转基因植物的分子检测与鉴定方法及进展
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转基因植物分子检测技术姜桐桐,2,黄凤兰1,2*,陈晓凤1,2,赵永1,2,李佳会1,2,周婷婷1,常旭丰1,刘佳琪1(1.内蒙古民族大学生命科学学院.内蒙古通辽028000;2.内蒙古自治区高校蓖麻产业技术研究中心.内蒙古通辽0280003内蒙古自治区高校蓖麻育种重点实验室.内蒙古通辽028000)摘要:分子生物学和植物基因工程技术不断发展,转基因分子检测技术也得到不断发展,本文介绍了外源基因整合的检测技术和外源基因表达的检测技术,细致的描述了每种检测技术的原理和优缺点。
关键词:分子检测技术;转基因植物;原理Transgenic plant molecular detection technology Tongtong jiang1.2 Fenglang Huang1.2 * xiaofeng chen1.2 Yong Zhao1.2 Jiahui Li1.2Tingting Zhou1 Xufeng Chang1 Jiaqi Liu1(1.College of Life Science, Inner Mongolia University for the Nationalities, Tongliao city,028000;2.Inner Mongolia RegionIndustrial Engineering Research Center of Universities for Castor, Tongliao city,028000;3 The Inner Mongolia autonomous region castor breeding, key laboratory of colleges and universities, Tongliao city,028000)Abstract:With the continuous development of molecular biology and plant gene engineering and transgenic molecular detection technology development, this paper introduces the foreign gene integration testing technology and exogenous gene expression detection technology, detailed describes the principle and advantages and disadvantages for each testing technology.Keywords:molecular detection technology; The transgenic plants; The principle of1近年来,转基因植物检测技术日趋成熟,多角度的多方面的检测方向分别从DNA、RNA、蛋白质来对转基因植物进行检测,无论从外源基因整合的方向,还是外源基因表达的方向,都能检测出正确的结果。
转基因作物快速检测技术进展与展望1. 引言1.1 转基因作物的定义转基因作物是指通过人为干预,将外源DNA或RNA基因导入植物细胞中,以实现目标基因的转导和表达,从而赋予植物新的性状或功能。
转基因技术的应用使得农作物具有抗虫、抗病、耐逆、提高产量等优点,极大地促进了农业生产的发展。
转基因作物的开发贯穿了整个农业生产领域,涉及粮食作物、经济作物、蔬菜等多个品种。
通过转基因技术改良的作物,能够更好地适应不利的生长环境,提高产量和品质,有效解决人类粮食安全和农业可持续发展的问题。
在转基因作物的相关研究中,基因检测是至关重要的一步。
通过检测和验证转基因作物中的外源基因,可以确保作物的品质和安全性,防止转基因作物对环境和人类健康造成潜在风险。
快速准确地检测转基因作物中的外源基因具有重要的意义,也成为转基因作物生产与监管的基础。
1.2 快速检测技术的重要性快速检测技术在转基因作物领域具有极其重要的意义。
随着转基因作物种类的增多和应用范围的扩大,需要对市场上的食品和农产品进行快速、准确的检测,以保障消费者的健康和权益。
快速检测技术能够在短时间内对样品进行高效筛查,确保产品的质量和安全性。
转基因作物的快速检测技术也对监管部门具有重要意义。
监管部门需要对市场上的转基因产品进行监测和管理,以确保产品符合法规标准。
快速检测技术能够帮助监管部门快速准确地对样品进行检测,为监管工作提供有力支持。
转基因作物的快速检测技术也在科研领域具有重要意义。
科研工作者需要对转基因作物进行研究和开发,快速检测技术可以帮助他们快速准确地对转基因作物进行鉴定和分析,推动科研工作的进展。
快速检测技术在转基因作物领域的重要性不言而喻,其应用将为消费者、监管部门和科研工作者带来诸多好处和便利。
2. 正文2.1 转基因作物快速检测技术的现状目前,转基因作物的快速检测技术已经取得了重要进展,使得检测的速度和准确性得到了显著提高。
传统的转基因作物检测方法主要依靠生物学特性和蛋白质检测,这些方法虽然准确,但耗时较长且操作复杂。
转基因筛选实验报告1. 实验目的本实验旨在通过转基因技术筛选出具有目标基因的转基因植物,并验证其功能表达。
同时,对转基因技术的应用进行探究与分析。
2. 实验方法2.1. 材料准备- 野生型植物种子- 目标基因载体- 转化载体(包含选择标记基因)- 催化剂(如乙酰丙酮)- 局部细菌感染试剂2.2. 实验步骤1. 制备植物组织培养基,包括必需的无机盐、营养物质以及植物激素。
2. 将野生型植物种子在无菌条件下在培养基上培养,保持温湿度合适。
3. 将目标基因载体和转化载体分别在乙酰丙酮的催化作用下加入植物组织培养基中。
4. 收取转基因植株,将其转移到相应的培养基中继续培养。
5. 利用PCR等方法对转基因植株进行基因分析,验证是否成功转化目标基因。
6. 进行型和酶解析实验,验证目标基因的功能表达情况。
3. 实验结果经过一段时间的培养和筛选,我们成功获得了若干转基因植株。
通过PCR实验验证,其中的部分植株确实成功转化了目标基因。
进一步的酶解析实验结果显示,这些转基因植株中的目标基因被成功表达,产生了相应的功能酶。
4. 实验分析通过转基因技术的应用,我们成功地筛选出了具有目标基因的转基因植物。
这为进一步研究和应用提供了重要的基础。
转基因技术的应用不仅可以用于改良作物品种,提高农作物的抗病虫能力和产量,还可以用于生物医学研究,产生用于疾病治疗的蛋白质等。
然而,转基因技术也面临一些争议和风险。
一方面,转基因植物可能对环境产生不可逆转的影响,对生态系统造成潜在风险。
另一方面,转基因植物可能引发食品安全问题,对人体健康构成潜在威胁。
因此,在推广应用转基因技术的过程中,需要更加严格的监管和安全评估。
5. 结论通过转基因筛选实验,我们成功获得了具有目标基因的转基因植物,并验证了目标基因的功能表达。
这为转基因技术的应用提供了实验依据和理论基础。
转基因技术具有广阔的应用前景,但也需要高度重视风险评估和监管措施,确保其安全使用。
植物转基因技术的原理和方法
植物转基因技术是一种利用分子生物学手段将外源基因导入植物细胞内,使其具有新的性状的技术。
转基因技术的原理是通过将外源基因导入植物细胞内,使得这些基因能够在植物细胞内正常表达,从而实现对植物性状的改良。
转基因技术的方法主要包括以下几个步骤:首先,利用现代分子生物学技术,将需要导入植物细胞内的外源基因与载体DNA连接起来,形成转基因载体。
其次,将转基因载体导入到植物细胞内,使其与植物细胞内的DNA发生重组,从而使外源基因被整合到植物细胞内。
最后,通过筛选和鉴定,确定已经被整合外源基因的植物细胞,并进行培养和繁殖。
转基因技术应用广泛,可以用于改良植物的品质、抗病性、耐旱性等性状。
在农业生产中,转基因技术可以提高作物的产量和品质,减少使用农药和化肥的数量,从而减少对环境的污染。
同时,转基因技术也可以用于生物医药领域,生产一些高价值的药物和医疗用品。
然而,转基因技术也存在一些争议和风险。
一些人担心转基因作物可能会对生态环境造成负面影响,并可能对人类健康产生潜在风险。
因此,在使用转基因技术时,需要进行严格的安全评估和监管。
同时,为了保护消费者的知情权和选择权,一些国家和地区还规定了
转基因食品的强制标识。
植物转基因技术是一种强大的生物技术手段,具有广泛的应用前景。
同时,也需要充分考虑其潜在的风险和影响,采取相应的安全措施和监管措施,确保其合理、安全地应用。
一、实验目的通过本实验,学习并掌握转基因检测的基本原理和方法,验证转基因植物或生物体内是否存在特定目标基因,为转基因生物的安全评估提供技术支持。
二、实验原理转基因检测主要基于分子生物学技术,通过PCR(聚合酶链反应)、Southern blotting、Western blotting等方法,检测转基因生物体内是否存在目标基因及其表达产物。
三、实验材料1. 转基因植物或生物样品2. 靶标基因DNA或cDNA3. DNA提取试剂盒4. PCR试剂5. Southern blotting试剂6. Western blotting试剂7. 仪器:PCR仪、电泳仪、凝胶成像系统、离心机等四、实验方法1. DNA提取(1)取一定量转基因植物或生物样品,按照DNA提取试剂盒说明书进行操作,提取总DNA。
(2)对提取的DNA进行定量,确保其浓度和纯度符合实验要求。
2. PCR检测(1)根据靶标基因设计特异性引物,进行PCR扩增。
(2)将PCR产物进行电泳分析,观察扩增条带。
3. Southern blotting检测(1)将PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,转移至尼龙膜上。
(2)用靶标基因探针进行杂交,洗涤后进行化学显色。
4. Western blotting检测(1)将转基因植物或生物样品制备成蛋白质提取物。
(2)进行SDS-PAGE电泳,转移至NC膜上。
(3)用靶标蛋白抗体进行免疫检测,洗涤后进行化学显色。
五、实验结果与分析1. PCR检测通过PCR扩增,成功得到预期大小的靶标基因片段,说明转基因植物或生物体内存在目标基因。
2. Southern blotting检测通过Southern blotting检测,成功将PCR产物与靶标基因探针进行杂交,说明转基因植物或生物体内存在目标基因。
3. Western blotting检测通过Western blotting检测,成功检测到目标蛋白的表达,说明转基因植物或生物体内存在目标基因的表达产物。
简述转基因动植物的检测鉴定方法
一、转基因检测鉴定方法
1、理化检测法
(1)流式细胞术:利用流式细胞术技术,检测转基因植物DNA 核酸的含量,即采用荧光染料标记的 DNA 膜,以流速技术,测定和对比转基因动植物与其他植物的 DNA 含量。
(2)蛋白质印迹:利用蛋白质印迹法,它可以对植物蛋白质分子进行快速和准确的检测,包括转基因植物中特异性抗性蛋白。
2、分子生物学技术
(1)PCR 技术:通过荧光定量 PCR 技术,可实现对单个核酸分子的高灵敏度检测,其是转基因植物检测的常用技术。
(2) Southern 胺基酸印迹:利用 Southern 胺基酸印迹法,检测基因的等位基因进行检测和分析,如同位素标记 PCR,可以有效鉴定和分析转基因植物种群中不同基因的表达量及突变情况。
3、其他技术
(1)生物分子识别:通过生物分子识别,可以有效地检测出转基因植物特有的 DNA 序列,从而对转基因植物进行鉴定。
(2)生物免疫技术:利用生物免疫技术,可以以免疫试剂盒的形式,对转基因植物进行快速检测,从而达到鉴定的目的。
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转基因植物的检测与鉴定宫雪超于丽杰高金秋哈尔滨师范大学环境与生命科学院黑龙江哈尔滨摘要对植物转基因过程中报告基因的种类和应用范围转基因植物的检测和鉴定方法转基因植物检测和鉴定方法的评价进行了综述关键词转基因植物检测鉴定评价中图分类法文献标识码文章编号植物转基因实验因受体系统的限制外源基因的转化频率较低为了达到转化目的必然要获得大量的转化材料如何在数以千万计的转化植株或细胞中快速有效地检测出转基因阳性植株或细胞外源基因是否整合到植物染色体上整合的方式如何整合到染色体上的外源基因是否正确表达等问题就成为重要的研究课题根据外源基因表达的不同水平对外源基因的检测和鉴定可以分为三个水平进行整合水平转录水平和翻译水平本文从外源基因表达的不同水平阐述转基因植物的检测与鉴定外源基因整合水平的鉴定检测外源基因是否转化成功首先是对报告基因进行检测必要时再进行目的基因的检测检测目的基因需要采用分子杂交方法报告基因报告基因必须具有两大特点一是表达产物和产物的类似功能在未转化的植物细胞内并不存在二是便于检测目前植物基因工程中使用的报告基因一般是编码酶的基因大致分为两类抗性基因和编码催化人工底物产生颜色变化的酶基因现在常用的报告基因主要有基因基因冠瘿碱合成酶基因H基因基因基因荧光素酶基因二氢叶酸还原酶基因等近年来绿色荧光蛋白基因作为一种新型的报告基因在植物基因转化及基因表达调控中得到应用并显示出较其他几个报告基因更大的优越性基因的检测基因具有以下优点①适用于各种生物的基因转化②检测方法简便无需底物酶辅因子等物质只要有紫外光或蓝光照射其表达产物就可以发出绿色荧光这对转化细胞的检测极为有利③便于活体检测十分有利于活体内基因表达调控的研究④检测时可获得直观信息有利于转基因植物安全性问题的研究及防范若此报告基因通过自然杂交扩散到其他栽培植物或杂草中时很容易通过光照获得直观信息基因的检测基因也是广泛用作转基因植物细菌和真菌的报告基因尤其是在研究外源基因瞬时表达的转化试验中基因应用的最多基因端与其他结构形成的融合基因能正常表达所产生的融合蛋白仍具有活性这为研究外源基因表达的具体细胞部位及组织部位提供了条件这是它的一大优点但是需要注意的是有一些植物在胚胎状态时能产生内源活性在转基因和代的子叶花粉和胚珠中检测到活性随着组织的成熟衰老表达逐渐停止在实验过程中要设定严格的阴性对照活性的检测方法有很多包括组织化学法色谱法荧光法等其中植物切片组织化学定位分析是分辨组织中不同细胞个体和不同的细胞类型基因表达差异的一种有效方法转基因植株的检测聚合酶链式反应是首选的转基因产品检测方法技术能够有效地扩增低拷贝的靶片段可以检测到每克样品含有~的转化基因成分对转基因产品大分子量检测的灵敏度可以达到样品含量的因为的高度特异性及检测所需的模板量仅为以内所以为外源基因整合的检测提供了便利条件尤其是在转化材料少又需及早检测的时候现在已经利用该技术对欧美杨番茄辣椒葡萄豆瓣菜小麦等转基因植物进行鉴定是转基因植物鉴定中最简单最常用的方法检测具有用量少操作简单成本低耗时少不需要同位素等优点但检测也存在缺点由于扩增十分灵敏有时会出现假阳性扩增因此检测只能作为初步结果杂交证明外源基因在植物染色体上整合情况的最可靠方法是杂交只有经过分子杂交鉴定为阳性的植株才可以称为转基因植物年第期牡丹江师范学院学报自然科学版总第期收稿日期利用杂交~可以确定外源基因在植物中的组织结构和整合位置~拷贝数以及转基因植株世代外源基因的稳定性]分子杂交是进行核酸序列分析~重组子鉴定及检测外源基因整合表达的强有力手段~它具有灵敏性高~特异性强的特点~是当前鉴定外源基因整合及表达的权威方法杂交可以清除操作过程中的污染以及转化愈伤组织中质粒残留所引起的假阳性信号~准确度高~但杂交程序复杂~成本高~且对实验技术条件要求较高根据杂交时所用的方法~核酸分子杂交又可分为印迹杂交<>~斑点<>杂交或狭缝<>杂交和细胞原位<>杂交等现在已在水稻]~玉米~大白菜]~豆瓣菜]~马铃薯~杏~烟草等植物中得到广泛应用外源基因转录水平的鉴定转录水平上的检测方法主要就是杂交~它以和探针杂交的技术检测基因在转录水平上的表达杂交杂交和杂交相比~更接近性状表现~更具有现实意义~被广泛用于转基因植物的检测~]~现已用于杨树~豆瓣菜~马铃薯~草莓~烟草等转基因植物的检测中但提取条件严格~在材料内含量不如高~不适于大批量样品的检测检测<>也是检测外源在植物体内转录表达的一种方法如果从细胞总提取物中得到特异的扩增条带~则表明外源基因实现了转录此法简单~快速~但对外源基因转录的最后决定~还需与杂交的实验结果结合外源基因表达蛋白的检测外源基因编码的蛋白在转基因植物中能够正常表达并表现出应有的功能是植物基因工程的最终目的杂交杂交是集蛋白质电泳~印迹和免疫测定为一体的检测方法它具有很高的灵敏性~可以从植物细胞总蛋白中检出的特异蛋白质~若是提纯的蛋白质~可检出~杂交检测目的基因在翻译水平的表达结果~可得知被检植物细胞内目的蛋白是否表达~表达的浓度大小及大致的分子量能直接显示目的基因在转化体中是否经过转录~翻译最终合成蛋白而影响植株的性状表现一般来讲~杂交的结果与性状表现有直接关系~]检测<酶联免疫吸附法>是一种利用免疫学原理检测抗原~抗体的技术由于酶的放大作用~使测定的灵敏度极高~可检测出的目的物~同时酶反应还具有很强的特异性除了可溶性抗原<抗体>之外~还可以检测含表面抗原的细胞该方法已用于辣椒~水稻~烟草~番茄~]等转化植株的鉴定工作中的检测虽然很灵敏~但容易出现本底过高的问题~应予以充分的注意蛋白检测试纸蛋白检测试纸是一种基于的改进方法或者~用于转基因植物表达量的检测]先将特异性抗体吸附在膜上~将膜蘸入样品溶液~蛋白质随着液相扩散~遇到抗体~发生抗原抗体反应~通过阴性对照筛选阳性结果~给出转基因成分含量的大致范围此方法操作简单~费用低~耗时少<~>原位杂交检测原位杂交技术目前在植物基因工程研究中已成为外源基因在染色体上整合定位及在组织细胞内表达定位的主要方法原位杂交技术主要有同位素原位杂交和荧光原位杂交<>~使用放射性同位素标记~放射自显影检出该方法灵敏性强~对于单拷贝的序列检出非常有效原位杂交可以分为三个层次:①染色体原位杂交~可以确定外源基因在染色体上的整合位置及整合方式~还可以研究外源基因的整合方式对外源基因遗传稳定性~外源基因表达的影响~以及不同的转化方式与外源基因整合方式的关系等重大机理问题;②组织细胞原位杂交~对特定的基因表达的进行组织细胞分布的空间定位~获得外源基因在植物组织细胞内表达情况<是否表达~表达位置~表达量等>;③外源基因表达蛋白的组织细胞免疫定位~指利用外源基因表达蛋白的抗体~通过免疫反应确定表达蛋白在转基因植物组织及细胞中的分布该方法也是研究转基因植物中外源基因功能~外源蛋白稳定性及功能蛋白含量的重要手段检测方法的评估用提取方法对目的基因进行检测方法简便~适合大批量样品的分析~又能检测目的基因的完整性~是早期检测的较好方法]~~杂交分别从整合~转录~翻译水平检测外源基因~是检测外源基因最经典~最可靠的方法虽然现在出现了一些像~等功能类似~方便快捷的检测技术~然而由于其技术本身的原因~还不能取代以上技术在转基因植物检测和鉴年第期牡丹江师范学院学报!自然科学版"# !总第期"定上的权威地位随着科学技术的发展 各种新的检测方法也在不断涌现 例如生物传感器筛选法 远红外线光谱法 定量 实时基因芯片等 每种检测方法都有其自身的优点和不足 应该根据不同的检测目的和要求 选择合适的方法 在实际工作中把几种方法结合运用 可获得外源基因不同表达水平的信息 是准确检测转基因植物产品的合理策略参考文献王学聘 卞祖娴 张晋华 等 欧美杨转基因植物的 检测 林业科学 朱新产 导入外源 对小麦基因表达的影响 西北植物学报 刘建强 孙仲序 赵春芝 转基因植物鉴定方法的研究概况 山东林业科技 李乃坚 袁四清 卡那霉素胁迫对转基因烟草种子发芽的影响 广东农业学报毛慧珠 唐惕 曹湘玲 等 抗虫转基因甘蓝及其后代的研究 中国科学 辑编辑 琳莉收稿日期 基金项目 黑龙江发展高新技术产业专项资金无基质喷雾栽培法生产脱毒小薯的研究于洪涛黑龙江省农业科学院绥化研究所 黑龙江绥化摘要 研究了无基质喷雾栽培法生产马铃薯脱毒小薯过程中不同品种 不同苗来源及不同收获方式对块茎产量的影响 结果表明 无基质喷雾栽培法生产马铃薯小薯以扦插苗分期收获效果最佳 无基质喷雾栽培比较适合栽培早熟品种以早大白最佳 关键词 无基质 马铃薯 脱毒小薯 中图分类法 文献标识码 文章编号在马铃薯良种繁育体系中 原种的生产是关键环节 其质量的高低和数量的多少直接影响马铃薯的生产 无基质喷雾栽培法是一种极有前途的核心种薯生产方法 其主要技术是将适于马铃薯不同发育时期的营养液适时适量地喷于保持在黑暗状态下的马铃薯植株根际 使马铃薯根际获得充分的养分 促进马铃薯块茎的生长 马铃薯喷雾栽培技术在我国尚属起步阶段 提高其生产效率是生产实践中亟待解决的问题 为此 本试验对无基质喷雾栽培法生产马铃薯脱毒小薯过程中不年第 期牡丹江师范学院学报 自然科学版总第 期转基因植物的检测与鉴定作者:宫雪超, 于丽杰, 高金秋, GONG Xuechao, YU Lijie, GAO Jinqiu作者单位:哈尔滨师范大学环境与生命科学院,黑龙江,哈尔滨,150025刊名:牡丹江师范学院学报(自然科学版)英文刊名:JOURNAL OF MUDANJING TEACHERS' COLLEGE(NATURAL SCIENCES EDITION)年,卷(期):2007(1)被引用次数:3次1.Datta S K;A Petew 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水稻转基因系的分子鉴定1.目的1.1从T2不同转基因株后代中鉴定得到分离出的纯转基因株、杂合转基因株和非转基因株,为根系和生理学实验提供材料;1.2鉴定纯转基因株中插入T-DNA的拷贝数和插入方式;1.3鉴定纯转基因株中插入T-DNA的插入位置。
2.材料中华11 (CK)H05系列石狩白毛(CK)E10系列WD17系列3.主要试剂和配方3.1 DNA微量提取微量提取液:200mM Tris-HCl(pH7.5250mM NaCl25mM EDTA0.5% SDS酚/氯仿氯仿无水乙醇、70%乙醇TE缓冲液(pH8.0)10mg/ml RNase3.2 Htp的PCR鉴定Taq酶及Buffer 购自Takara公司dNTPs购自华美公司3.3 植物DNA大量提取抽提液: 1.5%CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)75mmol/L Tris-HCl PH8.01M NaCl15mmol/L EDTA沉淀液: 1%CTAB50mmol/L Tris-HCl PH8.010mmol/L EDTA高盐TE: 1mol/L NaCl10mmol/L Tris-HCl PH8.01mmol/L EDTA3.4 Southern杂交Southern杂交液(1×):20×SSC 250 mL5%SDS 5 mL10%Sarkosyl 10 mLddH2O 735 mLBlocking Reagent 5 g洗脱液(1x):20x SSC 10 mL5%SDS 40 mLddH2O 950 mL3.5 RNA提取Trizol: 购自Invitragen公司10×MOPS: 80mmol/L NaAc0.2mol/L MOPS10mmol/L EDTA加DEPC处理的水定容,调pH值至7.0 RNA上样混合物:0.25%溴酚兰0.25%二甲苯菁50%甘油1 mmol/L EDT A1.2%甲醛变性胶(100ml):1.2g grose73ml DEPC水10×MOPBuffer 10 mL2.2M甲醛 6 mL3.6 RT-PCR反转录酶SuperscriptIII试剂盒购自Invitragen公司 PCR所用试剂同前。
植物基因转化及转基因植物的分析与鉴定1. 引言植物基因转化是一种重要的生物工程技术,利用这种技术可以引入外源基因或修改内源基因,从而改变植物的性状和功能。
转基因植物是通过植物基因转化技术获得的具有外源基因的植物,具有重要的应用价值。
本文将介绍植物基因转化的基本原理和方法,并探讨转基因植物的分析与鉴定方法。
2. 植物基因转化的基本原理和方法2.1 基本原理植物基因转化利用穿透细胞壁的技术,将外源DNA导入植物细胞,通过细胞的内源机制使其稳定地表达。
常用的植物基因转化方法包括农杆菌介导的转化、生物弹射法和基因枪法等。
2.2 基本方法2.2.1 农杆菌介导的转化农杆菌介导的转化是最常用的植物基因转化方法之一。
基本步骤包括构建表达载体、感受剂的处理和遗传转化的选择和鉴定。
构建表达载体时,将目标基因插入适当的载体上,并添加转录和翻译的调控序列,如启动子和终止子,以确保目标基因的表达。
感受剂的处理是将表达载体导入农杆菌中,并通过培养条件的优化,使农杆菌中的表达载体得到高效表达。
遗传转化的选择和鉴定是将感受剂经过适当的处理后,转化到植物细胞中,并通过筛选和鉴定来确定转化成功的细胞株。
2.2.2 生物弹射法生物弹射法是将DNA以高速撞击植物细胞,使其穿透细胞的质壁和细胞膜,进而将外源基因导入细胞内。
生物弹射法通常使用微粒子加速器或毛发管射击法进行。
微粒子加速器是一种将金属微粒或微球与外源DNA一起加速,并将其发射到目标细胞上的设备。
通过微粒的高速撞击,外源基因能够穿透细胞的质壁和细胞膜。
毛发管射击法是将DNA包裹在微小的金属颗粒上,然后使用高压气体将金属颗粒射击到目标细胞上。
这种方法也能够使外源基因穿透细胞膜进入细胞。
2.2.3 基因枪法基因枪法是将外源DNA包裹在金粒或微米级金属颗粒上,并使用高压气体或炮发射器将其穿过细胞质,进入植物细胞。
基因枪法不需要依赖转化菌或细胞融合等辅助手段,直接将外源DNA送入目标细胞,因此具有较高的成功率。
转基因植物的分子检测与鉴定方法及进展随着分子生物学和植物基因工程的不断发展,越来越多的育种工作者开始利用转基因技术获得常规育种技术难以得到的新种质和新品种。
植物转基因技术最大的好处在于可以打破自然界物种间原有的生殖隔离,促进基因在不同物种间的交流,极大地丰富变异类型,增大遗传多样性,为植物新品种的培育提供丰富的育种资源。
通过对基因功能的研究,筛选m目的基因,还可实现植物性状的定向改良。
因此该技术自1983年首次获得转基因植物以来,便深受育种工作者青睐,得到了蓬勃地发展。
至今已有30多科约200多种植物转基因成功;国际上相继有30多个国家批准3 000多例转基因植物进入田间试验,并且在美国、加拿大、中国等20多个国家成功进行了商品化生产…。
到2006年止,全球转基因作物的商业种植面积达1.02亿hm2,比2005年增长13%,是1996年的62倍。
转基因作物品种在农业生产中日益显现出巨大潜力。
植物转基因操作中,除利用抗生素抗性和除草剂抗性等选择基因排除非转化细胞而留存转化细胞,以及利用Gus和CFP等报告基因显示转基因成功外,更重要的是从分子水平鉴别出阳性转化体,明确目的基因在转基因植株中的拷贝数和转录与表达情况。
本文就常用的转基因植株检测与鉴定方法作一概述,并对近期发展起来的新方法做简要介绍。
1 外源基因整合与否及其整合拷贝数的鉴定1.1 PCR(p01 ymera se chain reaction)检测1.1.1 常规PCRPCR技术对目的片段的快速扩增实际上是一种在模板DNA、引物和4种脱氧核糖核苷酸存在的条件下利用DNA聚合酶的酶促反应,通过3个温度依赖性步骤(即变性、退火和延伸)完成的反复循环。
经PCR扩增所得目的片段的特异性取决于引物与模板DNA间结合的特异性。
根据外源基因序列设计出一对引物,通过PCR反应便可特异性地扩增出转化植株基因组内外源基因的片段,而非转化植株不被扩增,从而筛选出可能被转化的植株。
由于PCR检测所需的DNA用量少,纯度要求也不高,不需用同位素,实验安全,操作简单,检测灵敏,效率高,成本低,使之成为当今转基因检测不可或缺的方法,被广泛应用。
然而,PCR检测易出现假性结果。
引物设计不合理,靶序列或扩增产物的交叉污染,外源DNA 插入后的重排、变异等因素都会造成检测的误差。
因此常规PCR的检测结果通常仅作为转基因植物初选的依据,有必要对PCR技术进行优化,并对PCR(real-time quantitative PCR)检测为阳性的植株做进一步验证。
1.1.2 优化的PCRPCR技术的优化目的在于提高扩增产物的特异性、推测目的基因的拷贝数及整合情况,从而提高检测的效率。
常见的有多重PCR(Multiplex PCR, MPCR)、降落PCR(Touchdown PCR,TD-PCR)、 rpPCR、反向PCR(inverse PCR,IPCR)、实时定量 PCR等。
1.1.2.1 多重PCRMPCR是在同一管PCR反应体系中,使用多套针对多个DNA模板或同一模板的不同区域进行PCR扩增的方法。
与普通PCR法相比,MPCR反应更快捷,更经济,只需1次PCR反应,就能检测多个靶基因。
Matsuoka等用该方法同时扩增出了转基因玉米的5种外源基因Btll,Btl76Mort810,T25and GA21。
陈明洁等用MPCR对转基因小麦植株的报告基因uidA和选择基因hat进行扩增,MPCR的检测结果与单基因的PCR检测结果完全一致。
由于MPCR技术是在同一反应管中加多对引物同时对多个靶位点进行检测,因此对引物的要求较高,不同引物间的相互干扰应降至最低;同时扩增的目的片段大小也不能太接近,否则凝胶电泳时难以分开,无法辨别。
1.1.2.2 降落PCRTD-PCR是一种在一个反应管或少数几个反应管中通过一系列退火温度逐渐降低的反应循环来达到最佳扩增目的基因的PCR方案。
它通过体系自身的代偿功能弥补以反应体系和并非完美的循环参数所造成的不足。
此策略保证了最初形成的引物模板杂交体具最强的特异性。
尽管最后一些循环采用的退火温度会降到非特异的Tm值,但此时的扩增产物已开始几何扩增,在余下的循环中处于超过任何非特异性PCR产物的地位,从而使PCR产物仍然呈现出特异性扩增。
R.H.Don等认为,PCR过程中的前几个循环对于扩增产物的纯度非常重要,因此前几个循环较高的退火温度,会增加引物与模板结合的特异性,TD-PCR方法可以阻止非特异性产物的形成。
由于TD-PCR的策略是在较早的循环中避免低Tm值配对,故在TD—PCR中必须采用热启动技术。
田路明等用TD-PCR对高羊茅转基因植株两个片段进行了扩增,结果表明TD— PCR能快速准确检测转基因植株。
1.1.2.3 rpPCRF}1于外源基因整合到目标基因组时常发生重排,因此Southern杂交并不能清楚地分析转基因的拷贝数和整合情况。
Kumar和FladungIvl在研究转基因杨树的外源基因整合行为时发明了rpPCR方法。
这种方法就是利用不同的引物进行配对,对基因组DNA扩增,根据不同的引物对的扩增情况及产物的大小来推定 T-DNA的拷贝数、整合情况及拷贝的完整性等信息。
与Southern杂交相比,该法的优点在于能比较方便快捷地指出重复单位是否完整,并能表明这种重复的方向。
此方法的不足之处是在有多拷贝整合在不同的染色体上时不能显示作用㈣。
1.1.2.4反向PCRIPCR与普通PCR相同之处是都有一个已知序列的DNA片段,引物都分别与已知片段的两末端互补。
不同的是对该已知片段来说,普通PCR两引物的3、一末端是相对的,而IPCR则是相互反向的。
因而 IPCR可以扩增已知序列片段旁侧的未知序列。
根据这一特点,可以对外源基因在植物基因组中整合的拷贝数进行分析,多拷贝多位点整合时,扩增产物在电泳图谱上呈现多条带,单拷贝时只得到一条带。
然而,该技术要求DNA模板复杂度低于109bp,如果高于此值,则不能获得理想的效果。
另外,自连接(环化)的效率也是限制该技术成功的因素。
1.1.2.5 实时定量PCR实时定量PCR是一种在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法…1。
其特点是:特异性好,实时定量PCR技术通过引物或和探针的特异性杂交对模板进行鉴别,具有很高的准确性,假阳性低;灵敏度高,采用灵敏的荧光检测系统对荧光信号进行实时监控;线性关系好,由于荧光信号的强弱与模板扩增产物的对数呈线性关系,通过荧光信号的检测对样品初始模板浓度进行定量,误差小;操作简单,自动化程度高,实时定量PCR技术对PCR产物的扩增和检测在闭管的情况下一步完成,不需要开盖,交叉污染和污染环境机会少;没有后处理,不用杂交、电泳、拍照。
Ingham等研究发现可用双向实时定量PCR检测转基因植物中的外源基因拷贝数。
他们通过对37个株系的实时定量PCR检测,发现仅有2个株系是由于多个拷贝同时插人到了1个位点而与Southern结果不符,其余35个株系的双向实时定量PCR检测结果与 Southern结果高度吻合,表明实时定量PCR技术可用于检测转基因植物的拷贝数。
杜春芳等则建立了一种双重定量PCR技术鉴定转基因植物纯合子的新方法,该方法能鉴定出转基因植株是纯合型还是杂合型,并能准确鉴定出转化植株外源基因的拷贝数,为鉴定转基因植物的整合性提供了方便。
1.2 Southe rn杂交Southern杂交是利用经过标记的DNA、RNA探针与靶DNA进行特异性杂交,分析外源基因在植物染色体上的整合情况(如拷贝数、插人方式)以及外源基因在转基因后代的稳定性问题。
Southern杂交可以不受操作过程中的DNA污染影响和清除转化中的质粒残留所引起的假阳性信号,准确度高同,特异性强,是研究转基因植株外源基因整合最可靠的方法。
已广泛应用于水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、桃等各类作物转基因植株的检测。
然而该方法程序复杂,成本高,且对实验技术条件要求较高,使其使用受到了限制。
2 外源基因在转化植株中是否转录的检测与鉴定2.1 Nor t hern杂交外源基因在转化植株中的转录水平可以通过细胞总RNA和mRNA与探针杂交来分析,称为Northern杂交,它是研究转基因植株中外源基因表达及调控的重要手段。
Northern杂交程序一般分为三个部分:植物细胞总RNA的提取探针的制备印迹及杂交。
Northem杂交比Southern 杂交更接近于目的性状的表现,因此更有现实意义。
如竺晓平、孙辉、刘君等用Northem杂交分别对马铃薯、水稻、烟草的目的基因表达进行了鉴定。
但Northern杂交的灵敏度有限,对细胞中低丰度的mRNA检出率较低。
因此在实际工作中更多的是利用RT-PCR(reverse transcription PCR)技术对外源基因的转录水平进行检测。
2.2 RT—PCRRT-PCR的原理是在反转录酶作用下,以待检植株的mRNA合成cDNA,再以cDNA为模板扩增出特异的DNA。
因此,RT-PCR可在mRNA水平上检测目的基因是否表达。
RT-PCR十分灵敏,能够检测出低丰度的mRNA,特别是在外源基因以单拷贝方式整合时,其mRNA的检出常用RT-PCR。
Samia Diennane等把烟草硝酸还原酶基因Nia2经农杆菌介导导人马铃薯,经RT-PCR分析,Nia2基因在转基因马铃薯体内RNA水平得到表达。
周苏玫等。
以皖麦48为受体导人反义trxs基因,研究抗穗发芽特性,用RT-PCR检测trxs基因的转录水平,结果表明反义trxs 基因正常表达的阳性植株,lrxs基因mRNA的丰度极显著降低,从而起到抵制穗发芽的作用。
由于RT-PCR是在总RNA或mRNA水平上操作,检测过程中必须注意RNA的降解和DNA的污染,另外还要设置严格的对照来防止假性结果的出现。
3 转基因植株外源基因表达情况的检测与鉴定尽管在mRNA水平也能一定程度地研究外源基因的表达,但存在mRNA在细胞质中被特异性地降解等情况,mRNA与表达蛋白质的相关性不高(相关系数低于0.5),基因表达的中间产物mRNA水平的研究并不能取代基因最终表达产物的研究。
转基因植株外源基因表达的产物一般为蛋白,外源基因编码蛋白在转基因植物中能够正常表达并表现出应有的功能才是植物基因转化的最终目的。
外源基因表达蛋白检测主要利用免疫学原理,ELISA及Western杂交是外源基因表达蛋白检测的经典方法。
3.1 ELI SA检测E LIsA是酶联免疫吸附法(en zvme—linked immunosorbent assays)的简称,基础是抗原或抗体的同相化及抗原或抗体的酶标记,把抗原抗体反应的高度专一性、敏感性与酶的高效催化特性有机结合,从而达到定性或定量测定的目的。