常用的通用引物序列
- 格式:doc
- 大小:35.00 KB
- 文档页数:1
RT-PCR常用引物序列RT-PCR引物序列基因来源引物序列产物大小(kb)β-actin 人有意义链CCTCG CCTTT GCCGA TCC 反义链GGA TC TTCAT GAGGT AGTCA GTC 0.62 kbβ-actin* 大鼠有意义链TACAA CCTCC TTGCA GCTCC 反义链GGA TC TTCA T GAGGT AGTCA GTC 0.62kbβ-actin 小鼠有意义链GTCGT ACCAC AGGCA TTGTG A TGG反义链GCAAT GCCTG GGTAC ATGGT GG 0.49 kbGAPDH 人有意义链GGTGA AGGTC GGAGT CAACG反义链CAAAG TTGTC ATGGA TGHACC 0.50kbGAPDH 大鼠有意义链GATGC TGGTG CTGAG TATGR CG反义链GTGGT GCAGG ATGCA TTGCT CTGA 0.20 kbDynein 小鼠有意义链GCGGG CGCTG GAGGA GAA反义链GGA TC TTCA T GAGGT AGTCA GTC 12.3 kbPolymerase ε 人有意义链CGCCA AATTT CTCCC CTGAAA反义链CCGTA GTGCT GGGCA ATGTT C 6.8 kbPolymerase ε 人有意义链AAGGC TGGCG GATTA CTGCC反义链GA TGC TGCTG GTGAT GTACT C 3.5 kbTuberous Sclerosis 人有意义链GGAGT TTATC ATCAC CGCGG AAATA CTGAG AG反义链TATTT CACTG ACAGG CAATA CCGTC CAAGG 5.3 kb18S rRNA 大豆有意义链CTTTC GATGG TAGGA TAGTG GCCT反义链CAATG A TCCT TCCGC AGGTT CACCT AC 1.5 kb*引物不会扩增假基因PCR引物序列基因来源引物序列产物大小(kb)HIV gag region 病毒SK 38ATTAAT CACTA TCCAG TAGGA GAAATSK 39TTTGG TCCTG TCTTA TGTCC AGAAT GC 0.11kbβ-globin 人(29923)GGTGT TCCCT TGATG TAGCA CA(34016)CCAGG ATTTT TGATG GGACA CG 4.1kbβ-globin 人(31194)GCTGC TCTGT GCATC CGAGT GG(34016)CCAGG ATTTT TGATG GGACA CG 2.8kb序列来源:nvitrogen 公司大家用什么稀释引物?引物应该用TE稀释。
pet28a通用引物序列
Pet28a 是一种常用的原核高效表达载体,通常用于大肠杆菌中表达融合蛋白。
为了在大肠杆菌中克隆 Pet28a 载体上的特定基因,需要使用 Pet28a 的通用引物。
Pet28a 的通用引物是 T7 正向和反向引物。
T7 正向引物通常位于基因的上游区域,用于向载体的 DNA 序列中引入 T7 启动子,以便在宿主细胞中的表达。
T7 反向引物通常位于基因的下游区域,用于向 DNA 序列中引入终止子,以便在表达过程中产生合适的肽链。
Pet28a 通用引物的序列如下:
- T7 正向引物:5"-CTAAGTAACATAAGGAGAAGGAGAA-3"
- T7 反向引物:5"-CTAAGGAAAAAAGAAAAACTGA-3"
请注意,这些引物只能在特定的细菌中使用,并且应该在进行克隆之前进行优化。
植物actin引物序列
植物actin引物序列是用于PCR扩增植物中actin基因的引物序列。
actin是一种重要的细胞骨架蛋白,在植物细胞中起着维持细胞形态和细胞运动的作用。
因此,研究植物actin基因的表达及其调控对于理解植物细胞生长、发育和响应环境变化的机制具有重要意义。
常用的植物actin引物序列包括:ACTIN-F
(5'-ATGTCGACAACGGCTCCGGCATGT-3')和ACTIN-R
(5'-GCTCGGGCACGACAGCACAGCTT-3')。
这两个引物的长度分别为23 bp和24 bp,与植物中actin基因的保守区域相匹配。
在PCR反应中,这两个引物可以选择性地扩增植物中actin基因的编码序列,得到大小约为600 bp的DNA片段。
植物actin引物序列的设计需要考虑到引物的特异性和敏感性。
特异性是指引物只扩增目标基因序列,不产生非特异性扩增产物,避免干扰PCR反应的结果。
敏感性是指引物能够在较低的DNA模板浓度下扩增目标基因序列,以提高PCR反应的灵敏度。
因此,在设计植物actin引物序列时,需要根据不同植物物种的actin基因序列信息,合理选择引物的长度、GC含量和位置,以达到最佳的PCR扩增效果。
- 1 -。
常用引物序列引言引物序列是指在分子生物学实验中用来特异性引导DNA或RNA复制和扩增的短链核酸序列。
常用的引物序列在科研和实验室工作中起着重要作用。
本文将介绍几种常用引物序列及其在实验中的应用。
1. 通用引物序列通用引物序列是指适用于多种物种的引物序列。
常见的通用引物序列包括16S rRNA引物序列用于细菌和古细菌的分析,18S rRNA引物序列用于真核生物的分析,以及ITS引物序列用于真菌的分析。
这些通用引物序列具有高度保守性,可以用于不同物种的物种鉴定和进化分析。
2. 物种特异引物序列物种特异引物序列是指只在特定物种中存在的引物序列。
这些引物序列通常用于物种鉴定和种群遗传分析。
例如,人类特异引物序列可以用于人类DNA的特异扩增,从而进行人类个体的鉴定。
物种特异引物序列的选择和设计需要根据目标物种的基因组序列进行。
3. 定量引物序列定量引物序列是指用于定量PCR实验的引物序列。
这些引物序列通常与目标基因的外显子区域相结合,可以通过PCR扩增目标基因的特定片段,并通过实时荧光定量PCR技术进行定量分析。
定量引物序列的设计需要考虑引物的特异性和扩增效率,以确保准确的定量结果。
4. 荧光标记引物序列荧光标记引物序列是指在引物序列上加入荧光标记分子,用于检测和定量特定基因的表达水平。
常用的荧光标记引物序列包括荧光探针和荧光引物。
荧光标记引物序列可以通过荧光定量PCR或原位杂交等技术进行检测。
5. 反向引物序列反向引物序列是指用于反转录PCR实验的引物序列。
反转录PCR是一种将RNA转录成cDNA的技术,常用于研究基因的表达调控和mRNA的定量分析。
反向引物序列通常与反向转录酶结合,将RNA逆转录成cDNA,并通过PCR扩增特定基因的cDNA片段。
6. 基因特异引物序列基因特异引物序列是指用于特定基因扩增的引物序列。
这些引物序列通常与目标基因的外显子区域相结合,可以选择性地扩增目标基因,从而进行基因型鉴定和基因表达分析。
测序通用引物序列常见载体的测序引物:Primer of Vector:Vector:Primer(F);Primer(R)pACT T7 T3pACT2 GAL4 AD pACT2-RpAS2-1 GAL4 BD pAS2-1.RpB42AD pB42ADF pB42ADRpBACPAK8 BAC1 BAC2pBK-CMV T7 T3PBS(SK/KS)/M13- M13F/T7 T3/M13RpBV220 PBV220F PBV220RpCAMBIA 1301(1300) P1 P2pCAMBIA 2300 M13R(-48) M13F(-47)PCANTB5E S1/M13R S6pCAT3-enhancer RVP3 此载体无反向引物pcDNA3.0 CMV-F/T7 SP6/BGHpcDNA3.1 T7 BGHpcDNA4 T7/CMV-F BGHpcDNA6 T7/CMV-F(J21025在T7前面)BGHpcDNAII T7 SP6pCE2.1 M13F M13RpCEP4 pCEP-F EBV-RpCF-T M13F M13RpCI T7(17Base)此载体无反向引物pCI-neo T7(17Base)T3pCMS-EGFP T7 T3pCMV-3Tag-4A T3 /PFLAG-CMV-F T7pCMV5 pCMV5F pCMV5RpCMV5-Flag pCMV5F pCMV5RpCMV-MYC/HA pCMV-F pCMV-RpCMV-Sport M13F/T7 SP6/M13RpCMV-Tag(KAN+) T3 T7pCR2.1-TOPO M13F/T7 M13RpCR3.1 T7 BGHpCS2 SP6 T7pDonar M13F M13RpDONR221 M13F M13RpDrive T7 SP6pDRIveR(KAN+) T7 SP6pDsRED1-C1 pDsRED-ex-C1-F pEGFP-N-3’(距离很近,一般不用) pDsRED2-C1(KAN+) pDsRED-ex-C1-F pEGFP-N-3’pDSRED-N1(KAN+) pEGFP-N-5’ PDSRED-N-RpECFP-C pEGFP-C-5’ pECFP-C-3′pECFP-N1 pEGFP-N-5’ pEGFP-N-3’pEF/myc/ER pEF-F pCDNA3.1RpEGFP-C(KAN+) pEGFP-C-5’ pEGFP-C-3′pEGFP-N(KAN+) pEGFP-N-5’ pEGFP-N-3’pENTR/D-TOPO(KAN+) M13F M13RpET-*(His)(KAN+) T7 T7 TerpET22(a,b,c)(AMP+) T7 T7 TerpET28,30,24,49(KAN+) T7 T7 TerpET32(a,b,c)(AMP+) T7/S.tag T7 TerpET50(amp+) T7/s.tag T7TERpET44(AMP+) T7/s.tag T7 TerpEYFP-N1 pEGFP-N-5’ pEGFP-N-3’pEYFP-C1 pEGFP-C-5’ pEGFP-C-3′pFLAG-CMV pFLAG-CMV -F pFLAG-CMV -R pGAD424 GAL4 AD 3′ADpGADGH GAL4 AD 3′ADpGADT7-Rec GAL4 AD/T7 3′ADpGAPZa-A a-FACTOR 3′AOXpGBKT7(Kana+) T7 3′BDpGEM-T(-Easy) M13F/T7 SP6/M13RpGEX-(*)T pGEX-4T-5’ pGEX-4T-3’pGL2 GLP1 GLP2pGL3 RVP3 GLP2(RVP4)(没有特别说明用GLP2) PinpointTM Vector Pinpoint Primer SP6pIRES PIRES-F/T7 T3/PIRES-R (J40720)pIRES2-EGFP pIRES2-EGFP.P5’ pIRES2-EGFP.P3’pLXSN pLXSN-F pLXSN-RpMAL-c2E MalE primer M13F(-47)pMAL-C2x P5’ P3’pMAL-p2X MalE primer M13F(-47)PMD18-T M13R(-48) M13F(-47)PMD19-T M13F(-47) M13R(-48)pPIC9K(AMP+、ZEO+)5’AOX/a-factor 3’AOX pPICZa 5′AOX/PPICZa-F 3′AOXpPROEXHTA M13R(-48) 无反向引物pQE30or40 pQE30-F pQE-R:pRSET T7 T7TERpSilencer3.1-H1 hygro M13F(-47) 3.0REV pSILENCEV2.0-U6 T7 2.0REVpSK01-T M13F M13RpSK-CMV(KAN+) T7 T3pSP72 T7 SP6pSport1 SP6/M13F(-47) T7/M13RpSUPER T7 T3pTA2 M13F/T7(优先使用M13F)T3/M13RpT-Adv M13F /T7 M13RpTARGET TM pTarget.F(在T7前面)/T7 pTarget.R pTO-T7 T7 T7TERpTRC99a-c pTRC99C-F pTRC99C-RpTriPLEx2 5′pTriPLEx2 T7pTWIN-1 T7 T7TER(客户确认再用)pUC18(19)/118(119) M13F(-47) M13R(-48)pUCm-T M13F/T7 M13RpVAX1 T7 BGHpWSK29 T7/M13F/M13F(-47) T3/M13R/M13R(-48)pXT7 T7 SP6pYES2 T7 pYes2.RpLEXA pLEXA-F pLEXA-RpLNCX pLNCX-F pLNCX-RpRECEIVER CMV-F 此载体无反向引物pSHUTTLE-CMV PSHUTTLE-CMV-F PSHUTTLE-CMV-R pSP64/65 SP6 此载体无反向引物pSTBlue-1 T7 SP6pT7Blue(R) T7 M13F(-47)引物名称序列(5′-3′):M13R:CAG GAA ACA GCT ATG ACCM13F:TGT AAA ACG ACG GCC AGTM13F(-47):CGC CAG GGT TTT CCC AGT CAC GACM13R(-48):AGC GGA TAA CAA TTT CAC ACA GGAM13(-96):CCC TCA TAG TTA GCG TAA CGSP6:ATT TAG GTG ACA CTA TAGT7:TAA TAC GAC TCA CTA TAG GGT7 terminator:TGC TAG TTA TTG CTC AGC GGT3:ATT AAC CCT CAC TAA AGG GApGEX-4T-5′:GGG CTG GCA AGC CAC GTT TGG TG pGEX-4T-3′:CCG GGA GCT GCA TGT GTC AGA GG GLp1:TGT ATC TTA TGG TAC TGT AAC TGGLp2:CTT TAT GTT TTT GGC GTC TTC CARVp3:CTA GCA AAA TAG GCT GTC CCRVp4:GAC GAT AGT CAT GCC CCG CGpcDNA3.1R:TAG AAG GCA CAG TCG AGGPinPoint primer:CGT GAC GCG GTG CAG GGC G pCMV-F:TCT AAA AGC TGC GGA ATT GTpCMV-R:TCCAAACTCATCAATGTATCpTRC99C-F: TTG CGC CGA CAT CAT AACpTRC99C-R: CTGCGTTCTGATTTAATCTGpCEP-F: AGA GCT CGT TTA GTG AAC CGEBV-R : GTG GTT TGT CCA AAC TCA TCpIRES2-EGFP.P5’: GTA GGC GTG TAC GGT GGG AG pIRES2-EGFP.P3’: AAC GCA CAC CGG CCT TAT TC3′AD: AGA TGG TGC ACG ATG CAC AGCMV -F:CGC AAA TGG GCG GTA GGC GTGS1:CAA CGT GAA AAA ATT ATT ATT CGCS6:GTA AAT GAA TTT TCT GTA GTA GG5`AOX1:GAC TGG TTC CAA TTG ACA AGC3`AOX1:GCA AAT GGC ATT CTG ACA TCCα-Factor:TAC TAT TGC CAG CAT TGC TGCGAL4 AD:TAC CAC TAC AAT GGA TGpACT2-R:GTGCACGATGCACAGTTGAApB42ADF:CCA GCC TCT TGC TGA GTG GAG ATGpB42ADR:AAG CCG ACA ACC TTG ATT GGA GpEGFP-N-5’:TGG GAG GTC TAT ATA AGC AGA G pEGFP-N-3’:CGT CGC CGT CCA GCT CGA CCA G pEGFP-C-5’:CAT GGT CCT GCT GGA GTT CGT G pEGFP-C-3′ :TAT GGC TGA TTA TGA TCA GTPBV220F:AAG AAG GGC AGC ATT CAA AGPBV220R:CTG CGT TCT GAT TTA ATC TGU6:ATG GAC TAT CAT ATG CTT ACC GTA2.0rev primer:AGG CGA TTA AGT TGG GTA3.0rev:GAG TTA GCT CAC TCA TTA GGCS.tag:GAA CGC CAG CAC ATG GAC5′TriplEx2:CTC CGA GAT CTG GAC GAG CRVP4:GAC GAT AGT CAT GCC CCG CGRVP3:CTA GCA AAA TAG GCT GTC CCpQE30-R:GTT CTG AGG TCA TTA CTG GpQE30-F:TGA GCG GAT AAC AAT TTC ACpEF-F:TCA AGC CTC AGA CAG TGG TTCpDSRED-N1-R:TGA AGC GCA TGA ACT CCT TG pDsRED-express-C1-F:TCC CAC AAC GAG GAC TAC AC pCMV5R:ATT ATA GAG GAC ACC TAG TCpCMV5F:TTC CAA AAT GTC GTA ATA ACP5′:TGC GTA CTG CGG TGA TCA ACP3′:CTG CAA GGC GAT TAA GTT GGBAC2:ACG CAC AGA ATC TAG CGC TTBAC1:AAC CAT CTC GCA AAT AAA TA3′BD:TAA GAG TCA CTT TAA AAT TTG TAT AC pTarget.F:CCA GGA TTT TCC CAG TCA CpTarget.R:GGC TTT ACA CTT TAT GCT TCT7(17base):ACA TCC ACT TTG CCT TTC TCpYes2.R:TCG GTT AGA GCG GAT GTGGAL4 BD:TCA TCG GAA GAG AGT AGpAS2-1.R:AAG AGT TAC TCA AGA ACA AGA ApFlag-CMV-F: GGT AGG CGT GTA CGG TGGpFlag-CMV-R: GCA CTG GAG TGG CAA CTTpIRES-F: CTT ACT GAC ATC CAC TTT GCpIRES.R: CAC TGC ATT CTA GTT GTG GTP1:CCA GGC TTT ACA CTT TAT GCP2:GCG ATT AAG TTG GGT AAC GCpLEXA-F:CGT CAG CAG AGC TTC ACC ATpLEXA-R:TAA AAC CTA AGA GTC ACT TTpLNCX-F:AGC TCG TTT AGT GAA CCG TCA GAT CG pLNCX-R:ACC TAC AGG TGG GGT CTT TCA TTC CC pLXSN-F:CTT GAA CCT CCT CGT TCG ACpLXSN-R:GTT GCT GAC TAA TTG AGA TGpSHUTTLE-CMV-F:GGT CTA TAT AAG CAG AGG TG pSHUTTLE-CMV-R:GTG GTA TGG CTG ATT ATG ATC AG MalE Primer:GGT CGT CAG ACT GTC GAT GAA GCC。