鸡传染性贫血病毒广西株全基因组的克隆与序列分析
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广西一株流行猪瘟毒株全基因序列的克隆和序列分析郑加宾;张志;吴发兴;张燕霞;朱小甫;单虎;李晓成【期刊名称】《中国动物检疫》【年(卷),期】2008(025)003【摘要】本实验参照已发表的猪瘟病毒(CSFV)石门株、HCLV株、Paderborn株、GXWZ02株等的基因组序列设计合成了11对引物,通过RT-PCR方法从广西一株流行猪瘟病料中直接扩增得到了11个片段,将所得片段克隆至PGEM-Teasy载体上,经过测序、拼接,最终得到广西猪瘟GX54基因组全序列.序列分析表明,GX54基因组全长12296个碱基.与国内外已发表的10株猪瘟病毒系列进行同源性分析,结果表明,与各株核苷酸同源性分别为85.1%、85.0%、85.1%、84.7%、84.8%、94.4%、84.3%、94.3%、84.8%、84.5%.系统发育树分析发现,所比较的11个毒株可以分为2群,1群包括GX54,GXWZ02和Paderborn株,其余毒株属于2群,其中GX54株与GXWZ02株关系最近.【总页数】3页(P23-25)【作者】郑加宾;张志;吴发兴;张燕霞;朱小甫;单虎;李晓成【作者单位】青岛农业大学,青岛,266109;中国动物卫生与流行病学中心,青岛,266032;中国动物卫生与流行病学中心,青岛,266032;中国动物卫生与流行病学中心,青岛,266032;中国动物卫生与流行病学中心,青岛,266032;瑞普(保定)生物药业有限公司,保定,071000;青岛农业大学,青岛,266109;中国动物卫生与流行病学中心,青岛,266032【正文语种】中文【中图分类】S8【相关文献】1.福建省猪瘟病毒流行毒株E0基因的克隆与序列分析 [J], 张磊;王晶钰;张志;李晓成;朱小甫2.1株山东猪瘟病毒流行毒株全基因组的克隆与序列分析 [J], 吴旭锦;朱小甫;朱辉3.2006-2007年陕西省古典猪瘟流行毒株E0基因的克隆及序列分析 [J], 吴旭锦;朱小甫;陈德坤4.广西流行的猪瘟病毒株E2基因序列测定及分析 [J], 廖素环;罗廷荣;吴显实;刘芳;陆芹章;黄伟坚;温荣辉;秦爱珍;余克伦5.广西猪瘟流行毒株全基因组的克隆与序列分析 [J], 吴显实;罗廷荣*;廖素环;刘芳;陆芹章;黄伟坚;温荣辉;秦爱珍;余克伦因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
鸡传染性支气管炎病毒的研究进展鸡传染性支气管炎(Avian Infectious Bronchitis,IB)是鸡的一种急性、高度接触性传染病,它主要侵害呼吸系统、泌尿生殖系统和消化系统。
本病呈世界性分布,对养鸡业的危害极大,它能使成鸡的增重和饲料报酬降低,鸡蛋的产量、质量和孵化率下降,并直接导致雏鸡死亡、肾脏病变和输卵管永久性退化;另外,IB还经常做为病因之一参与混合感染,例如诱发慢性呼吸道病(CRD)的爆发,近年来,该病的流行呈上升趋势,尤其肾病变型IB已蔓延至全国各养鸡地区,造成了严重的经济损失。
本病最早由美国Schalk和Hawn报道,临床以患鸡咳嗽、喷嚏和气管哕音的呼吸道症状为主,之后陆续在世界各国发生,1936年Beach和Schalm确定病原为病毒(呼吸型IBV),后命名为鸡传染性支气管炎病毒(Infectious Bronchitis Virus,IBV),归入冠状病毒科,是冠状病毒的代表株。
1972年邝荣禄等首次在广东证实我国也有该病发生。
传染性支气管炎病毒血清型较多,常见的有Massachussetts、Connecticat、lowa97、Iowa609、Hotle、JMK、Clark333、SEl7、Florida、Arkanass99和Australian“T”。
1962年Wintefield等首次报道了肾型IBV,可引起肾脏肿大、尿酸盐沉积等症状。
1986年E1 Houadfi等在摩洛哥首次分离到以G株为代表的嗜肠型IBV,主要引起呼吸道、肾脏及肠道病变。
Gough等首先报道了英国存在一种新的特殊IBV血清型793/B,而来自西班牙、德国、希腊和墨西哥可疑血清样本中亦可发现抗此血清型IBV的特异性抗体,法国、荷兰、意大利、泰国等均有此血清型IBV的存在。
IBV基因组核酸RNA复制的不连续机制及RNA聚合酶的不完全校对机制,使得病毒RNA在复制过程中易发生基因点突变、插入、缺失或重组,造成大量IBV变异株的出现,目前世界上已分离到的IB血清型已达30种之多,不同血清型毒株疫苗之间仅有部分或无交叉保护作用,IB的多血清型性为其免疫预防增加了难度。
广西鸡源H9N2亚型禽流感病毒分离鉴定及遗传进化分析张艳雯;何永权;吴云月;于冬玲;曾文榜;宁志鹏【期刊名称】《南方农业学报》【年(卷),期】2018(049)004【摘要】[目的]明确广西鸡源H9N2亚型禽流感病毒(AIV)的分子遗传变异规律及其对公共卫生安全的影响,为H9亚型禽流感(AI)的防控提供参考依据.[方法]从广西某肉鸡养殖场采集病料,经SPF鸡胚接种进行病毒分离,对初步鉴定为H9亚型AIV 分离株的HA、NA、PB2、PB1、PA、NP、M和NS等8个基因片段进行克隆测定及遗传进化分析,同时对分离毒株的生物学特性进行测定.[结果]从广西发病鸡群中分离获得一株H9N2亚型AIV,命名为A/chicken/Guangxi/BT1/2016(H9N2).分离毒株A/chicken/Guangxi/BT1/2016(H9N2)HA基因的裂解位点为PSRSSR↓GLF,具有典型的低致病性AIV(LPAIV)分子特征,在遗传进化关系上属于4.2.5分支,与国内常用H9N2亚型AIV疫苗株所属的4.2.3分支存在一定差异;其他7个基因也分别来源于不同的AIV亚型.分离毒株A/chicken/Guangxi/BT1/2016 (H9N2)同时具备与α-2,3唾液酸和α-2,6唾液酸受体结合的特性,且具有感染人类的潜在风险;其感染鸡群后病毒分布主要集中在气管、肺脏和脾脏,可通过呼吸道和消化道同时排毒,且在攻毒后第1d即开始排毒,第5d为排毒高峰.[结论]从广西发病鸡群中分离获得的A/chicken/Guangxi/BT1/2016(H9N2)属于LPAIV,是由不同亚型AIV重组产生的H9N2亚型新毒株,可导致鸡群疫苗免疫失败,且具有感染人类的潜在风险.【总页数】7页(P780-786)【作者】张艳雯;何永权;吴云月;于冬玲;曾文榜;宁志鹏【作者单位】南宁学院,南宁530200;病毒学国家重点实验室,武汉430072;南宁市山凤农牧投资有限公司,南宁530000;南宁学院,南宁530200;南宁学院,南宁530200;南宁学院,南宁530200;南宁学院,南宁530200【正文语种】中文【中图分类】S858.31【相关文献】1.河南地区一株鸡源H9N2亚型禽流感病毒的分离鉴定及HA基因变异分析 [J], 王丽荣;董永军;杭柏林;刘兴友;王三虎;胡建和2.一株鸡源H9N2亚型禽流感病毒的致病性及其HA基因遗传进化分析 [J], 汪萍;刘丽娅;金映红;沙依兰·卡依扎;陆桂丽;夏俊;成进3.一株鸡源H9N2亚型禽流感病毒的分离鉴定 [J], 陈翠腾;施少华;黄瑜;傅光华;万春和;陈珍;朱春华;刘荣昌;傅秋玲;程龙飞;陈红梅4.广西鸡源H9N2亚型禽流感病毒分离鉴定及遗传进化分析 [J], 张艳雯;何永权;吴云月;于冬玲;曾文榜;宁志鹏;;;;;;;5.湖北地区鸡源H9N2亚型禽流感病毒的分离鉴定及遗传进化分析 [J], 任助;王毅;温国元;商雨;薛玉涵;李林涛;唐国毅;李丽;罗青平;王红琳;邵华斌因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄櫄 273(1):207-214.[13]LiuX,PanH,YangG,etal.Cloning,expressionandbiochemicalcharacterizationofabasic-acidichybridphospholipaseA2-ⅡfromAgkistrodonhalysPallas[J].BiochimicaetBiophysicaActa,1999,1431(1):157-165.[14]徐为民,卞 欢,王道营,等.鸭肉肌内磷脂酶解反应条件优化及其产物鉴定[J].江苏农业学报,2012,28(5):1130-1134.[15]王道营.肌内磷脂酶在传统板鸭加工中对磷脂的降解作用研究[D].南京:南京农业大学,2014.[16]李海珍,李 斌,张丽君,等.竹叶青蛇毒磷脂酶A2的克隆与表达[C]//全国酶学学术讨论会.杭州,2011.[17]BarroncasellaEA,KicklerTS,RogersOC,etal.Expressionandpurificationoffunctionalrecombinantepitopesfortheplateletantigens,PlA1andPlA2[J].Blood,1994,84(4):1157-1163.[18]PremzlA,KotnikV,KvederR,etal.Urineanalysissuggestsassociationcomplementactivationandapoptosiswithmembranousglomerulopatientsnephritis[J].MolecularImmunology,1999,36(4/5):306.[19]UpretiGC,HallEL,KoppensD,etal.StudiesonthemeasurementofphospholipaseA2(PLA2)andPLA2inhibitoractivitiesinramsemen[J].AnimalReproductionScience,1999,56(2):107-121.[20]TerpeK.Overviewoftagproteinfusions:frommolecularandbiochemicalfundamentalstocommercialsystems[J].AppliedMicrobiologyandBiotechnology,2003,60(5):523-533.孙芬芬,高玉龙,潘 伟,等.鸡传染性贫血病毒衣壳蛋白的截短表达及其兔抗血清制备[J].江苏农业科学,2018,46(17):175-177.doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2018.17.045鸡传染性贫血病毒衣壳蛋白的截短表达及其兔抗血清制备孙芬芬1,2,高玉龙2,潘 伟3,王笑梅2(1.徐州医科大学形态学实验教学中心,江苏徐州221004;2.中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江哈尔滨150001;3.徐州医科大学病原生物学与免疫学教研室/江苏省免疫与代谢重点实验室,江苏徐州221004) 摘要:通过制备原核表达鸡传染性贫血病毒衣壳蛋白(VP1),以进行抗VP1蛋白兔源血清制备。
吴 芸,欧正淼,殴小?,等.赤水乌骨鸡PTGDS基因克隆、序列特征及组织表达分析[J].江苏农业科学,2023,51(23):22-27.doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2023.23.004赤水乌骨鸡PTGDS基因克隆、序列特征及组织表达分析吴 芸1,欧正淼2,殴小?2,陈粉粉2,闫吉美1,李盼盼1(1.遵义师范学院生物与农业科技学院,贵州遵义563006;2.西南林业大学生命科学学院,云南昆明650224) 摘要:为研究赤水乌骨鸡PTGDS基因的结构和功能,检测其在赤水乌骨鸡不同组织、胸肌和腿肌中的表达情况,探究PTGDS基因对赤水乌骨鸡肉质性能的影响。
运用RT-PCR获得PTGDS基因CDS序列,对其氨基酸序列进行生物信息学分析,揭示其结构特征和亲缘关系,同时通过qPCR检测赤水乌骨鸡PTGDS基因在同一时期不同组织中的表达特性。
结果显示,赤水乌骨鸡PTGDS基因编码区长558bp,编码186个氨基酸,保守性分析发现赤水乌骨鸡PTGDS基因与原鸡的同源性最高,核酸和氨基酸序列比对同源性分别为100%;系统进化分析发现,赤水乌骨鸡与原鸡的亲缘关系最近,与黑天鹅和鸿雁的亲缘关系最远。
PTGDS基因在各组织中均有表达,在肾中的表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05);肌肉中腿肌的表达量高于胸肌,但差异不显著(P>0.05)。
研究结果可为进一步揭示PTGDS基因的功能和调控机制提供参考。
关键词:赤水乌骨鸡;PTGDS基因;生物信息学分析;组织mRNA表达 中图分类号:S831.2 文献标志码:A 文章编号:1002-1302(2023)23-0022-06收稿日期:2023-02-03基金项目:贵州省教育厅特色领域项目(编号:黔教合KY字[2019]076);遵义师范学院服务地方产业革命项目(编号:遵师合地方产业字[2020]05号);遵义师范学院博士启动基金(编号:遵师BS[2017]15号)。
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4、只要用点心,其余只是接受。
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5、人生就如调料一样,在人生中也有很多坎坷和曲折,我们在坎坷,曲折中找到前进动力和方向。
6、生命是单程路,不论你怎样转变抹用,都不会走回头,你一旦明白和接受这一点。
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7、我喜欢孤独,因为孤独也是一种享受,离开喧嚣的闹市,去一个山清水秀的地方,过着简朴清淡,清心寡欲的生活,别有一番风味。
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9、人生中最艰难的是选择;工作中最困难的是创新;生活中最痛苦的是自扰;做人中最苦恼的是委屈。
10、要是光明算得人生第一个恋爱对象,那么恋爱不就是心的光明吗,恋爱是我们第二次的脱胎换骨。
11、如果你知道你的具体的目的地,而且向它迈出了第一步,你便走上了成功之路!用小步而不是迈大步越过一个个障碍,你就会走向成功的巅峰。
12、你硬把单纯的事情看的很严重,那样子你会很痛苦。
13、结婚前你告诉我,你最大的优点就是贤惠,结婚后才发现,你真是只能闲着,啥也不会!14、以平和的心态、谈泊的心境看待得失,这样,你才能平静地快乐地生活。
无论得与失,不会因为你的喜或忧而多一些或少一些。
15、人生是一场旅行,要懂得好好欣赏每一段的风景。
16、不怕路远,就怕志短;不怕缓慢,就怕常站;不怕贫穷,就怕惰懒;不怕对手悍,就怕自己颤。
17、当一个人先从自己的内心开始奋斗,他就是个有价值的人。