自制教具_基因表达模型_简介_吴建华

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①A 位:又称氨酰基位点,主要在大亚基上, 是 接 受 氨 酰-tRNA 的 部 位 ;
②P 位:是肽酰基位,与 A 位紧邻,是不断增 长 的 肽 酰-tRNA 位 点 ;
③E 位 :是 接 受 和 释 放 空 载 tRNA 的 部 位 ; ④T 位:转肽酶位,简称 T 因子。 催化氨基与 延伸中的肽链缩合形成肽键,使肽链延伸; ⑤G 位 [8]:移 位 酶 位 ,简 称 G 因 子 。 位 于 大 亚 基上,催化肽酰转移,即把肽链从 P 位转向 A 位。 1.2.3 蛋白质合成的简要过程(见图 1) ①多 肽 链 的 起 始 :mRNA 从 细 胞 核 到 细 胞 质 , 在起始因子等作用下与核糖体结合。 甲硫氨酰tRNA 的 反 密 码 子 , 识 别 mRNA 上 的 起 始 密 码 AUG 并 互 补 结 合 进 入 核 糖 体 的 P 位 。 核 糖 体 上 一 次可容纳 2 个密码子。 ②多肽链的延长:第 2 个密码子对应的氨酰tRNA 进 入 核 糖 体 的 A 位 , 密 码 子 与 反 密 码 子 的 碱基互补结合。 在大亚基上 G 位移位酶的作用 下 , 将 P 位 tRNA 携 带 的 氨 基 酸 转 移 到 A 位 的 氨 基酸前面, 在 T 位转肽酶作用下形成二肽, 产生 新 肽 酰-tRNA。 P 位 上 的 tRNA 变 成 空 载 状 态 ,核 糖 体 沿 mRNA 往 前 移 动 ,E 位 点 接 受 空 载 tRNA, 再 将 其 释 放 出 核 糖 体 。 同 时 ,新 肽 酰-tRNA 进 入 P 位 点 ,A 位 点 腾 空 。 与 之 对 应 的 新 氨 酰-tRNA 又 进 入 A 位,G 位点移位酶把二肽转移到此氨基酸前 面 形 成 三 肽 [7]。 核 糖 体 又 往 前 移 动 , 如 此 反 复 循 环 ,使 得 mRNA 上 的 碱 基 序 列 转 变 为 蛋 白 质 的 氨 基酸序列。 ③多 肽 链 的 终 止 与 释 放 : 当 mRNA 上 出 现 终 止 密 码 时 (UGA、UAG 或 UAA), 就 无 对 应 的 氨 基 酸运入核糖体,肽链的合成停止。而被终止因子识 别,进入 A 位并抑制移位酶的作用,使多肽链与 tRNA 之 间 水 解 释 放 , 离 开 核 糖 体 , 同 时 核 糖 体 与
移动,合成多肽链的情境
⑧ 三 叶 草 形 地 板 代 表 tRNA
⑨乒乓球串
代表多肽链
⑩水果外包网罩 代表转录因子等
3.4 组装连接 参照图 3 组装,按下列顺序依次连接: 1)DNA 双 链 骨 架 :将 长 条 地 板 按 图 4 所 示 尺
码 和 角 度 ,用 801 大 力 胶 、钢 钉 和 合 页 连 接 。 其 中 , A 处 用 钢 钉 以 160° 角 固 定 ,B 和 C 2 处 用 合 页 连 接。
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生物学通报
2014 年 第 49 卷 第 5 期
自制教具“基因表达模型”简介
吴建华 王 雪 刘艳丹
( 吉 林 省 乾 安 县 第 七 中 学 吉 林 乾 安 131400 )
摘要 介绍一种基因指导蛋白质合成主要过程的木质模型, 把遗传信息的转录和翻译结 合在一起,展示了基因表达的主要过程。在模型制作过程中,将复杂的问题简单化,把抽象的知 识具体化,突破教学上的重点、难点,使学生对基因表达有更深刻的理解。
图 1 核 糖 体 上 3 个 tRNA 结 合 位 点 :A 位 、P 位 、E 位 及 合 成 蛋 白 质 的 核 心 步 骤 ( 引 自 文 献 )[7]
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图 2 核糖体上 2 个活性部位:T 位、 G 位及对应的 A 位、P 位和 E 位(自制模型)
mRNA 解 离 ,进 入 再 循 环 。 这些多肽链再经过系列加工处理, 形成具有
活性的蛋白质,才能执行特定的生物学功能。 2 材料用具
木 板 (160 cm×10 cm×2 cm)1 块 、木 方 (3 cm× 3 cm×6 cm)、废 地 板 条 若 干 块 、胶 合 板 1 m2、大 葫 芦 2 个、 手电钻 1 把、 石材切割机 1 台、 钢钉若 干、锤子、钳子、剪子、油漆(白、绿、棕色)各 1 小 桶 、 乒 乓 球 12 个 、 铁 丝 若 干 、 彩 色 不 干 胶 纸 ( 红 、 黄 、 蓝 、 绿 、 黑 、 棕 色 ) 各 1 m、801 大 力 胶 1 盒 、 小 合页 1 副和水果外包网罩。 3 制作方法 3.1 模型设计图(详见图 3)
模型底座
④ 方 形 胶 合 板 作 为 DNA 支 架 , 粘 贴 名 称
⑤椭 圆 形 胶 合 板 代表核糖体细微结构,其上有 A 位、P 位、E 位、
T 位转肽酶及 G 位移位酶
⑥球形葫芦
代 表 RNA 聚 , 用 于 演 示 核 糖 体 在 mRNA 上
② 转 录 延 伸 :PolⅡ 沿 着 DNA 链 从 3′ 端 到 5′ 端 移 动 , 不 断 合 成 mRNA 链 (5′ 端 到 3′ 端 ), 随 着 酶 的 迁 移 ,新 合 成 的 mRNA 链 向 后 延 伸 。
③转 录 终 止 :近 期 研 究 表 明 [4,5] PolⅡ依 赖 poly (A)的转录终止过程,mRNA 转录终止 与 其 3′端 加 尾(特定位点剪切)相关。 当 poly(A)加工信号转录 后,PolⅡ复合物变构,使转录暂停,mRNA 在 poly(A) 加 工 信 号 下 游 被 剪 切 而 游 离 ,PolⅡ的 下 游 产 物 在 5′-RNA 外切酶作用下降解,转录随即终止。 PolⅡ 与 DNA 模板脱离,DNA 重新形成双螺旋结构。 1.2 遗 传 信 息 的 翻 译 翻 译 就 是 将 mRNA 中 的 碱基序列翻译为蛋白质的氨基酸序列。 翻译过程 在 核 糖 体 上 进 行 ,mRNA 上 的 遗 传 密 码 经 核 糖 体 解 码 中 心 [6]翻 译 成 密 码 子 , 通 过 碱 基 互 补 配 对 与 tRNA 上 的 反 密 码 子 结 合 ,合 成 具 有 特 定 氨 基 酸 序 列的多肽链。 1.2.1 tRNA 也 叫 转 运 RNA,种 类 很 多 , 但 每 种 tRNA 只 能 识 别 并 转 运 1 种 氨 基 酸 。 tRNA 的 三 维 结构为倒 L 形,其一端携带特定的氨基酸(有高 度 专 一 的 氨 酰-tRNA 合 成 酶 催 化 形 成 氨 酰-tRNA 复 合 物 ),另 一 端 有 3 个 碱 基 称 为 反 密 码 子 。 tRNA 能以反密码子识别密码子, 将相应的氨基酸转运 到核糖体上合成肽链。 1.2.2 核糖体上 5 个功能区位:核糖体主要成分 为 蛋 白 质 和 rRNA,呈 椭 球 形 ,由 大 、小 2 个 亚 基 组 成 。 单 个 核 糖 体 上 存 在 3 个 tRNA 结 合 位 点 :A 位 、P 位 、E 位 和 2 个 活 性 部 位 [7,8], 在 蛋 白 质 合 成 中均有专一的识别作用(见图 1 和图 2)。
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⑨乒乓球串: 用细铁丝将 8 个乒乓球相互钩
挂成一串。 球上粘贴不同颜色的彩条。
3.3 各种材料在模型中的作用(详见下表)
各种材料在模型中的作用
材料
模型中的作用
①小木块
代表多种碱基
②长条地板
代 表 核 苷 酸 骨 架 (DNA 、mRNA )
③长条木板
关 键 词 基 因 表 达 RNA 聚 合 酶 转 录 核 糖 体 翻 译 木 质 模 型 中 国 图 书 分 类 号 :Q-33 文 献 标 识 码 :B
高中生物学“基因指导蛋白质的合成”一节 中, 基因通过转录和翻译过程最终将碱基序列转 化成氨基酸序列使遗传信息表达。 由于其过程十 分复杂且抽象,学生难以理解和掌握,为了突破教 学上的重、难点 ,自 制 教 具 “基 因 表 达 模 型 ”[1]。 本 教 具 采 用 木 质 结 构 ,主 要 由 DNA 转 录 mRNA 和 遗 传信息的翻译 2 个部分构成。 1 制作原理 1.1 DNA 转 录 mRNA 转 录 过 程 主 要 是 RNA 聚 合 酶 (RNA polymeraseII PolⅡ)通 过 与 转 录 因 子 等 系列组分构成动 态 复 合 体 与 编 码 基 因 结 合 [2],以 DNA 一条链上的基因序列为模板, 催 化 合 成 序 列 互补的 mRNA。 包括转录起始、延伸和终止等过程。
8)在小木块上粘贴各种碱基,用彩纸区分字 符(A、T、C、G、U),互补配对。 在模板 DNA 上注意 转 录 起 始 点 和 终 止 点 的 设 置 , 在 mRNA 模 板 上 注 意 起 始 密 码 AUG 和 终 止 密 码 UGA 的 设 置 。
9)打印和粘贴各种名签。 4 使用说明 4.1 mRNA 的 转 录 过 程 把 RNA 聚 合 酶 ( 葫 芦 球) 套入水果外包网罩内, 构成复合体。 将模板 DNA 链 抬 起 , 套 入 其 中 表 示 结 合 , 沿 3′~5′端 移 动 , 再 将 mRNA 模 板 插 入 葫 芦 洞 内 , 按 模 板 DNA 碱 基 顺 序 , 把 mRNA 上 的 碱 基 对 应 连 接 , 表 示 转 录开始和延伸。当葫芦球移到转录终止区域内,将 mRNA 模 板 从 葫 芦 球 后 面 拿 出 ,再 把 葫 芦 球 拿 出 , 表示转录完成。 4.2 核糖体的翻译过程
图 3 基因表达模型
3.2 选材制备 ①小木块:选用杨木、椴木、红松等软木质方
料 。 将 木 方 截 成 3 cm×3 cm×4 cm 的 小 木 块 100 多块打磨备用;
②将 地 板 截 成 80 cm×6 cm 的 长 条 4 块 ; ③长条木板: 选择合适的旧木板截成 160 cm× 10 cm×2 cm 长 条 1 块 ; ④方形胶合板:选择合适的胶合板截成 22 cm× 20 cm 长 方 形 1 块 ,在 其 背 面 沿 边 缘 钉 上 木 框 ; ⑤椭圆形胶合板:选取宽约 30 cm,高约 40 cm 的 胶 合 板 ,在 距 底 边 10 cm 处 做 成 直 角 ,上 面 做 成 近椭圆,下面连接木板底座,底面钉上凸形木条, 小直角边上钉弧形木板; ⑥球形葫芦 :选 自 然 生 球 形 葫 芦 1 个 (准 约 15 cm) 将 其 内 胆 取 净 , 在 两 侧 对 称 切 割 出 方 形 洞 (约 11 cm×6.5 cm),打 磨 备 用 。 ⑦纯形葫芦:选自然生纯葫芦形葫芦 1 个(直 径 最 大 处 约 15 cm) 将 葫 芦 倒 置 , 切 去 大 球 顶 端 , 除掉内胆, 在两侧对称切割出梯形槽, 能容纳 mRNA 模 板 ,打 磨 备 用 ; ⑧三 叶 草 形 地 板 : 选 取 10 cm×12 cm 地 板 块 3 块,将其切割打磨成三叶草形的两叶状,在其底 端 再 横 上 1 块 地 板 条 (约 9 cm×3 cm),居 中 钉 好 , 在左侧顶端铁丝做钩;