ch6 3,4-2008-基因组学
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遗传药理学---中南大学遗传药理研究所
作者:周宏灏 刘… 文章来源:本站原创 点击数:29046 更新时间:2008-12-26 14:36:37
遗 传 药 理 学
中南大学遗传药理研究所 周宏灏 刘洁
(原载于刘耕陶主编:当代药理学,中国协和医科大学出版社,2008年5月)
遗传药理学(pharmacogenetics)是研究人体先天性遗传变异引起的药物代谢酶、药物转运体和药物作用靶点功能异常,导致药物代谢和效应群体和个体差异的一门科学。近些年来,遗传药理学已成为生命科学中发展迅速和备受关注的研究领域。这是因为它从基因到基因的表达来解释药物治疗效应和不良反应的根本机理,因为它运用分子生物学的最新技术和方法来研究药物的作用,也因为它把从分子水平的学科到临床水平的学科,包括药理学、生理学、遗传学、基因组学、临床医学、流行病学、统计学、生物信息学、生物计算机学等多学科联合到一起来阐明药物的作用和作用机理。
药物反应个体差异是临床药物治疗中常见的普遍现象,因此,目前运用的传统药物治疗模式,即根据疾病的诊断实行“一病一药一剂量”治疗方案常常在部分病人中或是无效、或是发生严重不良反应甚至毒性反应。引起药物反应个体差异的原因很多,有性别、年龄、伴随的疾病、体重等,而其中尤为重要的是遗传因素,而这恰恰被忽视。随着新世纪的到来和生命科学的迅猛发展,人类对药物治疗的要求发生了重大变化。人类基因组计划的实施和进展,促进了遗传药理学和药物基因组学(pharmacogenomics)的发展。近20年来遗传药理学的研究证实了药物代谢酶、转运体和药物作用靶点的基因多态性是药物反应个体差异的原因,阐明了药物处置和效应差异的遗传本质。药物基因组学是应用已获得的遗传信息预测药物治疗结果(治疗性和毒性作用),以促进药物的开发,并为以每个病人的基因结构为基础的合理药物治疗提供科学依据。从而使药物治疗模式开始由过去的诊断导向治疗(diagnosis-directed drug therapy)向根据个体的遗传结构实行基因导向性治疗(gene-directed drug therapy)的新模式转换,美国华尔街日报敏锐地于1999年4月16日以“针对个人独特的遗传特征的个体化用药的新时代”(New era of personalized medicine: targeting drugs for each
·研究论文·Chinese Journal of Animal Infectious Diseases中国动物传染病学报
E亚群禽白血病病毒分离株的全基因组序列分析
摘 要:为了弄清江苏省某一地方品种种鸡场病死鸡的死亡原因,采集病死鸡组织,检测显示仅为ALV阳性;通过CEF和DF-1细胞培养、p27抗原检测和间接免疫荧光(IFA)对病毒进行鉴定;对病毒分离株前病毒DNA序列进行全基因组序列测定与分析。结果显示:分离株能够在CEF上生长,上清液中可检测到p27抗原,CEF出现特异性绿色荧光,DF-1细胞培养物以上检测均为阴性,初步表明分离株为ALV-E,命名为JY202106;其基因组大小为7529 bp,符合复制完整型C型反转录病毒特征,缺乏肿瘤基因;序列分析显示,分离株与参考株同源性为84.3%~98.7%,gp85进化分析分离株与ALV-E同属一个进化分支,与ev-1株同源性高达99.2%。研究表明地方品种鸡中存在内源性ALV,为该病的防控提供了参考和依据,也丰富了ALV基因组数据资料。关键词:禽白血病病毒;E亚群;分离鉴定;基因组分析中图分类号:S852.65 文献标志码:A 文章编号:1674-6422(2023)03-0134-08Whole Genome Sequencing of an Avian Leukosis Virus Subgroup E Isolate
WU Zhi1,2, WU Shuang2, YUAN Huisha2, ZHANG Cong2, ZHU Shanyuan2, FAN Hongjie1(1. Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China; 2. Jiangsu Key Laboratory for High-Tech Research and Development of Veterinary Biopharmaceuticals, Engineering Technology Research Center for Modern Animal Science and Novel Veterinary Pharmaceutic Development, Jiangsu Agri-Animal Husbandry Vocational College, Taizhou 225300, China)
原核、真核生物基因及表达调控
引言
现代生物学中“基因”一词甚为流行,细胞学、遗传学、生物化学等,以及各种生物学课本中,都涉及到“基因”一词。甚至象典型的宏观生物学科——生态学,也把一片森林称为一个“基因库”[1]。现代生物学已经完全证明,DNA分子是由称为核普酸的有机分子线性聚合而成。基因就是核普酸按一定顺序排列而成的DNA分子片段,它携带着遗传信息。基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。其实质就是遗传信息的转录和翻译。在个体生长发育过程中,生物遗传信息的表达按一定的时序发生变化(时序调节),并随着内外环境的变化而不断加以修正(环境调控)[2]。原核生物和真核生物的基因及表达过程有着差异。随着世界分子生物学研究不断深入,基因表达技术有了很大的提高。迄今为止,人们已经研究开发出多种原核和真核表达系统用以生产重组蛋白[3]。
一.原核、真核生物基因结构
原核生物基因分为编码区与非编码区,所谓的编码区就是能转录为相应的信使RNA,进而指导蛋白质的合成,非编码区位于编码区的上游及下游。[4]在调控遗传信息表达的核苷酸序列中最重要的是位于编码区上游的RNA聚合酶结合位点。RNA聚合酶是催化DNA转录为RNA,能识别调控序列中的结合位点,并与其结合。真核生物基因结构见图1:
图1 真核生物基因结构
二.原核、真核生物基因结构的区别
最主要的在于真核基因是不连续的,而原核基因是连续的。所谓真核基因的不连续,即一个基因的编码序列也叫外显子,被一个或多个非编码序列,又叫内含子所间隔。[5]这些内含子和外显子同属一个转录单位,转录形成前体。经过转录的加工,即切去内含子,重新连按外显子,从而得到成熟。而绝大多数的原核基因是连续的,没有内含子的间隔,转录产生成熟。不仅如此,而且凡在代谢途径上功能有关的多个基因可能紧密相联,与它们的调控基因一起组成一个操纵子,转录到一条链。[6]因此,原核是多顺反子结构,而真核则是单一的顺反子。原核、真核生物基因组也存在着区别,见图2[7]:
禾谷镰刀菌基因组学研究进展
张大军,邱德文,蒋伶活* (中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室,北京100081)
摘要 禾谷镰刀菌是小麦和大麦生产上一类重大的病原真菌。禾谷镰刀菌全基因组测序的完成,为禾谷镰刀菌功能基因的发掘提供了十分有利的信息。简述了禾谷镰刀菌在基因组学,包括比较基因组学和功能基因组学等领域的研究进展。关键词 禾谷镰刀菌;比较基因组学;功能基因组学中图分类号 S188 文献标识码 A 文章编号 0517-6611(2009)17-07892-03
ResearchProgressontheGenomicsofFusariumgraminearumZHANGDa-junetal (StateKeyLaboratoryforBiologyofPlantDiseaseandInsectPests,InstituteofPlantProtection,ChineseAcademyofAgricultur-alSciences,Beijing100081)Abstract Fusariumgraminearumisamajorfungalpathogenonwheatandbarleyproduction.ThecompletionofF.graminearumgenomicsequencingprovidesvaluableinformationforstudyingthefunctionalgenesofFusariumgraminearum.TherecentresearchprogressonthegenomicsofFusariumgraminearumwerereviewed,suchascomparativegenomicsandfunctionalgenomics.Keywords Fusariumgraminearum;Comparativegenomics;Functionalgenomics