与小麦抗白粉病基因Pm37连锁的分子标记及其应用的生产技术
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小麦传统育种在过去几十年中,取得了瞩目成就。然而,传统育种往往具有一定的盲目性,无法 保持稳定的增长。利用分子育种则可以在较少的回交代数中去除不利基因,加速育种进程
(Chhetri et al. Development of robust molecular markers for marker-assisted selection of leaf rust resistance gene Lr23 in common and durumwheat breeding programs. Molecular Breeding. 2017, 37: 21)。在小麦抗病分子育种过程中,遗传标记的开发及遗传连锁图谱的构建起到了至关重要的作 用。迄今已经发表了多张四倍体和六倍体小麦的遗传图谱,小麦参考基因组序列不断完善(The InternationalWheat Genome Sequencing Consortium. Shifting the limits in wheat research andbreeding using a fully annotated reference genome[J]. Science, 2018, 361(6403): eaar7191;Ling et al. Genome sequence of the progenitor of wheat AsubgenomeTriticumurartu[J]. Nature, 2018, 557:424-428;Zhao et al. TheAegilopstauschii genome reveals multiple impacts of transposons[J]. Natureplants, 2017, 3: 946955),小麦优异基因分子标记的开发效率大大提高,这有效促进了小麦抗病分子育种的进程 (Semagn et al. Single nucleotide polymorphismgenotyping using kompetitive allele specific PCR (KASP): overview of thetechnology and its application in crop improvement. Molecular Breeding. 2016,33:1–14.)。
所述分子标记YTURGA的上游引物为YTURGA-F,其核苷酸序列如下所示:
YTURGA-F:5' - 3':TGAGCTCCACTACTTCATCATCCAG;
所述分子标记YTURGA的下游引物为YTURGA-R,其核苷酸序列如下所示;
YTURGA-R:5' - 3':AGTGTATTTCCTCCATCACTGACT;
5.一种权利要求1-4所述的任一项与小麦抗白粉病基因Pm37连锁的分子标记在小麦抗白粉病基因 Pm37的定位、检测或图位克隆中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,检测小麦抗白粉病基因Pm37的方法包括以下步骤:
(1)从待测样品的幼嫩叶片提取小麦基因组DNA;
(2)利用分子标记YTURGA的上游引物和下游引物对所述基因组DNA进行PCR扩增,获得扩增 产物;所述分子标记YTURGA的引物包括上游引物YTURGA-F和下游引物YTURGA-R;所述上游 引物YTURGA-F的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;所述下游引物YTURGA-R的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;
标记,大大影响了在育种上的应用效率(李洪杰等,中国小麦品种对白粉病的抗性反应与抗病基
因检测. 作物学报.2011, 37:943-954;Li et al. Characterization of Pm65, a new powdery mildewresistance gene on chromosome 2AL of a facultative wheat cultivar.Theoretical and Applied Genetics. 2019, 132:2625–2632)。因此,加强广谱抗白粉病基因在生产上的高效利用可有效防控
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述PCR扩增的体系为10μL,包含30 ng/μL小麦基因 组DNA 1.0 μL、10×PCR buffer 1.0μL、10 mMdNTP 0.2μL、10 mM MgCl2 1.0μL、5U Taq聚合酶 0.2μL、5μM的上游引物0.4μL、5μM的下游引物0.4μL和无菌去离子水5.8μL;所述PCR扩增的程序 为:94℃预变性8分钟;94℃变性30秒,57℃退火40秒,延伸40秒,36个循环;72℃延伸10min; 4℃保存。
所述PCR扩增程序为:94℃预变性8分钟;94℃变性30秒,57℃退火40秒,延伸40秒,36个循环; 72℃延伸10min;扩增完毕后,扩增产物4℃保存。
扩增产物电泳分离在质量百分比浓度为8%的变性聚丙烯酰胺凝胶上进行,扩增电压为280 V恒 压,电泳时间为3h。
本技术提供的与小麦抗白粉病基因Pm37连锁的分子标记在小麦抗白粉病基因Pm37检测和图位克隆
以所述分子标记YTURGA的上游引物和下游引物对小麦基因组DNA进行PCR扩增,对扩增产物进 行电泳分离,获得扩增产物分子量为296bp,该段扩增产物即为与Pm37连锁的分子标记。
所述PCR扩增体系为10μL体系:30 ng/μL小麦基因组DNA 1.0 μL、10×PCR buffer1.0μL、10 mMdNTP 0.2μL、10 mM MgCl2 1.0μL、5U Taq聚合酶0.2μL、5μM上游引物0.4μL、5μM下游引物 0.4μL和无菌去离子水5.8μL。
(3)PCR扩增产物检测:在质量百分比浓度为8%的变性聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳,将所述扩 增产物和6μL上样缓冲液混合后,取2μL混合物点样,280V恒压下电泳3h,硝酸银染色后拍照,若 能扩增出296bp的特异条带,说明待测小麦种质中存在抗白粉病基因Pm37,否则,待测小麦种质 中不存在小麦抗白粉病基因Pm37。
本技术公开了一种与小麦抗白粉病基因Pm37连锁的分子标记及其应用;所述分子标记YTURGA的 上游引物为YTURGA F,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;所述分子标记YTURGA的下游引物 为YTURGA R,其核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;以所述分子标记YTURGA的标记引物对小麦 基因组DNA进行PCR扩增,将扩增产物电泳分离,获得对应的扩增产物分子量为296bp,即为与小 麦抗白粉病基因Pm37连锁的分子标记。本技术开发的与Pm37连锁的分子标记YTURGA,可高效 检测作图群体,应用于Pm37的分子标记定位和图位克隆;可高效检测育种群体,提高转移抗病基 因Pm37基因的效率,加快Pm37基因不同遗传背景抗白粉病小麦新品种的培育,提高小麦抗白粉病
小麦抗白粉病基因Pm37是一个源于提莫菲维小麦(Triticumtimopheevii,AAGG)的广谱抗白粉病 基因,目前已被转育到普通小麦品系NC99BGTAG11背景下,被定位在小麦7AL染色体上 (Perugini et al. Pm37, a new broadly effective powdery mildewresistance gene from Triticumtimopheevii. Theoretical and Applied Genetics.2008, 116:417–425)。经本实验室27个不同毒 性白粉病菌株抗谱分析表明, Pm37基因对所有菌株均表现免疫,是一个具有广谱抗性的优秀抗白 粉病基因,但是Pm37目前尚无育种可用标记报道,大大影响了Pm37在分子育种中的利用。因此, 若能开发与Pm37连锁的分子标记,且可用于高效检测和追踪该抗白粉病基因,对实现Pm37的高效
8.一种权利要求1-4所述的任一项与小麦抗白粉病基因Pm37连锁的分子标记在小麦分子标记辅助选
择育种中的应用。
技术说明书
一种与小麦抗白粉病基因Pm37连锁的分子标记及其应用
技术领域
本技术涉及小麦分子生物技术与育种应用领域,具体地说是一种与小麦抗白粉病基因Pm37连锁的
分子标记及其应用。
背景技术
小麦白粉病是小麦病害中最严重的三大病害之一(Ma et al. Characterizationof a powdery mildew resistance gene in wheat breeding line 10V-2 and itsapplication in marker-assisted selection. Plant Disease. 2018, 102:925–931.),严重威胁小麦安全生产。在众多小麦白粉病防治措施中,利用品 种抗性是最为经济、有效和环保的策略(Petersen et al. Mapping of powdery mildew resistance genePm53introgressed from Aegilopsspeltoides into soft red winter wheat.Theoretical and Applied Genetics. 2015, 128:303-312.)。
育种利用具有非常重要的价值和意义。
技术内容
本技术的目的是提供一种与小麦抗白粉病基因Pmቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ7连锁的分子标记及其应用,为高效检测小麦抗 白粉病基因Pm37提供了便利工具,应用于基因克隆和抗白粉病分子标记辅助选择育种。
本技术是通过以下方法实现的:一种与小麦抗白粉病基因Pm37连锁的分子标记,该分子标记是显 性标记YTURGA;
抗病基因是培育抗病品种的基础。迄今,已发现了70多个正式命名的小麦抗白粉病基因,分布在 53个位点(McIntosh et al. Catalogue of gene symbols for wheat:2017 supplement. http://www.shigen.nig.ac.jp/wheat/komugi/genes/symbolClassList.jsp. 2017)。但是,很多抗病基因由 于品种-菌群的互作逐渐丧失了对白粉病的抗性,一些有效抗病基因又因为缺少可利用的育种可用