2-(2-羟基苯亚甲基胺)-4,6-二羟基-嘧啶的质子转移异构化反应

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143.8
TS7
0.188793
-814.765660
-814.618123
-1011.5
19.3
TS8
0.187818
-814.709818
-814.563388
-1863.9
163.1
TS9
0.188075
-814.713744
various species isomers and transition states in reaction pathways by intra molecular prototropy obtained with
the DFT-B3LYP/6-311+G(d, p) calculations
周子彦 1,* 刘 敏 3 苏忠民 2 谢玉忠 3 丁慎德 1 王华静 1
(1山东理工大学化学工程学院, 山东 淄博 255049; 2东北师范大学化学学院功能材料化学研究所, 长春 130024; 3延边大学理学院化学系, 吉林 延吉 133002)
摘要: 为了探索 2-(2-羟基苯亚甲基胺)-4,6-二羟基-嘧啶(M1)分子醇式和酮式结构互变异构化的反应机理, 利 用密度泛函理论(DFT)方法, 在 B3LYP/6-311+G(d, p)基组水平上, 对 M1 化合物异构化反应的势能面进行了研 究, 在探讨各种可能的反应途径中, 发现单体至少有 8 种异构体和 10 种过渡态. 结果表明: 2-(2-羟基苯亚甲基 胺)-6-羟基-4(3H)嘧啶酮(M6)不论是单体、与水形成的配合物, 还是二聚体, 比其相对应的异构体能量低, 表明 在通常情况下是以 M6 形式稳定存在的; 在考察的可能反应途径中, 直接进行的分子内质子转移过程需要的活 化自由能为 143.8 kJ·mol-1, 水助催化时, 反应的活化自由能为 38.9 kJ·mol-1, 二聚体双质子转移的活化自由 能为 0.6 kJ·mol-1, 二聚体双质子转移所需活化自由能最低, 在室温下就可以进行, 由此可见氢键在降低反应活 化能方面起着重要的作用.
September [Article]
物理化学学报(Wuli Huaxue Xuebao) Acta Phys. -Chim. Sin. 2011, 27 (9), 2035-2042
2035
2-(2-羟基苯亚甲基胺)-4,6-二羟基-嘧啶的质子转移异构化反应
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34.6
M4
0.190941
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-814.576666
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128.2
M5
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146.4
M6
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-3.7
M7
0.192370
-814.767393
-814.616718
Ⓒ Editorial office of Acta Physico-Chimica Sinica
2036
Acta Phys. -Chim. Sin. 2011
Key Words: 2-(2-Hydroxybenzylidenamino)pyrimidine)-4,6-diol; Density functional theory; Tautomerism; Proton transfer
表 1 DFT-B3LYP/6-311+G(d, p)方法计算得到的目标分子单体各异构体和过渡态的零点能(Ezp)、总能量(E)、吉
布斯自由能(G)及谐振频率 v
Table 1 Zero-point energy (Ezp), total energy (E), Gibbs free energy (G) and imaginary frequency (ν) of
Received: February 28, 2011; Revised: May 26, 2011; Published on Web: July 4, 2011. ∗Corresponding author. Email: zyzhou@; Tel: +86-533-2767606. The project was supported by the National Natural Science Foundation of China (20703008) and Natural Science Foundation of Shandong Province, China (ZR2009BL024). 国家自然科学基金(20703008)和山东省自然科学基金(ZR2009BL024)资助项目
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23.0
M8
0.193109
-814.770382
-814.618993
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17.1
TS10.188881Fra bibliotek-814.766528
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-1212.9
18.4
TS2
0.187853
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-1856.4
166.4
TS3
0.186273
-814.678263
ZHOU Zi-Yan1,* LIU Min3 SU Zhong-Min2 XIE Yu-Zhong3 DING Shen-De1 WANG Hua-Jing1
(1College of Chemical Engineering, Shandong University of Technology, Zibo 255049, Shandong Province, P. R. China; 2Institute of Functional Material Chemistry, Faculty of Chemistry, Northeast Normal University, Changchun 130024, P. R. China;
Vol.27
1引言
水杨醛缩芳胺类席夫碱由于具有化学性质稳 定、结构特别易变的特殊性, 对光、热、电、压等外界 环境特别敏感, 具有光致变色、非线性光学、光致发 光等多种性质, 此类化合物与众不同的分子内超快 质子转移是实现电荷转移、传递的重要基础, 因而 引起了人们极大的研究兴趣.1,2 质子转移而产生的 互变异构现象, 不但在一般化学研究中会发生, 而 且在分子生物学上也同样具有非常重要的意义. 嘧 啶碱基广泛地存在于生物体系中, 质子在嘧啶碱基 中杂原子间的迁移, 主要是借助分子内氢键或者是 溶剂中的氢键桥而发生的异构化反应, 此过程导致 嘧啶碱基有很多异构体, 这些异构体的相对稳定性 和异构体之间的相互转变对生物分子的活性具有 重要影响.3,4 随着量子化学和计算机技术的发展, 质 子转移和旋转异构反应都能被精确地计算.5-21 我们 曾经报道了 8-羟基喹啉,22,23 6-甲基-4-羟基嘧啶 和 24,25 水杨酰苯胺 26 质子转移的理论研究. 但对水杨醛缩 嘧啶胺席夫碱的研究报道却较少.27,28 2-(2-羟基苯亚 甲基)胺基-4,6-二羟基-嘧啶分子内有一个 O-H…N 分子内氢键, 存在着质子转移的通道. 为了探讨其
2 计算方法
利 用 DFT 方 法, 在 B3LYP/6-311 + G(d, p) 水 平 上, 对标题化合物的单体质子转移、水助催化质子 转移和同种二聚体质子转移异构化过程进行了研 究; 在相同水平下进行了振动分析, 确认了异构体 的稳定态和一阶鞍点过渡态; 并通过内禀反应坐标 分析(IRC)对异构体之间对应的过渡态进行了确认; 全部计算用 Gaussian 03 量子化学程序包 29完成.
-814.534563
-1825.0
238.7
TS4
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TS5
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-1765.4
237.0
TS6
0.188097
-814.716378
-814.570733
-1868.9
3Department of Chemistry, College of Science, Yanbian University, Yanji 133002, Jilin Province, P. R. China)
Abstract: To determine the tautomerism mechanism between the enol form and the keto form of 2(2-hydroxybenzylidenamino)pyrimidine-4,6-diol (M1) the potential energy surface of the isomerization was studied using density functional theory (DFT) calculations at the B3LYP/6-311+G(d, p) level. We found that there were at least 8 isomers and 10 transition states in the possible reaction pathways. All the possible processes of the reaction were studied. The results showed that the energy of 6-hydroxy-2-(2hydroxybenzylideneamino) pyrimidine-4(3H)-one (M6) was lower than those of the other isomers in the form of a monomer, a hydrate, and a dimer. Therefore, it was the most stable isomer. In these possible reaction pathways the activation free energy required for intramolecular prototropy was 143.8 kJ·mol-1 and for the proton transfer process that was catalyzed by water was 38.9 kJ·mol-1. The activation free energy in the double-proton transfer of the dimer was 0.6 kJ·mol-1, which was the lowest value. The latter pathway was feasible at room temperature. This implies that hydrogen bonding plays an important role in depressing the activation energy of the reaction.