昆虫总RNA提取
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提取方法:SDS蛋白酶K法
提取试剂:A液:Tris 0.05mol/L;NaCl 0.1mol/L;EDTA 0.1mol/L;Ph=7.0~8.0.
B液:5%SDS
C液:20mg/ml 蛋白酶K
RNase 10mg/ml、Tris饱和酚(pH=8.0)、氯仿/异戊醇(24:1)
提取步骤:
(1) 提取DNA前,先用70%的乙醇和无菌水先清洗虫体三遍,以去除虫体表面可能附
着的杂质。
(2) 取昆虫组织加入1.5ml离心管中,加入100µlA液用研磨棒研磨至基本透亮,再加
入380µlA液冲洗研磨棒,然后加入B液60µl、C液6µl。58℃金属浴3~4小时。
(3) 加入RNase至终浓度100µg/ml,充分混匀后60℃金属浴30min。
(4) 反应液冷却至室温,加入等体积的饱和酚,温和地上下转动混匀,反复该动作10min,
切勿剧烈震荡。温室5000g离心15min。取上清至一干净的离心管中。重复该步直至水相与
液相交界处看不到白色的蛋白质为止,取上清。
(5) 上清中加入等体积的氯仿/异戊醇,上下缓慢颠倒10次,室温8000g离心10min,
取上清。
(6) 上清中加入两倍体积的预冷无水乙醇,-20℃冰箱内放置10min,沉淀DNA,12000g
离心10min,弃上清。
(7) 在留有沉淀的离心管中加入1ml 70%的预冷无水乙醇洗涤DNA,12000g离心5min,
弃上清。
(8) 管口向下,在室温自然干燥DNA,向干燥的DNA中加入适量TE(30~50µl)溶解,
4℃保存。
DNA的检测
纯度及浓度检测:使用微量分光光度计(NanoDrop2000/2000c)对所提取DNA进行检测,
若OD260/OD280的值在1.7~1.9之间(>1.9,表明有RNA污染;<1.6,表明有蛋白质、酚等污
染)。用于PCR扩增的DNA浓度应在100ng/µl左右。
完整性检测:取2~5µl样品与载样缓冲液(Loading Buffer)2µl混合,点样于1.0%的琼脂糖
凝胶,然后置于1×TAE缓冲液中电泳,电泳电压为110V,时间约30min。用凝胶成像系统检
测基因条带的有无,若出现明显条带则说明完整性良好。
昆虫总RNA提取:
(所有操作都在无菌操作台内进行,实验样品在冰盒上保存,4℃低温离心,操作人员带好
口罩和胶皮手套防止污染)
1. 将昆虫冷冻或新鲜组织在1.5ml离心管中加入500μl的Trizol快速研磨均匀(研磨时间
不宜超过2min),活体昆虫研磨前要清洗,去除表皮杂质。研磨完用500μlTrizol冲洗研
磨棒。静置5min,使得核蛋白与核酸完全分离。10000rpm4℃离心10min取上清。
2. 加入200μl的氯仿,剧烈振荡15sec,冰上放置5min,每1min上下混匀一次,10000rpm4℃
离心10min,取上清。
3. 取上清液转移至干净的离心管中,加入等体积的预冷异丙醇,混匀,-20℃放置20min,
沉淀RNA。
4. 10000rpm4℃离心10min,弃上清。
5. 加入1ml75%的乙醇洗涤沉淀。10000rpm4℃离心5min,弃上清。冰上干燥5min。
6. 加入30-50μl的RNase-free ddHKO,充分溶解RNA。将所得的RNA溶液置于-70℃保存或
用于后续实验。
总RNA质量检测
RNA纯品OD260/OD280 1.7-2.0 低(蛋白质或酚污染) 高RNA有降解
OD260/OD230 大于2.0 低表明有小分子盐污染
稀释到浓度500-1000ng/μl
电泳
RNA 反转cDNA
(RNA性质不稳定提出的RNA最好在第一时间进行反转形成cDNA以便进行后续实验)
1. 基因组DNA消除
2 5 X gDNA Eraser Buffer 2.0μl
1 gDNA Eraser 1.0μl
total RNA 1.0μl
6 RNase Free dH2O 6 .0μl
10μl
42℃ 2min
Store at 4℃
2. 反转录反应
4 5 X PrimeScript Buffer 2(for real time) 4.0μl
3 PrimeScript RT Enzyme Mix 1 1.0μl
5 RT Primer Mix 1.0μl
6 RNase Free dH2O 4.0μl
20μl
反应时间
37℃ 15min
85℃ 5sec
Store at 4℃