DNA测序常见问题及分析

DNA测序过程可能遇到的问题及分析对于一些生物测序公司(如Invitrogen等),我们的菌液或质粒经过PCR和酶切鉴定都没问题,但几天后的测序结果却无法另人满意。为什么呢?PCR产物直接进行测序,在PCR产物长度以后将无反应信号,机器将产生许多N值。这是由于Taq酶能够在PCR反应的末端非特异性地加上一个A碱基,我们所用的T载体克隆PCR产物就是应用该原理

2024-02-07
DNA测序常见问题分析及解决办法

DNA测序常见问题分析及解决办法

2024-03-08
测序常见问题分析与解答

测序常见问题分析与解答1、DNA测序样品用什么溶液溶解比较好?答:溶解DNA测序样品时,用灭菌蒸馏水溶解最好。DNA的测序反应也是Taq酶的聚合反应,需要一个最佳的酶反应条件。如果DNA用缓冲液溶解后,在进行了测序反应时,DNA溶液中的缓冲液组份会影响测序反应的体系条件,造成Taq酶的聚合性能下降。有很多客户在溶解DNA测序样品时使用TE Buffer。的确

2024-03-08
DNA测序分析常见问题整理

DNA测序分析常见问题整理

2020-01-17
一代测序常见问题及解决策略

测序常见问题及解决策略一、PCR常见问题1.假阴性,不出现扩增条带PCR出现假阴性结果,可从以下几个方面来寻找原因:1)模板:①模板中有杂蛋白;②模板中有Taq酶抑制剂;③在提取制备模板时丢失过多;④模板核酸变性不彻底。2)酶:酶失活或反应时忘了加酶。3)Mg2+浓度:Mg2+浓度过高可降低PCR扩增的特异性,浓度过低则影响PCR 扩增产量甚至使PCR扩增失

2024-02-07
PCR常见问题分析及解决策略

PCR常见问题分析及解决策略

2024-02-07
DNA测序常见问题分析及解决办法总结

DNA测序常见问题分析及解决办法总结

2024-02-07
测序常见问题解答

1.为什么需要新鲜的菌液?首先,新鲜的菌液易于培养,可以获得更多的DNA,同时最大限度地保证菌种的纯度.2.如何提供菌液?如果您提供新鲜菌液,用封口膜封口以免泄漏;也可以将培养好的4—5ml菌液沉淀下来,倒去上清以方便邮寄。同时邮寄时最好用盒子以免邮寄过程中压破.3.如何制作穿刺菌?用灭菌过1.5ml或2ml离心管加入LB琼脂(7g/L)斜面凝固,用接种针挑

2024-02-07
新测序常见问题分析

2.测序常见图谱分析图例:双克隆1现象: T载体序列峰图正常, 连接位置处出现套峰原因: 1.有插入片段的载体和空载体同时存在 2.PCR产物用T载体进行连接时,其片段能以正反两个

2024-02-07
测序常见问题分析实例

测序常见问题分析实例峰型整齐,在某一点前后突然变乱信号迅速衰减信号极弱或无信号整条序列信号杂乱峰型整齐,在某一点前后突然变乱:图1 PolyT特殊结构上图是我们的一个质粒测序样品,用T7通用引物进行测序,从图中可以看出,在约285bp的polyT结构后,序列明显变乱。主要原因是在polyT结构后,测序酶容易在模板上滑动,导致polyT结构后的峰型变得杂乱。此

2024-03-08
DNA测序常见问题及分析

DNA测序过程可能遇到的问题及分析对于一些生物测序公司(如Invitrogen等),我们的菌液或质粒经过PCR和酶切鉴定都没问题,但几天后的测序结果却无法另人满意。为什么呢?PCR产物直接进行测序,在PCR产物长度以后将无反应信号,机器将产生许多N值。这是由于Taq酶能够在PCR反应的末端非特异性地加上一个A碱基,我们所用的T载体克隆PCR产物就是应用该原理

2024-02-07
DNA测序分析常见问题整理

“钉子”峰● 现象:四色并存突然拔起的 尖峰,峰形锐利。 ● 原因:毛细管内有气泡、灰 尘、尿素结晶等,对激光全反射。 ● 对策 – 灌胶时,避免气泡产生; – 上样前,样品先离心

2024-02-07
DNA测序结果中常见的几个问题

D N A测序结果中常见的几个问题公司内部档案编码:[OPPTR-OPPT28-OPPTL98-OPPNN08]1 、为什么开始一段序列的信号很杂乱,几乎难以辨别这主要是因为残存的染料单体造成的干扰峰所致,该干扰峰和正常序列峰重叠在一起;另外,测序电泳开始阶段电压有一个稳定期,所以经常有20-50 bp 的紧接着引物的片段读不清楚,有时甚至更长。2 、为什么

2024-02-07
DNA测序结果中常见的几个问题

1 、为什么开始一段序列的信号很杂乱,几乎难以辨别?这主要是因为残存的染料单体造成的干扰峰所致,该干扰峰和正常序列峰重叠在一起;另外,测序电泳开始阶段电压有一个稳定期,所以经常有20-50 bp 的紧接着引物的片段读不清楚,有时甚至更长。2 、为什么在序列的末端容易产生N 值,峰图较杂?由于测序反应的信号是逐渐减弱的,所以序列末端的信号会很弱,峰图自然就会杂

2024-03-08
焦磷酸测序常见问题及解决方案

Cross-talkThis can result from very high signal in a well which results in cross-talk betw

2024-02-07
一代测序常见问题及解决策略

测序常见问题及解决策略一、PCR常见问题1.假阴性,不出现扩增条带PCR出现假阴性结果,可从以下几个方面来寻找原因:1)模板:①模板中有杂蛋白;②模板中有Taq酶抑制剂;③在提取制备模板时丢失过多;④模板核酸变性不彻底。2)酶:酶失活或反应时忘了加酶。3)Mg2+浓度:Mg2+浓度过高可降低PCR扩增的特异性,浓度过低则影响PCR扩增产量甚至使PCR扩增失败

2024-02-07
测序过程常见问题分析与解答

测序过程常见问题分析与解答1、DNA测序样品用什么溶液溶解比较好?答:溶解DNA测序样品时,用灭菌蒸馏水溶解最好。DNA的测序反应也是Taq酶的聚合反应,需要一个最佳的酶反应条件。如果DNA用缓冲液溶解后,在进行了测序反应时,DNA溶液中的缓冲液组份会影响测序反应的体系条件,造成Taq酶的聚合性能下降。有很多客户在溶解DNA测序样品时使用TE Buffer。

2024-02-07
DNA测序常见问题解析

DNA测序常见问题解析一.引物问题Q:为什么我在测序报告上找不到我的引物序列?A:这里分以下几种情况:1. PCR引物作为测序引物进行测序时,所测序列是从引物3'末端后第一个碱基开始的,而且刚刚开始的碱基由于在毛细管电泳中不能很好地分离而导致准确性下降,所以找不到您的引物序列。(1)对于较短的PCR产物((2)对于较长的序列,一个测序反应测不到头,因此就只能

2024-02-07
一代测序相关总结

目录一代测序的基本原理: .......................... 3Sanger 法测序原理: ...................................

2024-02-07
DNA测序分析常见问题

“钉子”峰● 现象:四色并存突然拔起的 尖峰,峰形锐利。 ● 原因:毛细管内有气泡、灰 尘、尿素结晶等,对激光全反射。 ● 对策 – 灌胶时,避免气泡产生; – 上样前,样品先离心

2024-02-07