当前位置：文档之家 › 喉鳞状细胞癌ESRRG基因启动子甲基化及临床意义研究

喉鳞状细胞癌ESRRG基因启动子甲基化及临床意义研究

  • 格式：pdf
  • 大小：658.75 KB
  • 文档页数：5
【 Abstract 】 Objective To investigate the methylation status of estrogen-related receptor γ (ESRRG) gene promoter in laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC) tissues and its relationship with clinicopathological characteristics and prognosis of patients. Methods ESRRG gene promoter methylation status in LSCC tissues and adjacent normal tissues of 89 male LSCC patients were detected by bisulfite pyrosequencing method. And the relationship between ESRRG promoter methylation and the clinicopathological characteristics of patients was analyzed. The diagnostic value of ESRRG methylation in LSCC was evaluated by ROC curve. Kaplan-Meier curve was used to evaluate the survival of patients, and the 5-year survival rate was compared between the hypermethylated group (methylation level ＞26.41%) and the hypomethylated group (methylation level≤26.41% ). Results ESRRG promoter was more frequently hypermethylated in LSCC tissues than that in adjacent normal tissues (P＜0.05). ESRRG promoter methylation in LSCC patients with T3~4 classification was higher than that with T1~2 classification (P＜0.05); ESRRG promoter methylation in patients with clinical stage Ⅲ, Ⅳ was higher than that in those with clinical stage Ⅰ, Ⅱ (P＜0.05). The area under the curve (AUC) of ROC curve was 0.81; taken the methylation of ESRRG promoter of 26.41%, the sensitivity and specificity of the diagnosis of LSCC were 0.7079 and 0.7865, respectively. The 5-year survival rate of ESRRG promoter hypomethylated group was significantly higher than that of hypermethylated group (69.03% vs 45.12%, P＜0.05). Conclusion ESRRG gene promoter methylation is higher in LSCC tissues; it increases significantly in patients with T3~4 classification and clinical stage Ⅲ, Ⅳ; and the patients with high levels of methylation may have poor prognosis.
浙江医学 2019 年第 41 卷第 15 期
喉鳞状细胞癌 ESRRG 基因启 动子甲基化及临床意义研究
胡燕 沈志森 周重昌 袁洁 徐捷 郝文娟 叶栋 邓红霞关受体 γ（ESRRG）基因启动子在 LSCC 组织中的甲基化状态，分析其与临床病理特征及预后的 关系，并评估其对 LSCC 的诊断价值。 方法 采用焦磷酸测序方法检测 89 例男性 LSCC 患者 LSCC 组织与癌旁正常组织的 ESRRG 基因启动子甲基化水平；分析 ESRRG 基因启动子甲基化水平与患者临床病理特征的关系；绘制 ROC 曲线评估 ESRRG 基因甲基化水 平对 LSCC 的诊断价值；采用 Kaplan-Meier 法绘制患者生存曲线，并比较高甲基化组（甲基化水平＞26.41%）与低甲基化组（甲基化水 平≤26.41%）5 年生存率。 结果 LSCC 组织 ESRRG 基因启动子甲基化水平高于癌旁正常组织 （P＜0.05）。T3~4 期患者 LSCC 组织 ESRRG 基因启动子甲基化水平高于 T1~2 期患者（P＜0.05），临床分期Ⅲ、Ⅳ期患者 LSCC 组织 ESRRG 基因启动子甲基化水平高于Ⅰ、 Ⅱ期患者 （P＜0.05）。AUC 为 0.81，当 ESRRG 基因启动子甲基化水平为 26.41%时，诊断 LSCC 的灵敏度、特异度分别为 0.7079、 0.7865。ESRRG 基因启动子低甲基化组患者 5 年生存率高于高甲基化组患者（69.03% vs 45.12%，P＜0.05）。 结论 ESRRG 基因启 动子在 LSCC 组织中呈高甲基化水平，且在 T3~4 期及Ⅲ、Ⅳ期患者 LSCC 组织中明显增高，高甲基化水平患者预后较差。
【 关键词 】 ESRRG 基因 DNA 甲基化 喉鳞状细胞癌
ESRRG promoter methylation in laryngeal squamous cell carcinoma and its clinical significance HU Y an, SHEN Zhisen, ZHOU Chongchang, et al. School of Medicine, Ningbo University, Ningbo 315200, China

合集下载

ECRG4基因甲基化在喉鳞状细胞癌中的表达及其临床意义

ECRG4基因甲基化在喉鳞状细胞癌中的表达及其临床意义

ECRG4基因甲基化在喉鳞状细胞癌中的表达及其临床意义刘彬;彭正加;梁分凤;廖俊【期刊名称】《中国耳鼻咽喉颅底外科杂志》【年(卷),期】2022(28)6【摘要】目的探讨喉鳞状细胞癌(LSCC)中ECRG4的mRNA和蛋白表达以及其在LSCC肿瘤组织中的甲基化水平,分析其临床意义。

方法从人类蛋白图谱(HPA)以及基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析ECRG4在头颈部肿瘤中的表达,收集15例原发LSCC患者的组织样本及癌旁正常组织样本,实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测样本中的ECRG4 mRNA表达,Western blot检测组织中的蛋白表达,甲基化特异性PCR(MSP)及测序分析检测ECRG4启动子甲基化水平,比较ECRG4mRNA表达及甲基化水平与LSCC患者临床病理特征之间的相关性。

结果HPA和GEPIA 分析结果发现ECRG4在头颈部鳞状细胞癌中表达下降。

与癌旁正常组织相比,RT-qPCR和Western blot实验结果表明LSCC患者肿瘤组织中的ECRG4 mRNA和蛋白表达较低(P<0.001),测序分析结果指出LSCC肿瘤组织中ECRG4启动子甲基化水平明显升高(P<0.001)。

ECRG4 mRNA高表达水平与LSCC患者Ⅲ、Ⅳ期、存在淋巴转移、复发以及G2、G3期相关(P<0.05),而Ⅲ、Ⅳ期、复发以及G2、G3期的LSCC患者肿瘤组织中的ECRG4启动子甲基化水平升高更明显(P<0.05)。

结论ECRG4在LSCC中表达水平下降,甲基化水平升高,在Ⅲ、Ⅳ期、复发以及G2、G3期的患者中变化更明显,为LSCC后续研究提供理论基础。

【总页数】6页(P100-105)【作者】刘彬;彭正加;梁分凤;廖俊【作者单位】湘潭医卫职业技术学院附属医院耳鼻咽喉头颈外科;湘潭市中心医院耳鼻咽喉头颈外科【正文语种】中文【中图分类】R739.65【相关文献】1.喉鳞状细胞癌中RASSF1A基因启动子区甲基化及蛋白表达2.喉鳞状细胞癌组织中YPEL3基因启动子甲基化及其临床意义3.LZTS2基因在喉鳞状细胞癌中的甲基化状态及其临床意义4.食管鳞状细胞癌中MGP基因的表达和启动子区甲基化状态及其临床意义5.喉鳞状细胞癌中p16^(INK4a)基因甲基化状况及表达因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

喉癌组织中LCRG1基因启动子的克隆、突变和甲基化检测

喉癌组织中LCRG1基因启动子的克隆、突变和甲基化检测

喉癌组织中LCRG1基因启动子的克隆、突变和甲基化检测李金花;曾龙武;谢海龙【摘要】目的观察喉癌候选抑瘤基因(laryngeal carcinoma related gene1,LCRG1)启动子的功能.方法 (1)通过5′-缺失突变、瞬时转染与荧光素酶报告基因活性检测,进一步分析与LCRG1基因表达调控有关的最小启动子区域;(2)通过PCR-单链构象多态性(PCR-single-strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)技术检测40例喉癌组织中LCRG1基因启动子突变;(3)应用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)技术检测40例喉癌组织中LCRG1基因启动子甲基化状态;(4)采用RT-PCR技术检测40例喉癌组织中LCRG1基因的表达.结果(1)LCRG1基因最小启动子片段位于转录起始位点上游-169~-57位点;(2)喉癌组织中LCRG1基因启动子无突变;(3)40例喉癌组织中有5.00% LCRG1基因启动子甲基化改变;(4)RT-PCR检测显示40%(16/40)喉癌组织中LCRG1基因表达下调.结论 LCRG1基因最小启动子位于转录起始位点上游-169~-57位点的DNA片段;LCRG1基因启动子甲基化部分改变可能参与该基因的表达调控.【期刊名称】《临床与实验病理学杂志》【年(卷),期】2013(029)008【总页数】6页(P819-824)【关键词】转录调控;最小启动子;瞬时转染;甲基化【作者】李金花;曾龙武;谢海龙【作者单位】杭州师范大学附属医院病理科,杭州310015;南华大学肿瘤研究所,衡阳421000;南华大学肿瘤研究所,衡阳421000;南华大学肿瘤研究所,衡阳421000【正文语种】中文【中图分类】R739.65喉癌是一种严重危害人类健康的恶性肿瘤，其发生、发展过程复杂，涉及大量相关基因结构和表达调控的改变，瘤基因的激活和抑瘤基因的失活起到关键性作用，喉癌的发病分子机制至今仍未清楚[1]。

喉鳞状细胞癌组织CLDN11基因启动子甲基化及临床意义研究

喉鳞状细胞癌组织CLDN11基因启动子甲基化及临床意义研究

浙江医学2018年第40卷第5期喉癌是呼吸系统常见恶性肿瘤之一，其发病率居呼吸系统恶性肿瘤的第2位，仅次于肺癌[1]；国人发病率有明显上升趋势，且发病年龄趋于年轻化，尤其在北方地区[2]。

喉鳞状细胞癌（LSCC ）是喉癌最常见的病理类型。

喉癌的发生包括遗传学和表观遗传学两大机制，以及吸烟、饮酒过度、病毒感染等因素的参与[3]。

目前认为，以抑癌基因启动子异常甲基化（会导致基因沉默或失活）为代表的表观遗传学改变是肿瘤发生的重要机制之一，检测肿瘤相关基因启动子异常甲基化已逐步成为早期筛查肿瘤的常用方法[4-5]。

人类CLDN11基因定位于3q26.2，其编码的Claudin-11蛋白是完整的膜蛋白，为组成细胞紧密连接的主要成分，而紧密连接蛋白的异常表达被认为是肿瘤进展的重要一步[6]。

CLDN11基因表达下调会增强肿瘤细胞迁移、侵袭能力，进而促进肿瘤发生、发曹炳沈志森林乐希郝文娟周重昌doi ：10.12056/j.issn.1006-2785.2018.40.5.2017-2263基金项目：浙江省自然科学基金（LY14H160003）；浙江省医药卫生省部培育计划（2014PYA017）；浙江省医药卫生科技计划项目（2012ZDA042）；宁波市科技创新团队（2012B82019、2015B11050）；宁波市重大择优委托项目（2012C5015）；宁波市自然科学基金（2012A610208、2017A610236）作者单位：315000宁波大学医学院（曹炳、林乐希、郝文娟）；宁波大学附属李惠利医院耳鼻咽喉头颈外科（沈志森、周重昌）通信作者：沈志森，E-mail:szs7216@喉鳞状细胞癌组织CLDN11基因启动子甲基化及临床意义研究【摘要】目的探讨喉鳞状细胞癌（LSCC ）组织中CLDN11基因启动子的甲基化水平及其临床意义。

方法采用实时荧光定量甲基化特异性聚合酶链反应（qMSP ）分别检测91例LSCC 患者的LSCC 组织及其配对的癌旁正常组织CLDN11基因启动子甲基化水平，分析其与临床病理特征及预后的关系，绘制ROC 曲线评估其诊断价值。

ctDNA启动子区甲基化在食管鳞癌诊断中的应用价值

ctDNA启动子区甲基化在食管鳞癌诊断中的应用价值

ctDNA启动子区甲基化在食管鳞癌诊断中的应用价值杨志珍;谈艳芳【期刊名称】《医学信息》【年(卷),期】2024(37)6【摘要】目的探讨ctDNA启动子区(Promoter)甲基化在食管鳞状细胞癌患者血浆中的表达情况,筛选可作为诊断食管鳞状细胞癌潜在的生物标志物。

方法收集2022年8月-2023年1月于德阳市人民医院初诊为食管鳞状细胞癌患者与健康体检者血浆标本分别作为食管鳞癌组与健康对照组。

采用全基因酶促甲基化测序(EM-Seq)检测两组间的ctDNA甲基化差异表达水平,结合GO、KEGG、Reactome富集筛选出食管鳞癌组甲基化水平高于健康对照组的前4位基因作为食管鳞状细胞癌相关的诊断生物标志物。

结果EM-Seq测序得到两组差异甲基化区基因共9354个,其中食管鳞癌组高于健康对照组的有553个基因位于Promoter上。

相关通路富集显示,食管鳞癌组甲基化水平高于健康对照组的前4位基因为AXIN1、EPS15、CACTIN、E2F1,分别位于16号染色体、1号染色体、19号染色体和20号染色体上,涉及DNA损伤修复、Wnt信号通路、EGFR信号通路及NF-kB信号通路等肿瘤中常见信号通路。

结论AXIN1、EPS15、CACTIN 和E2F1基因或可作为诊断食管鳞状细胞癌的潜在生物标志物。

【总页数】6页(P91-95)【作者】杨志珍;谈艳芳【作者单位】成都中医药大学医学技术学院;德阳市人民医院检验科【正文语种】中文【中图分类】R735.1【相关文献】1.RASSF1A基因启动子区甲基化状态在食管鳞癌诊断中的研究2.抑癌基因启动子区甲基化在食管鳞状细胞癌诊断、治疗和预后中的应用价值3.RASSF1A、MINT31启动子区高甲基化与食管上皮内瘤变和食管鳞癌的关系4.人食管鳞癌中CCNYL1启动子区甲基化研究因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。