梨小食心虫线粒体基因全分析及进化树的构建
- 格式:doc
- 大小:1016.71 KB
- 文档页数:39
苏北地区梨小食心虫的发生与防治摘要:对苏北地区梨小食心虫发生规律和危害特点观察研究,提出综合防治措施,包括农业防治、生物防治、化学防治等。
关键词:苏北地区;梨小食心虫;发生规律;综合防治梨小食心虫(Grapholitha molesta busck)属鳞翅目小卷叶蛾科,又名梨小蛀果蛾、东方果蠹蛾、梨姬食心虫、桃折梢虫、小食心虫、桃折心虫等,简称“梨小”。
梨小食心虫除危害梨、桃树外,也危害李、杏、苹果、山楂等。
近年来,我市果园梨小食心虫的发生危害有加重趋势,2008年虫果率25%~30%,危害重的(特别是桃和梨的混栽园)达60%以上,成为梨园和桃园的主要防治对象。
通过2008、2009年连续两年的观察研究和防治试验,基本掌握该虫在我市的发生规律,总结出一套有效的综合防治措施,现介绍如下。
1发生规律梨小食心虫在苏北地区一年发生5代,以老熟幼虫在树皮翘缝、伤疤处或树冠下表土内越冬。
越冬代成虫自3月底4月初开始羽化,4月上中旬为羽化盛期,成虫白天静伏在枝叶和杂草中,黄昏后活动,夜间产卵,散产。
4月下旬为产卵盛期。
第一代:4月底5月初第一代幼虫孵化,5月10日前后进入孵化盛期。
第一代幼虫主要危害桃梢。
5月20日前后化蛹,5月下旬成虫开始羽化,5月底6月初进入羽化盛期。
第二代:5月下旬第一代成虫开始产卵,6月上旬为产卵盛期,6月初开始孵化,6月10日前后为孵化盛期。
此期桃及苹果的幼果开始膨大,食料条件较好,幼虫发育较快。
6月下旬至7月上旬进入第二代成虫发生盛期。
第三代:第二代成虫多产卵于梨果的胴部,砂梨上产卵较多,白梨上产卵较少;单果上产卵少,双果上尤其是双果之间产卵多;果实接近成熟时产卵多。
第三代幼虫7月10日前后开始孵化,7月中旬进入孵化盛期。
此期果皮坚硬,幼虫难以蛀入,在果面暴露时间较长,是药剂防治最佳时期。
幼虫蛀果5—6天后蛀孔变黑色,幼虫脱果后,蛀虫孔周围逐渐腐烂成黑色,故名黑膏药。
7月中下旬进入成虫羽化盛期。
昆虫线粒体基因组的结构和演化研究随着生物技术的不断发展,昆虫线粒体基因组的研究也日益引起了科学家们的关注。
线粒体是细胞内一个非常重要的细胞器,其主要功能是合成细胞所需的能量ATP。
线粒体基因组是由DNA组成的一个闭合圆环,昆虫线粒体基因组的结构和演化研究一直是科学界研究的热点之一。
昆虫线粒体基因组的结构昆虫线粒体基因组是一个圆形的双链DNA分子,大小约为16-20kb。
与细胞核的染色体相比,昆虫线粒体基因组比较小,但是其在昆虫的进化和适应性方面起着至关重要的作用。
昆虫线粒体基因组的结构比较保守,通常包含13个编码蛋白质的基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因,其中有些基因横跨着整个线粒体基因组。
另外,在昆虫线粒体基因组中还存在着“非编码区”(non-coding region),该区域的长度和组成在不同昆虫物种之间差别很大,但是其在整个基因组的复制和转录中发挥着非常重要的作用。
昆虫线粒体基因组的演化在不同昆虫物种之间,线粒体基因组的组成和结构会存在一定的差异性,这种差异性主要表现在基因组的大小、基因数目和序列组成等方面。
研究表明,昆虫线粒体基因组的演化是一个比较复杂的过程,它不仅受到自然选择和遗传漂变的影响,还受到基因重组和基因转移等因素的影响。
在自然选择的作用下,一些昆虫物种会逐渐丧失不必要的基因,如维生素合成基因等。
而一些重要的基因则会得到保留和加强,以适应环境变化的需求。
此外,昆虫线粒体基因组中的tRNA基因和非编码区序列的演化速度比编码基因要快,这意味着在不同物种之间,这些区域的序列组成和长度可能会发生较大的变化。
昆虫线粒体基因组的研究意义昆虫线粒体基因组的研究对于昆虫的分类和系统发育研究具有重要的意义。
由于昆虫线粒体基因组的结构比较保守,因此可以通过对不同昆虫物种基因组的比较研究,了解它们之间的关系和进化历程。
此外,昆虫线粒体基因组的研究还有助于深入了解昆虫的适应性进化和遗传学特征,为昆虫的保护和利用提供科学依据。
北京平谷桃园梨小食心虫发生规律及防治Grapholitha molesta (Busck)梁泊鳞翅目,卷叶蛾科。
形态特点卵淡黄白色,半透明,扁椭圆形,直径~。
幼虫老熟幼虫体长10~12mm,蛀食桃梢时幼虫紫红色,蛀食桃果实幼虫粉红色,越冬幼虫浅黄褐色,臀栉4~7刺。
蛹体长6~7mm,纺锤形,深褐色。
茧白色丝质,扁平椭圆形,长约10mm。
成虫体长5~6mm,翅展~15mm,前翅前缘有7~10组白色斜纹。
全部暗黑褐色,雄雌极少不同。
为害特点1.蛀梢,幼虫从被害梢第2~3个叶片的叶柄基部蛀入,向下蛀食至半木质部,被蛀食的嫩尖萎蔫下垂。
6月上旬至7月下旬为蛀梢盛期。
幼虫有转梢为害习性。
2.蛀果,初孵幼虫蛀入后,先取食果肉,后蛀入果心,在核周围蛀食。
老熟幼虫脱果后留下明显的虫孔。
有的虫孔周围有虫粪和流胶。
幼虫蛀食套袋果果柄周围果肉,造成落果。
各虫态发育历期温度在23~28℃,相对湿度60%~70%的条件下,卵期3~5天,幼虫期10~14天,蛹期7~10天,成虫寿命4~7天,每头雌成虫产卵70~80粒。
月降雨量达到150mm以上,空气相对湿度80%~~90%的条件下,成虫产卵量大,繁衍较快,幼虫为害较重。
趋性成虫有趋光趋化性,据2006年监测记录,从4月1日至10月14日,5个性诱剂盆诱到雄成虫1690头,5个糖醋液盆诱到成虫464头,一盏杀虫灯诱到111头,在三种诱捕器同时利用的情形下,性诱剂成效最好。
越冬部位以老熟幼虫结薄茧在骨干老翘皮、人工绑草把内、主枝杈、主枝绑布条下、树上空纸袋中及根颈周围浅土层中越冬。
2006年12月份北京平谷5个监测点调查15棵树结果如下:骨干绑草把内38头,未绑草把骨干粗皮裂痕处11头,主枝杈处9头,主枝部位绑布条下9头,树上空纸袋8头,剪锯口和树上枯叶下未见,距根颈部周围100cm内的浅土层中10头。
有关资料介绍,距树干1~3m之内,1~3cm浅土层中,越冬幼虫占总量的70%以上。
梨小食心虫的发生及防治作者:来源:《山西果树》2019年第05期梨小食心虫又名东方蛀果蛾、桃折心虫,属鳞翅目,小卷叶蛾科。
其主要以幼虫蛀食杏、梨、苹果等果实和桃树的新梢,虫果常腐烂,被害状有“黑膏药、豆沙馅”之称,被害新梢萎蔫下垂形成折心,影响树木生长。
梨小食心虫目前在高台县发生比较严重,已对我县的果品生产造成很大的影响.下面就梨小食心虫的生活习性及防治方法作一介绍,以供果农参考.1生活习性梨小食心虫在我县一年发生3代,以老熟幼虫在树皮裂缝、果筐等处结茧越冬。
根据观察,在我县越冬代成虫羽化高峰在4月中下旬,羽化成虫交尾产卵于桃、杏新梢顶端叶背,卵孵化后从叶柄处蛀入梢内,向下蛀食,蛀孔处常流胶,被害梢则萎蔫下垂枯死,随后幼虫在地表等处作茧化蛹。
第1代成虫羽化高峰在6月中旬,为害新梢、杏果和桃果,第2代成虫羽化在8月上旬,其幼虫主要为害梨果,致使果实蛀孔处变黑、腐烂;9月上中旬老熟幼虫吐丝下垂入树皮裂缝处越冬。
2預测预报为准确掌握发生时期,为化学防治提供科学依据,每年4-8月,在为害重的果园内选5株样树,每株在树冠外围距地面1.5m处挂糖醋液诱集罐,罐内盛糖醋液(红糖:醋:水=1:4:16)至2/3处,按时填补诱液,并统计诱测成虫数量,当发现第1头成虫时,即开始产卵情况的测报。
7月份,隔3~5d随机抽样100个果实,统计卵果数,当卵果率达高O.5%~1%时,开始喷药防治。
3防治方法1)新建果园避免桃、梨混栽。
2)捕杀越冬幼虫。
早春发芽前,刮除梨树基部老树皮集中烧毁;采果前,树干茎部束草诱杀。
3)5-6月剪除被害新梢烧毁;7-9月发现虫果摘除深埋,消灭各代幼虫。
4)成虫发生期,利用性引诱剂或糖醋液诱杀成虫。
5)果实套袋。
成虫产卵前进行,提高果实品质,减少产卵基数。
6)药剂防治:成虫羽化期及产卵期喷1%苦参碱可溶性液剂1000倍液和4.5%高效氯氰菊酯乳油1500倍液,每隔15d喷药防治1次。
桃树梨小食心虫危害大,如何防治效果好?一、首先了解下梨小的基本情况梨小食心虫的寄主植物范围较宽,年发生世代多,它的成虫飞行能力较强,而且幼虫蛀果危害,一般杀虫剂难以接触到虫体。
这些都给防治工作带来了一定的困难。
因此怎样更好地防治它一直是让果农头疼的一件事。
要想做好防治工作,必须先一起去认识一下它。
梨小食心虫属鳞翅目,小卷叶蛾科,它又被称为梨小蛀果蛾、东方果蠹蛾和梨姬食心虫。
有时还被简称为梨小。
由于它在果实上和枝条上的危害症状,有的地方的果农又称它为黑膏药和桃折梢虫。
梨小食心虫在我国东北、华北、华东、西北的桃、梨、苹果产区普遍发生。
特别是在桃、梨、苹果混栽的果园中发生得更加严重。
梨小食心虫除了为害桃、梨、苹果外,它的寄主还有李、杏、枣、海棠、樱桃、杨梅、山楂等果树。
梨小食心虫属于全变态发育类型的昆虫。
也就是说在它的不同发育阶段,我们看到的是不同形态的虫体。
二、梨小各个时期长什么样呢1.先看卵它的卵是扁椭圆形,直径在0.8毫米左右。
刚产下的卵呈乳白色,随着卵的发育逐渐变为淡黄白色或白色,半透明。
孵化前变为黑褐色。
梨小食心虫的卵期3—6天。
注意观察桃园是否出现了梨小的卵。
2.幼虫长啥样梨小食心虫的初孵幼虫,它的身体白色,头及前胸背板黑褐色。
体长只有不到1毫米。
老熟幼虫不光是身体比刚孵出来时大了十几倍,而且在颜色上也发生了变化。
这时它的体长已经达到了10—13毫米。
头部变成了黄褐色,前胸背板变成了浅黄白色或黄褐色,身体变成了浅粉色。
梨小食心虫的幼虫期一般在10-15天,越冬代可达180天。
3.梨小的蛹长6—7毫米,纺锤形,黄褐色,复眼黑色。
第3-7腹节背面有2行刺突,第8至第10腹节各有一行较大的刺突,腹部末端有8根钩刺。
蛹期7-14天。
最后一代幼虫会结出白色的丝茧越冬。
4.成虫体长在4.6-6毫米之间,翅展10.6-15毫米。
全体灰褐色,无光泽。
头部具有灰色鳞片,触角丝状,下唇须灰褐色向上翘。
成虫的后翅,暗褐色,基部较淡,缘毛黄褐色。
梨小食心虫(Grapholitha molesta Busck )属鳞翅目(Lepidoptera )卷蛾科(Tortricidae ),是世界性分布的蛀果害虫。
我国除西藏外,其他各地均有分布。
梨小食心虫寄主广泛,可为害桃、梨、苹果、杏等10余种果树,是果园主要害虫之一[1,2]。
由于其具有钻蛀习性,幼虫大部分时期是在嫩梢和果实中度过的,因此,如果用药不及时,很难对其进行有效防治。
目前生产上对梨小食心虫的防治仍然以化学防治为主。
而化学农药具有污染环境、杀伤天敌、危害果品安全、破坏生态平衡等缺点[3,4],因此,急需绿色、环保、安全的梨小食心虫防控技术。
害虫综合治理符合当前人们对绿色环保的要求,成为人们关注的焦点。
在害虫综合治理体系中,诱捕是重要的组成部分。
诱捕就是利用害虫对某种物质的趋性,制成诱捕器,大量诱杀成虫,达到降低虫口密度、减轻为害的目的。
在梨小食心虫的诱捕防治中,主要的诱源物质包括性信息素、糖醋液、植物源挥发物、光源等。
作者对梨小食心虫不同诱源物质的研究进展进行了介绍,对各种诱源物质的特点进行了总结,旨为各类诱源物质的田间应用提供参考。
冉红凡1,刘文旭1,马爱红1,孙海鹏2,李建成1,路子云1*(1.河北省农林科学院植物保护研究所,河北省农业有害生物综合防治工程技术研究中心,农业部华北北部作物有害生物综合治理重点实验室,河北保定071000;2.河北农业大学林学院,河北保定071001)摘要:梨小食心虫是世界性分布的蛀果害虫,具有钻蛀为害习性,因此很难进行有效防治。
害虫综合治理符合当前人们对环保的要求,成为关注的焦点。
在梨小食心虫综合治理体系中,诱捕诱杀成虫是重要的组成部分。
目前在梨小食心虫的诱捕防治中,主要的诱源物质包括性信息素、糖醋液、植物源引诱剂、光源等。
介绍了不同诱源物质的研究进展、影响因素等,并对其应用前景进行了分析。
关键词:梨小食心虫;害虫综合治理;诱源物质;研究进展中图分类号:S436.6文献标识码:A 文章编号:1008-1631(2016)05-0051-08收稿日期:2016-03-18基金项目:河北省农林科学院科技研究与发展计划项目(A2015120303);公益性行业(农业)科研专项(201103024);国家梨现代产业技术体系项目(CARS-29);河北省农林科学院财政项目(F16C10004)作者简介:冉红凡(1976-),男,河北保定人,助理研究员,博士,主要从事害虫生物防治研究。
梨小食心虫发生规律及高效防治技术作者:武志强来源:《果农之友》2012年第09期近几年来,由于受气候变暖、农药使用量和次数的增加等因素的影响,梨小食心虫在山西省运城市发生和危害程度逐年加重,尤其在未套袋的晚熟酥梨、早熟红香酥梨和各品种桃中,在梨小食心虫发生严重的年份,危害率在50%以上。
为了有效防治此类害虫的危害,现将运城市果园梨小食心虫发生规律和高效防治技术介绍如下,供参考。
1 梨小食心虫发生严重的原因(1)梨、桃混栽或相邻建园给梨小食心虫提供丰富的食物来源,第1、2代危害桃梢和桃果,第3、4代危害梨果,发生世代重叠,没有明显的高峰和低谷,使果农不能有效、针对性防治,使梨小食心虫危害越来越严重。
(2)由于监测技术不到位及梨小食心虫透明状的卵极难发现和识别,果农只能大量、频繁使用农药进行防治,在运城市梨园中防治梨小食心虫的药剂甚至在10次以上,滥用农药,使其效果大幅下降。
2 梨小食心虫发生规律(1)桃梨混栽或间隔栽种的果园梨小食心虫发生严重,第1、2代梨小食心虫在桃树上危害桃梢、桃果,待梨果膨大、初步着色期第3、4代梨小食心虫开始在梨果上产卵、蛀果,进行危害。
(2)运城市梨小食心虫越冬代成虫一般在3月中a下旬开始发生,4月上旬达到高峰期,全年发生4~5代。
春季雨水较多、气候偏暖的年份,越冬代梨小食心发生严重。
夏季雨季较多的年份,第2、3代梨小食心虫发生严重。
第1、2代梨小食心虫成虫发生趋势明显,从第3代开始有明显的世代重叠现象,没有明显的发生高峰和低谷。
3 梨小食心虫高效防治技术(1)物理防治。
在9月中下旬,结合防治红蜘蛛等在树干上越冬的害虫,于8月下旬或早熟果实收获后在距地面80厘米高的树干上绑缚诱虫带,诱虫带为陕西省西北农林科技大学的专利产品,有两层纸组成,内层为瓦楞形,每个树干上1个,于深冬或初春萌动前解下,集中烧毁,可有效诱捕梨小食心虫、苹果红蜘蛛、康氏粉蚧、苹果卷叶蛾等害虫,明显降低越冬害虫的基数。
摘要:梨小食心虫,Grapholitha molesta (Busck ),属鳞翅目卷蛾科小食心虫属,又名梨小蛀果蛾、东方果蠹蛾。
广泛发生于我国各地,尤以东北、华北、华东、西北各桃果产区发生偏重,主要寄主有梨、桃、李、杏、海棠、樱桃、杨梅等。
随着天镇县种植苹果、梨面积的逐年加大,梨小食心虫的为害逐年加重,轻则减产5%,重则减产80%,给果农造成很大的损失。
本文从梨小食心虫的为害症状、形态特征、习性及发生规律、重度发生的原因,综合防治措施五个方面进行论述,以实现科学高效防治,提高果品品质,增加果农收益。
关键词:为害症状;形态特征;习性及发生规律;防治措施中图分类号:S436文献标识码:ADOI 编号:10.14025/ki.jlny.2019.23.050刘红飞(天镇县植保植检站,山西天镇038200)梨小食心虫的发生与防治zhi wu bao hu细胞增殖主要分为3个不同的类型,包括皮肤组织细胞瘤,反应性组织细胞增多症(皮肤型和系统型)以及组织细胞肉瘤(局部型和弥散型)。
已经有报道称发现了组织细胞肉瘤的亚型,称为“嗜血细胞性组织细胞肉瘤”,这些肿瘤由于免疫组织化学染色的结果与巨噬细胞一致(CD11d+,CD11c-,MHCII+,最低程度的CD1表达),而与树突细胞不一致,因此,将其区分出来。
临床病例中,在脾脏和骨髓中发现过该类肿瘤,并且由于肿瘤细胞能够吞噬物质(包括宿主红细胞)而更具有侵袭性。
组织细胞肉瘤,是起源于树突细胞的恶性肿瘤,分为局部型和弥散型。
组织细胞肉瘤在已知确定的一些品种个种更为常见,包括伯恩山犬,平毛猎犬,罗威纳犬等,表明遗传因素与易感性具有一定的关系。
但是,也可能发生在其他品种的犬上。
大多数的病例发生于中年或者老年犬,但是曾经有报道称在3岁犬上也发现了该肿瘤。
组织细胞肉瘤可能只涉及局部的器官,也有可能是弥散型的,涉及多个器官。
目前,局部和弥散型的组织细胞肉瘤发病机理并未清楚。
梨小食心虫的发生、危害及防治措施!梨小食心虫简称梨小,又名梨小蛀果蛾、桃折梢虫,属于鳞翅目、卷蛾科。
近年发生呈现加重趋势,造成梨果早落、腐烂,将严重影响梨果的品质及经济效益。
下面就梨小食心虫的发生规律和防治技术作一介绍,以供生产者参考。
发生规律梨小食心虫在我国长江、黄河流域为害比较严重。
梨小食心虫在华北每年发生3~4代,华南可发生6~7代。
有转寄主危害习性,第1、2代主要危害梨、桃新梢,第3、4代危害梨果。
以老熟幼虫在树干翘皮缝、根颈处、树冠下浅土层结灰白茧越冬。
翌年3月下旬老熟幼虫化蛹,蛹期20天。
4月上旬成虫开始羽化,时间集中在每天上午9:00-10:00。
成虫昼伏夜出,白天静止于枝叶杂草中,夜晚活动交尾,具明显的趋光性和趋化性。
成虫羽化后次日即可开始交尾产卵,散产,多集中新梢顶端第3~5片叶背,每雌产卵70~80粒。
幼虫5月上旬孵化,5月中旬为第1代幼虫危害盛期,主要危害梨、桃新梢,幼虫从叶柄基部蛀入新梢,有转梢危害习性。
6月下旬至7月上旬为第2代幼虫发生期,7月下旬至9月上旬为第3、4代梨小发生期,出现世代重叠,成虫卵产在果实萼洼和两果相接处。
随枝条木质化程度逐渐增强,水分含量相对减少,幼虫于6月下旬至7月中旬,开始钻蛀果实危害。
幼虫蛀食果实从梗凹处蛀入,一般1个果1头幼虫,严重时达3~4头,出现大量落果、烂果现象。
9月下旬至10月上旬老熟幼虫陆续脱果越冬。
梨小食心虫危害危害症状幼虫孵化后,前期由于梨果较小,石细胞多,果实较硬,不适合幼虫蛀食,而选择取食新梢。
幼虫从新梢顶端3~4片叶柄基部钻入,向下蛀食新梢髓部。
当蛀食到枝条硬化部分时,从新梢中爬出,转移到另一梢为害,1头幼虫一生可为害2~3个新梢。
新梢蛀孔有流胶并伴虫粪排出,枝条顶端萎蔫下垂,形似“折梢”,该症状为识别梨小食心虫的重要标志。
梨小食心虫—为害梨果实幼虫危害梨果时,多从梨果实萼洼和梗洼处蛀入,开始入果孔很小,呈青绿色,稍凹陷,从孔内排出虫粪,外有丝网连结。
杨天宇:梨小食心虫线粒体基因全分析及进化树的构建 1 梨小食心虫线粒体基因全分析及进化树的构建
摘要:伴随着生物信息学的发展,现在越来越多的学科接受了生物信息学的分析手段和分析方法,并将生物信息学的分析结果作为验证实验成果的有力依据。梨小食心虫的危害也越来越突出,并且梨小食心虫的研究也已经进入了分子研究阶段,非常需要生物信息学的科学分析方法和分析结论,为其分子水平的结果作有力论证。本论题的研究主要内容为运用生物信息学的各种成熟软件对从NCBI数据库中获取的梨小食心虫体内的线粒体基因全序列进行生物学分析,重点对基因的数列、外显子信息、编码蛋白及其理化性质进行分析,并预测其编码蛋白的结构与功能,并通过与代表性的生物进行同源进化树的构建。通过实验论证,我们得出梨小食心虫线粒体基因的NCBI的登录号NC 014806,基因全长为15717bp,为一环形的双链DNA,于6748~7299处存在一个长552bp的开放阅读框,可编码为183个氨基酸,其翻译的蛋白质为酸性蛋白,亲水性较强,且以α–螺旋肽链盘绕为主,其序列与日本的野桑蚕线粒体有很高的同源性。经过与八种物种进行多序列比对,构建进化树,我们可以得知梨小食心虫与其中的茶小卷叶蛾、朝灰蝶进化关系关系最近。 关键词:生物信息学;梨小食心虫;线粒体基因序列;基因分析;进化树 山西农业大学本科毕业论文(设计)
2 The complete analysis of Grapholita molesta mitochondrial DNA and the construction of the evolutionary tree
Abstract: With the development of bioinformatics, more and more subjects accept of the tools and analytical methods of bioinformatics, and the result of bioinformatics analysis can be as a strong basis for the verification. Grapholitha molesta’s hazards has become increasingly prominent, and Grapholitha molesta’s research has entered a phase of molecular studies, a great need for the scientific analysis methods and conclusions of the bioinformatics, make a strong argument for the results of its molecular.The main content of this study is to use a variety of sophisticated bioinformatics software to analysis the mitochondrial gene sequences of the pear borer obtained from the NCBI database , focusing on the gene sequence, exon information,coding proteins and their physical and chemical properties, and forecast its encoded protein structure and function, to expect the valuable biological data obtained from the mass of biological data, and to construct the evolution tree through the compare with the representation of the biology. Through experiments, we can know that the Grapholitha molesta mitochondrial gene sequences is circular double-stranded DNA, the NCBI accession number for the NC 014806, Full-length is 15717bp,and between 6748 and 7299 exist of a long open reading frame of 552bp, encoding 183 amino acids,whose translation of the protein is acidic protein, a strong hydrophilic, and coiled-based by α-helical peptide chain, the sequence have a high homology with the Japan wild silkworm mitochondria. Through the construction of evolutionary tree, we know that Grapholitha molesta with Adoxophyes honmai and Coreana raphaelis have the recently evolutionary relationship in the eight species. Key words:Bioinformatics;Grapholitha molesta;mitochondrial DNA sequence;Genetic analysis; evolutionary tree; 杨天宇:梨小食心虫线粒体基因全分析及进化树的构建
3 1 前言(Introduction) ....................................................................................................................... 5 2 材料和方法(Marerials and Methods) .......................................................................................... 6 2.1 研究思路 ........................................................................................................................................ 6 2.2 搜索基因 ........................................................................................................................................ 6 2.2.1 在NCBI中搜索梨小食心虫线粒体全基因序列 .............................................................. 6 2.2.2 用DNAMAN分析其基因结构 ......................................................................................... 7 2.2.3 碱基同源性分析的方法 ..................................................................................................... 7 2.2.4 开放性阅读框(ORF)分析的方法 ................................................................................. 7 2.3 基因编码蛋白质的理化性质分析 ................................................................................................ 7 2.3.1 氨基酸组成、分子质量、等电点分析方法 ..................................................................... 7 2.3.2 亲疏水性分析方法 ............................................................................................................. 7 2.4 基因编码蛋白质的结构分析 ........................................................................................................ 8 2.4.1 蛋白质的二级结构分析 ..................................................................................................... 8 2.4.2 蛋白质的三级结构分析 ..................................................................................................... 8 2.5 基因编码蛋白质的功能分析 ........................................................................................................ 8 2.5.1 信号肽预测的方法 ............................................................................................................. 8 2.5.2 磷酸化位点分析的方法 ..................................................................................................... 9 2.5.3 亚细胞定位的方法 ............................................................................................................. 9 2.5.4 二硫键分析的方法 ........................................................................................................... 10 2.6 构建系统进化树 .......................................................................................................................... 10 2.7 生物信息学主要软件介绍 .......................................................................................................... 11 2.7.1 DNAMAN ......................................................................................................................... 11 2.7.2 ExPaSy .............................................................................................................................. 11 2.7.3 Clustalx .............................................................................................................................. 11 3 结果与分析(Results and Analysis) ................................................................................................. 12