药物治疗后肾癌EMT相关基因表达谱分析及对预后的影响
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CYP27A1基因表达与肝癌患者临床表型相关性及其预后作用瞿兵The prognostic relevance of CYP27A1 in patients with hepatocarcinomaBing Qu摘要目的:从基因表达水平探讨肝癌患者的独立预后因素,为开发新的治疗肝癌靶向药物奠定基础。
方法:本研究通过在GEO数据下载肝癌基因表达数据GSE14520,分析CYP27A1与肝癌患者年龄、性别、 PRMS分类、血清ALT水平、肿瘤大小、结节数目、肝硬化、TNM分期、BCLC分期、CLIP分期以及血清AFP水平等临床表型的相关性,以及CYP27A1与肝癌患者临床预后指标(无进展生存期、总生存期)的关系,明确CYP27A1在对肝癌细胞的作用机制。
结果:相较于正常肝脏组织,CYP27A1在肝癌中表达明显下调;CYP27A1高表达组和CYP27A1低表达组患者在年龄和性别分布上及血清ALT水平和肝硬化情况无明显差异,CYP27A1高表达组患者中PRMS分类、肿瘤大小、肿瘤类型、TNM分期、BCLC分期、CLIP分期、血清AFP水平等临床表型均明显优于CYP27A1低表达组肝癌患者,CYP27A1高表达组肝癌患者的无进展生存期和总生存期明显优于CYP27A1低表达肝癌患者。
CYP27A1可能在细胞分裂、DNA复制及肿瘤增殖相关信号通路等生物学过程影响肝癌细胞增殖。
结论:CYP27A1或可作为肝癌患者独立预后因素,高表达CYP27A1的肝癌患者的临床预后明显优越与CYP27A1低表达肝癌患者。
关键词:肝癌;CYP27A1;临床表型;预后;AbstractBackground:hepatocarcinoma is one of most common cancers worldwide, and the prognosis of patients with hepatocarcinoma remains poor. Investigating the independent prognostic factors of hepatocarcinoma at gene-expression level might facilitate the development of novel agent for treating hepatocarcina. Methods: In the present study, we analyzed the correlation between the expression of CYP27A1 and the characteristics of hepatocarcina patients including age, gender, PRMS classification, ALT, main tumor size, multinodular, cirrhosis, TNM staging, BCLC staging, CLIP staging and AFP. Meanwhile, the progression free survival and overall survival of hepatocarcina patients were also analyzed. Gene set enrichment analysis (GSEA) was conducted to characterize the potential mechanisms regarding the impact of CYP27A1 on hepatocarcina cells. Results: Compared with normal liver tissues, the CYP27A1 was downregulated in tumor cells. No significant differences could be found between CYP27A1 high expression group and CYP27A1 low expression group regarding the age, gender and the serum ALT level of hepatocarcina patients. Patients with higher expression of CYP27A1 turned out to have better PRMS classification, tumor size, tumor type, TNM staging, BCLC staging, CLIP staging and serum AFP level (P<0.0001, P=0.003, P=0.071, P=0.01, P=0.007, P=0.004 and P=0.009, respectively), and patients in CYP27A1 high expression group proved to have better progression free survival and overall survival compared with patients in CYP low expression group. Our GSEA results suggested that CYP27A1 might influence the proliferation of hepatocarcinomathrough participating the mitotic spindle, spermatogenesis, G2M checkpoint, DNA repair, E2F target, MYC target, PI3K-AKT-mTOR signaling and unfolded protein response. Conclusions: CYP27A1 might be an independent prognostic factor for hepatocarcinoma patients, and patients with higher expression of CYP27A1were proved to have better survival than patients with lower expression of CYP27A1, while the exact mechanisms regarding the impact of CYP27A1 on the hepatocarcinoma cells remained to be elucidated.Keywords: hepatocarcinoma; CYP27A1; clinical phenotype; prognosis原发性肝胞癌(primary liver cancer)是起源于肝细胞或肝内胆管细胞的恶性肿瘤。
肾癌的基因表达谱及其临床意义的研究进展张守波1,2△,肖耀军1(综述),廖贤平1,2※(审校)(1.武警广东省总队医院泌尿外科,广州510507;2.河北医科大学,石家庄050001)中图分类号:R737.11文献标识码:A文章编号:1006-2084(2012)14-2194-03摘要:基因芯片技术是近年来形成和发展的一项新的分子生物学技术。
基因芯片技术能在转录水平高通量、大规模、平行地处理大量基因信息,尤其是近来全基因组基因芯片技术的出现,使全面、综合分析某些生命现象成为可能。
应用基因芯片技术检测肾肿瘤组织获得其基因表达谱,通过对表达谱的分析处理,发现肾肿瘤相关的特征性分子标志物,为肾癌的临床诊断、治疗、预后评估、病理分型,以及新药开发等方面提供帮助。
它的作用越来越巨大,正日益受到人们的重视。
关键词:肾癌;肾肿瘤;基因芯片;基因表达谱;原蛋白转化酶Research Progress of Gene Expression Profiling in Renal Carcinoma and the Clinical Significance ZHANG Shou-bo1,2,XIAO Yao-jun1,LIAO Xian-ping1,2.(1.Department of Urology,Chinese People's Armed Police Forces Guangdong Provincial Corps Hospital,Guangzhou510507,China;2.Hebei Medical University,Shijiazhuang050001,China)Abstract:Gene microarray is a new molecular biological technique developed in recent years,which can simultaneously deal with lots of gene information by high throughput,especially that the emergence of ge-nome-wide gene-chip technology in recent years makes it possible to analyze some phenomenon of life com-prehensively.The profile of measured samples of renal tumor tissue can be gained,then through the analysis of he expression profile,characteristic molecular markers of the disease can be discovered to help the clinical diagnosis,treatment,prognosis assessment,pathological classification and new medicine development,which displays a growing function drawing more attention nowadays.Key words:Renal cell carcinoma;Kidney tumor;Gene microarray;Gene expression profiling;Pro-protein convertase肾癌又称肾细胞癌,是成人最常见的一种肾实质恶性肿瘤。
肾癌又称肾细胞癌(Renal cell carcinoma,RCC),在我国RCC发病率呈现逐年上升趋势,男女比例为2.6:1[1]。
肾透明细胞癌(Renal clear cell carcinoma,ccRCC)是RCC中最常见的一种,约占RCC的75%~80%[2]。
目前肾脏CT和B超是国内诊断肾癌最常用的辅助检查方法。
RCC早期缺乏明显的临床症状,而且没有典型的肿瘤标志物供其早期诊断,部分RCC患者初次就诊时即为RCC晚期,无法进行手术,预后较差[3]。
随着分子生物学的进展,越来越多的LncRNA被证实参与了RCC细胞内多种重要的调控过程。
LncRNA是一类特殊类型的RNA,是指长度大于200bp的非编码RNA,主要存在于核内,研究表明,LncRNA参与了基因调控的基本过程,包括染色质的修饰和直接的转录调控,同时也调控转录后事件,根据LncRNA功能和涉及的分子机制可将其分为信号分子、诱饵分子、引导分子和支架分子等四类[4]。
LncRNA虽然不具有编码蛋白质的功能,但能在不同的肿瘤组织中过度表达或表达不足,在特定类型的癌症中,许多LncRNA已被证明是有效的潜在生物标志物[5]。
本文综述了LncRNA在肾癌分子领域发挥的作用,并探讨LncRNA作为肿瘤标志物在肾癌的诊断、治疗以及预后方面的研究进展。
1LncRNA用于RCC的诊断目前RCC的诊断金标准主要依赖于肾组织活检,但活检本身具有创伤性,难以重复检测且不适合用于大规模人群筛查[6],因此需要更加简便的诊断手段。
由于LncRNA可以在几种体液中检测到并可以抵抗核糖核酸酶介导的降解,因此它们有希望成为用于筛查肾癌的生物标志物。
无创血清学和尿液指标用于早期筛查诊断具有重要的临床价值。
研究表明,5-Ln⁃LncRNA在肾癌诊治及预后方面的研究进展程波1,邹菊2,向碧兰2,王倩2,刘威2,叶涛21.西南医科大学附属医院泌尿外科(泸州646000);2.西南医科大学临床医学院(泸州646000)【摘要】肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)是泌尿系统常见的肿瘤之一,且发病率逐年上升。
非小细胞肺癌组织中E M A表达水平与疾病预后的关系宁宇(解放军第21医院,河北张家口 07000)[摘要]观察非小细胞肺癌组织中上皮膜抗原(E M A)表达水平与疾病预后的关联性。
选择行肿瘤根治术的非小细胞肺癌患者84例(肿瘤组织标本84个),通过病理检查确诊,肺腺癌40例,肺鱗癌44例。
采 用免疫组化法测定E M A在84个肿瘤组织中表达水平,运用肯德尔等级相关系数(Kendall)、非参数Kaplan -m e i e r 法等分析非小细胞肺癌组织中E M A表达水平与病理类型、疾病预后的关系。
40例肺腺癌患者中E M A高表达率为70.0%,44例肺鱗癌患者中E M A高表达率为34. 1%,肺腺癌E M A高表达率明显高于肺鱗癌(P <0.05);E M A表达水平与曱状腺转录因子(T T F-1)表达水平呈正相关关系(=0.439,/?<0.05);运用非参数的Kaplan - m e i e r法分析显示,I I B〜1期肺鱗癌、肺腺癌组织中E M A表达水平与疾病预后没有明显的相关性(尸均>0. 05),而I〜H A期肺鱗癌组织中E M A高表达,预后相对于中晚期明显较差(P<0.05)。
E M A表达水平与肺癌的临床分型、肿瘤细胞侵袭、分化以及2年内复发或转移密切相关,尤其是E M A表达水平对I〜n A肺鱗癌预后有着较高的预示作用,可能是以后临床研究早期肺鱗癌疾病预后的新焦点。
[关键词]非小细胞肺癌;疾病预后;上皮膜抗原;曱状腺转录因子doi:10.3969/j. issn. 1008 -8849.2018.27.014[中图分类号]R734.2[文献标识码]B[文章编号]1008 -8849(2018)27 -3009 -04非小细胞肺癌(N SCLC)是肺癌最常见的临床类型,癌细胞的侵袭能力较强,手术后极易复发或转 移,导致预后差,因而目前肺癌研究的重点是了解NSCLC临床侵袭及转移的机制,探寻与NSCLC预散结之功;枳实可化痰散结,穿心莲、白花蛇舌草可 解毒散结,夏枯草、郁金、香附行气活血,桔梗宣肺利 咽、理气活血,甘草清热解毒、调和诸药;诸药合用共 奏理气解毒、活血散瘀之功。
miR-30b-5p作为肾癌预后标志物的回顾性队列研究共3篇miR-30b-5p作为肾癌预后标志物的回顾性队列研究1miR-30b-5p作为肾癌预后标志物的回顾性队列研究肾癌是一种常见的恶性肿瘤,由于其亚型多样性以及预后差异,使得肾癌治疗方案的选择变得非常困难。
因此,寻找预后标志物已成为肾癌研究的重要方向之一。
miRNA (MicroRNA)作为一种短链RNA 分子,参与了很多细胞生物学过程,对于许多肿瘤的发生和发展有着重要的影响。
近年来,越来越多的研究表明miRNA在肾癌治疗中具有重要的生物学意义,而miR-30b-5p是其中一个具有很大潜在价值的miRNA。
miR-30b-5p是一种保守的miRNA,其在人类和哺乳动物中均有表达。
研究显示,miR-30b-5p在许多经典肿瘤中的表达水平通常比正常组织低。
因此,研究人员开始着重关注miR-30b-5p在肾癌中的作用。
有些研究表明,肾癌中miR-30b-5p的表达水平与肿瘤的生长和转移有着密切的联系。
在miR-30b-5p水平被下调的患者中,肿瘤的侵袭性更强,转移风险也更高。
为了更好地了解miR-30b-5p在肾癌中的作用,一些研究人员进行了大规模回顾性队列研究。
他们从多个来源收集了大量肾癌组织样本和临床数据,将患者按照miR-30b-5p的表达水平进行分类,然后进行各种生存分析。
研究结果显示,miR-30b-5p的低表达水平与肾癌患者生存率的降低密切相关。
在低miR-30b-5p表达水平的患者中,肿瘤的侵袭性更强,转移风险也更高。
另外,低表达的患者更容易出现肾癌复发情况,且其疗效也不如高表达的患者显著。
此外,研究人员进一步明确了miR-30b-5p的作用机制。
miR-30b-5p通过与多个靶点结合,调节了多种信号通路的激活状态。
例如,miR-30b-5p可以与恶性肿瘤细胞的增殖、凋亡、血管生成等过程相关的关键基因结合,并影响这些基因的表达量。
这些研究表明,miR-30b-5p在肾癌的发生和发展中发挥着非常重要的作用。
宫颈癌细胞系中EMT相关基因的表达及其意义李晓锋;陈葳;李旭;赵乐【摘要】Objective Epithelial-mesenchymal transition (EMT)is thought to be one of the important mechanisms of invasion and metastasis of carcinoma cells,which includes down-regulation of epithelial cell markers and up-regulation of mesenchymal markers.The aim of our study was to investigate whether EMT occurs in cervical cancer cell lines and determine the proper cell model to study the mechanism of EMT in cervical cancer.Methods We detected the mRNA expression of EMT-associated genes,namely,E-cadherin,vimentin,Snail and Slug,in four cervical cancer cell lines using reverse transcriptase-polymerase chain reaction analysis.E-cadherin and vimentin protein expression levels were examined using Western blotting. Snail and Slug protein expression levels were examined by immunocytochemical staining.Results Vimentin and Snail mRNA was expressed in all of the four cell lines.E-cadherin and Slug mRNA was expressed in SiHa,HeLa and RJC-1 cells except CS1213 cells.E-cadherin protein was found in SiHa and RJC-1 cells whereas vimentin protein was detected in HeLa and CS1213.Snail protein was expressed in all of the four cell lines.Slug protein was found in SiHa,HeLa and RJC-1 cells.Conclusion It seems that HeLa and CS1213 display the phenotype of mesenchymal cells whereas SiHa and RJC-1 remain the epithelial phenotype.%目的上皮-间质转化(EMT)是上皮来源的恶性肿瘤侵袭转移的重要机制之一,其特征为上皮细胞标志物表达下调(E-cadherin等)而间质细胞标志物(vimentin等)表达上调.本研究旨在探讨人宫颈癌细胞系EMT相关标志物的表达情况,以确定宫颈癌细胞是否发生EMT,并为确定相关的细胞研究模型奠定基础.方法采用逆转录PCR方法检测4株人宫颈癌细胞系(SiHa、HeLa、RJC-1、CS1213)中E-cadherin、vimentin、Snail和Slug mRNA的表达;Western blotting检测E-cadherin和vimentin的蛋白表达;免疫细胞化学方法检测Snail和Slug的蛋白表达.结果 vimentin和Snail mRNA在4种细胞中均有表达,E-cadherin和Slug mRNA在SiHa、HeLa 和RJC-1细胞表达.E-cadherin蛋白在SiHa和RJC-1细胞表达,vimentin蛋白在HeLa和CS1213细胞表达.Snail蛋白在4个细胞株都有表达,Slug蛋白在SiHa、HeLa和RJC-1细胞表达.结论 HeLa和CS1213表现出间质细胞表型,SiHa和RJC-1则表现为上皮细胞表型.【期刊名称】《西安交通大学学报(医学版)》【年(卷),期】2017(038)002【总页数】5页(P210-214)【关键词】宫颈癌;上皮-间质转化(EMT);E-cadherin;vimentin;Snail;Slug【作者】李晓锋;陈葳;李旭;赵乐【作者单位】西安交通大学第一附属医院病理科,陕西西安 710061;西安交通大学第一附属医院检验科,陕西西安 710061;西安交通大学第一附属医院转化医学中心,陕西西安 710061;西安交通大学第一附属医院转化医学中心,陕西西安 710061【正文语种】中文【中图分类】R737.3侵袭和转移是恶性肿瘤的基本生物学特征,其机制一直是肿瘤研究领域的重要课题。
药物基因组学影响肾移植术后他克莫司疗效的研究进展
李欢周玉生李荣
【期刊名称】《临床与病理杂志》
【年(卷),期】2017(037)004
【摘要】他克莫司(tacrolimus,FK506)是从链霉菌属中分离出来的钙调磷酸酶抑制剂,是用于预防器官移植排斥反应的一线免疫抑制剂。
他克莫司作为免疫抑制剂,具有良好的治疗效果。
然而,其治疗窗狭窄和药动学个体差异巨大,容易导致免疫抑制不足或过度抑制而诱导肾毒性、糖尿病等不良反应,目前是困扰临床实践的关键问题。
【总页数】4页(P868-871)
【作者】李欢周玉生李荣
【作者单位】南华大学药物药理研究所,湖南衡阳421001
【正文语种】中文
【中图分类】R699.2
【相关文献】
1.药物基因组学影响肾移植术后他克莫司疗效的研究进展 [J], 李欢
2.肾移植患者服用他克莫司的药物基因组学因素分析 [J], 刘静;王虎军;赵刚涛
3.药物基因组学对器官移植后他克莫司药动学影响的研究进展 [J], 李丹滢;葛卫红
4.药物代谢酶CYP3A5基因多态性与肾移植术后他克莫司和环孢素A早期临床疗效的相关性 [J], 潘晓东;陈文伟;倪晓洁;王瑾珺;吴存造;蔡勇;夏鹏;郑少玲;陈必成
5.药物基因组学对肝移植术后免疫抑制药物疗效的影响研究进展 [J], 陈凯;杨洪吉
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基因表达谱在疾病发生与治疗中的应用前景近年来,随着生物技术和计算机技术的飞速发展,基因表达谱技术已经成为了研究疾病发生和治疗的重要工具。
基因表达谱指的是在特定条件下,某个生物体中所有基因的转录水平。
通过对基因表达谱的分析,可以了解某些基因在特定疾病状态下的表达差异,并为疾病诊断和治疗提供有力的支持。
1. 疾病发生的基因表达谱分析在疾病的发生过程中,由于某些基因的表达水平的变化,可能导致特定的生物学、生化和免疫反应失衡,从而引起疾病。
通过对某些疾病的基因表达谱进行分析,可以发现疾病发生的分子机制,同时也可以为诊断和治疗提供重要的线索。
例如,在肝癌研究中,研究人员对不同的肝癌组织和正常组织进行了基因表达谱分析。
他们发现,在肝癌组织中存在一些与肿瘤恶性程度相关的基因,这些基因的表达水平与肝癌的预后密切相关。
在临床实践中,通过对这些基因进行检测,可以帮助医生更准确地预测肝癌的预后,从而选择最佳的治疗方案。
2. 基因表达谱在疾病诊断中的应用除了了解疾病分子机制,基因表达谱还可以用于疾病的诊断。
由于基因表达谱可以反映细胞或组织的状态,因此可以利用基因表达谱来鉴别不同疾病或者不同疾病病程的状态。
例如,在乳腺癌的研究中,研究人员通过对基因表达谱的分析,发现了一些不同于正常组织的基因表达差异。
通过在大量乳腺癌病例中检测这些基因,可以帮助医生更加准确地诊断乳腺癌。
除了乳腺癌,基因表达谱还可以用于其他疾病的诊断,例如白血病、肺癌、结直肠癌等。
通过分析疾病相关基因的表达谱,可以帮助医生更加准确地进行疾病的诊断和鉴别诊断。
3. 基因表达谱在疾病治疗中的应用除了疾病的诊断,基因表达谱还可以为疾病治疗提供重要的支持。
通过对疾病相关基因的分析,可以发现一些潜在的治疗靶点,并为药物研发提供重要的线索。
例如,在肝癌治疗中,研究人员发现某些抑癌基因的表达水平降低,而某些促癌基因的表达水平升高。
通过选择合适的干预目标,可以借助药物或者基因治疗的手段来抑制肿瘤生长和扩散,从而控制疾病进程。
癌症组织基因表达谱分析及对治疗的指导作用癌症是一种非常复杂的疾病,其发生原因可能涉及到遗传因素、环境因素、免疫异常等多个方面。
因为其病因和病程十分复杂,治疗难度也较高,尤其是晚期癌症的治疗效果非常有限。
因此,研究癌症的发生机制和治疗策略一直是医学界的热点问题。
近年来,随着基因测序技术的发展和普及,越来越多的研究者开始将其应用于癌症研究中。
其中,基因表达谱分析是一种常用的手段,其主要作用是了解癌症细胞内基因表达的变化规律,并通过生物信息学方法对数据进行处理和分析,从而寻找可能的治疗靶点和诊断标志物。
基因表达谱分析通过测定细胞内RNA或蛋白质的表达量,对不同生物样本的表达谱进行比较,从而发现差异性基因。
对于癌症研究,常常会比较肿瘤组织和正常组织的表达谱差异,以此寻找与癌症发生和发展相关的基因。
在基因表达谱分析中,常用的技术包括DNA芯片技术和RNA测序技术。
DNA芯片技术是利用固定在芯片上的DNA探针进行靶向分析,可以同时检测数万个基因表达情况;而RNA测序则是通过高通量测序技术对RNA进行测序,可以检测所有基因的转录本,尤其是用于对于未知基因进行注释。
通过基因表达谱分析,可以发现大量参与癌症发生和发展的基因,在其中寻找致癌基因和抑癌基因,并对基因网络和通路进行分析,可以得到不同癌症类型的基因变化模式和分子分类。
这些信息不仅可以帮助医生进行精确的诊断和提供更好的治疗策略,还可以提供新的靶向治疗潜力和药物研发方向。
例如,目前已经有一些临床试验运用癌症基因表达谱数据为指导,为癌症患者提供个体化治疗。
例如,使用基因表达谱对乳腺癌进行分类,帮助医生选择更为精准的治疗方案;使用基因表达谱数据发现肺癌患者中存在一类没有特异突变但依赖于抑制剂的基因,预示着该患者可能会对特定的靶向治疗药物产生反应,这为后续药物研发和治疗提供了新思路。
总的来说,基因表达谱分析技术在癌症研究和治疗中具有非常重要的作用。
通过对癌症细胞内基因表达的差异性分析,可以寻找潜在的治疗靶点和诊断标志物,为精准医疗和个体化治疗提供了新思路。
差异表达基因分析揭示癌细胞特定信号通路癌症是全球范围内最重要的健康问题之一,而对于癌症的治疗研究一直是科学界的热点。
在过去的几十年里,人们通过对不同类型的肿瘤组织进行基因表达谱分析,发现了许多癌细胞的差异表达基因。
差异表达基因是指在癌症细胞与正常细胞之间存在显著差异的基因。
这些差异表达基因的研究为科学家们揭示了癌细胞的病理生理机制提供了重要线索。
通过对这些基因的功能进行深入研究,我们可以更好地了解癌细胞的特点,并找到治疗癌症的新方法。
差异表达基因分析通常包括不同类型组织样本的RNA序列测定以及数据分析。
通过对癌症组织和正常组织中基因表达水平的比较,我们可以确定那些在癌细胞中高度表达或低度表达的基因。
进一步分析这些差异表达基因的功能,可以帮助我们了解癌症细胞的异常生长和侵袭能力是如何发生的。
现代生物技术的快速发展使得对差异表达基因进行全基因组水平的分析变得可行。
例如,RNA测序技术的广泛应用使得我们可以比较数千个基因在不同组织样本中的表达水平。
同时,生物信息学和数据挖掘技术的进步也使得对差异表达基因进行综合分析成为可能。
在差异表达基因分析中,我们通常会使用一些常见的生物信息学工具和数据库。
例如,我们可以使用DESeq2、edgeR 或limma等软件进行差异表达基因的统计分析。
这些软件可以帮助我们筛选出在癌症组织和正常组织中差异表达的基因,并进行统计学上的验证。
为了更好地理解差异表达基因的功能,我们可以使用一些公共数据库,如Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)。
这些数据库可以帮助我们对差异表达基因进行功能富集分析,以确定哪些生物学过程和通路与癌症发展密切相关。
通过差异表达基因分析,研究人员发现了许多与癌症相关的信号通路。
例如,研究发现,某些癌细胞在调控细胞周期和增殖方面存在异常,这与细胞周期调控通路相关。
此外,研究还发现,许多癌症细胞在侵袭和转移过程中表达了一系列与EMT(上皮间质转化)相关的基因,这揭示了癌细胞扩散的分子机制。
(完整版)肾癌靶向治疗总结引言肾癌是一种高度恶性的癌症类型,治疗难度较大。
传统的治疗方式如手术切除、放疗和化疗效果不佳,副作用较大。
近年来,靶向治疗作为一种新的治疗方式受到广泛关注。
本文总结了肾癌靶向治疗的研究现状和进展。
靶向治疗的原理靶向治疗是通过选择性抑制肿瘤细胞特定的生物靶点,以达到杀灭肿瘤或抑制肿瘤生长的效果。
肾癌靶向治疗的主要原理是通过抑制肿瘤相关靶点,阻断肿瘤细胞的生长信号通路,从而抑制肿瘤的发展和扩散。
目前的靶向治疗药物目前,肾癌靶向治疗药物主要包括抗血管生成药物和蛋白酶抑制剂。
抗血管生成药物如索拉非尼、舒尼替尼等通过抑制血管内皮生长因子(VEGF)信号通路,抑制肿瘤的血管生成,从而达到抑制肿瘤生长的效果。
蛋白酶抑制剂如埃克替尼、阿帕替尼等则通过抑制肿瘤相关蛋白酶的活性,阻断肿瘤细胞的生长信号通路,起到抑制肿瘤生长的作用。
靶向治疗的优势相比传统的治疗方式,肾癌靶向治疗具有以下优势:- 高效:靶向治疗可以选择性地作用于肿瘤细胞,减少对正常细胞的伤害,提高治疗效果。
- 副作用较小:相比传统的化疗方式,肾癌靶向治疗的副作用较小,患者的生活质量得到了提高。
- 个体化治疗:靶向治疗可以根据患者的基因和肿瘤特征进行个体化治疗,增加了治疗的针对性和有效性。
发展趋势肾癌靶向治疗领域仍在持续发展和突破。
未来的研究方向主要包括:- 新靶点的发现:随着科技的不断进步,越来越多的肿瘤相关靶点被发现,将为肾癌靶向治疗带来更多的选择。
- 多靶点联合治疗:通过同时抑制多个靶点,可以增加治疗的效果,降低肿瘤对单一药物的耐药性。
- 免疫治疗与靶向治疗的结合:免疫治疗在肾癌治疗中也显示出了潜力,与靶向治疗结合可能会有更好的治疗效果。
结论肾癌靶向治疗作为一种新兴的治疗方式,已经取得了一定的研究成果,具有较高的治疗效果和较小的副作用。
未来的研究还需深入探索新靶点和多靶点联合治疗的应用,结合免疫治疗等方法,为肾癌的治疗提供更多的选择和可能性。
《GPR65通过β-catenin-YAP轴促进肾癌转移的分子机制》篇一GPR65通过β-catenin-YAP轴促进肾癌转移的分子机制一、引言肾癌是一种常见的泌尿系统恶性肿瘤,其高转移率是导致患者预后不良的主要原因之一。
近年来,随着分子生物学和肿瘤学研究的深入,越来越多的研究开始关注肾癌转移的分子机制。
其中,GPR65(G蛋白偶联受体65)作为细胞表面受体在肾癌转移过程中的作用逐渐受到关注。
本文旨在探讨GPR65通过β-catenin/YAP轴促进肾癌转移的分子机制,以期为肾癌的治疗提供新的思路。
二、GPR65与肾癌转移GPR65是一种G蛋白偶联受体,在多种肿瘤细胞中表达,并参与肿瘤的进展和转移过程。
研究表明,GPR65在肾癌组织中高表达,与肾癌的转移和不良预后密切相关。
然而,GPR65如何参与肾癌转移的分子机制尚不完全清楚。
三、β-catenin/YAP轴与肿瘤转移β-catenin和YAP(Yes相关蛋白)是两种重要的细胞内信号分子,在肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭过程中发挥重要作用。
β-catenin/YAP轴的异常激活被认为与多种肿瘤的转移密切相关。
因此,探究GPR65是否通过调控β-catenin/YAP轴来促进肾癌转移具有重要的科学意义。
四、GPR65通过β-catenin/YAP轴促进肾癌转移的分子机制研究发现,GPR65的过度表达能够激活β-catenin/YAP信号通路,从而促进肾癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力。
具体来说,GPR65与细胞表面其他分子相互作用后,通过一系列的信号转导过程激活β-catenin和YAP的活性。
激活的β-catenin和YAP能够进一步促进肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭,从而加速肾癌的转移过程。
五、实验验证与结果分析为了验证GPR65通过β-catenin/YAP轴促进肾癌转移的分子机制,我们进行了以下实验:1. 通过免疫组化等方法检测肾癌组织中GPR65、β-catenin和YAP的表达情况;2. 利用细胞实验和动物模型验证GPR65对肾癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响;3. 通过RNA干扰或基因敲除技术,探讨GPR65、β-catenin 和YAP在肾癌细胞中的相互作用及其对肾癌转移的影响。
细胞与分子生物学基于公共数据库分析FABP5在肾透明细胞癌中表达及预后的意义高鑫,张淑芳△,黄邓高,曹卉摘要:目的探讨脂肪酸结合蛋白5(FABP5)基因在肾透明细胞癌中的表达及预后意义。
方法提取Oncomine和GEO数据库中有关FABP5的信息并进行表达情况分析,通过DAVID数据库对差异基因进行功能注释,采用GEPIA进行预后分析。
结果Oncomine数据库中共找到445项FABP5在不同肿瘤类型中的研究数据集,表达差异有统计学意义的结果中表达增高的有32项(肾癌5项),表达降低的有24项(肾癌0项)。
肾癌中有4项涉及肾透明细胞癌和正常组织中FABP5的表达研究数据集。
综合比较这4项数据集发现,FABP5在肾透明细胞癌中的表达量高于正常组织(P<0.05)。
GEO数据库中GSE66271芯片数据分析结果发现差异基因FABP5在肾透明细胞癌中的表达量显著高于正常组织(P<0.01)。
DAVID功能分析发现这些差异基因主要集中于影响细胞的转运蛋白活性和蛋白质的消化和吸收代谢功能。
使用GEPIA分析来自TCGA数据库和GTEx项目的516例患者预后发现FABP5高表达的患者总体死亡率较高,低表达FABP5的患者预后较好(P=0.0011)。
结论FABP5在肾透明细胞癌组织中呈现高表达,并与肾透明细胞癌预后差相关,其有望成为抗肾透明细胞癌药物的重要治疗靶点。
关键词:腺癌,透明细胞;自动数据处理;数据库管理系统;FABP5基因;肾透明细胞癌;Oncomine数据库;GEO数据库;DAVID数据库;GEPIA;数据挖掘中图分类号:R737.11文献标志码:A DOI:10.11958/20180999Expression of FABP5and its prognostic role in renal clear cell carcinoma:An analysis based on the data-mining of public databaseGAO Xin,ZHANG Shu-fang△,HUANG Deng-gao,CAO HuiCentral Laboratory,Haikou People's Hospital,Central South University Xiangya School ofMedicine Affiliated Haikou Hospital,Haikou570208,China△Corresponding Author E-mail:haikouyiyuan@Abstract:Objective To explore the expression of fatty acid-binding protein5(FABP5)gene and its prognostic significance in renal clear cell carcinoma.Methods Data of FABP5were retrieved from Oncomine and GEO database,then the role of FABP5in renal clear cell carcinoma was mined and analyzed.The DAVID database was used to analyze the function of differentially genes,and the prognosis analysis was analyzed by GEPIA.Results Totally,445different types of cancer studies about the expression of FABP5were identified in the Oncomine database.The FABP5expression was statistically significant in63of the studies,over-expressed in32(5in renal carcinoma)and under-expressed in the other24 (0in renal carcinoma).There were4studies involved the expression of FABP5in clear cell renal cell carcinoma and normal pared with normal tissues,the expression of FABP5was higher in renal clear cell carcinoma(P<0.05).In addition,through further mining the data set GSE66271of GEO database,the results showed that the expression of FABP5 was higher in renal clear cell carcinoma than that in normal tissue(P<0.001).The results of GSE66271microarray data analysis in GEO database showed that the expression of differential gene FABP5was significantly higher in renal clear cell carcinoma than that of normal tissue(P<0.01).DAVID functional analysis found that these differential genes mainly focus on the affectting transfer protein activity and protein digestion and absorption metabolic function.The overall mortality was higher in patients with over-expressed FABP5(n=258),and the prognosis was better in patients with under-expressed FABP5(n=258)analyzed by GEPIA using TCGA database and GTEx project(P=0.0011).Conclusion FABP5is highly基金项目:国家自然科学基金资助项目(81460450、81760465);2017年海南省创新团队资助项目(2017CXTD010)作者单位:中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室(邮编570208)作者简介:高鑫(1992),男,硕士在读,主要从事泌尿系统肿瘤发生发展分子机制研究△通讯作者E-mail:haikouyiyuan@近年来,肾细胞癌的发病率和死亡率正在逐年上升,严重影响人类健康[1]。
肿瘤标志物及EMT通路表达水平对黑色素瘤预后的影响王倩【期刊名称】《现代医药卫生》【年(卷),期】2024(40)1【摘要】目的探讨上皮-间充质转化(EMT)通路对黑色素瘤患者预后的影响及黑色素瘤常见肿瘤标志物与EMT通路的相关性,为临床识别和随访高转移风险的黑色素瘤患者提供新思路。
方法从TCGA数据库中获得461例黑色素瘤患者的转录及临床数据,通过GSVA包对每个样本的表达进行非参数的无监督分析,得到EMT通路的表达评分并分为低和高两组,使用Survival包进行生存分析。
随后对肿瘤标志物的mRNA和EMT通路表达水平进行Spearman相关性分析,并根据年龄、性别和肿瘤分期进行亚组分析。
进一步从TCGA数据库中下载黑色素瘤患者肿瘤标志物的蛋白表达水平,同样进行Spearman相关性分析,从mRNA和蛋白表达水平2个角度探讨常见肿瘤标志物与EMT通路的相关性。
最后将上述肿瘤标志物、EMT通路表达水平和临床特征纳入多因素分析以明确对黑色素瘤预后的影响。
结果EMT通路的高表达预示黑色素瘤患者的不良预后。
黑色素瘤肿瘤标志物PMEL、MLANA、TYR和MITF的mRNA表达水平与EMT通路呈负相关(P<0.05),MKI67的mRNA表达水平与EMT通路呈正相关(P<0.05)。
肿瘤标志物与EMT通路相关性的亚组分析结果与总样本中所得结果基本一致。
肿瘤标志物PMEL高表达和EMT相关通路低表达时预示良好预后,EMT相关通路低表达时MLANA、MKI67低表达预示良好预后(P<0.05)。
PMEL、MLANA和MITF的蛋白表达水平与EMT通路的表达呈负相关(P<0.05)。
PMEL、年龄和病理分期是影响黑色素瘤预后的独立危险因素(P<0.05)。
结论黑色素瘤的常见肿瘤标志物PMEL、MLANA和MITF较低表达可能与EMT通路的高表达相关;EMT相关通路低时,PMEL与MLANA高表达、MKI67低表达预示良好预后,随访中应给予一定程度重视。
肾癌转化生长因子β1表达及与预后的关系冯新顺;王子明;种铁;苏宝山【期刊名称】《临床与实验病理学杂志》【年(卷),期】2003(19)1【摘要】目的探讨转化生长因子β1(TGFβ1)在肾癌发生、发展中的作用及与预后关系.方法采用免疫组化ABC法对45例肾癌组织中TGFβ1表达进行了研究,对患者存活率进行回顾性随访.结果癌旁肾组织中TGFβ1阳性表达率显著高于肾癌组织.TGFβ1阳性表达率随肾癌病理分级和临床分期的上升而下降,染色强度也减弱.TGFβ1阳性表达组3年及5年存活率高于阴性表达组.结论TGFβ1为肾癌的负性调节因子,对抑制肾癌的恶性转化和进展可能有重要的意义.临床上检测TGFβ1可作为肾癌恶性度及预后评估的参考指标之一.【总页数】3页(P67-69)【作者】冯新顺;王子明;种铁;苏宝山【作者单位】西安交通大学第一医院肾病中心,西安,710061;西安交通大学第二医院泌尿外科,西安,710004;西安交通大学第二医院泌尿外科,西安,710004;西安交通大学第二医院病理科,西安,710004【正文语种】中文【中图分类】R737.11【相关文献】1.转化生长因子-β1、Smad4与Smad7蛋白在肾癌组织中的表达及意义 [J], 王养民;鲁守琳;赵玉海;赵志强;王楠2.MTS1基因在肾癌中的表达及其与预后的关系 [J], 王固新;党建功;南勋义3.增殖细胞核抗原在肾癌中的表达及其与腔静脉癌栓形成及预后的关系 [J], 赵志德; 夏勇4.CREPT在肾癌组织中的表达及其与预后的关系 [J], 刘军;曹庆飞;叶雄俊;陈伟男;赵海岳;佟明;王银银;黄晓波;常智杰5.P^(16)蛋白、增殖细胞核抗原在肾癌的表达及与预后的关系 [J], 刘黎明;王万忠因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
miR-184在肾癌组织中的表达及其对癌细胞增殖和凋亡的影响
miR-184是一种微小RNA,最近的研究表明它在多种癌症中
扮演了重要的角色,包括肾癌。
据报道,miR-184在肾癌组织
中的表达水平明显降低,这提示了它在肾癌发生和发展中的可能作用。
本文将探讨miR-184在肾癌组织中的表达及其对癌
细胞增殖和凋亡的影响。
首先,研究表明,miR-184的表达水平在肾癌组织中显著下调。
实验证实,miR-184能够抑制肾癌细胞的增殖和促进其凋亡。
miR-184的过表达能够减少肾癌细胞的增殖,同时也可以促进
其凋亡。
这些研究结果表明,miR-184在肾癌中可能发挥了一
种肿瘤抑制基因的作用。
其次,miR-184对肾癌细胞的分化和侵袭也有重要的影响。
miR-184的过表达可以抑制肾癌细胞的侵袭和分化,这表明
miR-184可能通过调节肾癌细胞的分化和侵袭来抑制肿瘤的发展。
这些结果也表明,miR-184可能成为开发新型肾癌治疗方
法的有力工具。
总之,miR-184在肾癌组织中的表达水平明显降低,并且能够
抑制肾癌细胞的增殖和促进凋亡。
此外,miR-184还能影响肾
癌细胞的分化和侵袭。
这一研究表明,miR-184可能成为治疗
肾癌的新型潜在靶点,并有望开发出更有效的肾癌治疗方法。
药物治疗后肾癌EMT相关基因表达谱分析及对预后的影响南宁;寨旭;王宇;陈琦【摘要】目的通过对相关数据库数据分析,探究EMT相关调节因子的异常表达与肾癌的相关性.方法对NCBI中GEO数据库中的若干数据集数据进行表达量分析、生存分析和相关性分析.结果①研究分析表明,Snai1等EMT相关调节因子在肾癌中存在明显的高表达,而E-cadherin(CDH1)等则表现为明显的低表达.②Twist1等的高表达会导致肾癌患者的总生存率和无疾病生存率明显降低(P =0.0186;P <0.0015).③VIM和SIP1在药物治疗后的肾癌患者中有明显的高表达情况(VIM,P<0.001;SIP1,P=0.0021),而CDH1和TJP1在药物治疗后的肾癌患者中则表现为低表达(CDH1,P<0.0002;OCLN,P<0.0001).④VIM和SIP1在肾癌患者中的表达情况呈正相关(P<0.0001,γ=0.573);而其与OCLN呈负相关(P=0.0017,γ=-0.3316).结论通过对EMT指标在肾癌患者中的表达相关性分析表明,EMT调节因子的异常表达与肾癌患者疾病的发展存在一定的相关性,并且对其药物耐受和预后都有一定的影响.%Objective To study relevant database data analysis,and explorethe correlation of the abnormal expression of EMT related factors and renal cell carcinoma.Methods Based on some data sets of GEO in the NCBI database,to perform express analysis,survival analysis and correlation analysis.Results ①The results showed that Snaill and other EMT-related regulatory factors in renal cell carcinoma patients were significantly higher expression,while the E-cadherin (CDH1)and so the performance was significantly lower expression.②Twist1 and other high expression of renal cancer patients will lead to the overall survival and disease-free survival was significantly reduced(P =0.0186;P <0.0015).③VIM and SIP1 weresignificandy higher in patients with renal cancer after drugtreatment(VIM,P < 0.001;SIP1,P =0.0021),while CDH1 and TJP1 showed low expression in renal cancer patients after drug treatment (CDH1,P <0.0002;OCLN,P <0.0001).④There was a positive correlation between the expression of VIM and SIP1 in renal cell carcinoma(P <0.0001,γ=0.573)and negative correlation with OCLN(P =0.0017,γ =-0.3316).Conclusion The correlation analysis between the EMT index and the expression of RCC in RCC patients showed that the abnormal expression of EMT regulatory factor is correlated with the development of RCC and has certain influence on drug tolerance and prognosis.【期刊名称】《实用癌症杂志》【年(卷),期】2017(032)004【总页数】5页(P548-552)【关键词】肾癌;表达谱;EMT;预后【作者】南宁;寨旭;王宇;陈琦【作者单位】710004 西安交通大学第二附属医院;710004 西安交通大学第二附属医院;710004 西安交通大学第二附属医院;710004 西安交通大学第二附属医院【正文语种】中文【中图分类】R737.11肾癌是常见的致死率位于前十的恶性肿瘤之一,其患者仍然在逐年增加[1]。
约有30%的肾癌患者在诊断初期就已经发生了转移,且由于耐药性的存在,转移性肾癌患者5年生存率仅为5%[2]。
虽然目前一些靶向治疗药物可以在一定程度上改善预后,但对于很多恶性肾癌仍然无法治愈[3]。
所以鉴定驱动肾癌生长转移的分子生物学事件对于发展最佳的治疗策略是至关重要的。
上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)是一种上皮样细胞向间质样的细胞转分化的过程,与上皮细胞恶性肿瘤的发生发展关系密切[4]。
实验证据表明EMT在多种癌症的原发性浸润和继发性转移中起着举足轻重的作用[5],其相关基因的表达还对于肿瘤的耐药起着非常重要的作用[6]。
有研究提示EMT相关的基因,如Twist的表达与肾癌的转移以及耐药有着密切的关系[7]。
而完整的EMT信号网络是由细胞外信号触发,如转化生长因子(transforming growth factor β,TGF-β)信号[8-9],这些转录因子同肿瘤的侵袭和转移以及肿瘤耐药性的发展密切关联[10]。
目前仍没有研究直接证明他们之间的联系,故在本研究中我们探究了肾癌病例中相关EMT调节因子的异常表达情况,并分析了EMT调节因子的异常表达与肾癌耐药的相关性及对肾癌预后及生存的影响。
1.1 研究材料本研究所用到的材料均来自于NCBI的GEO数据库,具体信息如下。
1.2 方法1.2.1 表达量分析基于数据库特定研究样本数据集中特定目标基因的表达量的相对值进行表达量的分析,所有数据都经过对数转换和中位数中心化处理。
根据表达量处理后数据进行聚类和差异分析。
文中热图由HemI软件制作,比较差异分析图由GraphPad Prism 5软件制作。
(* P<0.05,** P<0.01,***P<0.001表示差异有统计学意义)。
1.2.2 生存分析基于数据库特定研究样本数据集中特定目标基因的表达量的相对值及对应样本的总生存(OS)和无疾病生存(DFS)信息进行生存分析,所有数据都经过对数转换和中位数中心化处理,并采用Kaplan-Meier分析方法进行分析。
1.2.3 相关性分析基于数据库特定研究样本数据集中特定目标基因的表达量的相对值进行相关性分析,所有数据都经过对数转换和中位数中心化处理。
(P<0.05表示差异有统计学意义,γ<0表示负相关,γ>0表示正相关)。
2.1 EMT相关指标在肾癌患者中的表达分析为了评估EMT与肾癌发生发展的关系,我们选取了6个EMT相关的调节因子,分别为Snai1、Twist1、vi mentin(VIM)、SIP1、E-cadherin(CDH1)和occludin (OCLN),据以往的相关研究表明,其中Snai1、Twist1、vimentin(VIM)和SIP1在EMT的过程中表达量上调,而E-cadherin(CDH1)和occludin(OCLN)在EMT 的过程中表达量下调。
据此,我们对研究数据集中的肾癌样本和正常肾组织样本的相关基因的表达进行了表达谱的聚类分析,结果表明Snai1、Twist1、VIM和SIP1在肾癌样本中均存在高表达,而E-cadherin和occludin在肾癌中均表现为低表达,这也与以往的类似研究结果相一致,表明EMT对于肾癌的发生发展有着重要的作用。
2.2 EMT相关指标对肾癌患者生存及预后的影响据以往的研究报道,EMT过程对于肾癌的发生发展以及肾癌患者的生存状态具有重要作用。
所以,为了进一步探究EMT相关调节因子的表达对肾癌患者的生存状态的影响,我们对上述部分基因进行了相关研究,结果表明,在肾癌患者中,SANI1的高表达会导致肾癌患者的总生存率明显降低(P<0.0001),并且在肾癌患者中,SANI1的高表达也同样会导致肾癌患者的无疾病生存率明显降低(P=0.0071)。
与此类似,我们也在同样的数据集中对Twist1的高表达对非小细胞肺癌患者的总生存率和无疾病生存率进行了分析,结果表明,Twist1的高表达同样也会导致肾癌患者的总生存率和无疾病生存率明显降低(P=0.0186;P<0.0015)(图1)。
2.3 EMT相关指标在药物治疗后肾癌患者中的表达分析在上述的研究中,我们分析了EMT相关指标在肾癌患者中的表达异常情况,以及部分基因的高表达对肾癌患者总生存率和无疾病生存率的影响。
为了研究药物治疗后肾癌患者中EMT相关调节因子的表达情况,我们在相关数据集中对部分上述高表达(VIM和SIP1)和低表达(CDH1和OCLN)的基因进行了表达量的比较分析。
结果表明,与在肾癌患者中的表达情况相似,VIM和SIP1在药物治疗后的肾癌患者中也有明显的高表达情况(VIM,P<0.001;SIP1,P=0.0021),而CDH1和OCLN在药物治疗后的肾癌患者中则同样表现为低表达(CDH1,P<0.0002;OCLN,P<0.0001)(图2)。
这一结果说明,EMT过程不仅对肾癌的发生发展有着重要的影响,而且其在药物治疗后肾癌患者中也表现出同样差异表达情况,暗示其在肾癌的耐药性发展过程中也发挥着同样重要的作用。
2.4 EMT相关指标在肾癌患者中表达的相关性分析为了进一步探究,EMT的相关基因的差异表达与肾癌耐药发展的相关性,我们在耐药性肾癌患者样本中进行了EMT的相关基因的表达的相关性分析。
结果表明,VIM和SIP1在肾癌患者中的表达情况呈正相关(P<0.0001,γ=0.573);而其与OCLN的相关性分析显示呈负相关(P=0.0017,γ=-0.3316)(图3)。