动物组织块DNA的提取
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实验目的】(1 )学习并掌握动物组织总DNA 的提取方法及其原理。
(2 )从肝脏组织中提取到一定量的纯净的DNA 样品。
【实验原理】
DNA 是一切生物细胞的重要组成成分,主要存在于细胞核中。通过研磨和SDS 作用破碎细胞;苯酚和氯仿可使蛋白质变性,用其混合液(酚:氯仿:异戊醇)重复抽提,使蛋白质变性,然后离心除去变性蛋白质;RNase 降解RNA ,从而得到纯净的DNA 分子。【仪器、材料、试剂】
(一)仪器1.高速离心机
2.烘箱
3.冰箱
4.水浴锅
5.微量移液器
6.高压灭菌锅
(二)材料
1.生理盐水
2.十二烷基硫酸钠(SDS )
3.三羟甲基氨基甲烷(Tris )4.乙二胺四乙酸(EDTA )
5.饱和酚
6.氯仿
7.异戊醇
8.无水乙醇
9.75% 乙醇
10.蛋白酶K
11.RNase 酶
12.手术剪刀、镊子、吸水纸
13.微量取液器
14 .研钵、1.5mL 离心管、一次性手套、1.5mL 离心管架、记号笔
三)试剂配制
1.Tris -HCL 1mol/L PH8.0 50ml
配制方法:
40ml 双蒸水,6.057g 固体Tris 放入烧杯中溶解,用浓盐酸调PH 值到8 . 0 ,转移到50ml
容量瓶中,加入双蒸水定容,摇匀后,转到准备好的输液瓶中,贴上标签,高压灭菌后,降至室温,4 C保存备用。
2.生理盐水: 0.85%NaCL 100ml
配制方法:
在20ml 双蒸水中溶解0.85g 固体NaCL ,加水定容至100ml ,摇匀后,转到准备好的输液瓶中,贴上标签,高压灭菌后,降至室温,4C保存备用。
3.EDTA 0.5mol/L PH8.0 50ml
配制方法:
将9.08g的EDTA Na2・2H2O 溶解于40ml双蒸水,用1g的NaOH颗粒(慢慢逐步加入)
调PH 值到8.0,用50ml 容量瓶定容,如果EDTA 难溶,先加NaOH 溶解,然后逐步加
EDTA- Na2-2H2O。
4.TES 缓冲液(释放DNA )100ml
配制方法:
将0.5844g 的5 mol/lNaCl 溶解于80ml 双蒸水,在分别加入1ml 的0.5 mol/l EDTA 、
0.2ml 的Tris-HCl (pH=8.0),加定容至100ml, 摇匀后,转到准备好的输液瓶中,贴上标签,高压灭菌后,降至室温,4 C保存备用。
5.10% SDS (变性剂破细胞壁)100ml
配制方法:
将10g的十二烷基硫酸钠(SDS )溶解于80ml双蒸水于68 C加热溶解,用浓HCI调至PH=7.2,定容至100ml,摇匀后,转到准备好的输液瓶中,贴上标签, 4 C保存备用。
6.蛋白酶K (降解蛋白质):20mg/mL 无菌三蒸水溶解。
7.RNA 酶(降解RNA)
配制方法:
将胰RNA 酶(RNA 酶A)溶于10mmol/L 的Tris CL (PH7.5 )、15mmol/LNaCL 中,配成
10mg/ml的浓度,于100 C加热15min,缓慢冷却至室温,分装成小份存于£0 C。
8.氯仿:异戊醇=24:1 100ml
按24:1的比例加入氯仿、异戊醇,摇匀,转到准备好的瓶中,贴上标签,4C保存备用。9.TE 缓冲液(溶解DNA)PH8.0 50ml
配制方法:
将0.5ml 的10mmol Tris-HCl(PH8.0)、0.1ml 的0.5mol/l EDTA(PH8.0)加入到50ml 的容
量瓶中,调PH8.0 定容至50ml 摇匀后,转到准备好的瓶中,贴上标签,高压灭菌后,降至室温,4 C保存备用。
【实验步骤】
1 .组织块解冻,用生理盐水洗去血污,剪取约0.5g 组织,放入1.5ml 离心管中,剪碎。
2.加入0.45ml TES 混匀,再加入50ul SDS (10%), 5.0ul 蛋白酶K (20mg/ml ),充分混匀后,于56° C保温4-6h,每2h摇1次。
3 .放置到室温,加入等体积饱和酚(500ul ),颠倒混匀,10000r/m,离心10m,分离水相和有机相,小心吸取上层含核酸的水相,到一个新的 1.5ml 离心管。
4.加入等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),颠倒混匀,10000r/m ,离心10分钟,取上层转移到新的1.5ml 离心管中。
5.加入等体积氯仿:异戊醇(24:1),颠倒混匀,10000r/m ,离心10 分钟,取上层清液到一个新的1.5ml 离心管。
6.加入2.5 倍体积的-20°C 预冷的无水乙醇沉淀DNA ,观察现象。
7.12000 r/m ,离心10 分钟,弃乙醇。
8.-20 °C 保存的75% 乙醇洗涤,10000 r/m ,离心5 分钟,去乙醇,55°C 干燥DNA 。
9 .加入适量TE溶解DNA (具体依DNA的多少而定),-20 °C保存备用。
【注意事项】
1 .抽提每一步用力要柔和,防止机械剪切力对DNA 的损伤。
2.取上层清液时,注意不要吸起中间的蛋白质层。
3.乙醇漂洗去乙醇时,不要荡起DNA。
4.离心后,不要晃动离心管,拿管要稳,斜面朝外。