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④避免引物内部出现二级结构:避免两条引物间互补,特别是 3’端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增 条带;
⑤引物3’端的碱基应严格要求配对:特别是最末及倒数第二 个碱基,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败;
⑥ 引物的熔解温度(Tm值),指把DNA的双螺旋结构热变性 过程中紫外吸收值达到最大值的1/2时的温度。DNA中G- C含量越高,Tm值越高,引物对之间的Tm值相差不超过 2~3℃,经验公式Tm=2℃(A+T)+4℃(G+C),引物的退火 温度通常低于Tm值5~10℃;
单、双链DNA均可
不能混有蛋白酶、核酸酶、DNA聚合酶抑制剂、DNA 结合蛋白类
对于哺乳动物基因组DNA开说,每个反应需要的模 板量是1μg,对于酵母染色体、细菌染色体和质粒 等模板的通常用量分别是10ng、1ng、1pg
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4. dNTP
dNTP在温度较高时容易失活, 因此需要-20℃下冰 冻保存,以保证dNTP的质量。
链
DNA单链
与引物复性
22 DNA双螺旋
子链延伸 DNA加倍
1
2
3
4
时间(min)
重复1~3步 25~30轮 目的DNA片段 扩增100万倍以上
5
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五、PCR的类型
在PCR反应中, dNTP浓度应为200 ~ 250μmol/L, 尤其重要的是4种dNTP的体积浓度要相等, 否则就 会引起错配