染色体文库的构建及筛选
- 格式:pptx
- 大小:856.67 KB
- 文档页数:26
鸭细菌人工染色体文库的构建及连锁群的FISH定位的开题报告一、研究背景人工染色体(artificial chromosome,AC)是指在体外合成的、能够与真核细胞染色体相媲美的一个或多个染色体。
AC具有许多优点,如能够容纳大的外源DNA片段、稳定遗传和高效表达等。
由于AC的这些优点,目前在人类、动物和植物等领域均有广泛的应用。
鸭细菌是一种重要的饲料添加剂,在家禽和畜牧业中广泛使用。
但是鸭细菌对抗生素具有抗性,因此对鸭细菌的研究对于制定合适的饲养管理计划具有非常重要的意义。
二、研究目的本研究的主要目的是构建鸭细菌人工染色体文库,并利用FISH技术对连锁群进行定位,以期实现对鸭细菌的更深入研究。
三、研究内容和方法1.构建鸭细菌人工染色体文库本研究采用现代分子生物学技术,包括基因组DNA的提取、文库的构建、高通量测序和数据分析等步骤。
首先,利用列式法对鸭细菌进行基因组DNA提取,并使用限制酶将DNA片段进行切割。
然后,将DNA 片段连入人工染色体载体中,得到一个鸭细菌人工染色体文库。
最后,进行高通量测序和数据分析,鉴定所得序列。
2.连锁群的FISH定位首先,根据测序获得的序列信息设计合适的探针,并进行标记。
然后,准备与其亲缘关系较近的鸭细菌菌株作为目标,将探针引入目标细胞内,进行FISH技术的检测,定位目标序列及连锁群。
四、研究意义和预期结果本研究利用人工染色体技术构建了鸭细菌文库,并利用FISH技术对连锁群进行定位,实现对鸭细菌的深入研究。
预期结果包括:获得鸭细菌人工染色体文库,识别出鸭细菌基因组中的重要序列,为后续的生物学功能研究提供基础,并掌握FISH技术,为针对鸭细菌及其它细菌的基因定位研究提供基础设施。
第八章 DNA文库的构建和目的基因的筛选第一节 概述基因工程主要是通过人工的方法分离、改造、扩增并表达生物的特定基因,从而深入开展核酸遗传研究或者获取有价值的基因产物。
通常将那些已被或者准备要被分离、改造、扩增或表达的特定基因或DNA片段,称为目的基因。
因目的基因片段需插入载体,导入宿主细胞内复制,所以对宿主细胞DNA而言,又称它为外源性基因。
目的基因主要是编码蛋白质(酶)的结构基因,诸如抗逆性相关基因、生物药和保健品相关基因、毒物降解相关基因以及工业用酶相关基因等。
随着生物长期的进化,生物界积累了大量对人类有用的基因。
它是大自然恩赐于人类的宝贵资源,等待人们去开发利用。
目的基因用途很广,主要有以下几个方面:①研究该基因的全貌与内涵,如详细分析其结构、功能及调控。
②与正常基因对比,寻找异常基因的异常点,进而探索疾病发生的分子生物学机理及治疗对策。
③研究生物种系进化与相关同源性。
④应用某种基因大量表达,生产所需要的蛋白质或多肽(如胰岛素、干扰素等药物)。
⑤在农、林、牧、副、渔业中,改造某些目的基因,以改良品种,促进经济发展。
⑥建立基因疗法院,选用某种正常基因,引入患者体内,对某些先天性遗传疾病进行治疗。
根据研究对象的研究目的不同,目的基因可来自原核细胞或真核细胞。
原核生物基因组较简单,较易获得目的基因。
哺乳动物真核细胞基因组庞大复杂,可根据不同的要求选择适宜方法,从中获得目的基因。
要从数以万计的核苷酸序列中挑选出非常小的所感兴趣的目的基因,是基因工程中的第一个难题。
欲想获得某个目的基因,必须对其有所了解,然后根据目的基因的性质制定分离的方案。
目的基因的制备是基因工程研究和应用的关键内容之一。
根据实验需要,待分离的目的基因可能是一个完整的有功能的基因,除了编码区,还包含转录启动区和终止区序列,或者是一个完全的操纵子或基因簇,也可能是只具有编码序列的基因区,甚至是只含启动子或终止子等部件的DNA片段。
基因组文库的构建和池化筛选综述与专论?生物技术通报BloTECHNoLoGYBULLETIN201O年第5期基因组文库的构建和池化筛选陈献伟娜日苏朱超.王会'雷娜,高剑峰关伟军马月辉(中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;2石河子大学生命科学学院,石河子832003;广西大学动物科学技术学院,南宁530004;山西农业大学,太谷030801)摘要:作为物种保护策略的重要部分,建立濒危畜禽的基因组文库,可有效保存濒危畜禽种质资源.BAC(bacterialartificialchromosome)文库具有高容量,遗传特性稳定和嵌合体少等优点,因而被用于畜禽基因组文库的构建.对BAC文库的构建方法和文库池化筛选系统作一综述.关键词:BAC栽体基因组文库池化筛选ConstructionandScreeningofGenomicLibrary ChenXianweitNaRisuZhuChaofWangHuifLeiNa?GaoJianfengGuanWeijunMaYuehui ('InstituteofBeijingAnimalScienceandV eterinary,CAAS,Beijing100193;CollegeofLife Science,ShiheziUniversity,Shihezi832003; CollegeofAnimalScienceandTechnology,GuangxiUniversity,Nanning530004;ShanxiA griculturalUniversity,raigu030801)Abstract:ConstructionofthegenomicLibraryofdomesticanimalasthebasiccompone ntofs peciesconservationstrategycan preserveendangeredanimalgermplasmresourcesefficiently.Beingcapableofinsertinglarg efragments,maintainingthestabilityofin—sertedDNAinE.coli,producingfewchimerismes,BAClibraryhavebeencontributedtorese archesofconstructionofgenomiclibrary. ThispaperdescribedtheconstructionmethodandscreeningsystemofBAClibrary. Keywords:BACvectorsGenomiclibraryPoolingScreening高分子量的DNA文库是基因组研究的基础,如重要经济性状基因的图位克隆,比较基因组研究,基因组测序及物理图谱的构建.BAC载体具有容量大,遗传特性稳定和嵌合体少等优点,非常适合于基因组文库的构建.1BAC文库的研究进展基因组文库是利用DNA重组技术将某种生物细胞的核DNA的全部或大部分片段随机地连接到克隆载体上,之后转移到适当的宿主细胞中,通过细胞增殖而形成的各个片段的无性繁殖系的总集.基因组文库构建的关键取决于所使用的克隆载体.自Cohen等构建第一个质粒载体pSC101以来,相继出现了大量的克隆载体.克隆载体大致可分为噬菌体系列和人工染色体系列.前者主要包括质粒(plasmid),噬菌体(bacteriophage),柯斯质粒(cosmid,又称粘粒)等,其主要特点是载体在宿主细胞内能稳定遗传,易分离,转化效率高,但克隆容量有限,一般小于45kb.许多真核生物的基因庞大而复杂,难以克隆到这些载体中.后者主要有酵母人工染色体(yeastartificialchromosome,YAC),细菌人工染色体(bacterialartificialchromosome,BAC)以及可转化人工染色体(TransformationArtificialChromo—some,TAC)和哺乳动物人工染色体(mammalianarti—ficialchromosome,MAC)等,显着特点是载体的容载收稿日期:2009—12-29基金项目:国家科技支撑项目(2006BAD13BOB,2008BADB2B01),转基因重大专项(2008ZX08009-003),国家"863"计划项目(2006AA10Z1982007AA10Z170)作者简介:陈献伟,男,硕士,主要从事分子生物学研究工作;E.mail:****************通讯作者:关伟军,男,教授,博士生导师,主要从事动物细胞分子生物学方面研究工作;E—mail:********************.cn马月辉,男,研究员,博士生导师,主要从事动物遗传资源保护方面研究工作;E—mail:yuehui—**********12生物技术通报BiotechnologyBulletin2010年第5期能力大,约100—350kb.这些具有较大外源片段承受能力的人工染色体对于真核生物基因组文库的构建极为有利.近年来得到广泛应用的克隆载体主要是细菌人工染色体(BAC).细菌人工染色体是在大肠杆菌F一因子基础上发展而来的.F.因子的复制是严谨型的,在每个细胞中仅有1—2个拷贝,这样就减少了质粒所携带的外源片段发生重组的可能性,而且F.因子能携带的外源片段可达1mb,表明F一因子更适合于克隆大片段的DNA.BAC克隆体系的第一代载体pBAC108L(图1).pBAC108L能克隆的外源片段可达300kb,但它存在的一个问题是只有10%一50%的转化子是重组子.自从BAC载体问世以来,出现了许多目的在于增加易用性和用于特定系统和环境的修饰.pBeloBAC11和pBACe3.6是对pBAC108L进行修饰构建的载体,通常作为进一步修饰的基础载体(图2).pBeloBAC11代表了第二代的BAC克隆系统,也是应用非常广泛的一种BAC载体.其外源DNA片段的容量最大可至300kb以上,可应用于基因组文库的构建工作.主要特点是在pBAC108L的多克隆位点上增加了LacZ基因,可用于蓝白斑筛选.然而pBeloBAC11仍是低拷贝质粒.T7—?'_SP6SalINotIBHNotI卜口_[卜卜—)—EcoRV图1pBAC108L载体H/ndmBamHIrepE图2pBeloBACll载体Frengen等构建了pBACe3.6载体(图3).pBACe3.6是在pBAC108L的基础上构建的,但比pBeloBAC11修饰程度高.此外,它利用了不同于pBeloBAC11蓝白斑选择的另一选择机制,其多克隆位点位于蔗糖致死基因sacB上,这样重组克隆可以在含有蔗糖的培养基上进行阳性选择.OCM(R)mHIfl1lCIIf811c0RInO,SacIf2O)胁II(221PUC—LINKLI(766)LI(2012)ApaLI(2509)南R322NotI(2850)图3pBACe3.6载体1997年,Hamilton等"结合根癌农杆菌双元载体和BAC载体的特点,构建了一种"双元BAC载体(abinaryBAC)",即BIBAC.BIBAC作为第三代文库载体,不仅具有第二代载体的特征,而且有植物2010年第5期陈献伟等:基因组文库的构建和池化筛选转化的功能.BIBAC转化技术在双子叶植物中已经建立,Hamilton等'通过农杆菌介导的方法把克隆在BIBAC2中的完整的150kb大小的人类DNA片段转进了番茄和烟草.TAC(transforma.petentartificialchromosome)也是一种直接用于转化的人工载体.1999年,Liu等结合PAC载体和双元载体的特点,构建了植物可转化基因人工染色体TAC载体Pyltae7和Pyhac17.TAC载体能在大肠杆菌和根癌农杆菌中以单拷贝形式复制.目前,已有人和一些哺乳动物的基因组DNABAC文库建成,如猪",牛,大熊猫"和鲶鱼H等动物.通过BAC文库的构建,不仅长久而有效地保存动物基因遗传资源,而且,为进一步研究,开发和利用其与重要经济性状,生殖和遗传性疾病相关的功能基因,提供可靠的基因材料平台.2BAC文库的构建方法基因组DNA文库的构建流程相对简单,但其需要很多特殊的处理以及必要的仪器设备,成功的关键都体现在操作的细节上.BAC文库的构建过程包括以下几个步骤.2.1BAC载体的制备载体制备的好坏,直接关系到文库中空白载体的比例和文库的质量,载体的纯度越高,获得阳性克隆的概率越高,文库的质量也越好.采取酶切的同时进行彻底的脱磷处理,以减少或避免空白载体的比例,保证其符合建库要求.载体的制备主要包括BAC载体的大量提取和纯化,CsCL.EtBr密度梯度离心纯化得到的超螺旋质粒,BAC载体的后期处理(酶切和去磷酸化),载体脱磷效果检测,载体自连回收.2.2高分子量(HMW)DNA的制备由于构建BAC文库需要得到尽可能完整的大片段DNA,因此,首先要保证将细胞核包埋在琼脂糖凝胶块中的质量,即细胞核的质量和浓度,琼脂糖凝胶的浓度等.而且如果是组织样品,一般使用液氮将组织捣碎,并在整个研磨过程中使组织浸泡在液氮中,然后包埋在低熔点琼脂糖中形成"Plugs",以此来保护核DNA免受降解.2.3高分子量DNA的不完全消化高分子量DNA的不完全消化的目的使通过限制性内切酶的不完全消化,产生大量比较适合和集中的片段,一般通过脉冲场凝胶电泳进行两次片段选择'.DNA的分离一般有一次尺度选择和二次尺度选择(尺度选择即脉冲电泳),在脉冲场电泳条件下,由于不同分子量的DNA片段发生"共迁移",在大片段中混有很多小片段DNA,而这些小片段DNA 在连接过程中效率要明显高于大片段DNA,从而影响基因组文库的构建质量.二次尺度选择法得到的DNA连接转化效率较高,转化后插入的片段整齐度好,空载率低.为了获得纯度高,含量多的大片段,减少大片段的降解,同时又尽可能的去除小片段,采用二次尺度法进行大片段DNA的分离,按照部分酶切所确定的最佳酶用量,对基因组Plugs进行大量酶切,然后进行脉冲场电泳.2.4大片段DNA和载体的连接大片段DNA能否有效地连接到载体上,主要取决于插入片段与载体的比例,对于不同的生物采用的比例不同,大部分处于1:5—15(摩尔比)范围.2.5将连接产物转化入受体细胞对于转化大肠杆菌而言,电转化是目前使用最普遍的一种方法.研究表明,文库中载体的平均插入大小主要与转化效率相关.插入片度越大,转化效率越低;反之,越高.此外,转化条件也直接影响转化效率,插入片段大小及假阳性克隆的含量.2.6挑选阳性克隆,构建文库阳性克隆的分检有人工和使用机器手技术两种.一般通过lacZ的插入失活,显示蓝白斑的负同选择来筛选重组子,但是在基因组文库构建中常常发现有1%一10%左右的假阳性,用机器人操作时假阳性更高.现在又产生了正向选择的BAC载体pBACe3.6,pBAC/SACB¨,利用sacB的插入失活,产生的零背景可使机器人进行挑选重组子时不必进行菌落间的分辨,便于自动挑取收集.2.7文库的保存管理与质量检测文库构建完成后,还需要对文库进行评价,其质量的高低标准包括文库中克隆的数量,平均插入片l4生物技术通报BiotechnologyBulletin2010年第5期段的大小,克隆的稳定性,细胞器DNA的含量以及假阳性克隆的含量等.3BAC文库的池化和筛选基因组BAC文库有数万到数十万个克隆组成,因此建立高效的管理和筛选系统是必要的.筛选系统有PCR筛选系统和Southern杂交筛选系统两种.3.1PCR筛选系统建立PCR筛选系统需要对所有的克隆进行保存和池化.整个BAC文库由若干个超级池组成,每个超级池有10个384孔板组成.将一个超级池的行克隆,列克隆和每板的克隆分别合并成池,提取质粒DNA作为第二步PCR筛选的模板,同时将10个板的克隆合并提取DNA,即有了第一步筛选超级池的DNA.对BAC文库进行两步.3D筛选的过程:首先,用目的序列的PCR引物筛选文库的若干个超级池的DNA,得到阳性超级池号;之后用阳性超级池的板池,行池,列池的DNA进行第二步筛选,得到阳性的板池号,行池号,列池号;从冻存的文库中依照筛选结果得出的克隆地址,挑出阳性克隆,再次做PCR验证.Bonet等¨构建了野草莓的BAC文库,共有18432个克隆,存于48块384孔板中,压缩到48个96孔板中.他将每6块96孔板的克隆混在一起,共形成8个超级池.用70个分子标记进行PCR分析,以超级池质粒为模板通过PCR的方法确定含有目的片段的阳性单克隆.Wang等.构建了尖吻鲈的BAC文库,49152个克隆保存在128块384孔板中,由11个超级池构成,每个超级池分成48个96 孔板,对文库进行超级池,板池和行列池3步法筛选,用24个微卫星和15个EST对文库进行PCR筛选表明文库具有较好的基因组覆盖率.3.2HD杂交膜筛选系统一般材料BAC文库库容量都是数以万计,若同时对这些数目庞大的BAC进行分析,非常困难.常规BAC文库的研究一般都是以尼龙膜为载体,用机械手将整个文库顺序点到膜上.将膜在固体培养基上培养一段时间后进行菌落原位裂解,将DNA结合在膜上,再用特异性探针进行Southern杂交筛选阳性克隆.每张膜可容纳50000以上的克隆.一个库用6—7张膜就可以包括.杂交膜筛选缺点是Southern杂交要用到同位素,存在假阳性和污染,放射性元素对人和环境都会产生影响,成本也高.对于功能基因克隆的筛选,用PCR筛选系统得到的结果比从高密度杂交膜筛选系统得到的结果更为可靠,假阳性少,而且方法简单,快速.但是对于构建大区域的物理重叠群,高密度膜杂交筛选阳性克隆可以一次得到一个标记的所有重叠克隆,更有利于快速的构建BAC重叠群.4展望细菌人工染色体(BAC)具有容量大,易于分离和操作等特性,比其它载体系统构建的基因组文库有更高的覆盖率和稳定性.利用BAC文库容量大的特点,进行基因筛选,目的基因定位,表达调控等研究是BAC文库利用的发展方向.BAC文库将在动物基因资源保存,基因组学,后基因组学等研究中发挥重要的作用.参考文献[1]QuiniouSM,WaldbieserGC,DukeMV,eta1.Afirstgeneration BACbasedphysicalmapofthechannelcatfishgenome.JBMCGe? nomics,2007,8:40.[2]JungS,MainD,StatonM,eta1.Syntenyconservationbetweenthe PrunusgenomeandboththepresentandancestralArabidopsisge- nomes.JBMCGenomics,2006,7:81.[3]ZhebentyayevaTN,Swire-ClarkG,GeorgiLL,eta1.Aframework physicalmapforpeach,amodelRosaceaespecies.JTreeGenetics andGenomes,2008,4:745-756.[4]CookRJ,LloydRS,WagnerC.IsolationandcharacterizationofcD? NAclonesforratliver10?formyhetrahydrofolatedehydrogenase.J BiolChem,1991,266(8):4965-4973.[5]ShizuyaH,BirrenB,KimUJ,eta1.Cloningandstablemaintenanceof300一kilobase—pairfragmentsofhumanDNAinEscherichiacoliU? singanF—factor-basedvector.JProcNatlAcadSciUSA,1992,89: 8794-8797.[6]FrengenE,WeiehenhanD,ZhaoB,eta1.Amodular,positiveselec- tionbacterialartificialchromosomevectorwithmuhiplecloning sites.Genomics,1999,58(3):250-253.[7]HamihonCM.Abinary—BACsystemforplanttransformationwith hjgh—molecular—weightDNA.Gene,1997,200:107?116.[8]HamiltonCM,LewisC,eta1.Stabletransferofintacthighmolecular weightDNAintoplantchromosomes.ProcNatlAcadSciUSA,1996,93(18):9975.[9]HamiltonCM,FraryA,XuYTanksleySD,ZhangHB.Construction 201O年第5期陈献伟等:基因组文库的构建和池化筛选oftomatogenomicDNAlibrariesinbinary-BAC(BIBAC)vector PlantJ.1999,18:223-229.[1O]LiuYG,ShiranoY,FukakiH,eta1.c0mplementationofplantmu—tantwithlargegenomicDNAfragmentsbyatransformation??compe? tentartificialchromosomevectoracceleratespositionalcloning. PNAS,1999,96(11):6535-6540.[11]Rogel—GaillC,BourgeauxN,BillauhA,eta1.Constructionofa swineBAClibrary:applicationtothecharacterizationandmapping ofporcinetypeCendoviralelements.JCytogenetCellGenet, 1999,85:205-211.[12]EggenA,GautierM,BillautA,eta1.Constructionandcharacter- izationofabovineBAClibrarywithfourgenome-equivalentcover. age.JGenetSelEvol,2001,33:543—548.[13]LiuW,ZhaoYH,LiuZL,ZhangY,eta1.Constructionofa7-fold BAClibraryandcytogeneticmappingof10genesinthegiantpanda (Ailuropodamelanoleuca).JBMCGenomics,2006,7:294.[14]QuiniouSM,WaldbieserGC,DukeMV:AfirstgenerationBAC. basedphysicalmapofthechannelcatfishgenome.JBMCGenom- ics,2007,8:40.[15]KimUJ,Bi~enBW,SlepakT,eta1.Constructionandcharactefiza. tionofahumanbacterialartificialchromosomelibrary.JGenom. ics,1996,34:213-218.[16]ZhangY,ZhangX,SeheuringCF,eta1.Constructionandcharac- terizationoftwobacterialartificialchromosomelibrariesofZhikong scallop(ChlamysfarreriJonesetPreston),andidentificationof BACclonescontainingthegenesinvolvedinitsinnateimmunesys—tern.JMarBiotechnol,2008,10:358-365.[17]TaoQZandZhangHB.CloningandstablemaintenanceofDNA fragmentsover300kbinEscherichiacoliwithconventionalplas- mid—basedvectors.JNucleicAcidsRes,1998,26:4901-4909. [18]BendahmaneA.Zero-backgroundplasmidvectorforBAClibraryconstruction.JBioTeehniques,1999,26(2):228—230,232.[19]BonetJ,GironaEL,SargentDJ,eta1.Thedevelopmentandcharac—terisationofabacterialartificialchromosomelibraryforFragariavesca.JBMCResNotes,2009,2:188.[20]WangCM,LoLC,FengF,eta1.ConstructionofaBAClibraryand mappingBACclonestothelinkagemapofBarramundi,Latescal?carifer.JBMCGenomics,2008,9:139.[21]FengJ,VickBA,LeeMK,eta1.ConstructionofBACandBIBAC librariesfromsunflowerandidentificationoflinkagegroup-specific clonesbyovergohybridization.JTheorApplGenet,2006,113:23—32.病毒学精要概览(双语版)科学出版社新书(英)T.斯科恩着,朱俊萍李相辉安静译978—7—03-026886—7$50.002010年3月出版内容简介:本书是CoffeeHouseNotesonVirology一书的中英双语版本,内容涵盖了病毒学的基本原理,概念以及与病毒学密切联系的学科中各项热点议题,例如:病毒和肿瘤,病毒和免疫系统,病毒进化及新病毒等.书中丰富的病毒实例几乎囊括了医学病毒学中所有重要的类群和相关医学问题.本书语言极其精炼,简单,以解答75个问题的形式阐释了病毒学中最普遍的性质和规律,为庞杂丰富的病毒学世界搭建起一个精要概括的知识框架.相信该书有助于普通高等学校和医学高等院校相关专业的本科生,研究生,教师以及相关领域的科研人员在最短的时间内学习和掌握病毒学的基本原理和事实.更希望通过对本书的阅读,激发起读者探索病毒学世界的兴趣.欢迎各界人士邮购科学出版社各类图书(免邮费)邮购地址:北京东黄城根北街16号科学出版社科学出版中心生命科学分社邮编:100717联系人:周文宇(010—64031535)网上订购: 更多精彩图书请登陆网站,欢迎致电索要书目。
yac构建基因文库的原理基因文库是DNA片段的集合,其中每个片段都包含来自基因组的某个部分。
这些片段可以来自不同的染色体区域,并且可能包含整个基因或其部分。
YAC(酵母人工染色体)是一种用于构建基因文库的载体,它允许研究人员在酵母细胞中克隆和表达大片段的基因组DNA。
下面将详细介绍YAC构建基因文库的原理,主要包含以下几个方面:1. 构建构建YAC载体的第一步是制备适合克隆大片段DNA的载体。
通常,YAC载体包含一个选择标记(如抗性基因),允许在含有特定抗生素的培养基上筛选和识别含有YAC的克隆。
此外,YAC载体还应包含一个多克隆位点,用于插入感兴趣的基因组DNA片段。
2. 转化一旦制备了YAC载体,就可以将其转化到酵母细胞中。
转化过程通常涉及将酵母细胞与YAC载体共孵育,以使载体与酵母细胞的DNA结合。
然后,通过加入选择标记来筛选和识别成功转化的细胞。
3. 克隆化在成功转化后,研究人员需要筛选和识别含有重组YAC载体的细胞克隆。
通常,这可以通过多轮筛选和鉴定来完成。
首先,研究人员可以使用特定抗生素来筛选含有选择标记的细胞。
然后,他们可以使用 Southern 印迹分析或 PCR 等技术来鉴定含有重组YAC载体的克隆。
4. 筛选筛选是YAC构建基因文库的关键步骤之一。
通过筛选,研究人员可以识别包含所需基因组区域的有效克隆。
这通常涉及对重组YAC进行分子遗传分析,以确定其包含的基因组区域。
通过比较筛选结果和基因组图谱,研究人员可以选择正确的克隆用于进一步研究。
5. 鉴定一旦筛选出正确的克隆,研究人员需要对其进行进一步鉴定。
这可以通过一系列技术来完成,包括 Southern 印迹分析、PCR、测序和功能分析等。
通过这些技术,研究人员可以确定重组YAC中的基因组区域是否包含所需的目标基因或DNA片段。
此外,他们还可以验证克隆的可靠性和稳定性,以确保其可以用于进一步实验和研究。
总之,YAC构建基因文库是一个复杂的过程,涉及多个步骤和关键环节。
酵母人工染色体的构建程序酵母人工染色体的构建程序染色体是生物体内的重要基因载体,包含了细胞遗传信息。
酵母人工染色体(YEAC)是通过人工手段构建的酵母基因组片段,具有重要的生物学和应用价值。
构建YEAC的程序是一个复杂而精密的过程,需要一系列步骤的有序进行。
首先,构建YEAC的第一步是设计合成目标染色体序列。
科研人员根据特定的研究目的和需求,选择需要构建的酵母人工染色体片段并进行基因序列的设计。
在设计过程中,要考虑到染色体稳定性、重要基因的完整性、引导序列的合理性等因素。
接下来,进行合成目标染色体序列的基因片段。
合成染色体片段的方法有多种,包括PCR扩增、化学合成、酶切连接等。
科研人员根据设计的基因序列,选择相应的合成方法进行基因片段合成。
在此过程中,需要考虑到合成效率、准确度以及避免合成错误的可能性。
完成基因片段的合成后,接下来进行染色体片段的组装。
这个过程需要将不同的基因片段按照设计顺序进行连接,并通过特定的酶切位点进行连接。
科研人员需根据设计的顺序和连接方式,进行准确而有效的组装操作。
构建YEAC的下一步是将组装好的染色体片段导入到酵母细胞中。
这个过程需要利用化学变性剂或电穿孔等方法,将染色体片段导入到酵母细胞中。
科研人员需要选择合适的导入方式,并进行适当的操作条件控制。
导入染色体片段后,需要进行筛选和鉴定工作。
这个过程是为了筛选出携带目标染色体片段的酵母细胞,并通过PCR扩增、序列测定等方法,进行目标染色体片段的确认。
科研人员需要仔细进行筛选和鉴定,确保所构建的YEAC是正确和稳定的。
最后,进行YEAC的研究和应用。
构建好的YEAC可以应用于基因组调控、基因功能研究、新药筛选等方面。
科研人员可以根据研究目的,设计相应的实验和应用方案,进一步探索和利用YEAC的潜力。
总之,酵母人工染色体的构建是一个复杂而精密的过程,需要经过设计、合成、组装、导入、筛选和鉴定等步骤,才能成功构建出目标染色体片段。
国防科技大学学报第30卷第1期J OUR NAL OF NA TIONA L UNIVERSI TY OF DEFENSE TECHNO LO GY Vol.30No.12008文章编号:1001-2486(2008)01-0120-05小粒野生稻可转化人工染色体文库初步构建及筛选*王正华1,曹筑荣1,曹孟良2(1.国防科技大学计算机学院,湖南长沙410073; 2.国家杂交水稻工程技术研究中心,湖南长沙410125)摘要:以小粒野生稻核DNA为材料构建了一个可转化人工染色体文库,获得了5000个克隆,平均插入片段约45kb。
稳定性检测结果表明,小粒野生稻基因组DNA能够在TAC载体中稳定存在。
基于已克隆抗性基因的保守序列设计探针,利用菌落杂交的方法,对文库进行筛选。
结果表明,该文库可以用于抗性基因的筛选。
关键词:可转化人工染色体;基因组文库;小粒野生稻中图分类号:Q94-33文献标识码:AThe Construction and Screening of Genomic Library Based onT ransformable Artificial Chromosome(T AC)Vector in Orazy.MinutaWANG Zheng-hua1,CAO Zhu-rong1,C AO Meng-liang2(1.College of Computer,National Uni v.of Defense Technology,Changs ha410073,China;2.National Hybrid Rice R&D Center,Changsha410125,China)Abstract:A transformation-competent artificial chromosome(TAC)library was constructed from the genomic DNA of orazy. mi muta.This library is composed of5,000clones while the average insertion fragment size is45kb.Stabili ty test indicated that genome DNA of Orazy.mimuta was s tably existence in the p YLTAC27carrier.A probe was designed according to the sequences of cloned resistance gene.With the colony hybridization method,the genome library was screened.The result shows that resistance gene can be screened in this library.Key words:transformation-competent arti ficial chromosome;genomic library;orazy.minuta稻属(Orazy)现已查明的有22种,分布在世界各地。
细菌人工染色体文库的构建及应用随着生物技术的迅速发展,细菌人工染色体文库作为一种新兴的技术平台,在基因组学、基因克隆、基因治疗等领域展现出巨大的潜力。
细菌人工染色体文库是一种利用细菌染色体作为载体,将外源基因克隆到细菌染色体上的技术。
与传统的基因组文库构建方法相比,细菌人工染色体文库具有更高的稳定性和可操作性,成为当前研究的热点。
细菌人工染色体文库构建的技术原理和基本流程细菌人工染色体文库构建的核心技术是将外源基因克隆到细菌染色体上。
需要提取细菌染色体作为载体;然后,将目的基因插入到载体上;将重组载体转化到受体细菌中。
与传统的基因组文库构建方法相比,细菌人工染色体文库构建具有更高的稳定性和可操作性。
传统的基因组文库构建需要依赖细胞分裂和基因重组,而细菌人工染色体文库则通过同源重组实现基因克隆,具有更高的精确性和可预测性。
以实际案例为例,详细阐述细菌人工染色体文库的构建步骤、实验流程及注意事项在实际操作中,构建细菌人工染色体文库需要以下步骤: (1)提取细菌染色体:从受体细菌中提取完整的染色体作为载体; (2)目的基因的获得:从供体细胞中提取目的基因; (3)载体与目的基因的连接:将目的基因插入到细菌染色体载体上; (4)转化受体细菌:将重组载体转化到受体细菌中; (5)筛选与鉴定:对转化后的受体细菌进行筛选和鉴定,确保正确克隆。
实验流程中需要注意以下几点: (1)实验操作过程中保持无菌环境,避免污染; (2)目的基因的插入位点应选择合适,避免对载体的稳定性和功能造成影响; (3)转化受体细菌时,应选择合适的培养条件,提高转化效率; (4)筛选和鉴定过程中,要设定准确的阳性对照,保证实验结果的可靠性。
介绍细菌人工染色体文库的应用领域,并分析其与传统基因组文库应用领域的优劣对比细菌人工染色体文库在多个领域都有广泛的应用,如基因组学研究、基因克隆、基因治疗等。
在基因组学研究方面,细菌人工染色体文库可以用于研究基因组结构、基因组进化、基因组编辑等方面,具有更高的稳定性和可操作性。
染色体相关模型的构建学案【学习目标】1.通过染色体相关模型的构建理解遗传和变异中相关概念及相关知识网络2.学会利用染色体相关模型解决遗传和变异中涉及的问题【学习过程】模型一:思维训练:(1)染色体是指能被_______________染成深色的物质;(2)染色体的化学组成包括____________和____________,其化学成分与__________(生物)相似;(3)染色质和染色体的关系是:___________________________________________________;(4)上图三个图形中处于细胞分裂间期的是_____________,处于细胞分裂期的是__________;(5)一条染色体上含有____________个DNA 分子。
巩固练习:1.下列关于染色质和染色体的说法正确的是( )A .健那绿可将活细菌中的染色体染成深色B .无丝分裂过程中存在染色质和染色体的相互转变C .观察洋葱根尖细胞的有丝分裂过程中视野中不同细胞的染色体数目可能不等D .一条染色体上最多含有2条脱氧核苷酸链模型二:思维训练:(1)一条染色体上有________个基因;基因在染色体上呈_________排列;在减数分裂形成配子的过程中,基因的行为与染色体的行为基本__________。
(2)上图中同源染色体是_____________________;非同源染色体是____________________________;(3)同源染色体的相同位置上一般含有________基因或___________基因;(4)脱氧核苷酸、基因、DNA 、染色体四者之间的关系是:复制 a b c A a b b C C D d E e f f1 2 3 4____________________________________;巩固练习:2.右图是科学家对果蝇一条染色体上的基因测定结果。
下列有关该图的说法中,正确的是( )A .控制朱红眼与深红眼的基因是等位基因B .控制白眼和朱红眼的基因在遗传时遵循基因的分离定律C .该染色体上的基因在后代中都能表达D .该染色体上的碱基数A=T 、G=C模型三:思维训练: (1)请在上图括号中填写各模型所处的细胞分裂时期;(2)有丝分裂中期与减Ⅰ中期及减Ⅱ中期染色体的主要区别是:__________________________________________________________________________________________________________________________;(3)减Ⅰ后期染色体的行为是:______________________________;根据非同源染色体的组合情况,该个细胞可以产生______种配子,该种细胞可以产生______种配子;(4)请将模型二中A/a 、E/e 基因分别标注在模型三中染色体相对应位置;(5)在减数分裂形成配子的过程中,_______染色体上的_________基因彼此分离分别进入不同的配子;___________染色体上的____________基因在形成配子时发生自由组合,这也是_________定律和_______________________定律的本质。