甘蓝型油菜及近缘种中异质型ACCase亚基accD编码基因的克隆及序列分析
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甘蓝型油菜REVEILLE家族鉴定及诱导表达分析
刘蓉;田闵玉;李光泽;谭成方;阮颖;刘春林
【期刊名称】《生物技术通报》
【年(卷),期】2024(40)6
【摘 要】【目的】REVEILLE家族基因具有重要生物学功能,而在甘蓝型油菜(Brassica napus L.)中该家族基因研究较少,深入认识甘蓝型油菜中RVE家族基因功能及其与非生物胁迫的关系。【方法】利用生物信息学方法,在甘蓝型油菜、白菜(Brassica rapa)和甘蓝(B.oleracea)中分别鉴定到33、16和16个RVE基因,并对其系统进化、染色体定位、基因结构和理化性质以及启动子顺式元件进行分析。【结果】所有的RVE蛋白被分为两个亚家族。33个BnaRVE分别定位在18条A亚基因组的染色体和15条C亚基因组的染色体上。大部分成员属于较稳定的疏水蛋白;多数Ka/Ks值小于1,说明该家族受到强烈的纯化选择作用。基因结构变异较大,内含子数目在4-11之间。共线性分析结果表明,甘蓝型油菜和拟南芥、白菜、甘蓝存在大量的同源基因。大部分甘蓝型油菜RVE家族成员在子叶和叶都有表达且表达量最多。BnaRVE启动子上含有大量与激素和生物逆境相关的元件,通过定量PCR分析,4个BnaRVE在ABA与MeJA诱导和低温胁迫下的表达量显著上调。【结论】在甘蓝型油菜基因组中鉴定出33个BnaRVE家族成员。不同基因在不同发育时期和不同组织中表现出不同的表达模式。不同基因对各种胁迫存在响应,且表达模式不一。RVE家族成员对ABA、MeJA和冷胁迫具有正向响应功能。
【总页数】11页(P161-171)
【作 者】刘蓉;田闵玉;李光泽;谭成方;阮颖;刘春林 【作者单位】作物代谢调控与代谢工程实验室、湖南农业大学农学院;作物表观遗传调控与发育湖南省重点实验室、湖南农业大学生物科技学院
【正文语种】中 文
【中图分类】Q94
【相关文献】
1.甘蓝型油菜光敏色素(PHY)家族基因的鉴定及表达分析2.甘蓝型油菜BnFUL基因家族全基因组鉴定与表达分析3.甘蓝型油菜WOX基因家族的鉴定与表达分析4.甘蓝型油菜MAP70基因家族全基因组鉴定与表达分析5.甘蓝型油菜HIPPs基因家族的鉴定与表达分析
作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2009, 35(1): 71−78 /zwxb/ ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9 E-mail: xbzw@
本研究由国家自然科学基金资助项目(30170600), 湖北省自然科学基金项目(2001ABD113)资助。 * 通讯作者(Corresponding author): 甘莉, E-mail: ganli@; Tel: 027-87287376; Fax: 027-87287376 第一作者联系方式: E-mail: yangyang401@(杨鸯鸯); leeyun307@(李云) **共同第一作者 Received(收稿日期): 2008-04-20; Accepted(接受日期): 2008-06-15.
DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.00071
甘蓝型油菜Cu/ZnSOD和FeSOD基因的克隆及菌核病菌诱导表达
杨鸯鸯 李 云** 丁 勇 徐春雷 张成桂 刘 英 甘 莉*
华中农业大学植物科学技术学院, 湖北武汉 430070
摘 要: 依据拟南芥、芥菜型油菜和白菜已知超氧化物歧化酶(SOD)保守序列设计引物, 用同源序列法和RT-RACE
技术克隆甘蓝型油菜Cu/ZnSOD和FeSOD基因, 经序列分析和基因片段拼接, 得到Cu/ZnSOD和FeSOD基因的全长
cDNA, 分别为756 bp (GenBank登录号AY970822)和1 037 bp (GenBank登录号EF634058)。以cDNA序列设计引
物, 获得1 322 bp的Cu/ZnSOD基因组DNA (GenBank登录号DQ431853)和1 659 bp的FeSOD基因组DNA (GenBank
我国发现自己的油菜低芥酸基因源
中国农业科学院油料作物研究所卢长明研究员领导的研究小组从我国的甘蓝型双低油菜中发现并克隆到我国特有的低芥酸基因(基因数据库AY888037),成为在我国油菜品种中首次发现的不同于国外油菜低芥酸基因的基因源。基因测序、基因库检索和序列比对分析表明,该品种控制芥酸合成的关键基因FAE1存在由4个碱基的缺失导致的移码突变,其编码蛋白质的第282位氨基酸为丝氨酸,与一般的高芥酸品种相同,不同于迄今为止国内外报道的低芥酸油菜单核苷酸突变类型。
无芥酸或低芥酸含量是油菜籽优良食用品质的重要指标。二十世纪60年代初加拿大科学家从德国饲料用油菜品种LIHO中发现低芥酸单株,从而培育成为世界上第一个无芥酸的春油菜品种ORO。60年代后,ORO品种先后引种到世界各国,引发了世界的低芥酸油菜育种,大大推动了油菜籽品质改良。迄今为止,国内外还没有第二个低芥酸基因源的报道。
1974年我国农业部从加拿大引进甘蓝型油菜低芥酸或无芥酸种质资源ORO及其衍生品系并开始试种。1976年起我国一些农业科研单位着手进行低芥酸油菜的育种工作。1981年中国农业科学院油料作物研究所选育出81001等7个低芥酸油菜品系。其后,我国低芥酸油菜育种不断取得新的进展。目前,我国已经选育了一批杂交或常规低芥酸油菜品种,并实现了优质高产的基本目标。90年代以来我国低芥酸油菜品种推广迅速,目前全国低芥酸品种的种植面积已达到全国油菜播种面积的70%左右。
由于低芥酸基因来源单一,我国油菜育种长期无法摆脱近亲繁殖带来的不良后果,产量与品质的矛盾以及优质与抗病性的矛盾日显突出。新型低芥酸基因源的发现将为我国油菜育种走出困境提供重要的物质基础。
甘蓝型油菜酸性磷酸酶与磷营养关系的研究的开题报告
一、研究背景及意义
油菜是全球重要的油料和蔬菜作物之一,其生长过程中的磷(P)吸收和利用至关重要。磷酸酶是植物体内参与磷代谢的关键酶之一,其中酸性磷酸酶(ACP)是大多数植物细胞膜上的主要磷酸酶。研究表明,ACP参与了植物根尖吸收、转运和储存P的过程,因此对于磷代谢和油菜生长发育具有重要的作用。
二、研究目的
本研究旨在探究甘蓝型油菜中ACP基因的表达及其与磷代谢之间的关系,为油菜磷营养调控和改良提供理论依据。
三、研究内容和方法
1. 采集甘蓝型油菜在不同生长期不同部位的样品,提取总RNA并进行cDNA合成;
2. 通过基因克隆技术获得甘蓝型油菜ACP基因序列;
3. 对甘蓝型油菜不同生长期不同部位中ACP基因的表达量进行定量分析;
4. 通过磷素的不同浓度处理,研究ACP基因表达与磷素浓度的关系。
四、研究预期结果
1. 成功克隆甘蓝型油菜ACP基因序列;
2. 研究不同生长期不同部位中ACP基因的表达量差异;
3. 研究磷素浓度对于ACP基因表达量的影响。
五、研究意义和创新点
本研究对于理解甘蓝型油菜磷代谢机制,优化其磷营养水平,提高油菜产量和品质具有重要意义。同时,本研究揭示了ACP基因在油菜磷代谢中的作用,为油菜基因研究提供创新点。