不少人认为因明只是一门辩论的学问，这其实是很大的误解。因明主要抉择的是第三转FL中随理唯识经典的教义，并以理论成立佛是具足一切智智的量士夫，佛所说的法是正法，以及因果、轮回、涅槃等的世俗正理。为了破除外道等的遍计执著，引其进入趋向解脱的内道，才以慈悲的发心与智慧的力量与其展开辩论，解除他们的邪见、边执。
如世亲菩萨，在印度被称为第二全知，又亲口说过自己在过去五百世中一直转生为班智达，但在显现上，其中观观点在印度被认为尚未究竟。如他把第二转般若FL按随理唯识抉择后，将般若解释成：遍计法为空性，依他起为实有。他对“中观承认有无否”便承认有依他起。
唯识分随理唯识、随教唯识两种，其中随理唯识在抉择了遍计法是空性的同时，承认了依他起是实有，故也是非遮见。随教唯识在抉择了佛陀第二转FL世俗谛中的不清净现法为空性的同时，承认如来藏的大光明是实有，亦属非遮见。
“法性以柱谓成空”，这是藏地门朗格日以及随理唯识的观点。门朗格日在抉择第二转FL的观点时，认为法性(圆成实法)不空，在法性，柱子等世俗不清净显现法才是空性。随理唯识认为在第二转FL中，虽然佛没有传讲与空体相违的法，但可以随理论而推出有依
他起等不空的法。
至于随理唯识，空基是依他起，余空是遍计法。
还有，如果按第二转FL之义把觉囊派所宣说的如来藏理解成实有，而只有世俗中因无明产生的不清净显现法是空性；又随理唯识说依他起不空，只有遍计法是空，这样也不可能圆满断德，因为若如来藏、依他起实有，则没法遣除对它们的执著，而世俗的不清净现法、遍计法空也好，不空也好，对通达如来藏或依他起的空性有什么帮助？
随理唯识中的依他起与遍计执也是无关的他法，故这些实际上都不能成为法与法性的关系。
又随理唯识及误解了觉囊派他空的人认为依他起、如来藏在胜义中实有，而相对于它们的遍计法、世俗迷乱显现在胜义中不存在。这样有的在二谛中都有，没有的在二谛中都没有，这怎么能构成现空双运？这根本不是空性的法与根本没有的法怎么去成立双运？
在随理唯识等不了义他空中，依他起应取，遍计法应舍，有取舍便不是大平等的本性，而与经论相违。究竟的法界上，轮回是空性，涅槃也是空性，这二者一味一体，没有取舍，成为大平等的本性。若一个应取、一个应舍，则不可能成为平等，就象一间房子中，黑暗与光明