lecture 04

第四讲多孔介质中的多相流动非水相液体 NAPL：非水相液体DNAPL：高密度的非水相液体 氯化溶剂煤焦油LNAPL：低密度的非水相液体 石油燃料典型NAPLs的密度四氯乙烯 四氯化碳 氯仿三氯乙烯二氯甲烷 煤焦油 二甲苯 甲苯苯汽油喷气燃料 柴油燃油不饱和、饱和介质中DNAPL四氯乙烯的实验室实验见图片XI.a ：Friedrich Schwille, 1988. Dense Chlorinated Solvents in Porous and Fractured Media, Model Experiments. Lewis Publishers, Chelsea, Michigan.见图1：M.M. Poulsen and B.H. Kueper, 1992.A Field Experiment to Study the Behavior of Tetrachloroethylene in Unsaturated Porous Media. Environmental Science & Technology, Vol. 26, No. 5, Pp. 889‐895, May 1992.见图2：M.M. Poulsen and B.H. Kueper, 1992. A Field Experiment to Study the Behavior of Tetrachloroethylene in Unsaturated Porous Media. Environmental Science & Technology, Vol. 26, No. 5, Pp. 889‐895, May 1992.残余物和溶解的形成残余和蒸汽羽的形成典型残余饱和值残余饱和度 NAPL体积孔隙体积（没有量纲）物质 残余饱和度 三氯乙烯全氯乙烯汽油来源：良好的粗略猜测：风化玻璃“多孔介质”中的残余见图1：S.H. Conrad, J.L. Wilson, W.R. Mason, and W. J. Peplinski, 1992. Visualization of Residual Organic Liquid Trapped in Aquifers. Water Resources Research. Vo. 28, No. 2, Pp. 467‐ 478. February 1992.见：S.H. Conrad, J.L. Wilson, W.R. Mason, and W. J. Peplinski, 1992. Visualization of Residual Organic Liquid Trapped in Aquifers. Water Resources Research. Vo. 28, No. 2, Pp. 467‐478. February 1992.沙地多孔介质的残余见图5：S.H. Conrad, J.L. Wilson, W.R. Mason, and W. J. Peplinski, 1992. Visualization of Residual Organic Liquid Trapped in Aquifers. Water Resources Research. Vo. 28, No. 2, Pp. 467‐ 478. February 1992.见图6： S.H. Conrad, J.L. Wilson, W.R. Mason, and W. J. Peplinski, 1992. Visualization of Residual Organic Liquid Trapped in Aquifers. Water Resources Research. Vo. 28, No. 2, Pp. 467‐478. February 1992.四氯乙烯渗透到不饱和多孔介质见图XVIII.a 和b ： Friedrich Schwille, 1988. Dense Chlorinated Solvents in Porous and Fractured Media, Model Experiments. Lewis Publishers,Chelsea, Michigan.少量的全氯乙烯释放后来：更多的全氯乙烯释放出来，全貌形成渗流区DNAPL渗透的形成见：Friedrich Schwille, 1988.Dense Chlorinated Solvents in Porous and Fractured Media, Model Experiments. Lewis Publishers, Chelsea, Michigan.“溢出的问题”问题：“给定溢出发生在土壤表 面，对NAPL多长时间能 渗透到潜水面？”剩余饱 和度。

GATK软件具有准确度高、可扩展性强和易于使用等特点，广泛应用于全 基因组关联分析、突变检测和基因组组装等领域。
SAMtools软件
1
SAMtools是一个用于处理和分析序列对齐映射 （SAM）格式数据的生物信息学软件工具。
2
SAMtools软件提供了多种用于双序列比对的工 具，如SAMtools sort、SAMtools index和 SAMtools view等。
BLAST软件具有高效、准确和灵活的特点，广泛应用于生物信息学领域的序列比对 和相似性搜索。
GATK软件
GATK（Genome Analysis Toolkit）是一个用于分析高通量测序数据的生 物信息学软件工具集。
GATK软件提供了多种用于双序列比对的工具，如Smith-Waterman算法 和Burrows-Wheeler变换等。
药物作用机制研究
通过比对药物作用前后的基因或蛋白质序列，分析药物对生 物分子的影响和作用机制，有助于深入理解药物的作用原理 和潜在副作用。
05
双序列比对的挑战与未来发展
数据规模与计算复杂度
数据规模
随着测序技术的快速发展，产生的序列数据量呈指数级增长，给 双序列比对带来了巨大的挑战。
计算复杂度
双序列比对的算法复杂度较高，尤其是在处理大规模数据时，需 要消耗大量的计算资源和时间。
通过比对患者与健康人的基因序列，寻找与疾病相关的基因变异位点，有助于定位和阐明疾病发生的分子机制。
药物靶点发现
通过比对不同物种的基因或蛋白质序列，寻找与药物分布、活化等相关的靶点，有助于发现新的药物候选分子。
药物发现与设计
药物靶点筛选
通过比对已知药物靶点序列与数据库中的序列，筛选出潜在 的药物靶点，有助于发现新的药物作用机制和候选药物。

Lecture Four
Tense
Comments on writing
But in the past many years, children had another kind of lifestyle, they had several brothers and sisters. And their parents needed to take care of several children at the same time, so they couldn’t be looked after well like the children who live in the modern time, but they had fine childhoods what they thought of.
When I was a child, I always wear my mother clothes are done, or my brother wearing a small, not clothes. About one year to get a new clothes until my high school age in 1983.
pronoun
我 你 他 她 它 我们 你们 他们
主格
I you he she it we you they
宾格
me you him her it us you them
形容词性 所有格
my your his her its our your their
名词性 所有格
mine yours his hers its ours yours theirs
The postman is always putting your letters into my letter-box. (不满情 绪)；

Lecture 4 Traditional Philosophies and Religion of China---Confucianism中国传统宗教文化与翻译---儒家思想Pre-class exercisesTranslate the following所以中国从前的忠孝、仁爱、信义种种旧道德，固然是驾乎外国人，说到和平的道理，更是驾乎外国人。

这种特别好的道德，便是我们的民族精神。

（《孙中山选集》684页）Lecture Notes一、儒教ConfucianismFour Books and Five Classics (四书五经): The Great Learning (《大学》), The Mean (《中庸》), Analects (《论语》), and Mencius (《孟子》); Book of Change (《易经》), Book of History (《尚书》), Book of Odes (《诗经》), Book of Rites (《礼记》), and Spring and Autumn Annals (《春秋》).1. 儒家代表人物Representatives of Confucianism1）孔子Confucius (551- 479 BC)2）孟子Mencius (372-289 BC)2. 儒家思想Concepts of Confucianism1）仁benevolence樊迟问仁，子曰“爱人”。

（《论语·颜渊》第二十二）Fan Chi asked about “ren”. Confucius said, “Love all men.” (周仪)唯仁者能好人，能恶人。

（《论语·里仁》第三）Only the man of ren knows how to like and dislike others.子曰：“知者不惑，仁者不忧，勇者不惧。