质粒DNA的提取、鉴定与转化
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一、实验目的
1. 理解质粒转化实验的基本原理和操作步骤。
2. 掌握感受态细胞制备和质粒转化方法。
3. 学会筛选和鉴定转化子。
二、实验原理
质粒转化实验是将外源DNA片段(如质粒)导入受体细胞(如大肠杆菌)的过程。通过转化,受体细胞获得外源DNA片段所携带的遗传信息,从而表现出相应的生物学特性。本实验采用热冲击法将质粒DNA导入大肠杆菌感受态细胞中,通过筛选和鉴定转化子,实现对目的基因的克隆。
三、实验材料
1. 质粒:pUC19质粒(含有抗生素抗性基因)
2. 受体菌:大肠杆菌DH5α
3. 试剂:氯化钙、NaCl、Tris-HCl、EDTA、TE缓冲液、无水乙醇、酚、氯仿、异丙醇、琼脂糖、DNA Marker、DNA测序引物等
4. 仪器:恒温摇床、台式离心机、PCR仪、电泳仪、凝胶成像系统、紫外灯、超净工作台等
四、实验步骤
1. 制备感受态细胞
(1)将大肠杆菌DH5α在含有抗生素的LB液体培养基中培养过夜。
(2)取适量培养物,按1:100的比例加入新鲜的LB液体培养基中,37℃振荡培养1.5小时,使细菌处于对数生长期。
(3)将细菌离心收集,弃去上清液,用冷的CaCl2溶液重悬细胞,使细胞浓度约为1×10^8个/mL。
(4)将重悬的细胞置于冰浴中5分钟,以降低细胞膜通透性。
(5)将细胞与质粒DNA混合,37℃温育30分钟。
(6)将混合物迅速置于冰浴中5分钟,以停止转化过程。 (7)将混合物加入到LB固体培养基中,37℃培养过夜。
2. 筛选和鉴定转化子
(1)将培养皿中的单菌落接种到含有抗生素的LB液体培养基中,37℃培养过夜。
(2)提取转化子DNA,进行PCR扩增,检测目的基因是否存在。
(3)对PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,观察条带是否与预期相符。
(4)对阳性克隆进行测序,验证目的基因是否正确导入。
五、实验结果
1. 感受态细胞制备成功,转化效率较高。
2. 成功筛选出转化子,目的基因导入受体细胞。
一般普通质粒扩增:
先将质粒转化到DH5α等大肠杆菌中,通过扩大培养获取大量含有质粒的大肠杆菌。
大肠杆菌的培养需要用到LB液体培养基,配方见下文。根据质粒带有的抗生素抗性基因,还需要在LB中加入适量相应抗生素,如氨苄青霉素、卡那霉素等。
LB 液体培养基(Luria-Bertani) :称取蛋白胨(Tryptone)10 g,酵母提取物(Yeast extract) 5 g,NaCl 10 g,溶于800ml 去离子水中,用NaOH 调 pH至7.5, 加去离子水至总体积 1 升,高压下蒸气灭菌 20 分钟。
质粒提取目前一般都有商业化生成的试剂盒销售,可按照相应试剂盒的说明书操作。
转化:
① 取出感受态细胞(也有商品化感受态销售),冰浴10分钟。
② 取连接产物10μl 放入感受态细胞中(100μl/管) ,轻轻旋转以混匀内容物,冰浴 30分
钟。
③ 42℃热休克 120 秒(按照需要加长或减少时间),不能摇动Ep管。冰浴 5 分钟,然后转移到事先预热至 37℃的无抗生素的普通LB培养基800ul,50~100rpm 37℃恒温振荡 1 小时 30 分钟。
④ 用无菌弯头玻棒铺菌器将150ul 菌液铺于含有抗生素的 LA平板。
⑤ 铺菌的LA 平板于 37℃正放 2~3 小时,然后倒置培养 16-24 小时。
⑥ 将疑似阳性克隆的白斑选出,接到新的含有抗生素的LB中培养14小时左右,做菌液PCR或抽提质粒酶切以进一步鉴定转化是否成功。
转染:
① 将3μl(约4μg)纯化好的经除菌的质粒DNA溶入250μl 无血清培养基 DMEM (无双抗) 中,轻轻混匀,室温放置 5 mim。
② 再吸取10 μl 脂质体溶入250 μl 无血清培养基 DMEM(无双抗)中,轻轻混匀,室温放置5 mim。
③ 将制备好的DNA 与脂质体轻轻混合均匀,室温放置20 mim。然后加入1.5 ml 无血清培养基DMEM(无双抗)中,轻轻混匀,即为包裹好的脂质体/DNA。
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总结 质粒DNA的提取、定量、酶切与PCR鉴定
一、实验目的
1.学习并掌握用碱裂解法提取质粒DNA的方法;
2.学习并掌握了解质粒酶切鉴定的方法;
3.学习并掌握紫外吸收检测DNA浓度和纯度的原理和方法;
4.学习并掌握PCR基因扩增的实验原理和操作方法;
5.学习并掌握水平式琼脂糖凝胶电泳的原理和使用方法。
二、实验原理
1.PCR(多聚酶链式反应)
在DNA聚合酶催化下,可以DNA为模板,以特定引物为延伸起点,以dNTP为原料,通过变性、退火、延伸等步骤, 在体外(缓冲液中)复制DNA,使目的DNA按2n方式呈指数形式扩增。
PCR一次循环的具体反应步骤为:
A.变性:加热反应系统至95℃,使模板DNA在高温下完全变性,双链解链 。
B.退火:逐渐降低溶液温度,使合成引物在低温(35-70℃,一般低于模板Tm值的5℃左右),与模板DNA互补退火形成部分双链。
C.延伸:溶液反应温度升至中温72℃,在 Taq酶作用下,以dNTP为原料,引物为复制起点,模板DNA的一条单链在解链和退火之后延伸为一条双链。
2.质粒DNA的提取与制备
(1).碱裂解法:
染色体DNA与质粒DNA的变性与复性存在差异:
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总结 A.高碱性条件下,染色体DNA和质粒DNA均变性;
B.当以高盐缓冲液调节其pH值至中性时,变性的质粒DNA复性并保存在溶液中,染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构,可通过离心形成沉沉淀去除。
质粒DNA酶切、连接、转化、筛选、鉴定
(2011-04-29 10:42:22)
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质粒DNA酶切、连接、转化、筛选、鉴定
实验目的
1、学习和掌握限制性内切酶的特性
2、掌握对重组质粒进行限制性内切酶酶切的原理和方法
3、掌握利用CaCl2制备感受态细胞的方法
4、学习和掌握热击法转化E.coli的原理和方法
5、掌握α互补筛选法的原理
6、学习用试剂盒提取重组质粒DNA的方法
7、复习琼脂糖凝胶电泳的原理及方法
实验原理
重组质粒的构建需要对DNA分子进行切割,并连接到合适的载体上进行体外重组。限制性核酸内切酶和DNA连接酶的发现与应用,为重组质粒的构建提供了有力的工具。
限制性核酸内切酶酶切分离法适于从简单基因组中分离目的基因。质粒和病毒等DNA分子小的只有几千碱基,大的也不超过几十万碱基,编码的基因较少,获得目的基因的方法也比较简单。
DNA连接酶催化两双链DNA片段相邻的5’-磷酸和3’-羟基间形成磷酸二酯键。在分子克隆中最有用的DNA连接酶是来自T4噬菌体的DNA 连接酶:T4 DNA连接酶。T4 DNA连接酶在分子克隆中主要用于:1、连接具有同源互补粘性末端的DNA片段;2、连接双链DNA分子间的平端;3、在双链平端的DNA分子上添加合成的人工接头或适配子。
目的DNA片段与载体DNA片段之间的连接方式(以T4DNA连接酶为例)主要有以下几种:
(一)、具互补粘性末端片段之间的连接
大多数的核酸内切限制酶都能够根据识别位点切割DNA分子,形成1~4核苷酸单链的粘性末端。当载体和外源DNA用同一种限制性内切酶切割时,产生相同的粘性末端,连接后仍保留原限制性内切酶的识别序列;如果用两种能够产生相同的粘性末端的限制酶(同尾酶)切割时,虽然可以有效地进行连接,但是获得的重组DNA分子消失了原来用于切割的那两种限制性核酸内切酶的识别序列,这样不利于从重组子上完整地将插入片段重新切割下来。