒这些质粒的复制是在寄主细胞的松弛控制之下的,每个细胞中含有10-200份拷贝,如果用一定的药物处理抑制寄主蛋白质的合成才会使质粒拷贝数增至几千份。
如较早的质粒pBR322即属于严紧型质粒,要经过氯霉素处理才能达到更高拷贝数穿梭载体(shuttle vector) 可以在两种生物体内复制的载体分子质粒的命名规则⏹小写字母p表示质粒(plasmid)⏹p后面的两个大写字母表示发现或者构建该质粒的作者或者实验室名称⏹数字表示编号⏹例:pBR322、pET21、pGEM-T质粒的宿主范围⏹质粒只编码少数几个其自身复制所需要的蛋白质,甚至在许多情况下只编码其中一个蛋白质⏹所有其他复制所需的蛋白,包括DNA聚合酶、DNA连接酶、解旋酶等都是由宿主细胞提供的⏹质粒所编码的复制蛋白质定位在ori 附近,因此只有ori 周围的一小部分区域是复制所必需的⏹因此,把质粒的其他部分删除掉,把外源序列加到质粒上,复制仍然可以继续进行⏹质粒的宿主范围是由它的ori 决定的质粒的不相容性⏹在没有选择压力的情况下,两种质粒不能共存于同一个宿主细胞内⏹如果质粒拥有相同的复制调控机制,它们就不相容显性质粒和隐蔽质粒⏹显性质粒(表达型质粒)----除了携带与本身复制和转移有关的基因外, 还携带一些其他的基因, 宿主细胞由于含有这样的质粒而呈现出新的性状, 这样的质粒称为显性质粒⏹隐蔽质粒----无异常性状表现出来克隆载体例:pBR322、pUC18、pUC19、pGEM-T表达载体例:pET-21、pGEX⏹质粒DNA的制备碱裂解法、煮沸法、层析柱过滤法碱裂解法原理:在高pH的碱性条件下,染色体DNA和蛋白质变性,质粒DNA由于其超螺旋共价闭合环状结构,尽管其DNA的大部分氢键也断裂,但是双链DNA仍然不会分离,当恢复到中性时,染色体DNA复性,并聚集形成不可溶的网架。
基因工程常用的三种载体载体是基因工程中常用的一种工具,用于将外源基因导入宿主细胞中并进行表达。
常见的载体有质粒、病毒和人工染色体。
本文将分别介绍这三种载体的特点、用途和优缺点。
1. 质粒:质粒是圆形、双链DNA分子,广泛应用于基因工程中。
质粒的构建相对简单,可以通过DNA重组技术来插入外源DNA 片段。
质粒通常包含由宿主细胞识别的来源于细菌或酵母的起源序列,以实现在细胞中的复制和维持。
此外,质粒上还包含选择性标记基因和表达调控元件,以便筛选和调控目标基因的表达。
质粒在基因工程中有着广泛的应用。
首先,质粒载体可以在大肠杆菌等常见细菌中表达外源基因,用于重组蛋白的产生和纯化,或进行功能研究。
此外,质粒也可以构建用于植物和动物细胞的转染,用于基因转导和基因治疗等领域的研究。
质粒的优点在于构建简单,易于操作,并且可以在多种细胞中进行表达。
然而,质粒的转染效率较低,不适合大规模基因转导。
此外,在某些细胞中,质粒的稳定性较差,易丧失外源基因。
2. 病毒:病毒是一类依赖于细胞代谢活动的生物体,可以将外源基因导入宿主细胞并进行复制和表达。
常见的基因工程病毒载体包括腺病毒、逆转录病毒和腱实病毒等。
病毒载体的主要特点是高效的基因转导能力和细胞特异性。
由于病毒依赖于细胞进行复制和表达,因此病毒载体能够实现高效转导和表达目标基因。
此外,病毒载体还可以通过选择性修饰病毒表面蛋白来实现对特定细胞的特异性转染,进一步提高基因转导效率。
病毒载体被广泛应用于基因治疗和基因敲除等研究领域。
在基因治疗中,病毒载体能够将替代基因导入患者细胞中,以治疗某些遗传性疾病。
在基因敲除中,病毒载体则可以导入携带某种特殊序列的DNA片段,进而敲除靶基因。
然而,病毒载体也存在一些限制。
首先,病毒复制过程中可能引起细胞毒性反应,对细胞造成伤害。
其次,病毒载体的构建和生产相对复杂,需要严格的无菌操作和关键的质控步骤。
3. 人工染色体:人工染色体是一种合成的染色体模拟体,可用于将大片段基因组DNA导入宿主细胞中。
名词解释1.基因工程:是将目的基因或DNA片段与合适的载体连接转入目标生物细胞,通过复制、转录、翻译外源目的基因以及蛋白质的活性表达,使转基因生物获得新的遗传性状的操作。
2.限制性内切核酸酶:能够识别双链DNA分子中的某一段特定核苷酸序列,并在此切割DNA 双链的内切核酸酶。
3.同切点酶:又称同裂酶,是一类来源于不同微生物、能识别相同DNA序列的限制性内切核酸酶。
4.同尾酶:是一类限制性内切核酸酶,它们来源各异,识别的靶序列也各不相同,但切割后能产生相同的黏性末端。
5.酶的星号活性(Star activity):高浓度的酶、高浓度的甘油、低离子强度、极端pH值等,会使一些核酸内切酶的识别和切割序列发生低特异性,即所谓的酶的星号活性现象。
6.DNA连接酶:是能催化双链DNA片段靠在一起的3’羟基末端与5’端磷酸基团末端之间通过形成磷酸二酯键,使两末端连接的一种核酸酶。
7.载体:在基因克隆中能携带外源基因进入受体细胞复制、整合或表达的工具称为载体。
8.多克隆位点:是包含多种同一个限制性酶切点的一段很短的DNA序列9. α互补:为质粒DNA编码β—半乳糖苷酶的α亚基,宿主细胞可编码β亚基虽然宿主和质粒编码的片段各自都没有酶活性,但它们可以融为一体,形成具有酶学活性的蛋白质,这种互补现象叫α互补。
10.黏粒载体(考斯质粒载体):是一类人工构建的含有λ-DNAcos序列和质粒复制子的特殊类型的载体。
11.质粒:是生物细胞内固有的、能独立于寄主染色体而自主复制、并被稳定遗传的一类核酸分子12.探针:当用一个标记的核酸分子与核酸样品杂交,便可查明该样品中是否存在与该标记核酸分子具有同源性的核酸分子。
这个标记的核酸分子称为探针(probe),可以是DNA,也可以是RNA,或合成的寡核苷酸.13、SD序列:是存在于原核生物起始密码子上游7-12个核苷酸内的一种4-7个核苷酸的保守片段,它与16SrRNA3‟端反向互补,所以可将mRNA的AUG起始密码子置于核糖体的适当位置以便起始翻译作用。
1.2 基因工程的基本操作程序1.简述基因工程的原理及基本操作程序。
2.尝试设计某一转基因生物的研制过程。
一、目的基因的获取1.从基因文库中获取目的基因将含有某种生物不同______的DNA片段导入________的群体中储存,各个________分别含有这种生物的不同的基因,称为基因文库。
基因文库包括两种:________文库,即包含一种生物所有基因的文库;________文库,即只包含一种生物的一部分基因的文库,如______文库。
2.利用PCR(1)PCR的含义:是一项在生物______复制特定DNA片段的核酸合成技术。
(2)目的:短时间内大量扩增目的基因。
(3)原理:__________。
(4)过程:第一步,加热至90~95 ℃,________________。
第二步,冷却至55~60 ℃,________________________________________________。
第三步,加热至70~75 ℃,________________________________________________。
如此重复循环多次.(5)特点:指数形式扩增。
3.用化学方法人工合成如果基因比较____,核苷酸序列又已知,也可以通过DNA合成仪用化学方法直接人工合成。
二、基因表达载体的构建基因表达载体的组成:必须有启动子、________、终止子以及________等。
1.启动子启动子是一段有特殊结构的______片段,位于基因的首端,是____________________的部位,可驱动基因______。
2.终止子终止子也是一段______短片段,位于基因尾端,使______在需要的地方停止。
3.标记基因标记基因的作用是为了鉴定受体细胞中是否含有________,从而将含有________的细胞筛选出来。
三、将目的基因导入受体细胞1.转化________进入受体细胞内,并且在受体细胞内________和______的过程,称为转化。
载体,质粒,基因表达载体3者有何不同?
载体是一种运输工具,细胞膜上的蛋白质也是一种载体,其识别很单一,也因此有了选择透过性。
质粒是一种小型环状DNA,广泛存在于微生物中,一般的基因工程中,质粒被用来当做目的基因的运载体,也是一种运输工具。
基因表达载体是目的基因和运载体连接后的产物。
基因表达载体和重组质粒的区别
基因表达载体的构建(即目的基因与运载体结合)是实施基因工程的第二步,也是基因工程的核心。
将目的基因与运载体结合的过程,实际上是不同来源的DNA重新组合的过程。
如果以质粒作为运载体,
首先要用一定的限制酶切割质粒,使质粒出现一个缺口,露出黏性末端。
然后用同一种限制酶切断目的基因,使其产生相同的黏性末端(部分限制性内切酶可切割出平末端,拥有相同效果)。
将切下的目的基因的片段插入质粒的切口处,首先碱基互补配对结合,两个黏性末端吻合在一起,碱基之间形成氢键,再加入适量DNA连接酶,催化两条DNA链之间形成磷酸二酯键,从而将相邻的脱氧核糖核酸连接起来,形成一个重组DNA分子。
这个重组的DNA分子也叫重组质粒。
就是这样。
简单的说,重组质粒是基因表达载体的一种。
生物学上marker是什么意思
从文字上说,标记(Marker),染色体上一个可以被识别的区域(比如限制性内切酶的酶切点,基因的位置等)。
标记的遗传能够被检测出来。
标记可以是染色体上有表达功能的部分(比如基因),也可以是没有编码蛋白质功能但遗传特性能够被检测出来的部分
从实验上说,marker有两种,一种是基因marker,一种是蛋白质marker。
两种marker分别是进行琼脂糖凝胶电泳和SDS-PAGE(蛋白质电泳)所用的标准参照物,用以指示目的基因或者蛋白的大小。
一般常称呼的marker都是指基因marker,即DNA marker
DNA Marker
作为一种分子标记(Marker),构建分子图谱。
分子标记克隆在质粒上,可以繁殖及保存。
DNA Marker 是分子量不同的DNA片段,主要用途就是DNA 分子凝胶电泳时,加样用做对比来检测琼脂糖凝胶是否有问题。
现在常用的DNA MARKER有两种,一种是病毒等DNA经过酶切获得的,分子量大小有零有整,另外一种是固定数值的,比如100BP,200BP等。
两种MARKER都不难制作,对于第一种,稍微难一些,主要是要获得病毒等大的基因组片段,然后用适当的酶切,切割完全以后,就能得到相应的图谱。
第二中实际上很简单,如果你手头有任何一个载体,而且它的序列完全清楚,那么可以采用PCR的方法获得一系列大小不同的片段,比如上游引物可以使用一个,然后用数数的方法确定下游100BP处的下游引物,扩增出的就是100BP的片段,200BP处的引物就是200BP的片段,依此类推,可以获得一系列不同大小的片段,扩增后,把它们放到一起,就获得了自制的MARKER了
RNA电泳条带中的28s 18s 5s分别代表什么?
生物体内一般含有核糖体RNA(rRNA)、信使RNA(mRNA)、转运RNA(tRNA)三种主要的RNA,其中rRNA含量最多,提取组织总RNA所得最多的就是rRNA。
真核生物中含有5S、5.8S、18S、28S,原核生物中有5S、16S、23S;而植物组织中一般较多的为5S、18S、28S
S代表沉降系数,当用超速离心测定一个粒子的沉降速度是,此速度与粒子的大小直接成比例。
5S、18S、28S分别具有120、1900和4700个核苷酸RNA 的28s/18s 指的是什么,还有,RIN怎么测定?
28s和18s是真核生物rRNA(核糖体RNA)的两个主要亚基,在体内含量较多。
RNA提取过程中可能发生各种途径的降解,28S/18S即为衡量提取的RNA完整性的指标,如果28S/18S为1.8~2.0表明所提取RNA完整性较好,基本无降解发生。
电泳条带上应是28S在上,18S在下,且亮度为28S是18S的两倍。
RIN 值的测定有专门的仪器,还可以产生RNA主要条带的峰图。