动物组织基因组的提取ppt课件
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实验一动物组织基因组DNA的提取一、实验目的掌握从动物组织中提取总DNA的方法。
二、实验原理DNA是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象,为了进行测序、杂交、基因表达、文库构建等实验,获得高分子量和高纯度的基因组DNA是非常重要的前提,因此基因组DNA的提取也是分子生物学试验技术中最重要、最基本的操作之一。
染色体存在于细胞核中,外有核膜及胞膜。
从组织中提取DNA必须先将组织分散成单个细胞,然后破碎胞膜及核膜,使染色体释放出来,同时去除与DNA结合的组蛋白及非组蛋白。
整个实验可分为细胞裂解、DNA分离与纯化和DNA 的洗脱收集。
1.细胞裂解:酶法(蛋白酶K)。
2. DNA 分离与纯化:细胞破碎后,常使用吸附材料结合方法去除杂质和纯化DNA,主要有硅基质材料、阴离子交换树脂和磁珠等。
本实验采用TIANGEN血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒中的硅基质材料的离心吸附柱。
硅基质材料吸附核酸的原理,主要利用DNA在高盐低pH值环境下与硅基质材料相结合,在低盐高pH值环境下与硅基质材料脱离的特征,高效、专一吸附DNA,可最大限度去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物。
三、材料、试剂和设备1.材料:动物组织2.试剂:TIANGEN血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒,无水乙醇等3.设备:离心机,微量移液器等四、实验步骤1.处理材料:取动物组织10mg,尽量切碎,加200μl 缓冲液GA,振荡至彻底悬浮。
2.加入20μl蛋白酶K溶液,混匀后56℃水浴,直至组织溶解(不同组织裂解时间不同,通常需1-3小时即可完成)。
简短离心以去除管盖内壁的水珠,再进行下一步骤。
(细胞裂解)3.加入200μl缓冲液GB,充分颠倒混匀,70℃放置10分钟,溶液应变清亮,简短离心以去除管盖内壁水珠。
(溶解DNA)注意:加入缓冲液GB时可能会产生白色沉淀,一般70℃放置时会消失,不会影响后续实验。
如溶液未变清亮,说明细胞裂解不彻底,可能导致提取DNA 量少和提取出的DNA不纯。
动物组织DNA提取1样品预处理取新鲜组织25-50mg(组织不宜过多,否则裂解不完全堵塞离心柱),组织剪碎或者切成小块,放入预冷研钵,快速加入液氮用力研磨,或直接放入匀浆器中匀浆。
冻存组织同样使用研钵研磨或匀浆器快速用力研磨或匀浆(冻存组织避免反复冻融,使细胞破碎,内源酶外泄影响基因组DNA提取)2.加入100ulPBS到研磨好的样品中,样品均匀悬浮于PBS3.加600ul的Lysis Buffer,颠倒混匀,如需消化RNA,可加入20ulRNase A,颠倒混匀,室温放置5min4.加入10ul ProteinaseK,混匀,56度水浴45-60min,(颠倒混匀数次,裂解完全液体则清亮粘稠,此步骤可过夜)5 .12000rpm 离心10min,上清转入新的离心管,加800ul无水乙醇,混匀6.液体分次转入离心柱(一次加不完可分次加入),12000rpm 离心1min,弃废液。
7.加入700ulWash bufferA(用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm 离心30s-1min,弃废液。
8. 加入700ulWash bufferB(用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm 离心30s-1min,弃废液。
9.加入500ulWash bufferB,12000rpm 离心30s-1min,弃废液。
10.再次12000rpm 离心2min,将离心柱置于心得离心管中,打开离心柱盖,于室温或37度恒温箱放置5-10min,直至无明显乙醇味。
11.在硅基质膜中央加入50-200ulTEbuffer(事先预热55-65度)置于室温2-5min,12000rpm 离心30s。
12. 离心得到的溶液再次加入离心柱中,室温放置2min,12000rpm 离心2min,所得溶液为纯化后的基因组DNA.纯化效果检测:取2-5ulDNA产物,0.7%agarose电泳检测DNA分子的完整性和紫外分光光度计检测浓度和纯度。