病毒宏基因组学 PPT课件
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宏基因组学的PPT宏基因组学是通过收集宿主的粪便里的微生物、以及培养皿中的微生物,利用专业的宏基因组技术进行分析。
它能够获得宏基因组信息和相关序列,从而为疾病相关症状的诊断和治疗提供依据。
随着人类健康问题愈演愈烈,为了降低成本,并能通过生物技术进行治疗,研究人员开发了宏基因组学技术。
其通过收集环境中存在的特定细菌,来分析它们在土壤、水源或大气中的分布,以了解它们在整个生态系统中所扮演的角色。
宏基因组学(宏测序法)是一种对人体和环境进行科学评价(包括微生物菌群与疾病之间关系)的工具。
它是一种高通量方法来鉴定微生物群落或疾病(包括寄生虫病等),并用于进行疾病和环境健康状态跟踪和诊断。
虽然宏基因组学可以通过分析病原体来诊断疾病——但目前还没有针对特定微生物群落或某一种病原体开展研究。
1.目的宏基因组学通过收集宿主的粪便和排泄物,以及在培养皿或土壤中的特定微生物群落来检测微生物菌群。
它们在宿主的整个生命周期中都是重要的,并且是许多宿主健康相关问题发生和治疗的潜在因素之一。
通过对宿主宏基因组学数据进行统计分析,可以更好地了解宿主微生物多样性与环境健康状况之间的关系;进而有助于了解宿主肠道微生物及其他微生物群落对人体健康所发挥作用;同时也有助于了解特定微生物群落与其健康状况之间的关系。
此外,还可以通过研究宿主体内微生物种群之间互相作用机制,从而更好地理解宿主微生物群落结构及疾病发生背后原因。
这为人类健康提供了新的见解。
在环境方面,宏基因组学可以从宿主微生物群落中发现与生态系统结构相关、通过检测宿主体内微生物群落来揭示生命现象本质和机制;还可以通过感染或死亡微生物群落以及与宿主相互交互作用规律来揭示微生物群落与疾病发生之间关系:同时宏基因组学还可以为相关研究人员提供研究资源、为治疗提供科学依据。
此外,宏基因组学还能为环境健康状态跟踪和诊断提供参考——为了解环境健康状态和健康风险提供科学依据。
2.方法原理在了解宿主肠道中的微生物群落的组成之后,宏基因组学可以分析宿主的粪便样本。
病毒宏基因组学(Meta-virome)病毒宏基因组学(Meta-virome)是在宏基因组学理论的基础上,结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支,是某类样本中所有病毒(virus)或病毒类似物(virus-like-particle)及其所携带遗传信息的总称。
宏病毒组直接以环境中所有病毒的遗传物质为研究对象,能够快速准确的鉴定出环境中所有的病毒组成,在病毒发现、病毒溯源、微生物预警等研究方面具有重要作用。
宏病毒研究可应用于人或动物肠道或者血液样本、海洋、土壤等的研究,用以挖掘潜在的对人类和环境的危害。
易基因科技同丹麦哥本哈根大学知名微生物课题组联合开发高效的宏病毒组颗粒富集方法,可对微量样本进行病毒颗粒富集,并保证病毒活性及高均质性,为宏病毒组学、噬菌体与细菌之间的互作关系等研究提供优良技术支持,保驾护航!技术路线信息分析由NT-V、ViPR、PATRIC、IRD等数据库序列组成的非冗余病毒序列数据库。
技术参数样本要求∙样本直接运输(干冰);粪便、土壤、底泥建议≥400mg(最低不低于200mg);水样需微孔滤膜过滤后送样。
∙测序策略:PE150∙其他注意事项:①最终样本质量以我司的检测结果为准;②若样本总量超过要求,可以进行样本保存,反样;项目完成后,将不再保存剩余样品。
项目周期∙15个样本以下标准运转周期约为45个工作日,大样本量项目需分批建库,项目周期需要与技术支持人员确定。
产品优势∙可对微量样本中的病毒组进行有效分离。
∙对噬菌体不造成损伤,最大程度保证了病毒活性,适用于下游FVT研究。
∙相较于传统的PEG,CsCl等方法,均质性高,噬菌体偏好性低。
∙全面的数据分析策略,定制的多组学关联数据挖掘。
研究案例噬菌体是粪便病毒组的主要成员,粪便病毒组移植(FVT)或能有效的调节肠道菌群。
Gut 最新发表了来自丹麦哥本哈根大学团队(易基因合作方)的研究,在该项概念验证试验中发现,接受瘦小鼠的粪便病毒组移植后,饲喂高脂食物的小鼠体重增长变慢,同时还能保持正常的血糖指标,FVT引起的肠道菌群变化介导了这些保护性功能代谢作用。