第七章原核生物的基因调控
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第七章遗传和变异第一节遗传的物质基础【知识概要】一、染色体是遗传物质的主要载体1.染色体的化学成分染色体的主要成分为DNA和组蛋白,两者含量比率相近,此外,还有少量非组蛋白和RNA。
组蛋白为含赖氨酸和精氨酸比较多的碱性蛋白质,带正电荷。
其功能是参与维持染色体结构,有阻碍NDA转录RNA的能力。
非组蛋白为含天门冬氨酸、谷氨酸等酸性蛋白质,带负电荷。
非组蛋白的特点是:既有多样性又有专一性,含有组蛋白所没有的色氨酸。
非组蛋白的功能是DNA 复制、RNA转录活动的调控因子。
2.染色体的结构核体→螺线管→超螺线管→染色单体。
从舒展的DNA双螺旋经四级折叠,压缩到最短的中期时,DNA分子缩短约5000~10000倍。
二、DNA是主要的遗传物质l.噬菌体侵染细菌实验证实DNA是遗传物质实验步骤如下:2.肺炎双球菌的转化实验证实DNA是遗传物质3.烟草花叶病毒(CMV)的重建说明CMV是不具DNA的病毒,RNA是遗传物质三、DNA的结构和功能1.DNA的结构DNA是四种脱氧核苷酸的多聚体,见下图:DNA的一级结构DNA的主干由磷酸和脱氧核糖交互组成,磷酸和糖由3’、5’一磷酸二酯键联结在一起。
碱基接在每一脱氧核糖的1’碳上其结构要点如下:(1)两条DNA链反向平行,一条走向是5’→3’,另一条走向是3’→5’,两条互补链相互缠绕,形成双螺旋状。
(2)碱基配对不是随机的。
腺嘌呤(A)通过两个氢键与胸腺嘧啶(T)配对,鸟嘌呤(G)通过三个氢键与胞嘧啶(C)配对(见右图)。
GC对丰富的DNA比AT对丰富的DNA更为稳定。
(3)DNA的双螺旋结构中,碱基顺序没有限制性,但是碱基对的顺序却为一种DNA分子提供了它性质上的特异性。
(4)双链DNA具有不同的构型,其中3种具有生物学上重要性。
①B—DNA:右旋,正常生理状态下的常见形式。
②A-DNA:右旋,脱水状态下的常见形式。
③Z—DNA:左旋,这种结构可能与真核生物中基因活性有关。
第七章基因的表达与调控(上)——原核基因表达调控模式(一)基本概念1.基因表达:细胞在生命过程中,把蕴藏在DNA中的遗传信息经过转录和翻译,转变成为蛋白质或功能RNA分子的过程称为基因表达。
2.基因表达调控:围绕基因表达过程中发生的各种各样的调节方式都统称为基因表达调控。
rRNA或tRNA的基因经转录和转录后加工产生成熟的rRNA或tRNA,也是rRNA或tRNA 的基因表达,因为rRNA或tRNA就具有在蛋白质翻译方面的功能。
3.组成型表达:指不大受环境变动而变化的一类基因表达。
如DNA聚合酶,RNA聚合酶等代谢过程中十分必需的酶或蛋白质的表达。
管家基因:某些基因在一个个体的几乎所有细胞中持续表达,通常被称为管家基因。
管家基因无论表达水平高低,较少受到环境因素的影响。
在基因表达研究中,常作为对照基因适应型表达:指环境的变化容易使其表达水平变动的一类基因表达。
应环境条件变化基因表达水平增高或从无到有的现象称为诱导,这类基因被称为可诱导的基因;相反,随环境条件变化而基因表达水平降低或变为不表达的现象称为阻遏,相应的基因被称为可阻遏的基因。
4.结构基因:编码蛋白质或功能性RNA的任何基因。
所编码的蛋白质主要是组成细胞和组织基本成分的结构蛋白、具有催化活性的酶和调节蛋白等。
原核生物的结构基因一般成簇排列,真核生物独立存在。
结构基因簇由单一启动子共同调控。
调节基因:参与其他基因表达调控的RNA或蛋白质的编码基因。
①调节基因编码的调节物质通过与DNA上的特定位点结合控制转录是调控的关键。
②调节物与DNA特定位点的相互作用能以正调控的方式(启动或增强基因表达活性调节靶基因,也能以负调控的方式(关闭或降低基因表达活性)调节靶基因。
操纵子:由操纵基因以及相邻的若干结构基因所组成的功能单位,其中结构基因的转录受操纵基因的控制。
(二)原核基因调控的分类和主要特点一、原核生物的基因调控特点:(1)基因调控主要发生在转录水平上,形式主要是操纵子调控.(2)有时也从DNA水平对基因表达进行调控,实质是基因重排。
原核生物基因表达调控概述基因表达调控是生物体内基因表达调节控制机制,使细胞中基因表达的过程在时间,空间上处于有序状态,并对环境条件的变化做出适当的反应复杂过程。
1.基因表达调控意义在生命活动中并不是所有的基因都同时表达,代谢过程中所需各种酶和蛋白质基因以及构成细胞化学成分的各种编码基因,正常情况下是经常表达的,而与生物发育过程有关的基因则需在特定的时空才表达,还有许多基因被暂时的或永久的关闭而不来表达。
2.原核基因表达调控特点原核生物基因表达调控存在于转录和翻译的起始、延伸和终止的每一步骤中。
这种调控多以操纵子为单位进行,将功能相关的基因组织在一起,同时开启或关闭基因表达即经济又有效,保证其生命活动的需要。
调控主要发生在转录水平,有正、负调控两种机制在转录水平上对基因表达的调控决定于DNA的结构,RNA 聚合酶的功能、蛋白质因子及其他小分子配基的相互作用。
细菌的转录和翻译过程几乎在同一时间内相互偶联。
细胞要控制各种蛋白质在不同时期的表达水平,有两条途径:(1)细胞控制从其DNA模板上转录其特异的mRNA的速度,这是一条经济的途径,可减少从mRNA合成蛋白质的小分子物质消耗,这是生物长期进化过程中自然选择的结果,这种控制称为转录水平调控。
(2)在mRNA合成后,控制从mRNA翻译肽链速度,包括一些与翻译有关的酶及其复合体分子缔合的装配速度等过程。
这种蛋白质合成及其基因表达的控制称为翻译水平的调控。
二.原核生物表达调控的概念(1)细菌细胞对营养的适应细菌必须能够广泛适应变化的环境条件。
这些条件包括营养、水分、溶液浓度、温度,pH等。
而这些条件须通过细胞内的各种生化反应途径,为细胞生长的繁荣提供能量和构建细胞组分所需的小分子化合物。
(2)顺式作用元件和反式作用元件基因活性的调节主要通过反式作用因子与顺式作用元件的相互作用而实现。
反式作用因子的编码基因与其识别或结合的靶核苷酸序列在同一个DNA分子上。
RNA聚合酶是典型的反式作用因子。
原核生物基因表达的调控一、名词解释1、Operon操纵子:一个或几个结构基因与一个调节基因和一个操纵基因,加上启动子构成一个操纵单元,这个单元称为操纵子。
在操纵子中,结构基因产生mRNA并作为模板合成蛋白质;而调节基因则产生一种阻遏蛋白与操纵基因相互作用;阻遏蛋白与操纵基因结合从而阻碍了结构基因转录成为mRNA;在诱导过程中,诱导物通过与阻遏蛋白相结合而阻止阻遏蛋白与操纵基因结合。
2. CAP:环腺苷酸(cAMP)受体蛋白CRP(cAMP receptor protein ),cAMP与CRP结合后所形成的复合物称激活蛋白CAP(cAMP activated protein )3.Attenuator弱化子:在操纵区与结构基因之间的一段可以终止转录作用的核苷酸序列。
4. 魔斑:当细菌生长过程中,遇到氨基酸全面缺乏时,细菌将会产生一个应急反应,停止全部基因的表达。
产生这一应急反应的信号是鸟苷四磷酸(ppGpp)和鸟苷五磷酸(pppGpp)。
PpGpp与pppGpp的作用不只是一个或几个操纵子,而是影响一大批,所以称他们是超级调控子或称为魔斑。
5. 上游启动子元件:是指对启动子的活性起到一种调节作用的DNA序列,-10区的TA TA、-35区的TGACA及增强子,弱化子等。
二、填空题1.启动子中的元件通常可以分为两种:()和()。
2. 因表达正调控系统中,加入调节蛋白后,基因表达活性被,这种调节蛋白被称为。
在负调控系统中,加入调节蛋白后,基因表达活性被,这种调节蛋白被称为。
3. 糖对细菌有双重作用;一方面();另一方面()。
所以需要一个不依赖于cAMP—CRP的启动子S2进行本底水平的永久型合成;同时需要一个依赖于cAMP—CRP的启动子S1对高水平合成进行调节。
有G时转录从()开始,无G时转录从()开始。
三、选择题1、如果在没有----- -----存在时基因是表达的,加入这种----- ----后,基因的活性被关闭,这种控制系统叫做负调控系统。
原核⽣物基因表达调控概述原核⽣物基因表达调控概述基因表达调控是⽣物体内基因表达调节控制机制,使细胞中基因表达的过程在时间,空间上处于有序状态,并对环境条件的变化做出适当的反应复杂过程。
1.基因表达调控意义在⽣命活动中并不是所有的基因都同时表达,代谢过程中所需各种酶和蛋⽩质基因以及构成细胞化学成分的各种编码基因,正常情况下是经常表达的,⽽与⽣物发育过程有关的基因则需在特定的时空才表达,还有许多基因被暂时的或永久的关闭⽽不来表达。
2.原核基因表达调控特点原核⽣物基因表达调控存在于转录和翻译的起始、延伸和终⽌的每⼀步骤中。
这种调控多以操纵⼦为单位进⾏,将功能相关的基因组织在⼀起,同时开启或关闭基因表达即经济⼜有效,保证其⽣命活动的需要。
调控主要发⽣在转录⽔平,有正、负调控两种机制在转录⽔平上对基因表达的调控决定于DNA的结构,RNA 聚合酶的功能、蛋⽩质因⼦及其他⼩分⼦配基的相互作⽤。
细菌的转录和翻译过程⼏乎在同⼀时间内相互偶联。
细胞要控制各种蛋⽩质在不同时期的表达⽔平,有两条途径:(1)细胞控制从其DNA模板上转录其特异的mRNA的速度,这是⼀条经济的途径,可减少从mRNA合成蛋⽩质的⼩分⼦物质消耗,这是⽣物长期进化过程中⾃然选择的结果,这种控制称为转录⽔平调控。
(2)在mRNA合成后,控制从mRNA翻译肽链速度,包括⼀些与翻译有关的酶及其复合体分⼦缔合的装配速度等过程。
这种蛋⽩质合成及其基因表达的控制称为翻译⽔平的调控。
⼆.原核⽣物表达调控的概念(1)细菌细胞对营养的适应细菌必须能够⼴泛适应变化的环境条件。
这些条件包括营养、⽔分、溶液浓度、温度,pH等。
⽽这些条件须通过细胞内的各种⽣化反应途径,为细胞⽣长的繁荣提供能量和构建细胞组分所需的⼩分⼦化合物。
(2)顺式作⽤元件和反式作⽤元件基因活性的调节主要通过反式作⽤因⼦与顺式作⽤元件的相互作⽤⽽实现。
反式作⽤因⼦的编码基因与其识别或结合的靶核苷酸序列在同⼀个DNA分⼦上。
第七讲原核生物的基因调控科学家把这个从DNA到蛋白质的过程称为基因表达(gene expression),对这个过程的调节就称为基因表达调控(gene regulation或gene control)。
要了解动、植物发展发育的规律、形态布局特征和生物学功能,就必需弄清楚基因表达调控的时间和空间概念,掌握了基因表达调控的奥秘,我们手中就有了一把揭示生物学微妙的金钥匙。
基因表达调控主要暗示在以下几个方面:①转录程度上的调控(transcriptional regulation);②mRNA加工成熟程度上的调控(differential processing of RNAtranscript);③翻译程度上的调控(differential translation of mRNA).原核生物中,营养状况(nutritionalstatus)和环境因素(environmental factor)对基因表达起着举足轻重的影响。
在真核生物尤其是高等真核生物中,激素程度(hormone level)和发育阶段(developmental stage)是基因表达调控的最主要手段,营养和环境因素的影响力大为下降。
二、基因表达调控的底子道理〔一〕基因表达的多级调控基因的布局活化、转录起始、转录后加工及转运、mRNA降解、翻译及翻译后加工及蛋白质降解等均为基因表达调控的控制点。
可见,基因表达调控是在多级程度长进行的复杂事件。
此中转录起始是基因表达的底子控制点。
四个底子的调控点:〔1〕基因布局的活化。
DNA表露碱基后RNA聚合酶才能有效结合。
活化状态的基因暗示为:1.对核酸酶敏感;2.结合有非组蛋白及修饰的组蛋白;3.低甲基化。
〔2〕转录起始。
最有效的调节环节,通过DNA元件与调控蛋白彼此作用来调控基因表达。
〔3〕转录后加工及转运。
RNA编纂、剪接、转运。
〔4〕翻译及翻译后加工。
翻译程度可通过特异的蛋白因子阻断mRNA 翻译翻译后对蛋白的加工、修饰也是底子调控环节。
〔二〕基因转录激活调节底子要素1.DNA序列原核生物大大都基因表达调控是通过把持子机制实现的。
把持子通常由2个以上的编码序列与启动序列、把持序列以及其他调节序列在基因组中成簇串联组成。
启动序列是RNA聚合酶结合并起动转录的特异DNA序列。
多种原核基因启动序列特定区域内,通常在转录起始点上游-10及-35区域存在一些相似序列,称为共有序列。
大肠杆菌及一些细菌启动序列的共有序列在-10区域是TATAAT,又称Pribnow盒〔PribnowBox〕,在-35区域为TTGACA。
这些共有序列中的任一碱基突变或变异城市影响RNA聚合酶与启动序列的结合及转录起始。
因此,共有序列决定启动序列的转录活性大小。
把持序列是原核阻遏蛋白的结合位点。
当把持序列结合阻遏蛋白时会阻碍RNA聚合酶与启动序列的结合,或使RNA聚合酶不克不及沿DNA向前移动,阻遏转录,介导负性调节。
原核把持子调节序列中还有一种特异DNA 序列可结合激活蛋白,使转录激活,介导正性调节。
顺式作用元件就是指可影响自身基因表达活性的DNA序列。
在不同真核基因的顺式作用元件中会时常发现一些共有序列,如TA TA盒、CCAA T 盒等。
这些共有序列就是顺式作用元件的核心序列,它们是真核RNA聚合酶或特异转录因子的结合位点。
顺式作用元件通常长短编码序列。
顺式作用元件并非都位于转录起点上游〔5′端〕。
按照顺式作用元件在基因中的位置、转录激活作用的性质及阐扬作用的方式,可将真核基因的这些功能元件分为启动子、增强子及沉默子等。
2.调节蛋白原核调节蛋白分为三类:特异因子、阻遏蛋白和激活蛋白。
特异因子决定RNA聚合酶对一个或一套启动序列的特异性识别和结合能力。
阻遏蛋白可结合把持序列,阻遏基因转录。
激活蛋白可结合启动序列邻近的DNA序列,促进RNA聚合酶与启动序列的结合,增强RNA聚合酶活性。
真核调节蛋白又称转录因子。
绝大大都真核转录调节因子由某一基因表达后,通过与特异的顺式作用元件彼此作用〔DNA-蛋白质彼此作用〕反式激活另一基因的转录,故称反式作用因子。
有些基因产物可特异识别、结合自身基因的调节序列,调节自身基因的开启或关闭,这就是顺式作用。
具有这种调节方式的调节蛋白称为顺式作用蛋白。
3.DNA-蛋白质、蛋白质和蛋白质彼此作用DNA-蛋白质彼此作用指反式作用因子与顺式作用元件之间的特异识别及结合。
这种结合通常长短共价结合。
绝大大都调节蛋白结合DNA前需通过蛋白质-蛋白质彼此作用形成二聚体或多聚体。
所谓二聚化就是指两分子单体通过必然的布局域结合成二聚体,它是调节蛋白结合DNA时最常见的形式。
由同种分子形成的二聚体称同二聚体,异种分子间形成的二聚体称异二聚体。
除二聚化或多聚化反响,还有一些调节蛋白不克不及直接结合DNA,而是通过蛋白质一蛋白质彼此作用间接结合DNA,调节基因转录。
4.RNA聚合酶DNA元件与调节蛋白对转录激活的调节最终是由RNA聚合酶活性表达的。
启动序列/启动子的布局,调节蛋白性质对RNA聚合酶活性影响很大。
(1)启动序列或启动子与RNA聚合酶活性:原核启动序列或真核启动子是由转录起始点、RNA聚合酶结合位点及控制转录的调节组件组成。
会影响其与RNA聚合酶的亲和力,而亲和力大小那么直接影响转录起始频率。
〔2〕调节蛋白与RNA聚合酶活性:一些特异调节蛋白在适当环境信号刺激下在细胞内表达,随后这些调节蛋白通过DNA-蛋白质彼此作用、蛋白质-蛋白质彼此作用影响RNA聚合酶活性,从而使根底转录频率发生改变,呈现表达程度变化。
三、原核基因表达调控原核生物的调控主要发生在转录程度上,按照调节机制的不同分为负转录调控和正转录调控。
在负调控系统中,调节基因的产物是阻遏蛋白〔repressor〕,起着阻止布局基因转录的作用。
按照作用特征又可分为负诱导作用和负阻遏作用。
在负诱导系统中,阻遏蛋白不与效应物〔诱导物〕结合时,布局基因不转录;在负控阻遏系统中,阻遏蛋白与效应物结合时,布局基因不转录。
在正转录调控系统中,调节基因的产物是激活蛋白〔activator〕。
在正控诱导系统中,诱导物的存在使激活蛋白处于活性蛋白;在正控阻遏系统中,效应物分子的存在是激活蛋白处于非活性状态。
〔一〕原核基因调节特点σ因子决定mRNA识别特异性原核生物细胞仅含有一种RNA聚合酶,核心酶参与转录耽误,全酶司转录起始。
在转录起始阶段,σ亚基〔又称σ因子〕识别特异启动序列;不同的σ因子决定特异基因的转录激活,决定tRNA、mRNA和rRNA基因的转录。
〔二〕乳糖把持子调节机制1乳糖把持子的发现细菌能随环境的变化,迅速改变某些基因表达的状态,这就是很好的基因表达调控的尝试型。
人们就是从研究这种现象开始,翻开认识基因表达调控分子机理的窗口的。
大肠杆菌可以操纵葡萄糖、乳糖、麦芽糖、阿拉伯糖等作为碳源而发展繁殖。
当培养基中有葡萄糖和乳糖时,细菌优先使用葡萄糖,当葡萄糖耗尽,细菌遏制发展,颠末短时间的适应,就能操纵乳糖,细菌继续呈指数式繁殖增长(图19-1)。
说明酶可以诱导。
在不含乳糖及β-半乳糖苷的培养基中,lac+基因型每个大肠杆功细胞内大约只有1-2个酶分子。
如果在培养基中参加乳糖,酶的浓度很快达到细胞总蛋白量的6%或7%,每个细胞中可有超过105个酶分子。
当有乳糖供应时,在无葡萄糖培养基中发展的lac+细菌中将同时合成β-半乳糖苷酶和透过酶,如图。
用32P标识表记标帜,成果说明培养基中参加乳糖1-2min后,编码β-半乳糖苷酶和透过酶的lac mRNA量就迅速增加。
去掉乳糖后,lac mRNA 量当即下降到几乎无法检测到,说明乳糖确实能激发lac RNA的合成。
事实上,研究诱导作用时很少使用乳糖,因为培养基中的乳糖会被诱导合成的β-半乳糖苷酶所催化降解,从而使其浓度不竭发生变化。
尝试中通常使用乳糖类似物:异丙基硫基半乳糖苷〔IPTG〕、琉甲基半乳糖苷〔TMC〕和O-硝基半乳糖苷〔ONPG〕。
它们都是高效诱导物,因为它们都不是半乳糖苷酶的底物,所以又称为安抚性诱导物〔gratuitous inducer〕。
为了证明诱导物的作用是诱导新合成酶而不是将已存在于细胞中的酶前体物转化成有活性的酶,把大肠杆菌细胞放在加有放射性35S标识表记标帜的氨基酸但没有任何半乳糖诱导物的培养基中繁殖几代,然后再将这些带有放射活性的细菌转移到不含35S、无放射性的培养基中,随着培养基中诱导物的参加,β-半乳糖苷酶便开始合成。
别离β-半乳糖苷酶,发现这种酶无35S标识表记标帜。
说明酶的合成不是由前体转化而来的,而是参加诱导物后新合成的。
把持子模型的提出—莫洛(Monod)和雅各布(Jacob)获1965年诺贝尔生理学和医学奖1940年,Monod发现:细菌在含葡萄糖和乳糖的培养基上发展时,细菌先操纵葡萄糖,葡萄糖用完后,才操纵乳糖;在糖源转变期,细菌的发展会呈现停顿。
即发生“二次发展曲线〞。
1947年,陈述:“酶的适应现象及其在细胞分化中的意义〞。
1951年,Monod与Jacob合作。
发现两对基因:Z基因:与合成β-半乳糖苷酶有关;I基因:决定细胞对诱导物的反响。
Szilard:I基因决定阻遏物的合成,当阻遏物存在时,酶无法合成,只有有诱导物存在,才能去掉该阻遏物。
Jacob:布局基因旁有开关基因〔即把持基因〕,阻遏物通过与开关基因的结合,控制布局基因的表达。
2布局大肠杆菌的乳糖把持子含Z、Y及A三个布局基因,别离编码β-半乳糖苷酶、透酶、乙酰基转移酶,此外还有一个把持序列O、一个启动序列P 及一个调节基因Ⅰ。
Ⅰ基因编码一种阻遏蛋白,后者与O序列结合,使把持子受阻遏而处于转录掉活状态。
在启动序列P上游还有一个分解〔代谢〕物基因激活蛋白CAP结合位点,由P序列、O序列和CAP结合位点共同构成LAC把持子的调控区,三个酶的编码基因即由同一调控区调节,实现基因产物的协调表达。
A P-O区P区是从I基因结束到mRNA转录开始点为止,而O区的范围是按捺物结合区。
mRNA是从第85对碱基开始的,所以P区共84个碱基,按捺物结合区从78-112,共35对碱基,和P区有7个碱基的重复。
使这段序列可能无法同时结合RNA聚合酶和阻遏蛋白,也可能虽然可以同时结合,但无法形成开放的转录起始复合物。
P-O区碱基对的命序,是从mRNA起始的第一个核苷酸为+1与转录标的目的一致的为正,与转录标的目的相反的为负。
所以P区从-84到-1,按捺物庇护区是-7到28。
B阻遏蛋白的负性调节当大肠杆菌在没有乳糖的环境中保留时,1ac把持元处于阻遏状态。
i 基因在其自身的启动子Pi控制下,低程度、组成性表达发生阻遏蛋白R,每个细胞中仅维持约10个分子的阻遏蛋白。
R以四聚体形式与把持子O结合,阻碍了RNA聚合酶与启动子P1ac的结合,阻止了基因的转录起动。