生物药学作业题
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1.改造鼠源性单克隆抗体的首要目的是 C. 降低免疫源性
2.能用于防治血栓的酶类药物有( ）Ｄ．尿激酶
3.以下可用于菌种纯化的方法有（)B. 平板划线
4.下列属于多肽激素类生物药物的是（ )D．降钙素
5.由于目的蛋白质和杂蛋白分子量差别较大，拟根据分子量大小分离纯化并获得目的蛋白质，可采用 ( )C. 凝胶过滤
6. 获得目的基因最常用的方法是：B． PCR 技术
7.促红细胞生长素（ＥPO)基因能在大肠杆菌中表达,但却不能用大肠杆菌的基因工程菌生产人的促红细胞生长素，这是因为： (）
D. 大肠杆菌不能使人的促红细胞生长素糖基化
8.以下能用重组ＤNＡ技术生产的药物为 (） B. 生长素
9.以大肠杆菌为目的基因的表达体系，下列正确的是：(）Ｃ. 容易培养，产物提纯简单
10.外源基因在动物细胞与大肠杆菌中表达产物的主要区别是()A. 糖基化
11.筛选杂交瘤细胞（脾-瘤融合细胞)选用的培养基是 :（）Ｂ． HＡT
12.鼠源性单克隆抗体改造后得到小分子抗体，常用的是() B.单链抗体
13.能够实现微生物菌种定向改造的方法是（ )Ｄ.基因工程
14.目前分离的１000多种抗生素,约2/3产自（）B. 放线菌
15.基因表达最常用的宿主菌是:(）B.大肠杆菌
16.分离纯化早期,由于提取液中成分复杂，目的物浓度稀，因而易采用( )A．分离量大分辨率低的方法
17.能够用沙土管保存的菌种是( ）C.青霉菌
18.人类第一个基因工程药物是： (）Ａ.人胰岛素
19.外源基因的高效表达会影响宿主细胞正常的生长代谢。A.√
20.抗体中结合抗原的部位分布在恒定区B．×
21.质粒不具有自主复制能力。Ｂ．×
22.单克隆抗体就是单链抗体B．×
23.单克隆抗体只识别一种表位(抗原决定簇)的高纯度抗体,一般来自单个B淋巴细胞的克隆或一个杂交瘤细胞的克隆。Ａ.√
24.PCR是聚合酶链式反应法的缩写A．√
25.生物药物指包括生物制品在内的生物体的初级和次极代谢产物或生物体的某一组成部分,甚至整个生物体用作诊断和治疗疾病的医药品。A.√
26.细胞因子:由细胞分泌的能调节生物有机体生理功能，参与细胞的增殖、分化和凋亡的小分子多肽物质
27.生物药物:利用生物体、生物组织或其成分,综合应用生物学、生物化学、微生物学、免疫学、物理化学、生物技术和现代药学的原理和方法，进行加工、制造而成的一大类用于预防、治疗和诊断疾病的制品
28.发酵工程制药：采用现代工程技术手段，利用微生物的某些特定功能，为人类生产有用的药品，或直接把微生物应用于工业生产过程的一种新技术。
29.诱变育种:诱变育种是指有意识地将生物体暴露于物理的、化学的或生物的一种或多种诱变因子下,促使生物体发生突变，进而从突变体中筛选具有优良性状的突变株的过程。
30.基因表达:基因表达是指结构基因在生物体中的转录、翻译以及所有加工过程。
31.抗体药物:用于治疗的单克隆抗体、抗体片段、基因工程改造的抗体、免疫偶联物以及融合蛋白均可统称为抗体药物
32.亚单位疫苗：不含病原体核酸,选用能诱发宿主产生中和抗体的微生物蛋白或表面抗原而制成
的疫苗。
33.人-鼠嵌合抗体:嵌合抗体是最早制备成功的基因工程抗体。它是由鼠源性抗体的V区基因与人抗体的C区基因拼接为嵌合基因,然后插入载体,转染骨髓瘤组织表达的抗体分子。因其减少了鼠源成分，从而降低了鼠源性抗体引起的不良反应,并有助于提高疗效。
34.基因工程药物：利用DNＡ重组技术生产出来的药物被称为基因工程药物。
35.疫苗:用于人工主动免疫的生物制品。
36.多肽药物:多肽和蛋白质类药物指用于预防、治疗和诊断的多肽和蛋白质类物质生物药物
37.生物技术制药：生物技术制药是指运用微生物学、生物学、医学、生物化学等的研究成果,从生物体、生物组织、细胞、体液等,综合利用微生物学、化学、生物化学、生物技术、药学等科学的原理和方法进行药物制造的技术。
38.原生质体融合：用脱壁酶处理将微生物细胞壁去除,制成原生质，再用聚乙二醇(PEG)促进原生质体发生融合,从而获得融合子的技术。
39.治疗性酶:传统的药物分子作为受体激动剂或抑制剂也能起到酶治疗的部分效果，但是它们没有催化功能，不能介导级联反应。酶的应用包括溶解血栓以促进灌注水平和加强对癌细胞的毒性
40.核酸药物:具有药理活性的天然结构的核酸类物质和人工合成合成的核酸类物质
41.杂交育种:杂交育种一般指将两个基因型不同的菌株通过接合使遗传物质重新组合,再从中分离和筛选出具有新性状的菌株。杂交后的杂种不仅能克服原有菌种活力衰退的趋势，而且,杂交育种使得遗传物质重新组合,扩大了变异范围,改善了产品的质量和产量。
42.单克隆抗体：利用杂交瘤技术制备的单克隆抗体及其衍生物,由一个识别一种抗原表位的 B 细胞克隆产生的同源抗体
43.发酵工程产品开发的关键是筛选到高效菌株，一般优良菌种的选育方法主要有自然选育、诱变育种和原生质体融合。自然选育、诱变育种、原生质体融合
44.基因工程药物制造的主要步骤是：；； ; ；。
基因工程药物制造的主要步骤是: 目的基因的获得 ; 构建DNA重组体；构建工程菌；目的基因的表达; 产物的分离纯化 ; 产品的检验。
45.根据真核基因在原核细胞中表达的特点，表达载体必须具备那些条件?
表达载体必须具备下列条件:
(１）能够独立的复制;
（2）具有灵活的克隆位点和方便的筛选标记,以利于外源基因的克隆、鉴定和筛选；
(３)应具有很强的启动子,能为大肠杆菌的RAＮ聚合酶所识别；
(4)应具有阻遏子
（5）应具有很强的终止子
（6)所产生的mRNＡ必须具有翻译的起始信号。
46.列举两种亚单位疫苗
白喉类毒素、破伤风类毒素;流感嗜血杆菌荚膜多糖、脑膜炎球菌荚膜多糖;流感病毒血凝素和神经氨酸酶;乙型肝炎HBsＡｇ(基因工程疫苗）；人乳头瘤病毒
47.简述生物药物的药理学特性答：1、活性强：体内存在的天然活性物质。 2、治疗针对性强,基于生理生化机制。3、毒副作用一般较少，营养价值高。4、可能具免疫原性或产生过敏反应。48．简述发酵工程制药的基本过程答：1．菌种的选育2. 培养基的配置3 灭菌 4.扩大培养和接种５.发酵过程６.分离提纯
49基因工程制药过程中阳性克隆的筛选方法有哪些
答:１．根据重组子遗传重组表型改变的筛选法,包括利用抗生素抗性基因进行筛选
通过α互补使菌产生颜色来筛选,利用报告基因筛选克隆子；2.根据重组子结构特征的筛选法，包括琼脂糖凝胶电泳比较重组DNA的大小，限制性内切酶分析,印迹杂交方法,PＣＲ法和DNＡ的序列分析;根据表达产物采用免疫化学方法筛选
50.简述抗体药物的研发历史答；
第一阶段以18９0年Behriｎg发现白喉抗毒素为代表,其特点是用抗原免疫动物来获得多克隆抗体。
第二阶段以１975年Ｋohler创建杂交瘤技术制备单克隆抗体为代表。
1９8６年,美国FDA批准了世界上第一个单抗治疗性药物——抗CＤ3单抗OKT3进入市场，用于器官移植时的抗排斥反应,此时单克隆抗体的研制和应用达到了顶点
第三阶段以１994年Ｗｉnter以基因工程方法制备人源化抗体为代表
51简述基因工程药物的质量控制要点答：1蛋白质含量的测定。2蛋白质纯度检测。３蛋白质Mr测定。4蛋白质等电点测定。5蛋白质序列分析。6内毒素分析，宿主蛋白液和酸残留分析
５２简述生物药物的用途
答：1）作为治疗药物2)作为预防药物3）作为诊断药物4)用作其他生物医药用品
53.简述单克隆抗体经筛选和克隆化的杂交瘤细胞仅能合成及分泌单一抗原表位的特异性抗体，是单克隆抗体。单抗的制作过程大体分为抗原的制备,动物的免疫,b细胞与骨髓瘤细胞融合形成杂交瘤细胞,筛选杂交瘤细胞,筛选能产生某种特异性单抗的杂交瘤细胞，杂交瘤细胞的克隆化,体外大规模培养或动物腹腔培养特异性杂交瘤细胞克隆,单抗的纯化及鉴定。
54.简述基因工程制药的主要步骤 ;； ; ; 。基因工程药物制造的主要步骤是：目的基因的获得；构建DＮA重组体; 构建工程菌；目的基因的表达 ;产物的分离纯化；产品的检验。
55.比较蛋白和多肽药物的差异，并分别列举三个多肽和蛋白质药物的名称和功能
相对大分子蛋白或抗体类，多肽在常温下却更稳定,用量更少,单位活性也更高;与大分子蛋白相比,多肽化学合成技术成熟,多肽容易与杂质或副产品分离;重组蛋白的质量、纯度和产量都难以保证。重组蛋白也不能引人非天然氨基酸,不能在末端酰胺化,同时生产周期长,成本高；多肽一般比蛋白抗体类药物成本低,但比很多小分子药物的合成成本高。
多肽药物：格拉替雷，用于治疗多发性硬化症；兰瑞肽、伐普肽、巾白瑞肽、somatoprim 和司格列肽等,用于治疗胃肠胰内分泌肿瘤、肢端肥大症等多种相关疾病。
蛋白药物：重组人胰岛素,用于治疗糖尿病;重组人促红细胞生成素，用于治疗贫血；重组人甲状旁腺激素，用于治疗骨质疏松症。
56.如何控制基因工程药物质量？基因工程药物的质量控制要点如下。1蛋白质含量的测定。2蛋白质纯度检测。3蛋白质Mr测定。4蛋白质等电点测定。5蛋白质序列分析。６内毒素分析,宿主蛋白液和酸残留分析
57.什么是单克隆抗体？简述制备过程。答：经筛选和克隆化的杂交瘤细胞仅能合成及分泌单一抗原表位的特异性抗体,是单克隆抗体。单抗的制作过程大体分为抗原的制备,动物的免疫,b细胞与骨髓瘤细胞融合形成杂交瘤细胞,筛选杂交瘤细胞,筛选能产生某种特异性单抗的杂交瘤细胞，杂交
瘤细胞的克隆化,体外大规模培养或动物腹腔培养特异性杂交瘤细胞克隆，单抗的纯化及鉴定。58.比较基因工程疫苗和传统疫苗。答：基因工程疫苗：1、免疫原性良好、效果持久及交叉免疫防护 2、可精细设计、便于操作、制备简便 3、能制备联合疫苗 4、能重复利用 5、可用于免疫治疗。虽然基因工程疫苗拥有传统疫苗所没有的优越性,但是目前还存在一下不足与缺点:１、安全性尚不稳定２、免疫效果有待提高 3、抗核酸免疫反应。
59.基因工程制药过程中阳性克隆的筛选方法有哪些?1．根据重组子遗传重组表型改变的筛选法,包括利用抗生素抗性基因进行筛选
通过α互补使菌产生颜色来筛选,利用报告基因筛选克隆子；2．根据重组子结构特征的筛选法,包括琼脂糖凝胶电泳比较重组DNA的大小，限制性内切酶分析，印迹杂交方法,PCＲ法和DNＡ的序列分析 ;根据表达产物采用免疫化学方法筛选
60.何谓治疗性疫苗。比较治疗性疫苗和预防性疫苗的区别。治疗性疫苗是指在已感染病原微生物或已患有某些疾病的机体中,通过诱导特异性的免疫应答,达到治疗或防止疾病恶化的天然，人工合成或用基因重组技术表达的产品或制品。治疗性疫苗与预防性疫苗的主要区别是,一、预防性疫苗主要作用于未感染机体。而治疗性疫苗的作用对象作为曾经感染的病原体。二、治疗性疫苗能打破机体的免疫耐受状态，预防性疫苗可通过实验室进行监测,结果可靠,而预防性疫苗可能有一定的不良反应伴有不同程度免疫损伤较为复杂且其准确性尚有争议激发免疫应答的类型不同。
61.综合分析生物药物和化学药物的差异,以及这些差异对药物的治疗领域和给药类型的影响
小分子化学药通常是化学合成的,而大分子生物药则通常是生物合成的。源头的不同就直接造成两者在结构、成分、生产方法和设备、知识产权、配方、保存方法、剂量、监管方式以及销售方式均有不同。
与合成的小分子化学药相比,生物药在分子大小上要大一百至上千倍。比如抗体药分子量高达15万道尔顿,而化学药通常不到1000道尔顿。有报道将小分子化学药的大小比作一辆自行车,而生物药的个头则相当于一架飞机，其实两者的区别不仅仅是分子大小的差别。更重要的是,生物药的分子结构要远比化学药复杂。
相似还是仿制？
由于生物药具有更大的分子量和复杂的结构,生物药的表征面临很大挑战。但由于上述特点,即使目前全世界最先进的仪器设备全用上,也不可能将生物药的结构等特性完全表征清楚。这些特点也注定生物仿制药不可能完全和原研药一模一样，即使是同一家公司生产的同一种生物药,不同批次也会有差异。即使是同一批次,在储存、流通的过程中,生物药(尤其是蛋白类药物)的结构和活性也不可避免地会有所变化。
对于生物仿制药生产商而言,由于知识产权保护等多种原因，原研药公司所采用的生产工艺甚至是所采用的细胞系都会不清楚，这就更导致生物仿制药与原研药不会一样。另外，对于生物药而言，其生产及流通过程更加复杂,要求也更高，有许多步骤,细胞培养的条件（温度和营养）、产品的加工、纯化、储存和包装等各个环节都会影响产品的生产，整个过程中的微小差别都可能会对最终产品的质量、纯度、生物特性以及临床效果产生较大影响。
正由于上述种种原因,虽然化学仿制药的英文是genｅric ｄrug,但是生物仿制药并非是ｂioｇeneric，而是ｂiosiｍiｌaｒ，因为生物仿制药只可能与原研药“相似”(ｓimilar），绝不可能一样。正是由于这个原因，中国有业内人士认为ｂioｓiｍｉlar应该被译为生物相似药，而非生物仿制药。
而对于传统的小分子化学药而言,一般都有非常确定而且稳定的化学结构，现有的分析方法(比如红外、核磁共振、X-射线衍射、质谱等）足以将其化学结构完全搞清楚。总的来说,生物药的生产对于其生产条件的要求远比化学药苛刻，当然生产成本也更高，而且生物药的临床前和临床阶段的研发成本也更高。
监管差别
基于此，监管机构（尤其在欧美）要求生物仿制药生产商提供足够的临床数据，这也导致生物仿制药在获批上市前的仿制成本往往比化学药高上百倍。也正是由于生物仿制药高昂的仿制成本和生产成本,一般生物仿制药和原研药相比,只能降价1０%~3０%,而化学仿制药则可高达80%甚至更高。所以，化学原研药一旦专利过期,就会受到仿制药的猛烈冲击,而化学仿制药也会很快抢占市场；生物原研药则在专利过期后，其销量受仿制药的影响较小。生物药和化学药的另外一个重要区别是它们的免疫原性，几乎所有的治疗性蛋白都会在人体内产生抗体。它们会通过中和内源性因子而降低活力甚至诱发严重的副作用。
上市后的监管同样有区别。化学仿制药由于和原研药结构相同,且结构简单,欧美监管机构允许自动替换政策(即药剂师可以自主用化学仿制药替换原研药）,无须通知开处方的医生。而对于生物仿制药,欧盟法规明确要求不允许自动替换。尽管美国目前还没有明确要求,但是目前看,以后的政策有可能向欧盟靠近。这对于有志于进军生物仿制药的企业而言,也是一个潜在的风险。
所以,相较于化学药，更加复杂并且通常也更加昂贵的生物药推向市场也面临更大的挑战，尤其是对于低收入水平的发展中国家而言。尽管目前在我国，本土生物药(如干扰素、生长因子等）在总的药物市场所占比例较小，而在欧美获批的创新生物药数量近几年基本占获批新药总量的三成以上,由于生物药价格一般更高，生物药的市场份额在全球不断快速上升(2011年约占16％）。
62阐述鼠源性单克隆抗体改造后的小分子抗体类型和应用
（1）人－鼠嵌合抗体将鼠MAb的可变区和人抗体的恒定区组成嵌合抗体由于这两部分在空间结构上相对独立,其独特的抗体亲和力保持得很好，但因鼠单抗可变区的存在,应用时仍有较强的排斥反应。（２）改形抗体在嵌合抗体的基础上进一步将鼠ＭAb可变区中相对保守的FR替换成人的FR,保留与抗原结合的CDR部位 (3)Ｆab抗体Fab段由重链V 区及ＣＨ1功能区与整个轻链以二硫键形式连接而成，主要发挥抗体的抗原结合功能。Fａｂ抗体只有完整IgG的１/3。(4)单链抗体单链抗体(Singｌｅ chａｉｎ Fv,scFv）是由一段弹性连接肽(Ｌｉnker)把抗体可变区重链(VH)与轻链(ＶL)相连而成，是具有亲代抗体全部抗原结合特异性的最小功能结构单位。（5)单域抗体只含V区基因片段的小分子抗体,即只有VH或 VL一个功能结构域，也能保持原单克隆抗体的特异性。这种小分子的抗体片段就称为单域或单区抗体,其分子量仅为整个Ig分子的1／1２。（６）分子识别单位只含有一个CDＲ多肽的抗体。
６3、治疗性酶的临床使用范围
(1)助消化的治疗酶类
（2）消化酶可以用于补充内源消化酶的不足,促进食物中蛋白质、脂肪、糖类的消化吸收,治疗消化器官疾病和由其他各种原因所致的食欲不振、消化不良。
（3）（2）心血管疾病治疗酶类
（4）心血管疾病治疗酶类是能够作用于血液循环系统的酶，临床上具有独特的抗凝、止血、扩展血管等功能。弹性蛋白酶能够降低血脂，用于防治动脉粥样硬化。
（5）（３）抗肿痛治疗酶类
（6）抗肿瘤的治疗酶类,如Ｌ-门冬酰胺酶，是从大肠杆菌发酵液中提取的，是世界上第一个治疗癌症的酶，是令人瞩目的抗白血病药物，临床上用于治疗淋巴白血病和急性粒细胞白血病。
（7）(4）其他治疗酶类
（8）超氧化物歧化酶（SＯD)用于治疗类风湿性关节炎和放射病。PEG-腺苷脱氨酶 (ＰEG －Aｄｅnase Ｂovine)用于治疗严重的联合免疫缺陷症。DNＡ酶和RNA酶可以降低痰液的黏度,用于治疗慢性支气管炎。细胞色素C用于组织缺氧急救,透明质酸酶用于药物扩散剂。青霉素酶可以用于治疗青霉素过敏。
６4、简述生物技术药物质量控制特点
(1）结构确认的不完全性
生物技术药物多数为蛋白质或多肽及其修饰物，具有分子量相对较大，结构复杂多样性和可变性等特点，通过现有的理化方法和手段不能完全确认其化学结构特征，如产品的空间构象等。
(2）质量控制的过程性
生物技术药物的结构特性容易受到各种理化因素的影响，且分离提纯工艺复杂,因此其质量控制体系是针对生产全过程,采用化学、物理和生物学等手段而进行的全程、实时的质量控制。生产过程中每一环节或制备条件的改变均可能影响其非临床安全性评价的合理性。
(3）生物活性检测的重要性
生物技术药物的生物活性与其药效和毒性有一定或较好的相关性，因此药效学和安全性研究应关注生物活性的测定。鉴于生物技术药物结构确认的不完全性，生物活性检测成为反映生物技术药物天然结构是否遭受破坏、生产各阶段工艺合理性和评价终产品质量控制的重要内容，也成为非临床药理毒理、药代等试验方案中剂量确定的依据。
65、基因工程中的载体应满足什么条件
１).能自我复制并能带动插入的外源基因一起复制；（２）．载体分子的合适位置上必须有外源DNＡ插入的位点，即克隆位点，这些位点也就是限制性内切酶的切点，在载体上单一的限制性内切酶位点越多越好,这样可以将不同限制性内切酶切割后的外源DNA方便的插入载体。（3）．具有合适的筛选标记,如抗药性基因等,以便进行重组体筛选和鉴定。(4). 在细胞内稳定性高且多拷贝,这样可以保证重组体稳定且高效传代而不易丢失。
66、单克隆抗体的优点
与常规抗体相比，单克隆抗体具有以下优点：①McAb为高纯度单一抗体,在氨基酸序列以及特异性方面均为一致,检测灵敏度极高；②可以通过杂交瘤细胞的大规模培养进行生产；③杂交瘤细胞可以用液氮深冻法进行长期保存;④可在分子水平上解析存在于病毒表面的抗原或受体;⑤可以用不纯的抗原制备纯的ＭｃAb。但ＭｃAb也存在一些缺点:①ＭｃAb特异性太强,有时不能检出微生物突变株；②有时不能产生与抗原交联的功能；③易受pH、温度及盐浓度的影响，或亲和力较低、半衰期短；④McAb制备程序复杂、工作量大。因此，可以采用常规抗体解决的问题就无须制备ＭｃAb。
67临床前安全性评价的一般原则
（1)常规研究的适用性
鉴于生物技术药物结构和生物学性质的专一性和多样性，包括种属特异性、免疫原性和无法预料的多种组织亲和性等,常规的药物毒性试验的研究思路,包括研究步骤、考察项目等，可能不一定完全适合生物技术药物。
（2)具体品种具体分析
应根据具体生物技术药物的立题设计(包括药物设计思路、作用机制、分子结构特点、创新性程度和特点等)、质量控制、非临床安全性和临床特点(临床适应症的性质和用药人群、临床拟用药剂量、是否已有较多人用经验、预期重要临床不良反应等）和注册法规中治疗用生物技术药物注册分类及申报资料项目要求、其它相关技术指导原则等来对上述内容进行具体问题具体分析。对于那些在结构和药理作用上与已有大量临床经验的产品类似的生物技术药物，可酌情减少毒性试验。
(３)良好的试验管理规范（GLP）
毒性试验条件应符合 GLP要求。若不符合ＧＬＰ条件,应阐明其对于总体安全性评价的影响。68、多肽蛋白药物的优势和缺点
肽类药物多数源于内源性肽或其他天然肽，因此,其结构清楚,作用机制明确;与多数一般有机小分子药物相比，肽类药物具有活性高、用药剂量小、毒副作用低、代谢终产物为氨基酸等突出特点;与蛋白类相比，较小的肽几乎没有免疫原性；可化学合成，产品纯度高,质量可控。其缺点在于：易降解、半衰期较短；生物利用度差;大多不能口服，一般为注射剂，需要研发适当的给药方式;大规模合成、分离纯化难度大;大肽具有免疫原性。
6９、生物技术药物质量标准的研究内容主要包括
（1）研究生物技术药物产品的均一性。
(２）研究建立生物技术药物产品生物学活性或者免疫学活性测定方法。
（3）研究建立生物技术药物产品的国家标准品或参考品。
(4）建立生物技术药物目标产品生产相关杂质限量分析方法和标准。
（５）在以上研究的基础上制定出保证上述生物技术药物产品安全有效并与WHO标准相一致的质量控制标准和药物分析方法。
70、单克隆抗体原理
体内不同克隆的B淋巴细胞可合成不同特异性的免疫球蛋白。当机体受到抗原剌激后,抗原表面的抗原决定簇被携带有相应BCＲ的B细胞克隆识别，在Tｈ细胞的辅助下，该B细胞活化、增殖、分化为浆细胞,分泌针对同一抗原决定族的抗体。由于这一抗体是由来源于同一 B细胞克隆产生的，只能识别单一抗原决定簇，因此称为单克隆抗体。
两个或两个以上不同特性的细胞借助物理或化学手段融合在一起，形成杂交细胞,杂交细胞同时具有两种亲本细胞的基因和特性。经抗原免疫的小鼠脾细胞 (含有大量B细胞)能分泌特定抗体，但在体外不能长期存活;而小鼠骨髓瘤细胞在体外可无限增殖，但不能分泌抗体。用一个骨髓瘤细胞和一个具有分泌抗体能力的B淋巴细胞融合形成杂交瘤细胞。这种杂交瘤细胞既具有骨髓瘤细胞无限增殖的特性,又具有免疫Ｂ细胞合成和分泌抗体的能力。由杂交瘤细胞无性繁殖形成的细胞系分泌的单克隆抗体分子在结构、活性、亲和力等方面均相同,具有高度的均一性。
71、基因工程小鼠制备人全抗体的优缺点
转基因小鼠：将人抗体生产基因转入小鼠，以替换小鼠的抗体生成基因。转基因小鼠制备人抗体的优点是,其功效优于其它生产抗人体蛋白单抗技术。不足之处：(1)转基因通常有体细胞突变和其它独特的序列，导致不十分完全的人序列；(2）由于抗体是在小鼠体内装配,因而产生的单抗具有鼠糖基化模式,所以这些单抗最终并不是全人的;(3)转基因小鼠表达的人Ｉg多样性较少，而且在同一小鼠中不能够产生IgＧ各亚类。
72、简述发酵工程中的菌种选育
菌种选育是按照生产的要求，以微生物遗传变异理论为依据,采用人工方法使菌种发生变异,再用各种筛选方法筛选出符合要求的目的菌种。菌种选育的目的包括改善菌种的基本特性,以提高产量，改进质量,降低成本，改进工艺等。选育菌种的基本方法包括自然选育，诱变选育,代谢工程育种,基因定向育种，基因组改组等一系列方法。
73、生物药物质量控制中的安全性检测项目包括
（1）无菌试验
按照中国药典进行。注射用制品无菌试验有平皿法和滤膜法。口服和外用制剂检查项目还包括需氧菌、厌氧菌、霉菌和支原体。
（２)热原试验
热原试验一般采用家兔法。每只家兔耳沿静脉注射人用最大量的３倍量药物，判断标准为每只家兔体温升高不得超过０.６℃,3只总和不超过１.6℃。对生物活性比较高的细胞因子产品可以考虑用内毒素检测替代家兔热原试验。
（3) 异常毒性试验
主要检查生产工艺中是否含有目标产品以外的有毒物质。具体方法参考中国药典。常用动物为小鼠和豚鼠,注射剂量分别是小鼠1ｍl和豚鼠5ml。由于大多数重组产品本身有很强的生物活性,注射量过大会导致药物本身的生物活性引起毒性反应。因此不同重组产品，剂量选择和注射途径要根据各自的生物学活性来确定。
（1) 无菌试验
按照中国药典进行。注射用制品无菌试验有平皿法和滤膜法。口服和外用制剂检查项目还包括需氧菌、厌氧菌、霉菌和支原体。
（2) 热原试验
热原试验一般采用家兔法。每只家兔耳沿静脉注射人用最大量的3倍量药物,判断标准为每只家兔体温升高不得超过0.6℃，3只总和不超过1.6℃。对生物活性比较高的细胞因子产品可以考虑用内毒素检测替代家兔热原试验。
（3) 异常毒性试验
主要检查生产工艺中是否含有目标产品以外的有毒物质。具体方法参考中国药典。常用动物为小鼠和豚鼠，注射剂量分别是小鼠１ｍl和豚鼠5ml。由于大多数重组产品本身有很强的生物活性,注射量过大会导致药物本身的生物活性引起毒性反应。因此不同重组产品,剂量选择和注射途径要根据各自的生物学活性来确定。
7４、目前主要用来制备人源单克隆抗体的两种方法
(一)噬菌体抗体库
噬菌体抗体库技术是噬菌体表面展示技术在基因工程抗体应用上的一个成功范例，它可以模拟体内B淋巴细胞受到刺激后分化、成熟直至分泌抗体的过程。通过噬菌体表面展示技术,可将目的蛋白或多肽的编码基因与编码M13噬菌体颗粒末端蛋白的基因Ⅲ构建成融合基因，将含有融合基因的重组Ｍ１3噬菌体转染大肠杆菌,可以在噬菌体颗粒表面展示目的蛋白。通过基因重组技术,将全套人抗体重链和轻链的V区基因与Ｍ13噬菌休基因Ⅲ构建成融合基因，在噬菌体表面以抗体Fv片段-末端蛋白融合蛋白的形式表达，表达这些融合蛋内的噬菌体群体就构成了噬菌体抗体库（phaｇe antiboｄy liｂraｒy)。通过免疫法筛选,可从中得到针对某一抗原的人抗体Fv 编码基因。利用噬菌休抗体库，不需要杂交瘤细胞就可得到目的单克降抗休的编码基因，而且是人源性的。从理论上讲,噬菌体抗体库具有B细胞所编码的全部抗体信息，从抗体库中可筛选到任何一种抗体。出于该抗体库中重、轻链是随机组合的，又称组合文库。迄今已成功制备出多种人源单克隆抗体。
(二)人源性抗体转基因小鼠
通过构建转基因小鼠,可使小鼠产生人源性单克隆抗体。用人的抗体基因转入小鼠替代小鼠相应基因，产生分泌人抗体的转基因小鼠。第一个获得的人源性抗体是抗破伤风类毒素的单克隆抗体。在转基因小鼠基础上,建立了一种产生人抗体的小鼠模型（xcｎo ｍoｕsｅ）。将小鼠的全套抗体基因敲除掉,同时将人的大部分轻链和重链基W插到小鼠染色体中,当利ffl抗原刺激时就产生人源性抗体。
7５、单克隆抗体的治疗作用
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本题参考答案:
单克隆抗体问世以来，由于其独有的特征已迅速应用于生物学相关学科的很多领域,主要有以下几个方面。
1.诊断试剂：作为医学和兽医学相关实验室的诊断试剂,单克隆抗体以其特异性强、纯度高和均一性好等优点，广泛应用于检i贝0各种抗原,如病原微生物抗原、肿瘤抗原、受体和激素、细胞因子及神经递质等活性物质。
2.肿瘤的导向治疗和放射免疫显像技术：将针对某一肿瘤抗原的单克隆抗体与化疗药物或放疗物质连接,利用单克隆抗体的导向作用,将药物或放疗物质携带至靶器官，可直接杀伤靶细胞,称为肿瘤导向治疗。此外,将放射性标记物与单克隆抗体连接．注入患者体内可进行放射免疫显像,协助肿瘤的诊断。
３.蛋白质的提纯：单克隆抗体是亲和层析中重要的配体。将单克隆抗体吸附在一个惰性的固相基质(如琼脂糖）上，并制备成层析柱。该方法的特点是,通过一步纯化产品即可达到很高的纯度，大大提高了产品的总回收率。这种单抗免疫亲和层析技术已作为高效的分离纯化手段广泛应用于生物医药产品的研究与开发。
4．机体内微量成分的测定:应用单克隆抗体和免疫学检测方法建立的放射免疫分析技术,可对机体的多种微量成分进行测定，如诸多酶类、激素、维生素、药物等,对受检者的健康状态判断、疾病检出和指导诊断及治疗均具有实际意义。
76、基因工程制药主要步骤
(1)从供体细胞中分离基因组ＤNA,用限制性核酸内切酶分别将外源目的DNＡ和载体分子切开(简称切)；
(2）用DNＡ连接酶将含有目的基因的DNA片段接到载体分子上，形成DＮA重组分子(简称接）；
（3）将人工重组的DNA分子导入它们能够正常复制的受体(宿主）细胞中（简称转）;
（4)短时间培养转化细胞,以扩增(ampｌiｆicatioｎ)DNA重组分子或使其整合到宿主细胞的基因族中(简称增)；
（5）筛选和鉴定转化细胞,获得使外源基因高效稳定表达的基因工程菌或细胞(简称检）。
(6)基因工程菌发酵,收获有目的蛋白的发酵液,采用一系列分离纯化手段从发酵液中获得高纯度的目的产物。
(7）对目的蛋白进行过滤除菌，对某些要求严格的药物而言,还需要除热原等处理。
(8)对目的蛋白进行制剂研究,并进行半成品或成品检测,检测合格后进行包装。
由上述可知，一个完整的基因工程药物的制备包括上游的基因分离、重组、转移、基因在宿主细胞中的保持、转录、翻译，以及下游的分离纯化、除菌检测等多个步骤,其中切、接、转、增、检为基因工程药物上游技术的主要操作过程,为了下游获得大量的目的蛋白，必须对上游技术进行优化。
77、
南方医科大学本科专业教学大纲 生物化学 Biochemistry 适用专业：药学专业（四年制本科） 执笔人：朱利娜 审定人：方振伟 学院负责人：马文丽 南方医科大学教务处 二○○六年十二月
一、课程简介 课程代码：B820003 学分：4分 学时：72学时 先修课程：无机化学、有机化学、医用物理学、细胞生物学 后续课程：医学遗传学、药理学、生物药剂学与药代动力学、微生物与生化药学 适用专业：药学专业（四年制本科） 生物化学是一门应用化学的原理和方法在分子水平上研究生物体的化学组成，生物体分子结构与功能，物质代谢与调节，以及遗传信息的分子基础与调控规律的科学。生物化学与分子生物学的理论和技术已经渗透到基础医学和临床医学的各个领域：许多疾病的病理或征象都要用生化的理论在分子乃至基因水平上加以解释；生化的技术和方法应用于疾病诊断、治疗和预防等诸方面具有独特的优势，因而生物化学是一门极为重要的医学专业基础课程。本课程由生物化学和分子生物学二部分内容组成。通过教学要使学生掌握人体的化学组成，重要生物大分子的结构与功能及其相互关系，物质代谢的基本过程和调控规律，遗传信息的分子基础与调控规律，以及血液、肝脏的生物化学等生命科学内容，并使学生了解和掌握生物化学基本实验技术的原理和方法，并具有实际应用和独立分析问题、解决问题的能力，为学习其它基础医学和药学课程奠定扎实的理论基础，同时具有综合应用生物化学基本实验技术和优化实验条件的能力，密切联系科学研究和医学临床应用的实际。 Introduction COURSE CODE：B82003 UNITS OF CREDIT：4 HOURS OF CREDIT：72 REQUIRING COURSE：Inorganic Chemistry，Organic Chemistry，Medical Physics，Cell Biology COUNTINUING COURSE：Medical Genetics，Pharmacology，Biopharmacyand Pharmacokinetics，Microbiotic and Biochemical Pharmacy SUITED PROGRAM：Pharmacy（Undergraduate Courses For 4 Years） Biochemistryis the study of life on the molecular level. Life, at its most basic level, is a biochemical phenomenon including two basic characteristics: self-refresh (metabolism)and self-replication and self-assembly (expression and transmission of genetic information). The 21st century is an era of life science. Lots of wonders are being created, and explosive information is being provided at an unprecedented speed. Biochemistry and molecular biology is a window opening to the world of life science. Thus, the knowledge of biochemistry and molecular biology which involves the study of chemical molecules and reactions in living organisms, and the elucidations of the nature of live phenomenon on the molecular level, is essential to the students of medical related disciplines and also helpful to the students who are going to pursue their scientific career in the future.
生物信息学复习题 名词解释 1. Homology (同源):来源于共同祖先的序列相似的序列及同源序列。序列相似序列并不一定是同源序列。 （直系同源）：指由于物种形成的特殊事件来自一个共同祖先的不同物种中的同源序列，它们具有相似的功能。 （旁系（并系）同源）：指同一个物种中具有共同祖先，通过基因复制产生的一组基因，这些基因在功能上的可能发生了改变。基因复制事件是促进新基因进化的重要推动力。 (异同源)：通过横向转移，来源于共生或病毒侵染而产生的相似的序列，为异同源。 Score：The sum of the number of identical matches and conservative (high scoring) substitutions in a sequence alignment divided by the total number of aligned sequence characters. Gap总是不计入总数中。 6.点矩阵（dot matrix）：构建一个二维矩阵，其X轴是一条序列，Y轴是另一个序列，然后在2个序列相同碱基的对应位置（x，y）加点，如果两条序列完全相同则会形成一条主对角线，如果两条序列相似则会出现一条或者几条直线；如果完全没有相似性则不能连成直线。 7. E值：得分大于等于某个分值S的不同的比对的数目在随机的数据库搜索中发生的可能性。衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以找到与查询序列（query）相匹配的随机或无关序列的概率，E值越小意味着序列的相似性偶然发生的机会越小，也即相似性越能反映真实的生物学意义，E值越接近零，越不可能找到其他匹配序列。 值：得分为所要求的分值比对或更好的比对随机发生的概率。它是将观测得到的比对得分S，与同样长度和组成的随机序列作为查询序列进行数据库搜索进行比较得到的HSP（高分片段对）得分的期望分布联系起来计算的。通常使用低于来定义统计的显著性。P=1-e-E 9.打分矩阵（scoring matrix）：在相似性检索中对序列两两比对的质量评估方法。包括基于理论（如考虑核酸和氨基酸之间的类似性）和实际进化距离（如PAM）两类方法,是序列相似性分析的基础，其不同的选择将会出现不同的分析结果。 10．空位（gap）：在序列比对时，由于序列长度不同，需要插入一个或几个位点以取得最佳比对结果，这样在其中一序列上产生中断现象，这些中断的位点称为空位。 ：美国国家生物技术信息学中心，属于美国国立医学图书馆的一部分，具有BLAST, Entrez ,GenBank等工具，还具有PubMed文献数据库。另外还具有Genome, dbEST, dbGSS , dbSTS, MMDB, OMIM, UniGene, Taxonomy, RefSeq, etc. 序列格式：是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有大于号（>）开始的核苷酸或者氨基酸序列的新文件，其中大于号后可以跟上序列的相关信息，其他无特殊要求。 13genbank序列格式：是GenBank 数据库的基本信息单位，是最为广泛的生物信息学序列格式之一。该文件格式按域划分为4个部分：第一部分包含整个记录的信息（描述符）；第二部分包含注释，主要包含生物功能或数据库信息；第三部分是feature，对序列的注释；第四部分是序列本身，以“统发生树（Phylogenetic tree ）是研究生物进化和系统发育过程中的一种用树状分支图来概括各种生物之间亲缘关系，是一种亲缘分支分类方法。在树中，每个节点代表其各分支的最近共同祖先，而节点间的线段长度对应演化距离（如估计的演化时间）。是用来研究物种进化与多样性的基础，是相近物种相关生物学数据的来源。17.基因树与物种树：物种树反映一组物种进化历程的系统树，其中每一个内部节点就代表一个物种形成的过程，而基因树则是代表来源于不同物种的单个同源基因的差异构建的系统树，而其内部的一个节点则代表一个祖先基因分化为两个新的独特的基因序列的事件。基因
1、BLAST教案所程序中，哪个方法是不存在的？（D） A：BLASTP B：BLASTN C：BLASTX D:BLASTQ 2、下列哪个软件不是常用来观察蛋白质结构视图的？（D） A：AVS B：Chimera C:MICE D:HMM 3、下列哪个不是点突变的类型?(A) A:染色体畸变 B：错义突变 C：无义突变 D：移码突变 4、基因突变的效应不包括：（C） A：有利突变 B：中性突变 C：移码突变D：遗传多态现象 5、人类基因组的结构特点不包括：（A） A：基因进化 B：基因数目 C：基因重复序列 D：基因组复制 6、世界上三大数据库不包括：（B） A:NCBI B:BLAST C:UCSC D:Ensembl 7、常用序列比对方法错误的是：（C） A：编辑距离 B：点阵描图 C：局部比对 D：记分模式 8、下列哪个不是蛋白质结构模型？（D） A：同源性模型 B：折叠识别 C：ab initio折叠 D： MoLScript结构9、下列哪个选项不是微阵列实验设计的内容？（A） A：贝叶斯网络法 B：对照组的选择 C：重复样本的使用 D：随机化原则10、构建序列进化树的一般步骤不包括：（A） A：建立DNA文库 B：建立数据模型 C：建立取代模型 D：建立进化树 11、下列中属于一级蛋白质结构数据库的是：（C） A. EMBL B. DDBJ C. PDB D.SWISS-PROT 12．蛋白质结构预测分为：（B） A．一级和三级结构预测 B. 二级和空间结构预测 C. 三级和空间结构预测 D. 二级和三级结构预测 13．数据挖掘的四个步骤不包括下列哪个：（C） A. 数据选择 B. 数据转换 C. 数据记录 D. 结果分析 14．下列哪项不是生物学研究必备的工具：（A） A.数据分析Ｂ．数据统计Ｃ．因素分析Ｄ．多元回归分析 15.Linux中rmdir 命令的功能是：（D） A．改变工作目录 B.删除工作目录 C. 创建目录 D.删除空目录 16．BLAST教案所程序中，哪个方法是不存在的？（D） A：BLASTP B：BLASTN C：BLASTX D:BLASTQ 17．下列哪个不是蛋白质结构模型？（D） A：同源性模型 B：折叠识别 C：ab initio折叠 D： MoLScript结构18．人类基因组的结构特点不包括：（A） A：基因进化 B：基因数目 C：基因重复序列 D：基因组复制 19、下列哪个选项不是微阵列实验设计的内容？（A） A：贝叶斯网络法 B：对照组的选择 C：重复样本的使用 D：随机化原则20、构建序列进化树的一般步骤不包括：（A） A：建立DNA文库 B：建立数据模型 C：建立取代模型 D：建立进化树三、填空题
研究生课程考试卷 学号、姓名： j20112001 苗天锦 年级、专业：2011生物化学与分子生物学 培养层次：硕士 课程名称：生物信息学 授课学时学分： 32学时 2学分 考试成绩： 授课或主讲教师签字：
生物信息学现状与展望 摘要：生物信息学是一门新兴学科，起步于20世纪90年代，至今已进入"后基因组时代"，本文对生物信息学的产生背景及其研究现状等方面进行了综述，并展望生物信息学的发展前景。生物信息学的发展在国内、外基本上都处在起步阶段。 关键词：生物信息学；生物信息学背景；发展前景 一、生物信息学概述 1.生物信息学发展历史 随着生物科学技术的迅猛发展，生物信息数据资源的增长呈现爆炸之势，同时计算机运算能力的提高和国际互联网络的发展使得对大规模数据的贮存、处理和传输成为可能，为了快捷方便地对已知生物学信息进行科学的组织、有效的管理和进一步分析利用，一门由生命科学和信息科学等多学科相结合特别是由分子生物学与计算机信息处理技术紧密结合而形成的交叉学科——生物信息学(Bioinformatics)应运而生,并大大推动了相关研究的开展, 被誉为“解读生命天书的慧眼”【1】。 研究生物细胞的生物大分子的结构与功能很早就已经开始，1866年孟德尔从实验上提出了假设：基因是以生物成分存在。1944年Chargaff发现了著名的Chargaff规律，即DNA中鸟嘌呤的量与胞嘧定的量总是相等，腺嘌呤与胸腺嘧啶的量相等。与此同时，Wilkins与Franklin用X射线衍射技术测定了DNA纤维的结构。1953年James Watson 和FrancisCrick在Nature杂志上推测出DNA 的三维结构（双螺旋）。Kornberg于1956年从大肠杆菌（E.coli）中分离出DNA 聚合酶I（DNA polymerase I），能使4种dNTP连接成DNA。Meselson与Stahl （1958）用实验方法证明了DNA复制是一种半保留复制。Crick于1954年提出了遗传信息传递的规律，DNA是合成RNA的模板，RNA又是合成蛋白质的模板，称之为中心法则（Central dogma），这一中心法则对以后分子生物学和生物信息学的发展都起到了极其重要的指导作用。经过Nirenberg和Matthai（1963）的努力研究，编码20氨基酸的遗传密码得到了破译。限制性内切酶的发现和重组DNA的克隆（clone）奠定了基因工程的技术基础【2】。自1990年美国启动人类基因组计划以来，人与模式生物基因组的测序工作进展极为迅速。迄今已完成了约40多种生物的全基因组测序工作，人基因组约3x109碱基对的测序工作也接近完成。至2000年6月26日，被誉为生命“阿波罗计划”的人类基因组计划终于完成了工作草图，预示着完成人类基因组计划已经指日可待。生物信息学已成为整个生命科学发展的重要组成部分，成为生命科学研究的前沿。 2.生物信息学研究方向 2.1 序列比对
生物化学课程标准药学 专业 集团文件发布号：（9816-UATWW-MWUB-WUNN-INNUL-DQQTY-
生物化学课程标准 所属系部：基础医学部适用专业：药学专业 课程类型：专业基础课 一、前言 （一）课程性质与任务 生物化学是研究生物体的化学组成和生命过程中化学变化规律的科学，它是从分子水平来探讨生命现象的本质。生物化学既是重要的专业基础课程，又与其它基础医学课程有着广泛而密切的联系。 通过本课程的学习，使学生掌握生化基本理论和基本技能，并能灵活运用生化知识解释疾病的发病机理，并采用相应的药物治疗；培养学生科学思维、独立思考、分析问题和解决问题的能力；培养学生相互沟通和团结协作的能力。 （二）设计思路 围绕药学专业的培养目标，结合后续课程和医疗岗位实际工作对知识、能力和素质要求，合理取舍生物化学教学内容，确定教学的重难点。根据教学内容，采用任务驱动、项目导向等教学方法和多媒体等教学手段，将基础理论与药学知识进行对接。 本课程的主要内容有生物大分子的结构功能、物质代谢、基因信息传递三大模块共八个章节。药学专业在第二学期开课，总学时48学时，其中理论42学时，实验6学时。 二、课程培养目标 （一）知识目标 1.系统掌握人体的物质组成、正常的物质代谢和基因信息传递的过程、特点及其生理意义。 2.熟悉生物化学的基本概念。 3.了解营养物质的消化吸收。 （二）能力目标 1.能运用生化知识从分子水平上阐明药物的作用机理。 2.能使用常规生化仪器来测定常用生化项目，并能解释其对疾病诊断的意义，为后期药学专业课的学习奠定良好的基础。 （三）素质目标
1.注重职业素质教育，培养学生良好的职业道德，树立全心全意为病人服务的医德医风。 2.提高分析问题和解决问题的能力。 3.培养学生与人沟通、团结协作的整体观念。 三、课程内容、要求及教学设计
一、名词解释(31个) 1.生物信息学:广义：应用信息科学的方法和技术，研究生物体系和生物过程中信 息的存贮、信息的内涵和信息的传递，研究和分析生物体细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程中的各种生物信息，或者也可以说成是生命科学中的信息科学。狭义：应用信息科学的理论、方法和技术，管理、分析和利用生物分子数据。 2.二级数据库：对原始生物分子数据进行整理、分类的结果，是在一级数据库、实验 数据和理论分析的基础上针对特定的应用目标而建立的。 3.多序列比对：研究的是多个序列的共性。序列的多重比对可用来搜索基因组序列的 功能区域，也可用于研究一组蛋白质之间的进化关系。 4.系统发育分析：是研究物种进化和系统分类的一种方法，其常用一种类似树状分支 的图形来概括各种（类）生物之间的亲缘关系，这种树状分支的图形称为系统发育树。 5.直系同源：如果由于进化压力来维持特定模体的话，模体中的组成蛋白应该是进化 保守的并且在其他物种中具有直系同源性。 指的是不同物种之间的同源性，例如蛋白质的同源性，DNA序列的同源性。（来自百度） 6.旁系（并系）同源：是那些在一定物种中的来源于基因复制的蛋白，可能会进化出 新的与原来有关的功能。用来描述在同一物种内由于基因复制而分离的同源基因。 （来自百度） 7.FASTA序列格式：将一个DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或 氨基酸字符串。 8.开放阅读框（ORF）：是结构基因的正常核苷酸序列，从起始密码子到终止密码子 的阅读框可编码完整的多肽链，其间不存在使翻译中断的终止密码子。（来自百度）9.结构域：大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域，折 叠得较为紧密，各行其功能，称为结构域。 10.空位罚分：序列比对分析时为了反映核酸或氨基酸的插入或缺失等而插入空位并进 行罚分，以控制空位插入的合理性。（来自百度） 11.表达序列标签：通过从cDNA文库中随机挑选的克隆进行测序所获得的部分cDNA的 3’或5’端序列。（来自文献） 12.Gene Ontology 协会： 13.HMM 隐马尔可夫模型：将核苷酸序列看成一个随机序列，DNA序列的编码部分与非 编码部分在核苷酸的选用频率上对应着不同的Markov模型。 14.一级数据库：数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据，只经过简单的归类 整理和注释 15.序列一致性：指同源DNA顺序的同一碱基位置的相同的碱基成员, 或者蛋白质的同 一氨基酸位置的相同的氨基酸成员, 可用百分比表示。 16.序列相似性：指同源蛋白质的氨基酸序列中一致性氨基酸和可取代氨基酸所占的比 例。 17.Blastn：是核酸序列到核酸库中的一种查询。库中存在的每条已知序列都将同所查 序列作一对一地核酸序列比对。（来自百度） 18.Blastp：是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同 每条所查序列作一对一的序列比对。（来自百度）
一、名词解释： 1.生物信息学：研究大量生物数据复杂关系的学科，其特征是多学科交叉，以互联网为媒介，数据库为载体。利用数学知识建立各种数学模型; 利用计算机为工具对实验所得大量生物学数据进行储存、检索、处理及分析，并以生物学知识对结果进行解释。 2.二级数据库：在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来，是对生物学知识和信息的进一步的整理。 序列格式：是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨基酸字符串，大于号（>）表示一个新文件的开始，其他无特殊要求。 序列格式：是GenBank 数据库的基本信息单位，是最为广泛的生物信息学序列格式之一。该文件格式按域划分为4个部分：第一部分包含整个记录的信息（描述符）；第二部分包含注释；第三部分是引文区，提供了这个记录的科学依据；第四部分是核苷酸序列本身，以“询序列（query sequence）：也称被检索序列，用来在数据库中检索并进行相似性比较的序列。P98 8.打分矩阵（scoring matrix）：在相似性检索中对序列两两比对的质量评估方法。包括基于理论（如考虑核酸和氨基酸之间的类似性）和实际进化距离（如PAM）两类方法。P29 9.空位（gap）：在序列比对时，由于序列长度不同，需要插入一个或几个位点以取得最佳比对结果，这样在其中一序列上产生中断现象，这些中断的位点称为空位。P29 10.空位罚分：空位罚分是为了补偿插入和缺失对序列相似性的影响，序列中的空位的引入不代表真正的进化事件，所以要对其进行罚分，空位罚分的多少直接影响对比的结果。P37值：衡量序列之间相似性是否显著的期望值。E值大小说明了可以找到与查询序列（query）相匹配的随机或无关序列的概率，E值越接近零，越不可能找到其他匹配序列，E值越小意味着序列的相似性偶然发生的机会越小，也即相似性越能反映真实的生物学意义。P95 12.低复杂度区域：BLAST搜索的过滤选项。指序列中包含的重复度高的区域，如poly（A）。 13.点矩阵（dot matrix）：构建一个二维矩阵，其X轴是一条序列，Y轴是另一个序列，然后在2个序列相同碱基的对应位置（x，y）加点，如果两条序列完全相同则会形成一条主对角线，如果两条序列相似则会出现一条或者几条直线；如果完全没有相似性则不能连成直线。 14.多序列比对：通过序列的相似性检索得到许多相似性序列，将这些序列做一个总体的比对，以观察它们在结构上的异同，来回答大量的生物学问题。 15.分子钟：认为分子进化速率是恒定的或者几乎恒定的假说，从而可以通过分子进化推断出物种起源的时间。 16.系统发育分析：通过一组相关的基因或者蛋白质的多序列比对或其他性状，可以研究推断不同物种或基因之间的进化关系。 17.进化树的二歧分叉结构：指在进化树上任何一个分支节点，一个父分支都只能被分成两个子分支。 系统发育图：用枝长表示进化时间的系统树称为系统发育图，是引入时间概念的支序图。 18.直系同源：指由于物种形成事件来自一个共同祖先的不同物种中的同源序列，具有相似或不同的功能。（书：在缺乏任何基因复制证据的情况下，具有共同祖先和相同功能的同源基因。） 19.旁系（并系）同源：指同一个物种中具有共同祖先，通过基因重复产生的一组基因，这些基因在功能上可能发生了改变。(书：由于基因重复事件产生的相似序列。) 20.外类群：是进化树中处于一组被分析物种之外的，具有相近亲缘关系的物种。 21.有根树：能够确定所有分析物种的共同祖先的进化树。
药学专业生物化学探析 1建立课程标准 改革药学专业《生物化学》教学内容不同的专业有不同的教学目标,以区分专业特色。课程标准是教师根据专业人才培养目标制定的大纲,在教学中有提纲挈领的作用,对教材内容的选择,上课学时的分配,实验内容项目的选择等都有重要的指导作用。所以应该根据我校实际的教学经验,借鉴其他院校的成功实例,制定符合我校实际情况的药学专业生物化学课程标准,使老师在教学中有章可循,更好地完成课程任务,更有针对性地因生施教。根据课程标准,应选择合适的教学内容,和药学相关性大的章节应该多分配学时和精力,以对学生以后的专业课程学习打下坚实的基础。 2加强实验教学 实验教学是生物化学重要的组成部分。在具体实践中,我们应该合理分配实践教学的内容,在验证性实验、综合性实验、设计性实验三个层次中达到平衡,适当增加药学相关的实践教学内容。另外,在实践教学中,要注重学生动手能力的培养,尽量做到2人1组,共同完成实践教学内容,而不是以往因为人多,很多同学只是看实验,理解实验这种误区。在实践中渗透理论知识,验证理论知识,强化理论知识。知道为什么做,怎么做。 3有效的教学过程 引人入胜的绪论 绪论是生物化学的开篇,是整门课程的缩影。所以,精彩的绪论对之后的内容有重要的意义。所以教师要合理把握绪论的介绍,简明扼要地讲明整门课的内容。具体来说,就是组成成分是什么,什么作用,怎么变化,怎么调节,发生机理及专题生化。介绍时层层递进,吸引学生的注意力,引起学生的兴趣。可引入一些临床或生活实例提几个为什么,让学生对生物化学的了解更形象更实际,从心里接受生物化学的重要性。在绪论结束,介绍几种学习方法,使学生在学习中更加轻松。总之,好的开头是成功的一半,教师在绪论上应该多下点功夫,一开始就抓住学生的心。 精美的课件 教学过程几乎都是以多媒体课件形式进行展示。在教学过程中应该注重课件的美化与内容的涵盖。首先,教师应该坚持独立制作课件,依据自己上课的思
一、名词解释(每小题4分,共20分) 1、生物信息学 广义：生命科学中的信息科学。生物体系和过程中信息的存贮、传递和表达；细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程的中各种生物信息。 狭义：生物分子信息的获取、存贮、分析和利用。 2、人类基因组计划 人类基因组计划准备用15年时间，投入30亿美元，完成人类全部24条染色体的3×109脱氧核苷酸对(bp)的序列测定，主要任务包括作图(遗传图谱、物理图谱的建立及转录图谱的绘制)、测序和基因识别。其中还包括模式生物(如大肠杆菌、酵母、线虫、小鼠等)基因组的作图和测序，以及信息系统的建立。作图和测序是基本的任务，在此基础上解读和破译生物体生老病死以及和疾病相关的遗传信息。 3、蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构是指多肽链中氨基酸的序列 4、基因 基因--有遗传效应的DNA片断,是控制生物性状的基本遗传单位。 5、中心法则 是指遗传信息从DNA传递给RNA，再从RNA传递给蛋白质，即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA，即完成DNA的复制过程。这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。 6 、DNA序列比较 序列比较的根本任务是：（1）发现序列之间的相似性；（2）辨别序列之间的差异 目的： 相似序列 相似的结构，相似的功能 判别序列之间的同源性 推测序列之间的进化关系 7、一级数据库 数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据，只经过简单的归类整理和注释 8、基因识别 基因识别，是生物信息学的一个重要分支，使用生物学实验或计算机等手段识别DNA 序列上的具有生物学特征的片段。基因识别的对象主要是蛋白质编码基因，也包括其他具有一定生物学功能的因子，如RNA基因和调控因子。 9、系统发生学 系统发生学(phylogenetics)——研究物种之间的进化关系。 10、基因芯片 基因芯片（gene chip），又称DNA微阵列（microarray），是由大量cDNA或寡核苷酸探针密集排列所形成的探针阵列，其工作的基本原理是通过杂交检测信息。
浅谈生物信息学在生物方面的应用 生物信息学（bioinformaLics）是以核酸和蛋白质等生物大分子数据库及其相关的图书、文献、资料为主要对象，以数学、信息学、计算机科学为主要手段，对浩如烟海的原始数据和原始资料进行存储、管理、注释、加工，使之成为具有明确生物意义的生物信息。并通过对生物信息的查询、搜索、比较、分析，从中获得基因的编码、凋控、遗传、突变等知识；研究核酸和蛋白质等生物大分子的结构、功能及其相互关系；研究它们在生物体内的物质代谢、能量转移、信息传导等生命活动中的作用机制。 从生物信息学研究的具体内容上看，生物信息学可以用于序列分类、相似性搜索、DNA 序列编码区识别、分子结构与功能预测、进化过程的构建等方面的计算工具已成为变态反应研究工作的重要组成部分。针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找过敏原基因，找出基因的位置和功能位点的位置，以及标记已知的序列模式等过程。针对蛋白质序列的分析，可以预测出蛋白质的许多物理特性，包括等电点分子量、酶切特性、疏水性、电荷分布等以及蛋白质二级结构预测，三维结构预测等。 生物信息学中的主要方法有：序列比对，结构比对，蛋白质结构的预测，构造分子进化树，聚类等。基因芯片是基因表达谱数据的重要来源。目前生物信息学在基因芯片中的应用主要体现在三个方面。 1、确定芯片检测目标。利用生物信息学方法，查询生物分子信息数据库，取得相应的序列数据，通过序列比对，找出特征序列，作为芯片设计的参照序列。 2、芯片设计。主要包括两个方面，即探针的设计和探针在芯片上的布局，必须根据具体的芯片功能、芯片制备技术采用不同的设计方法。 3、实验数据管理与分析。对基因芯片杂交图像处理，给出实验结果，并运用生物信息学方法对实验进行可靠性分析，得到基因序列变异结果或基因表达分析结果。尽可能将实验结果及分析结果存放在数据库中，将基因芯片数据与公共数据库进行链接，利用数据挖掘方法，揭示各种数据之间的关系。 生物信息学在人类基因组计划中也具有重要的作用。 大规模测序是基因组研究的最基本任务，它的每一个环节都与信息分析紧密相关。目前，从测序仪的光密度采样与分析、碱基读出、载体标识与去除、拼接与组装、填补序列间隙，到重复序列标识、读框预测和基因标注的每一步都是紧密依赖基因组信息学的软件和数据库的。特别是拼接和填补序列间隙更需要把实验设计和信息分析时刻联系在一起．拼接与组装中的难点是处理重复序列，这在含有约30％重复序列的人类基因组中显得尤其突出。 人类基因组的工作草图即将完成，因此发现新基因就成了当务之急。使用基因组信息学的方法通过超大规模计算是发现新基因的重要手段，可以说大部分新基因是靠理论方法预测出来的。比如啤酒酵母完整基因组（约1300万bp）所包含6千多个基因，大约60％是通过信息分析得到的。 当人类基因找到之后，自然要解决的问题是：不同人种间基因有什么差别；正常人和病人基因又有什么差别。”这就是通常所说的SNPs（单核苷酸多态性）。构建SNPs及其相关数据库是基因组研究走向应用的重要步骤。1998年国际已开展了以EST为主发现新Spps 的研究。在我国开展中华民族SNPs研究也是至重要的。总之，生物信息学不仅将赋予人们各种基础研究的重要成果，也会带来巨大的经济效益和社会效益。在未来的几年中DNA 序列数据将以意想不到的速度增长，这更离不开利用生物信息学进行各类数据的分析和解释，研制有效利用和管理数据新工具。生物信息学在功能基因组学同样具有重要的应用目前应用最多的是同源序列比较、模式识别以及蛋白结构预测。所谓同源序列，是指从某一共同祖先经趋异进化而形成的不同序列。利用数据库搜索找出未知核酸或蛋白的同源序列，是序列分析的基础[lol。如利用BLASTn和BLASTx两种软件分别进行核苷酸和氨基
生物化学课程标准 所属系部：基础医学部适用专业：药学专业 课程类型：专业基础课 一、前言 （一）课程性质与任务 生物化学是研究生物体的化学组成和生命过程中化学变化规律的科学，它是从分子水平来探讨生命现象的本质。生物化学既是重要的专业基础课程，又与其它基础医学课程有着广泛而密切的联系。 通过本课程的学习，使学生掌握生化基本理论和基本技能，并能灵活运用生化知识解释疾病的发病机理，并采用相应的药物治疗；培养学生科学思维、独立思考、分析问题和解决问题的能力；培养学生相互沟通和团结协作的能力。 （二）设计思路 围绕药学专业的培养目标，结合后续课程和医疗岗位实际工作对知识、能力和素质要求，合理取舍生物化学教学内容，确定教学的重难点。根据教学内容，采用任务驱动、项目导向等教学方法和多媒体等教学手段，将基础理论与药学知识进行对接。 本课程的主要内容有生物大分子的结构功能、物质代谢、基因信息传递三大模块共八个章节。药学专业在第二学期开课，总学时48学时，其中理论42学时，实验6学时。 二、课程培养目标 （一）知识目标 1.系统掌握人体的物质组成、正常的物质代谢和基因信息传递的过程、特点及其生理意义。 2.熟悉生物化学的基本概念。 3.了解营养物质的消化吸收。 （二）能力目标 1.能运用生化知识从分子水平上阐明药物的作用机理。 2.能使用常规生化仪器来测定常用生化项目，并能解释其对疾病诊断的意义，为后期药学专业课的学习奠定良好的基础。 （三）素质目标 1.注重职业素质教育，培养学生良好的职业道德，树立全心全意为病人服务的医德医风。 2.提高分析问题和解决问题的能力。 3.培养学生与人沟通、团结协作的整体观念。 三、课程内容、要求及教学设计
一、名词解释 1. 生物信息学： 1）生物信息学包含了生物信息的获取、处理、分析、和解释等在内的一门交叉学科； 2）它综合运用了数学、计算机学和生物学的各种工具来进行研究； 3）目的在于阐明大量生物学数据所包含的生物学意义。 2. BLAST（Basic Local Alignment Search Tool） 直译：基本局部排比搜索工具 意译：基于局部序列排比的常用数据库搜索工具 含义：蛋白质和核酸序列数据库搜索软件系统及相关数据库 3. PSI-BLAST：是一种迭代的搜索方法，可以提高BLAST和FASTA的相似序列发现率。 4. 一致序列：这些序列是指把多序列联配的信息压缩至单条序列，主要的缺点是除了在特 定位置最常见的残基之外，它们不能表示任何概率信息。 5. HMM 隐马尔可夫模型：一种统计模型，它考虑有关匹配、错配和间隔的所有可能的组合 来生成一组序列排列。（课件定义）是蛋白质结构域家族序列的一种严格的统计模型，包括序列的匹配，插入和缺失状态，并根据每种状态的概率分布和状态间的相互转换来生成蛋白质序列。 6. 信息位点：由位点产生的突变数目把其中的一课树与其他树区分开的位点。 7. 非信息位点：对于最大简约法来说没有意义的点。 8. 标度树：分支长度与相邻节点对的差异程度成正比的树。 9. 非标度树：只表示亲缘关系无差异程度信息。 10. 有根树：单一的节点能指派为共同的祖先，从祖先节点只有唯一的路径历经进化到达其 他任何节点。 11. 无根树：只表明节点间的关系，无进化发生方向的信息，通过引入外群或外部参考物种， 可以在无根树中指派根节点。 12. 注释：指从原始序列数据中获得有用的生物学信息。这主要是指在基因组DNA中寻找基 因和其他功能元件（结构注释），并给出这些序列的功能（功能注释）。 13. 聚类分析：一种通过将相似的数据划分到特定的组中以简化大规模数据集的方法。 14. 无监督分析法：这种方法没有内建的分类标准，组的数目和类型只决定于所使用的算法 和数据本身的分析方法。 15. 有监督分析法：这种方法引入某些形式的分类系统，从而将表达模式分配到一个或多个 预定义的类目中。 16. 微阵列芯片：将探针有规律地排列固定于载体上，与标记荧光分子的样品进行杂交，通 过扫描仪扫描对荧光信号的强度进行检测，从而迅速得出所要的信息。 17. 虚拟消化：是基于已知蛋白序列和切断酶的特异性的情况下进行的理论酶切（课件定 义）。是在已知蛋白质序列和蛋白外切酶之类切断试剂的已知特异性的基础上，由计算机进行的一种理论上的蛋白裂解反应。 18. 质谱(MS)是一种准确测定真空中离子的分子质量/电荷比(m/z)的方法，从而使分子质量 的准确确定成为可能。 19. 分子途径是指一组连续起作用以达到共同目标的蛋白质。 20. 虚拟细胞：一种建模手段，把细胞定义为许多结构，分子，反应和物质流的集合体。 21. 先导化合物：是指具有一定药理活性的、可通过结构改造来优化其药理特性而可能导致 药物发现的特殊化合物。就是利用计算机在含有大量化合物三维结构的数据库中，搜索能与生物大分子靶点匹配的化合物，或者搜索能与结合药效团相符的化合物，又称原型物，简称先导物，是通过各种途径或方法得到的具有生物活性的化学结构
《基因组学与生物信息学》教案 授课专业：生物学大类各专业 课程名称：基因组学与生物信息学 主讲教师：夏庆友程道军赵萍徐汉福
课程说明 一、课程名称：基因组学与生物信息学 二、总课时数：36学时（理论27学时实验9学时） 三、先修课程：遗传学、分子生物学、基因工程 四、使用教材： 杨金水. 基因组学. 北京:高等教育出版社,2002. 张成岗. 贺福初, 生物信息学方法与实践. 北京:科学出版社，2002. 五、教学参考书： T.A.布朗著，袁建刚译著，基因组(2rd版)，北京：科学出版社,2006. 沈桂芳，丁仁瑞，走向后基因组时代的分子生物学，杭州：浙江教育出版社，2005. 罗静初译，生物信息学概论，北京：北京大学出版社，2002. 六、考核方式：考查 七、教案编写说明： 教案又称课时授课计划,是任课教师的教学实施方案。任课教师应遵循专业教学计划制订的培养目标，以教学大纲为依据，在熟悉教材、了解学生的基础上，结合教学实践经验，提前编写设计好每门课程每个章、节或主题的全部教学活动。教案可以按每堂课（指同一主题连续1~2节课）设计编写。教案编写说明如下： 1、编号：按施教的顺序标明序号。 2、教学课型表示所授课程的类型，请在相应课型栏内选择打“√”。 3、题目：标明章、节或主题。 4、教学内容：是授课的核心。将授课的内容按逻辑层次，有序设计编排，必要时标以“*”、“#”“？” 符号分别表示重点、难点或疑点。 5、教学方式既教学方法，如讲授、讨论、示教、指导等。教学手段指教科书、板书、多媒体、模型、 标本、挂图、音像等教学工具。 6、讨论、思考题和作业：提出若干问题以供讨论，或作为课后复习时思考，亦可要求学生作为作业 来完成，以供考核之用。 7、参考书目：列出参考书籍、有关资料。 8、日期的填写系指本堂课授课的时间。
生物化学总结归纳 第一节蛋白质结构和功能 一、蛋白质的分子组成 1.蛋白质元素组成的特点:平均为16%。 1克样品中蛋白质的含量=每克样品含氮克数×6.25(1/16%) 2.氨基酸的结构特点： ⑴蛋白质的基本组成单位：氨基酸 ⑵组成人体蛋白质的氨基酸都是: L-α-氨基酸（甘氨酸、脯氨酸除外） 3.氨基酸的分类: ⑴极性中性氨基酸（7个） 甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、天冬酰胺、谷胺酰胺 ⑵非极性疏水性氨基酸（8个）(甲硫氨酸=氮氨酸) 4.多肽链中氨基酸的连接方式：肽键（—CO—NH—，酰胺键） 二、蛋白质的分子结构 1.蛋白质的一级结构： ⑴蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列顺序。 ⑵基本化学键：肽键 2.蛋白质的二级结构： ⑴概念：局部主链 ⑵主要的化学键：氢键 ⑶基本结构形式：α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规卷曲 3.蛋白质的三级结构： ⑴概念：一条多肽链内所有原子的空间排布，包括主链、侧链构象内容。 ⑵化学键：疏水作用力、离子键、氢键和范德华力。（次级键） 4.蛋白质的四级结构 ⑴亚基：由二条或二条以上具有独立三级结构的多肽链组成，其中每条多肽链称之。亚基单独存在没有生物学活性。 ⑵蛋白质四级结构：蛋白质分子中各亚基之间的空间排布及相互接触关系。 ⑶亚基之间的结合力主要是疏水作用，其次是氢键和离子键。 三、蛋白质的结构与功能的关系（结构决定功能） 1.蛋白质一级结构与功能的关系： ⑴蛋白质一级结构的改变：镰刀形红细胞贫血（分子病）（六月，携镰刀割谷子） 注：第六个氨基酸，谷氨酸→缬氨酸 四、蛋白质的性质 1.蛋白质的两性解离： ⑴蛋白质分子是两性电解质。
生物信息学在医学领域的应用研究现状 摘要生物信息学是研究生物信息处理(采集、管理和分析应用),并从中提取生物学新知识的一门科学,它连接生物数据和医学科学研究。生物信息数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域，截止至2010年，总数已达1230个。生物信息学已不断渗透到医学领域的研究中。生物信息学在医学领域中主要应用于医学基础研究、临床医学、药物研发和建立与医学有关的生物信息学数据库。 关键词生物信息学，医学，应用 前言据统计,生物学信息正以每14个月翻一倍的速度增长。随着基因组及蛋白质序列数据库的快速增长,以及从这些序列中获取最大信息的需求,生物信息学(bioinformatics)作为一门独立学科应运而生。简言之,生物信息学就是利用计算和分析工具去收集、解释生物学数据的学科。生物信息学是一门综合学科,是计算机科学、数学、物理、生物学的结合。它对于管理现代生物学和医学数据具有重大意义,其研究成果将对人类社会和经济产生巨大推动作用。生物信息学的基础是各种数据库的建立和分析工具的发展。 数据库 迄今为止,生物学数据库总数已达500个以上。归纳起来可分为4大类:即基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构数据库、生物大分子三维空间结构数据库,以及以上述3类数据库和文献资料为基础构建的二级数据库。 生物信息学在临床医学上的应用 1.疾病相关基因的发现:很多疾病的发生与基因突变或基因多态性有关。发 现新基因是当前国际上基因组研究的热点,使用生物信息学的方法是发现新基因的重要手段。目前发现新基因的主要方法有多种:(1)基因的电脑克隆:所谓基因的“电脑克隆”, 就是以计算机和互联网为手段,发展新算法,对公用、商用或自有数据库中存储的表达序列标签(express sequence tags,EST)进行修正、聚类、拼接和组装, 获得完整的基因序列, 以期发现新基因。(2)通过多序列比对从基因组DNA 序列中预测新基因[1]:从基因组序列预测新基因,本质上是把基因组中编码蛋白质的区域和非编码蛋白质的区域区分开来。(3)发现单核苷酸多态性[2]:现在普遍认为SNPs研究是人类基因组计划走向应用的重要步骤。这主要是因为SNPs将提供一个强有力的工具,用于高危群体的发
生化名词解释 ●第一章蛋白质的结构和功能 等电点（isoelectric point, pI）氨基酸分子带有相等正、负电荷时，溶液的pH值称为该氨基酸的等电点 肽键(peptide bond) 是由一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基脱水缩合而形成的化学键。 肽键平面（peptide bond）由于肽键具有部分双键的性质，使参与肽键构成的六个原子被束缚在同一平面上，这一平面称为肽键平面 模体(motif) 在蛋白质分子中，若干具有二级结构的肽段在空间上相互接近，形成具有特殊功能的结构区域，称模体 结构域（domain）在一级结构上相距较远的氨基酸残基，通过三级结构的形成，多肽链的弯折，彼此聚集在一起，从而形成一些在功能上相对独立的，结构较为紧凑的区域，称为结构域（domain）。 亚基（subunit）就是指参与构成蛋白质四级结构的、每条具有三级结构的多肽链 变构效应（allosteric effect）由于蛋白质分子构象改变而导致蛋白质分子功能发生改变的现象称为变构效应。 蛋白质的变性(denaturation)在某些物理或化学因素的作用下，蛋白质严格的空间结构被破坏（不包括肽键的断裂），从而引起蛋白质若干理化性质和生物学性质的改变，称为蛋白质的变性。 ●第二章核酸 遗传密码（coden）mRNA分子中每三个相邻的核苷酸组成一组，在蛋白质翻译合成时代表一个特定的氨基酸，这种核苷酸三联体称为遗传密码。 核酶（ribozyme）某些小分子RNA具有催化特定RNA降解的活性，这种具有催化作用的小RNA被称为核酶（ribozyme）。 DNA的变性（denaturation）在理化因素作用下，DNA双螺旋的两条互补链松散而分开成为单链，从而导致DNA的理化性质及生物学性质发生改变，这种现象称为DNA的变性。融解温度，melting temperature, Tm 加热DNA溶液，使其对260nm紫外光的吸收度突然增加，达到其最大值一半时的温度，就是DNA的变性温度（融解温度）。 核酸的分子杂交（hybridization）两条来源不同的单链核酸（DNA或RNA），只要它们有大致相同的互补碱基顺序，经退火处理即可复性，形成新的杂种双螺旋，这一现象称为核酸的分子杂交。 限制性核酸内切酶（限制酶，restriction enzyme）能识别特定的核苷酸顺序，并从特定位点水解核酸的内切酶称为限制性核酸内切酶 增色效应（hyper chromic effect）：当DNA 从双螺旋结构变为单链的无规则卷曲状态时，它在260nm 处的吸收便增加，这叫“增色效应”。 ●第三章酶 酶（enzyme）是由活细胞产生的、能对特定的化学反应或能量转换进行高效率催化的生物催化剂。 酶的活性中心（active center of enzyme）酶分子上具有一定空间构象的部位，该部位化学基团集中，直接参与将底物转变为产物的反应过程，这一部位就称为酶的活性中心。