基因工程实验的详细步骤
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简述基因工程的基本操作步骤随着科学技术的不断进步,基因工程成为当代科技领域的重要研究方向之一。
基因工程是通过改变生物体内部的基因结构和功能来达到人为干预和控制生物现象的目的。
基本操作步骤可以概括为以下几个方面:第一步,选取目标生物体。
选择一个已知的基因序列,对其进行修改,向其中添加或删除一些基因信息或者改变这些基因的排列顺序,制造出新的DNA序列。
这样做出来的DNA序列也称为重组 DNA。
第二步,将重组 DNA 导入到宿主细胞中。
将准备好的重组 DNA导入到细胞内,可采用注射,体外转化,或用病毒带入等方法。
宿主细胞需要同时具有稳定性和能够快速繁殖的特点,例如大肠杆菌等。
第三步,将重组 DNA 插入到宿主细胞染色体上,使其变为永久性的遗传物质。
此时,需要借助工具酶等将重组 DNA 单链插入到宿主细胞中的DNA 双链片段之间,形成永久性的遗传物质。
第四步,使用酶对重组基因进行切割。
利用限制酶,可以将重组基因从宿主细胞的染色体中切割下来。
第五步,进行测序和分析。
在完成以上操作后,需要对切割得到的基因片段进行测序和分析,以确定重组成果的成功与否以及其质量是否达到实验需求的标准,同时也需要进行针对宿主细胞的表达和鉴定工作。
需要注意的是,在进行基因工程时,要注意实验的安全性等问题。
需要遵循相关的实验操作规范,确保人类及环境的不受到污染和伤害。
综上所述,基因工程由基本的实验操作步骤组成,可以利用这些步骤来改变基因序列,创造新的生物品种,并为医学和工业等领域的发展提供支持。
这些操作可以打造出具有生物多样性和可再生性的材料和产品,并带来人们从未想到的各种应用和发展。
基因工程实验流程1.选择目标基因:首先,确定要研究或改造的目标基因。
这个基因可以是来自任何生物的DNA序列,包括原核生物和真核生物,甚至可以是合成的DNA片段。
2.基因分离:将包含目标基因的DNA从生物体中分离出来。
这可以通过提取目标生物体的基因组DNA,然后使用特定的酶切酶将目标基因从DNA中剪切出来。
3.DNA克隆:将目标基因插入到合适的载体中,形成重组DNA分子。
常用的载体包括质粒、病毒或人工染色体。
重组DNA分子可以通过转化、感染或转染等方法导入到宿主细胞中。
4.转化宿主细胞:将重组的DNA分子导入到适当的宿主细胞中。
这可以通过热冲击、电穿孔、化学方法或用载体病毒感染的方式实现。
在这一步中,多个宿主细胞可能被转化,以增加目标基因的表达量。
5.分子鉴定:通过PCR反应、限制性酶切、DNA测序等方法,对导入宿主细胞的重组DNA分子进行鉴定和验证。
这可以确认目标基因是否被正确克隆和定位在宿主细胞的基因组中。
6.蛋白质表达:通过转录和翻译,使目标基因在宿主细胞中转录成mRNA,然后翻译成蛋白质。
这个过程可以通过合适的启动子和转录因子来调控。
7.蛋白质纯化:通过细胞裂解和各种分离技术,获得纯度较高的目标蛋白质。
这包括离心、超滤、电泳等技术,可以去除其他细胞组分和杂质。
8.蛋白质功能研究:对纯化的目标蛋白质进行功能研究,了解其生物学功能和相互作用。
这可以通过基因敲除、突变、结构分析、生物活性检测等方法进行。
9.结果分析和确认:对实验结果进行数据分析和统计,确保实验结果的可靠性和重复性。
这包括基因表达水平、蛋白质功能、相互作用准确性和可靠性的验证。
10.应用和进一步研究:根据实验结果,根据需要对目标基因进行进一步改造或利用。
这可能涉及到设计新的实验和技术,以满足具体的应用需求。
总结:基因工程实验流程是一个复杂的过程,需要多个步骤和技术的相互协作。
这个过程涉及到基因选择、分离、克隆、转化、鉴定、蛋白质表达和纯化等多个关键步骤。
基因工程的基本操作
基因工程的基本操作包括以下几个步骤:
1. 取得目标基因:首先需要获得目标基因的DNA序列。
这可以通过多种方法实现,如克隆、PCR扩增、合成等。
2. DNA切割:将目标基因从DNA样本中分离出来,通常需要用到一种特殊的酶——限制性内切酶。
这些酶可以在DNA的特定序列处切割,从而得到目标基因的DNA片段。
3. DNA连接:将目标基因的DNA片段与载体DNA连接在一起。
载体DNA是一种能够自复制的DNA分子,可以在细胞中稳定存在。
连接的过程通常需要使用DNA连接酶。
4. 转化:将连接好的DNA载体导入宿主细胞中。
这可以通过多种方法实现,如电穿孔、热激击等。
5. 克隆和筛选:选择合适的宿主细胞,并用培养基培养细胞,使其增殖。
通过筛选方法,如抗生素筛选、荧光检测等,筛选出带有目标基因的克隆。
6. 验证:对获得的克隆进行验证,确认目标基因已经成功导入宿主细胞,并且在细胞中表达。
7. 基因表达和应用:利用已经导入细胞中的目标基因进行进一步的研究。
可以通过控制基因的表达水平,探究基因的功能和
调控机制。
同时,还可以利用基因工程技术将目标基因导入其他生物体,实现特定性状的改良和应用。
实验一:大肠杆菌5 a和21感受态细胞的制备【实验步骤】1从平板上挑取新活化的大肠杆菌 5 a单菌落,接种到5培养基中,37C振荡培养过夜。
2取1培养物接种到100培,养基(250三角瓶)中,37C振荡培养2~3h。
3将菌液转移到50离心管(2管)中,冰上放置15。
4 4C 4000离心5,弃去上清液,倒置使培养液流尽。
5用20冷2溶液悬浮菌体沉淀合并成一管,在4C 4000离心5,弃去上清液。
6用10冷2溶液悬浮菌体沉淀,冰浴30。
7 4 C 4000 离心5,弃去上清液,用2的冷2溶液悬浮。
8分装到数个管中,每管200,冷冻保存备用。
实验二:目的基因质粒(或218)和表达载体质粒(32或30)的转化及大量提取【实验步骤】一、载体的转化(无菌条件,冰上进行)1、取200新鲜制备的感受态细胞,分别加入质粒 2 (32a, 18),混匀,冰上放置30。
2、将管放到42C保温90s,冰浴2。
3、加入800液体培养基,37 C慢摇复苏1 h。
4、将100的复苏细胞涂布在含有(100)的培养皿中,正置平皿30 (使菌液被培养基吸收)。
5、倒置平皿37C培养16 h,出现菌落。
二、质粒的提取1挑取单菌落接种于100加入50的液体培养基中,振荡培养过夜。
2过夜培养的菌液加入1.5的小指管(20个每组)中,每次1 , 4 C, 12000,离心1 ,4次,弃上清。
3加入150溶液I悬浮细胞,漩涡振荡,室温静置10。
4加入350溶液H (新鲜配制),轻微颠倒混匀20次,冰浴5。
(不能再剧烈震荡)5加入300溶液川(冰上预冷),颠倒混匀20次,不能剧烈震荡,冰浴10。
6 4 C, 12000,离心10,取上清转移至另一离心管中。
7向上清中加入0.6倍异丙醇,轻轻混匀,室温静置20。
8 4 C, 12000,离心10,弃上清,倒扣于吸水纸上,吸净液体。
9用1 70%乙醇洗涤质粒沉淀2次,每次4 C, 12000,离心3,吸去上清。
基因工程的基本过程介绍基因工程是一项重要的生物技术领域,它利用DNA重组技术,对生物体的基因信息进行修改和重新组合,实现改变生物体性状的目的。
基因工程的基本过程包括基因定位、基因克隆、基因表达和基因转导等步骤。
本文将详细介绍基因工程的基本过程。
一、基因定位基因定位是基因工程的第一步,通过确定目标基因在染色体上的位置,为后续的基因克隆提供准确的目标。
基因定位可以通过物理方法、遗传方法和分子生物学方法等多种手段来实现。
1. 物理方法物理方法主要包括荧光原位杂交(FISH)和比较基因组杂交(CGH)等。
其中,荧光原位杂交可以通过标记特定探针并与目标基因序列进行杂交,从而在染色体上检测到目标基因的位置。
比较基因组杂交可以通过将目标基因与参考基因组进行杂交,通过比较两者的杂交强度,确定目标基因在染色体上的位置。
2. 遗传方法遗传方法主要包括连锁分析和关联分析等。
连锁分析是利用基因在染色体上的连锁关系,通过研究特定遗传标记和目标基因之间的连锁程度,来确定目标基因在染色体上的位置。
关联分析则是通过研究染色体多态性和目标基因之间的关联程度,来确定目标基因与某个特定区域的关系。
3. 分子生物学方法分子生物学方法主要包括PCR、Southern blotting和DNA测序等。
PCR可以通过目标基因的序列信息,设计特定引物并进行扩增,从而实现对目标基因的定位。
Southern blotting可以通过转移DNA片段到膜上,并进行测序等。
二、基因克隆基因克隆是基因工程的关键步骤,它通过将目标基因从来源生物体中分离出来,并进行扩增,得到足够多的DNA材料用于后续的实验。
1. DNA提取DNA提取是基因克隆的第一步,它可以通过细胞裂解、溶解和沉淀等步骤将DNA从生物体中提取出来。
常用的DNA提取方法包括酚-氯仿法、盐析法和商业DNA提取试剂盒等。
2. PCR扩增PCR扩增是基因克隆的关键技术,它可以通过DNA聚合酶的作用,将目标基因序列进行扩增。
基因工程过程
基因工程是通过对生物体的基因进行操作,使其具有新的性质或功能的一种技术手段。
它被广泛应用于生物学研究、农业生产和医学治疗等领域。
基因工程的过程包括以下几个步骤:
1.选择目标基因
在进行基因工程之前,首先需要确定需要操作的目标基因。
这通常需要对生物的遗传信息进行分析和研究,确定哪些基因具有重要性或潜在价值。
2.克隆目标基因
克隆目标基因是对基因工程来说非常重要的一步。
将目标基因从生物体中提取出来,并进行 PCR 扩增和克隆。
这通常需要将基因插入载体中,如质粒、病毒或细胞。
3.构建表达载体
在进行基因工程的过程中,表达载体是必不可少的。
表达载体可以将目标基因导入到宿主细胞中,并使其表达出目标蛋白质。
表达载体可以是质粒、病毒或其他载体。
4.转染宿主细胞
将构建好的表达载体转染到宿主细胞中。
这通常需要利用转染剂或其他工具来实现。
5.筛选目标细胞
在将表达载体转染到宿主细胞中后,需要进行筛选以找到目标细胞。
通常,这可以通过对细胞进行荧光或抗生素抗性选择来实现。
6.表达目标蛋白质
找到目标细胞后,可以开始表达目标蛋白质。
这需要对细胞进行培养和处理,以促进目标蛋白质的表达和分泌。
以上就是基因工程的基本过程。
通过这些步骤,可以制造出具有新功能或性质的生物体或者蛋白质。
基因工程已经得到广泛的应用,为生物学的研究和应用带来了革命性的变化。
实验一:大肠杆菌DH5α和BL21感受态细胞的制备【实验步骤】1 从LB平板上挑取新活化的大肠杆菌DH5α单菌落,接种到5mL LB培养基中,37℃振荡培养过夜。
2 取1mL培养物接种到100mL LB培养基(250mL三角瓶)中,37℃振荡培养2~3h。
3 将菌液转移到50mL离心管(2管)中,冰上放置15min。
4 4℃4000 rpm 离心5min,弃去上清液,倒置使培养液流尽。
5 用20 mL 冷CaCl2溶液悬浮菌体沉淀合并成一管,在4℃4000 rpm 离心5min,弃去上清液。
6 用10 mL 冷CaCl2溶液悬浮菌体沉淀,冰浴30min。
7 4℃4000 rpm 离心5min,弃去上清液,用2 mL的冷CaCl2溶液悬浮。
8 分装到数个EP管中,每管200 uL,冷冻保存备用。
实验二:目的基因质粒(T-SOD或T-IL218)和表达载体质粒(PET32或PET30)的转化及大量提取【实验步骤】一、载体的转化(无菌条件,冰上进行)1、取200 uL 新鲜制备的感受态细胞,分别加入质粒DNA 2 uL(PET32a,IL-18),混匀,冰上放置30min。
2、将EP管放到42℃保温90s,冰浴 2min。
3、加入800uL LB液体培养基,37℃慢摇复苏1 h。
4、将100 uL 的复苏细胞涂布在含有Amp(100mg/mL)的LB培养皿中,正置平皿30min (使菌液被培养基吸收)。
5、倒置平皿37℃培养16 h,出现菌落。
二、质粒的提取1 挑取单菌落接种于100 mL 加入50uL Amp 的LB液体培养基中,振荡培养过夜。
2 过夜培养的菌液加入1.5 mL的小指管(20个每组)中,每次1 mL,4℃,12000 rpm,离心1min,4次,弃上清。
3 加入150uL溶液Ⅰ悬浮细胞,漩涡振荡,室温静置10min。
4 加入350uL溶液Ⅱ(新鲜配制),轻微颠倒混匀20次,冰浴5min。
基因工程实验实验一、质粒DNA的提取、分离和纯化试剂A.LB液体培养基(L): 1000ml蛋白胨(tryptone)10g,酵母提取物(yeast extract)5g,NaCl 10g,加去离子水至1000ml用5MNaOH调至pH7.2-7.5。
121o C高压下蒸汽灭菌20分钟。
B.LB固体培养基(L):每升液体培养基加15g 琼脂粉,高压下蒸汽灭菌20分钟。
C.氨苄青霉素(Amp)母液:配成50mg/ml水溶液,-20 o C下保存备用。
Amp使用时配成100mg/ul,按千分之一加入培养基中。
D.溶液I:50mmol/L葡萄糖、25mmol/L TrisCl (pH8.0), 10mmol/LEDTA(pH8.0). 高压蒸汽灭菌15分钟, 储存于4 o C冰箱。
E.溶液II:0.2mol/L NaOH (临用前用10 mol/L NaOH母液稀释), 1%SDS.F.溶液III: 5mol/L KAC 60ml, 冰醋酸 11.5ml, 水28.5ml.G.RNase A母液:将RNase A酶粉溶于10mmol/L TrisCl (pH7.5)、15mmol/LNaCl, 终浓度为10mg/ml。
100 o C加热15分钟,冷却后分装。
H.饱和酚:市售酚需重蒸。
重蒸后加0.1%8-羟基喹啉,并用等体积的0.5mol/L TrisCl (pH8.0)和0.1mol/L TrisCl (pH8.0)缓冲液反复抽提,使pH达到7.6以上。
I.氯仿:按氯仿/异戊醇=24:1混合。
J.酚/氯仿:将上述饱和酚和氯仿按1:1混合。
K.TE缓冲液:10mol/L TrisCl (pH8.0), 1mmol/L EDTA(pH8.0). 高压蒸气灭菌15分钟, 储存于4 o C冰箱。
三、操作步骤1.细菌的培养和收集:将含有质粒pBS的DH5α菌株接种在LB固体培养基(含50μg/ml Amp)中,37o C培养12-24小时。
基因工程实验详细步骤一、目的基因LK的扩增——PCR(含电泳)(一)目的基因LK的扩增——NE201(1)实验准备材料:rLK重组质粒(模板)试剂:PCR试剂盒用具:移液枪(2.5μl、10μl、50μl)以及相应枪头(盒)、EP管(100μl)、EP板(大、小);冰袋两只、手套、废液桶仪器:离心机(14000rpm)、PCR扩增仪(2)反应体系(50μl)试剂(按照加样顺序)用量dH2O23μL重组质粒1μL上游引物F 0.5μL下游引物R 0.5μLTaq酶25μL(3)反应条件预变性95℃,10min变性95℃,30s退火56.6℃,35s延伸72℃,40s最终延伸72℃,10minTIP:*吸取或加入液体时,枪头尽量少伸入,可避免气泡产生;若有气泡,需10000rcf离心1min 再进行下一步实验*勤换枪头,避免污染试剂或产物*任何移液枪用完后及时调回最大量程*仪器用完后及时关闭(二)LK PCR产物的电泳——NE217(1)实验准备材料:LK PCR产物试剂:去离子水、50×TAE缓冲液、电泳用琼脂糖、6×Loading Buffer、DL1000marker(D526A)、Ultrapower DNA Stain染液用具:钥匙、称量纸、橡皮筋、100ml锥形瓶、50ml量筒;制胶槽、制胶卡、制胶梳(18teeth);移液枪(10μl、1000μl)及相应枪头(盒),100μl EP管,EP板(大、小);冰袋两只、手套(包括塑料和麻布)、废液桶仪器:电子天平、微波炉、电泳仪(含电泳槽)(2)制胶(3%)1. 称取电泳用琼脂糖0.6g(即总体积20ml 的3%),小心倒入100ml锥形瓶中2. 取TAE缓冲液400μl于50ml量筒中,去离子水定容至20ml(实为电泳缓冲液)3. 将量筒中液体转入锥形瓶中,盖上吸量纸,用橡皮筋封好,再用步骤2中用剩的枪头扎一个小孔4. 将制胶梳(18 teeth)、制胶卡、制胶槽洗净并用吸水纸擦干,组装好5. 至于微波炉中,注意观察,煮沸后立即拿出(戴上麻布手套),轻轻晃匀,重复2-4次,至胶完全澄清均一为止6. 及时将胶转入准备好的制胶槽,凝固30min后,连着横条纹塑料板一起放入电泳槽中(胶孔靠近负极)(3)加样和电泳1. 在EP管内分别加入A. DL1000marker 5μl,染液1μl;B. PCR产物5μl,6×loading buffer1.2μl,染液1μl2. 将样品全部转入胶孔中。
基因工程实验实验一、质粒DNA的提取、分离和纯化试剂A.LB液体培养基(L): 1000ml蛋白胨(tryptone)10g,酵母提取物(yeast extract)5g,NaCl 10g,加去离子水至1000ml用5MNaOH调至pH7.2-7.5。
121o C高压下蒸汽灭菌20分钟。
B.LB固体培养基(L):每升液体培养基加15g 琼脂粉,高压下蒸汽灭菌20分钟。
C.氨苄青霉素(Amp)母液:配成50mg/ml水溶液,-20 o C下保存备用。
Amp使用时配成100mg/ul,按千分之一加入培养基中。
D.溶液I:50mmol/L葡萄糖、25mmol/L TrisCl (pH8.0), 10mmol/LEDTA(pH8.0). 高压蒸汽灭菌15分钟, 储存于4 o C冰箱。
E.溶液II:0.2mol/L NaOH (临用前用10 mol/L NaOH母液稀释), 1%SDS.F.溶液III: 5mol/L KAC 60ml, 冰醋酸 11.5ml, 水28.5ml.G.RNase A母液:将RNase A酶粉溶于10mmol/L TrisCl (pH7.5)、15mmol/LNaCl, 终浓度为10mg/ml。
100 o C加热15分钟,冷却后分装。
H.饱和酚:市售酚需重蒸。
重蒸后加0.1%8-羟基喹啉,并用等体积的0.5mol/L TrisCl (pH8.0)和0.1mol/L TrisCl (pH8.0)缓冲液反复抽提,使pH达到7.6以上。
I.氯仿:按氯仿/异戊醇=24:1混合。
J.酚/氯仿:将上述饱和酚和氯仿按1:1混合。
K.TE缓冲液:10mol/L TrisCl (pH8.0), 1mmol/L EDTA(pH8.0). 高压蒸气灭菌15分钟, 储存于4 o C冰箱。
三、操作步骤1.细菌的培养和收集:将含有质粒pBS的DH5α菌株接种在LB固体培养基(含50μg/ml Amp)中,37o C培养12-24小时。
用无菌牙签挑取单菌落接种到5ml LB液体培养基(含 50μg/ml Amp)中,37 o C培养约12小时至对数生长后期。
2.质粒DNA的少量快速提取---碱裂解法A.取1.5ml培养液倒入1.5ml ependorf 管中,4o C下12000g离心3min。
B.弃上清,将管倒置于卫生纸上数秒钟,使液体流尽。
C.菌体沉淀重悬浮于100μl预冷的溶液I中(激烈震荡,充分混匀)。
D.加入新配制的溶液II 200μl,快速盖紧管口,并倒置离心管,温和颠倒ependorf管6-8次,以混匀内容物(千万不要震荡),放置5分钟。
E.加入150μl预冷的溶液III,盖紧管口,并倒置离心管,温和颠倒ependorf管数次,以混匀内容物,放置5分钟。
4o C下12000g离心5-10分钟。
F.将上清液移入干净ependorf管中,加入等体积的酚/氯仿(1:1)(吸取酚/氯仿试剂瓶中的下层溶液),震荡混匀,4o C下12000g离心5分钟。
G.将上清液(水相)移入干净ependorf管中,加入等体积的氯仿/异戊醇(吸取氯仿/异戊醇剂试瓶中的下层溶液),震荡混匀,4o C下12000g离心5分钟。
H.将上清液(水相)移入干净ependorf管中,加入2倍体积的无水乙醇,震荡混匀后置于-20o C冰箱中20分钟。
然后在 4o C下12000g离心10分钟。
I.弃上清液,将管口敞开并倒置于卫生纸上,使液体流尽。
加入0.3ml 70%乙醇洗涤沉淀。
4o C下12000g离心5-10分钟。
J.吸去上清液,将管倒置于卫生纸上,使液体流尽,室温干燥或真空干燥10分钟K.将沉淀溶于20μl TE缓冲液(pH8.0, 含20μg/ml Rnase A)中,储于-20o C冰箱。
实验二、基因组DNA的提取1.1 材料1.1.1植物材料银杏等木本植物。
1.1.2 主要试剂CTAB抽提液:1g CTAB,5ml 1M Tris,2ml 500mM EDTA,4.1g Nacl至50ml。
(2% CTAB,0.1M Tris,20mM EDTA,1.4M NaCl,pH8.0)CTAB/NaCl:10g CTAB,4.1g NaCl,溶解后定容至100ml。
(10% CTAB,0.7M NaCl) TE/NaCl:0.5ml 1M Tris,10μl 500mM EDTA,2.9g NaCl,至50ml。
(10mM Tris,0.1mM EDTA,1M NaCl,pH8.0)。
RNase: 溶于10mM Tris.Cl(pH7.5),15mM NaCl溶液中,配成10mg/ml浓度,于100℃加热15min,缓慢冷却至室温,添加等体积甘油后贮于-20度。
3 mol/L NaAc(pH 5.2),氯仿:异戊醇(24:1)。
β-巯基乙醇,氯仿,异丙醇,异戊醇,饱和酚,无水乙醇,不溶性PVP等。
上述药品及Lambda DNA/Hin dIII均购自上海生物工程公司。
1.2改进的CTAB法根据文献(Frederick M. et al.,1998)CTAB法,稍做改进。
具体步骤:① 吸取8ml CTAB抽提液,加入320μl β-巯基乙醇,混匀,预热至65℃;② 称取0.5克叶片,置于事先用液氮预冷的研钵中,快速加入适量不溶性PVP,加入液氮研磨成粉未;③ 迅速将粉未倒入至CTAB抽提液中,摇匀,65℃保温1h,期间每隔5min 摇匀一次;④ 加入等体积氯仿/异戊醇(24:1),颠倒数次,10000rpm离心5min;⑤ 将上清液转入另一无菌离心管中,加入1/10体积CTAB/NaCl、等体积氯仿/异戊醇,颠倒混匀,10000rpm离心10min;⑥ 将上清液转入一无菌离心管中,加入2/3体积异丙醇,颠倒混匀,置于-20℃冰箱中一小时,然后10000rpm 离心10min;⑦ 弃掉上清液,加入TE/NaCl缓冲液溶解沉淀,10000rpm离心;⑧ 上清液转入一个1.5ml无菌离心管中,加入1/10体积NaAc及2/3体积异丙醇,颠倒混匀,此时会出现絮状沉淀,钩出此沉淀,在70%乙醇中漂洗数次,用无菌滤纸上吸干,溶于含Rnase浓度为10 μg/ml的0.5mlTE缓冲液中,37︒C 处理半小时,加入等体积的酚/氯仿(体积比为1:1),轻轻混匀,室温下静置10min,12000rpm 离心10 min,上清液转入新离心管中,加入1/10体积的3 mol/L NaAc(pH 5.2)和二倍体积的无水乙醇,颠倒混匀,此时已出现DNA絮状物,-20︒C 放置30min以上,用玻璃棒钩出DNA絮团,在70%乙醇中漂洗,无菌滤纸上吸干,溶解于0.5mlTE缓冲液中,-20 ︒C保存。
电泳分析取 2μl DNA样品在0.7%琼脂糖凝胶上电泳,溴化乙锭染色,紫外灯上观察和拍照。
实验三、DNA凝胶电泳与PCR2008-05-24 22:07试剂:1.5⨯TBE缓冲液:Tris. 54g, 硼酸27.5g, 加入20ml 的0.5mol/L EDTA(pH8.0), 定溶至1000ml.2.50×TAE: 24.2克Tris, 3.72克EDTANa2·2H2O, 加适量水, 搅拌并稍加热溶解后加5.71ml冰乙酸,加水至100ml.3.6⨯上样缓冲液:0.25% 溴酚兰, 40%(w/v)蔗糖水溶液。
4.溴化乙啶(EB)溶液母液:将EB配制成10mg/L,用铝箔或黑纸包裹容器,储于温室即可。
5.DNA分子量标准:λDNA/EcoR I/Hind III:λDNA/EcoR I: 21.2, 7.4, 5.8, 5.6, 4.9,和2.5kbλDNA/ Hind III: 23.1, 9.4, 6.6, 4.4, 2.3, 2.0, 0.56和0.12kb.一、实验步骤1.电泳缓冲液可选用0.5×TBE或1×TAE,前者缓冲能力较后者强,但不适用于从胶中回收DNA,建议只采用1×TAE用于琼脂糖凝胶电泳。
琼脂糖用电泳缓冲液配制。
2.胶液的制备:称取0.4g琼脂糖,置于200ml 三角烧瓶中,进入50ml 的1×TAE稀释缓冲液,放入微波炉或电炉加热至琼脂糖全部熔化,取出混匀。
3.胶板的制备:将二端封闭的电泳槽置于水平支持物上,插上样品梳子。
在冷却至50~600C的琼脂糖胶液中加入EB溶液至终浓度为0.5μg/ml, 即10mg/ml 的母液加2.5ul,混匀。
小心地倒入电泳槽中至一定高度。
待胶液完全凝固后拔出梳子。
然后向槽内加1×TAE稀释缓冲液至液面刚好没过胶板表面。
1.胶的浓度因DNA长度而异:基因组DNA,λDNA 0.4-0.5%质粒(3-5kb) 0.7%3-1kb 0.7-1.0%1-0.5kb 1.0-1.5%4. <0.5kb 2.0%5.加样:取2-5μl样品加1μl 的6⨯上样缓冲液,用移液枪混匀(在Parafilm膜上操作),小心加到样品槽中。
同时加DNA分子量标准对照。
6.电泳:从负极到正极,60-80V, (电泳电压以5V/cm为宜, 即电泳槽的长度×5)电流40mA以上。
当溴酚兰条带移动至距凝胶前沿约2cm时,停止电泳。
7.观察和拍照:在波长为254nm的紫外灯下,观察DNA电泳带并估计其分子量大小。
同时可用加红色滤光片和近摄镜片的相机拍照(光圈5.6下暴光10-120秒)。
实验四、聚合酶链式反应(PCR)扩增PCR反应:1体系:取0.5ml 的eppendorf 管中依次加入效率试剂(共40.5μl):35μl H25μl 10XPCR反应缓冲液4μl 25mmol/L MgCl24μl 4种 dNTP0.5μl 上游引物(引物1)0.5μl 下游引物(引物2)0.5μl 模板DNA(约1ng)0.5ul TaqDNA聚合酶(约2.5单位)混匀后离心5秒钟2程序:混合物在94℃下加热5min94 ℃变性30秒种,62℃退火一分钟,72℃延伸2分钟,循环35轮,进行PCR。
最后一轮循环结束后,于72℃下保温10分钟,使反应产物扩增充分。
电泳:取10ul扩增产物用1%琼脂糖凝胶进行电泳分析,检查反应产物及长度。
实验五、DNA片段的回收DNA凝胶回收试剂盒TaKaRa Agarose Gel DNA Purification Kit Ver.2.0操作方法操作流程见图1,全套操作约需30分钟,详细说明如下。
1. 使用TAE缓冲液或TBE缓冲液制作琼脂糖凝胶,然后对目的DNA进行琼脂糖凝胶电泳。
2. 在紫外灯下切出含有目的DNA的琼脂糖凝胶,用纸巾吸尽凝胶表面的液体。
此时应注意尽量切除不含目的DNA部分的凝胶,尽量减小凝胶体积,提高DNA回收率。