HLD+ATP+7B基因8、12、14、16、18号外显子突变的DNA分析(Ⅱ)
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MspI digestion Tail digestion
DNA mutation
Wilson病(WD)是一种与铜代谢障碍有关的常 染色体隐|生遗传病。由于铜代谢障碍,铜沉积于大脑 基底节、肝脏、肾脏等处,导致各种症状,包括锥体外 系症状、急性和慢性肝功能损害及肾功能损害等。不 同地区及人群的患病率不一,估计世界人群的患病率 为0.3-3/10万。1引,近年来,随着Wilson病的进一步 研究,WD基因最近被克隆并定位于13号染色体长 臂上,编码一个P型铜转运ATP酶(ATP7B),此酶参 与铜跨膜转运的代谢过程。3引。WD基因包含21个 外显子,国外报道欧洲以14和18号外显子为基因突 变热区,作者曾于2007年在中国优生优育第49期就 wilson氏病ATP7B基因的第8号外显子突变的DNA 进行了分析和介绍,现就该基因的第12、14、16、18号
万方数据
中国优生优育2007年9月第13卷第3期 Chinese Jounaal of Healthy Birth&Child Care V01.1 3 No.3 September 2007
尿铜排泄量>100ug。记录下每个病人的发病年龄 及|}鑫床表现。82馕健康自愿者,男58铡,女24铸, 年龄最小7岁,最大36岁,平均21.7岁。血清镧蓝 嚣白及铜氧化酶等生化检查均为正常水平。 2方法 2+l基因组DNA稠备擒取研究对象外鼷静脉直 2ml,用酚氯仿法提取基因组DNA。 2.2目的基因的扩增 聚合酶链反应(PCR):扩增 ATP 7B基因外短子8、12、14、16、18,弓|物与文献报道 一致1乱¨(表1),由上海生工公司合成。扩趱采用 50ul反应体系进行,含基因组DNA 400ng,dNTP各 200umol/L,引物各2.0pmol/uL,Taq plus酶(Sangon 公司)1U及其棚应Taq plusl×Buffer,M92+浓度2.0 mmol/L,采蔫Hema基因扩增仪(产品标准:Q 192HM010-95),条件为950c 3min预变性,94℃50 秒,退火50秒,退火温度因外妲子不同而不同(50— 60℃),720C延伸60秒,循环数26~30个,最后72℃ 延伸∞分锌。
摘 要 目的 对肝豆状核变性(又称Wilson病,WD)基因的突变位点外显子8、12、14、16、18进行DNA测序分析并建立直
接基因诊断方法。方法 对102例WD病人和82例对照正常人提取基因组DNA,PCR扩增ATP7B第8、12、14、16、18号外 显子,8号外显子及12号外显子扩增产物分别行Msp I及Tail内切酶酶切分析;后对所有病人及对照组DNA外显子扩增产物 行直接测序,进而与临床表型做相关分析。结果 102例WD病人,8号外显子35例存在Msp I酶切反应异常,测序示 ArgV78Leu纯合或杂合突变,占34.31%,其中12例伴Leu770I.eu多态性;12号外显子13例存在Tail酶切反应异常,测序示 Thl935Met杂合错义突变,占12.75%,1例存在lr9919Gly杂合错义突变,Ar9952Lys在患者及对照组中均检出;余外显子14、 16、18对照组与患者均未发现突变。结论 ATP7B基因外显子8、12为WD突变热点,其中8号外显子以Ar’9778Leu、12号外 显予以Thr935Met为主要突变形式,PCR—Msp I酶切、PCR—Tail酶切反应可作为WD病人初步筛选方法。 关键词 肝豆状核变性 WD基因8、12号外显子 Msp I酶切Tail酶酶切DNA突变
表3 eXOH 12扩增产物Tail酶切反应体系
2.4 DNA基因测序PCR产物经Qiaquick Spin柱 (Qiagen Inc。)纯化。对所有瘸人稀对照组进行 DNA测序以了解8、12、14、16、18号外显子突变的 位置和形式,测序工作委托上海生工公司完成。 3结果 3。1抽提基因组DNA共184份标本,DNA浓度为 0.66ug/ul,电泳纯,在1.7%琼脂糖凝胶电泳示一条 带(约20kb)。 3.2酶切分析 3.2.】MspI酶切分析 在102例WD患者中,8号 外显子扩增产物经MspI酶切异常者共35例, Ar9778Leu纯合突变14例,占所有瘸人的13.73% (Msp l内切酶未酶切,296bp一条带),杂合型突变 2l铡,占20.59%(Msp I内切酶部分酶切,296bp、 237bp、59bp三条带),而对照组无一例检出此突变 (Msp I内切酶完全酶切,237bp、59bp两条带)。 (图1)
1 对象
102例WD患者,均为安徽中医学院第一附属 医院神经内科2004年9月一2006年12月期间收住 的患者,其中男61例,女41例,年龄最大者53岁, 最小者6岁,平均15.2岁土3.2岁,所有病例均依 据以下主要条件诊断:(1)具有锥体外系症状和/或 肝损害表现及精神异常等临床特点;(2)眼裂隙灯 下查角膜K—F环阳性;(3)血清铜蓝蛋白(CP)< 200mg/L或血清铜氧化酶<0.2活力单位;(4)24h
万方数据
圈1 ATP 7B基因8霹外显子PCR产物MspI酶切电泳豳
正常对照缀(237bp,59bp) 不含Ar妒78Leu突变粒患者(237bp,59bp) Ar9778Leu纯合突变患者(296bp) Ar9778Leu杂合突变患者(296bp,237bp,59bp) 酶切Mark
中国优生优育2007年9月第13卷第3期 Chinese Journal of Health),Birth&Child Care V01.13 No.3 Septemher 2007
表1 PCR扩增所用的5对弓I物
2,3限制性内切酶消化 2。3.1 MspI内切簿消讫ATP 7B基因8号外显子 扩增产物采用25ul酶切反应体系,如表2所示, 37。C孵育4小时使样本完全酶切后,3%琼脂糖凝胶 电泳。
表2 exon 8 g-增产麓MspI酶甥复痉露系
2.3.2 Tail内切酶消化ATP 7B基因12号外显子 扩增产物亦采用25ul酶切反应体系,如表3所示, 65℃孵育5小时使样本完全酶切后,3%琼脂糖凝胶 电泳。
amelioration.35 cases were abnormal in 102 patients.Sequence result shows that in the 102 patients 34.3l%have homozygous or heterozygous Ar9778Leu mutation in exon 8,12 Leu770Leu polymorphism;and that for exon 12,13 cases were abnormal using digestion bv TAjl.direct sequencing shows 12.75%of the cases have heterozygous Thl935Met mutation,one case was identified as heterozygous Ar9919Glv.while Ar9952Lys was detected in both patients and normal contr01.No mutation was found in exonl4、16、18 of all volun—
Analysis of The Mutation of Exon 812 14 16来自7718
of Wilson+S
Disease Gene
BAO Yuan—cheng YU Yuan—xun WU peng JIANG Huai—zhou WANG Hong—hao ABSTRACT Objectives To sequence and study the exon 8、12、14、16、18 of wD gene(hepatolenticular degeneration,Wilson§ discase 1 and to establish the direct gene diagnosis.Methods Extract the genonfic DNA from 102 WD patients and 82 normal controls, and amplify exon 8、12、14、16、18 of ATP7B gene by polymerase chain reaction(PCR).The amplification products of exon 8、exon 12 were digested with MspI and Tail respectively followed by sequencing the PCR products of exom 8、12、14、16、1 8 from all the patients and normal controls.The correlation between the mutation and clinical manifestation were stucdied.Results Digested by MspI through
作者单位1.安徽中医学院第一附属医院神经内科 2.安徽优生优育遗传医学中心
外显子突变的分析研究作进一步的探讨。 对于中国人,大部分基因突变发生在外显子8、12
上,作者对来自98个家系102位WD病人进行调查分 析,PCR扩增ATP7B第8、12、14、16、18号外显子,8号、 12外显子扩增产物分别行MspI及Tail酶切分析,对所 有病人及对照组进行DNA测序,分析其突变隋况。
例中12例在8号外显子Ar9778Leu突变基础上发 生Leu770Leu同义突变。102例病人中8号外显子 总染色体突变率34.31%。(图3-5)
图2 ATP 7B基因12号外显子PCR产物Tail酶切电泳图 1.酶切Mark 2.正常对照组(229bp) 3.不含‘Phl935Met突变的患者(229bp) 4.Thr935Met杂合突变的患者(89bp、140bp、229bp)